Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGAGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGAGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGAGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
| view | Chimp |
-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGGGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGGGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGGGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
| view | Rhesus |
-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAG-GGGUGGGAUGUUCUGGGCUCCGGGUAGAGGAUG---------------------------UUUGCCGGUCCCU----GCU-----------------------GCUGGC--CC----UGACA-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAG-GGGUGGGAUGUUCUGGGCUCCGGGUAGAGGAUG---------------------------UUUGCCGGUCCCU----GCU-----------------------GCUGGC--CC----UGACA-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAG-GGGUGGGAUGUUCUGGGCUCCGGGUAGAGGAUG---------------------------UUUGCCGGUCCCU----GCU-----------------------GCUGGC--CC----UGACA-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
| view | Bushbaby |
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| view | Tree Shrew |
-AGGCUGGCAG---GAACGGCCUCUGUUCA--UUAUGG------AAAAGGGCAGAACAUACAGAGU----GGCAGGAAACAAGCCCCACCUCCCCUCCAG----ACUCUCUAGUAGUCAAG----GAU-----------------------GUUGGGACUCCCUAUGACA-----GGCACCAU---------CCUCUCUGC-----AGCCCCGCUUAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCCCCCUUCAGA-AGGCUGGCAG---GAACGGCCUCUGUUCA--UUAUGG------AAAAGGGCAGAACAUACAGAGU----GGCAGGAAACAAGCCCCACCUCCCCUCCAG----ACUCUCUAGUAGUCAAG----GAU-----------------------GUUGGGACUCCCUAUGACA-----GGCACCAU---------CCUCUCUGC-----AGCCCCGCUUAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCCCCCUUCAGA-AGGCUGGCAG---GAACGGCCUCUGUUCA--UUAUGG------AAAAGGGCAGAACAUACAGAGU----GGCAGGAAACAAGCCCCACCUCCCCUCCAG----ACUCUCUAGUAGUCAAG----GAU-----------------------GUUGGGACUCCCUAUGACA-----GGCACCAU---------CCUCUCUGC-----AGCCCCGCUUAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCCCCCUUCAGA |
| view | Horse |
-GAGCACGCUGGCGGCACAGCCUCUGCUCG--UGAUGG------AAAAGCGUAGAACAU------------GUGAGAGACAAGCCGU-----------------------------UCCCC----ACC-----------------------ACUGAC-CAC----UGA-----------CUUC---------UCUG----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCAAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCACGCUGGCGGCACAGCCUCUGCUCG--UGAUGG------AAAAGCGUAGAACAU------------GUGAGAGACAAGCCGU-----------------------------UCCCC----ACC-----------------------ACUGAC-CAC----UGA-----------CUUC---------UCUG----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCAAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCACGCUGGCGGCACAGCCUCUGCUCG--UGAUGG------AAAAGCGUAGAACAU------------GUGAGAGACAAGCCGU-----------------------------UCCCC----ACC-----------------------ACUGAC-CAC----UGA-----------CUUC---------UCUG----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCAAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
| view | Armadillo |
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| view | Cat |
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| view | Dog |
-GAGCAUCCCGCAGGC----UUGCAGUUGG--GGGUGG----------GCGCUGGGCUG------------GUGGCAGAGCACCCCC-----------------------------UCCAUUUAGAGC-----------------------GGUGGC-CAC----UGAUG-----GGCACCUC---------UCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCAUCCCGCAGGC----UUGCAGUUGG--GGGUGG----------GCGCUGGGCUG------------GUGGCAGAGCACCCCC-----------------------------UCCAUUUAGAGC-----------------------GGUGGC-CAC----UGAUG-----GGCACCUC---------UCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCAUCCCGCAGGC----UUGCAGUUGG--GGGUGG----------GCGCUGGGCUG------------GUGGCAGAGCACCCCC-----------------------------UCCAUUUAGAGC-----------------------GGUGGC-CAC----UGAUG-----GGCACCUC---------UCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
| view | Elephant |
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| view | Cow |
====================================================================---GGGUUCGGGGACUCGU-----------------------------CAGGC----AGC-----------------------UGAAGC-UCC----UGACA-----GCCGCCUC---------CCCC----CGCCCCAGCUCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGG====================================================================---GGGUUCGGGGACUCGU-----------------------------CAGGC----AGC-----------------------UGAAGC-UCC----UGACA-----GCCGCCUC---------CCCC----CGCCCCAGCUCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGG====================================================================---GGGUUCGGGGACUCGU-----------------------------CAGGC----AGC-----------------------UGAAGC-UCC----UGACA-----GCCGCCUC---------CCCC----CGCCCCAGCUCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGG |
| view | Rabbit |
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| view | Guinea Pig |
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| view | HedgeHog |
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| view | Mouse |
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| view | Shrew |
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| view | Rat |
================================================================================================================================--------------------------------C----UGACU-----UUUAGUUU---------UCUG----U-----AGCCCCUCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAAGCCCCCUUCAGA================================================================================================================================--------------------------------C----UGACU-----UUUAGUUU---------UCUG----U-----AGCCCCUCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAAGCCCCCUUCAGA================================================================================================================================--------------------------------C----UGACU-----UUUAGUUU---------UCUG----U-----AGCCCCUCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAAGCCCCCUUCAGA |
| view | Tenrec |
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| view | Opossum |
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| view | Platypus |
UGUGACCGCCUCUCGUCCAGCCACAGUUCAGCUCAUAGUCCAUUCAGUGGGCAGGUGGG--UGGGCUC-----UGAAGGGGCCCCAUACUCGCCGUUUUGGAUGAU---------------------------------------------GCAGUAUUCC----UGAUGAUGGGGAUGUCCU---------CGCU----C-----AGCUCCCCUCAAAGGAAUACCCAAGCAGGCUCCAUUCAGAUGUGACCGCCUCUCGUCCAGCCACAGUUCAGCUCAUAGUCCAUUCAGUGGGCAGGUGGG--UGGGCUC-----UGAAGGGGCCCCAUACUCGCCGUUUUGGAUGAU---------------------------------------------GCAGUAUUCC----UGAUGAUGGGGAUGUCCU---------CGCU----C-----AGCUCCCCUCAAAGGAAUACCCAAGCAGGCUCCAUUCAGAUGUGACCGCCUCUCGUCCAGCCACAGUUCAGCUCAUAGUCCAUUCAGUGGGCAGGUGGG--UGGGCUC-----UGAAGGGGCCCCAUACUCGCCGUUUUGGAUGAU---------------------------------------------GCAGUAUUCC----UGAUGAUGGGGAUGUCCU---------CGCU----C-----AGCUCCCCUCAAAGGAAUACCCAAGCAGGCUCCAUUCAGA |
| view | Chicken |
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| view | Lizard |
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| view | Frog |
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| view | Zebrafish |
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| view | Stickleback |
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| view | Tetradon |
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| view | Fugu |
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| view | Medaka |
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