Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
Species | Sequence | |
---|---|---|
view | Human |
-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGAGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGAGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGAGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
view | Chimp |
-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGGGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGGGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAGAGGGUGGGACGUUCUGGGCUCGGGGUGGGGGACG---------------------------UUUGCCGGUCACU----GCU-----------------------GCUGGCGCCC----UGACU-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
view | Rhesus |
-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAG-GGGUGGGAUGUUCUGGGCUCCGGGUAGAGGAUG---------------------------UUUGCCGGUCCCU----GCU-----------------------GCUGGC--CC----UGACA-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAG-GGGUGGGAUGUUCUGGGCUCCGGGUAGAGGAUG---------------------------UUUGCCGGUCCCU----GCU-----------------------GCUGGC--CC----UGACA-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GCGCUAGCC-------------------------UAG------AAG-GGGUGGGAUGUUCUGGGCUCCGGGUAGAGGAUG---------------------------UUUGCCGGUCCCU----GCU-----------------------GCUGGC--CC----UGACA-----GUUGCCGU---------CCUC----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
view | Bushbaby |
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view | Tree Shrew |
-AGGCUGGCAG---GAACGGCCUCUGUUCA--UUAUGG------AAAAGGGCAGAACAUACAGAGU----GGCAGGAAACAAGCCCCACCUCCCCUCCAG----ACUCUCUAGUAGUCAAG----GAU-----------------------GUUGGGACUCCCUAUGACA-----GGCACCAU---------CCUCUCUGC-----AGCCCCGCUUAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCCCCCUUCAGA-AGGCUGGCAG---GAACGGCCUCUGUUCA--UUAUGG------AAAAGGGCAGAACAUACAGAGU----GGCAGGAAACAAGCCCCACCUCCCCUCCAG----ACUCUCUAGUAGUCAAG----GAU-----------------------GUUGGGACUCCCUAUGACA-----GGCACCAU---------CCUCUCUGC-----AGCCCCGCUUAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCCCCCUUCAGA-AGGCUGGCAG---GAACGGCCUCUGUUCA--UUAUGG------AAAAGGGCAGAACAUACAGAGU----GGCAGGAAACAAGCCCCACCUCCCCUCCAG----ACUCUCUAGUAGUCAAG----GAU-----------------------GUUGGGACUCCCUAUGACA-----GGCACCAU---------CCUCUCUGC-----AGCCCCGCUUAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCCCCCUUCAGA |
view | Horse |
-GAGCACGCUGGCGGCACAGCCUCUGCUCG--UGAUGG------AAAAGCGUAGAACAU------------GUGAGAGACAAGCCGU-----------------------------UCCCC----ACC-----------------------ACUGAC-CAC----UGA-----------CUUC---------UCUG----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCAAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCACGCUGGCGGCACAGCCUCUGCUCG--UGAUGG------AAAAGCGUAGAACAU------------GUGAGAGACAAGCCGU-----------------------------UCCCC----ACC-----------------------ACUGAC-CAC----UGA-----------CUUC---------UCUG----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCAAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCACGCUGGCGGCACAGCCUCUGCUCG--UGAUGG------AAAAGCGUAGAACAU------------GUGAGAGACAAGCCGU-----------------------------UCCCC----ACC-----------------------ACUGAC-CAC----UGA-----------CUUC---------UCUG----C-----AGCCCCACUCAAAGGCAUCCCAAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
view | Armadillo |
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view | Cat |
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view | Dog |
-GAGCAUCCCGCAGGC----UUGCAGUUGG--GGGUGG----------GCGCUGGGCUG------------GUGGCAGAGCACCCCC-----------------------------UCCAUUUAGAGC-----------------------GGUGGC-CAC----UGAUG-----GGCACCUC---------UCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCAUCCCGCAGGC----UUGCAGUUGG--GGGUGG----------GCGCUGGGCUG------------GUGGCAGAGCACCCCC-----------------------------UCCAUUUAGAGC-----------------------GGUGGC-CAC----UGAUG-----GGCACCUC---------UCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA-GAGCAUCCCGCAGGC----UUGCAGUUGG--GGGUGG----------GCGCUGGGCUG------------GUGGCAGAGCACCCCC-----------------------------UCCAUUUAGAGC-----------------------GGUGGC-CAC----UGAUG-----GGCACCUC---------UCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCGCCCUUCAGA |
view | Elephant |
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view | Cow |
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view | Rabbit |
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view | Guinea Pig |
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view | HedgeHog |
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view | Mouse |
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view | Shrew |
================================================================================================================================-----------------------GCCACC-CAC----CGG------------CUC---------CCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCACCUUUCCGC================================================================================================================================-----------------------GCCACC-CAC----CGG------------CUC---------CCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCACCUUUCCGC================================================================================================================================-----------------------GCCACC-CAC----CGG------------CUC---------CCUG----C-----AGCCCCGCUCAAAGGCAUCCCGAAGCAGGCACCUUUCCGC |
view | Rat |
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view | Tenrec |
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view | Opossum |
================================================================================================================================----------------------------CUCCC----UCAUU-----GUUAUCCU---------CUUU----C-----AGCACCUCUGAAAGGCAUCCCAAAACAGGCUCCUUUCAGA================================================================================================================================----------------------------CUCCC----UCAUU-----GUUAUCCU---------CUUU----C-----AGCACCUCUGAAAGGCAUCCCAAAACAGGCUCCUUUCAGA================================================================================================================================----------------------------CUCCC----UCAUU-----GUUAUCCU---------CUUU----C-----AGCACCUCUGAAAGGCAUCCCAAAACAGGCUCCUUUCAGA |
view | Platypus |
UGUGACCGCCUCUCGUCCAGCCACAGUUCAGCUCAUAGUCCAUUCAGUGGGCAGGUGGG--UGGGCUC-----UGAAGGGGCCCCAUACUCGCCGUUUUGGAUGAU---------------------------------------------GCAGUAUUCC----UGAUGAUGGGGAUGUCCU---------CGCU----C-----AGCUCCCCUCAAAGGAAUACCCAAGCAGGCUCCAUUCAGAUGUGACCGCCUCUCGUCCAGCCACAGUUCAGCUCAUAGUCCAUUCAGUGGGCAGGUGGG--UGGGCUC-----UGAAGGGGCCCCAUACUCGCCGUUUUGGAUGAU---------------------------------------------GCAGUAUUCC----UGAUGAUGGGGAUGUCCU---------CGCU----C-----AGCUCCCCUCAAAGGAAUACCCAAGCAGGCUCCAUUCAGAUGUGACCGCCUCUCGUCCAGCCACAGUUCAGCUCAUAGUCCAUUCAGUGGGCAGGUGGG--UGGGCUC-----UGAAGGGGCCCCAUACUCGCCGUUUUGGAUGAU---------------------------------------------GCAGUAUUCC----UGAUGAUGGGGAUGUCCU---------CGCU----C-----AGCUCCCCUCAAAGGAAUACCCAAGCAGGCUCCAUUCAGA |
view | Chicken |
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view | Lizard |
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view | Frog |
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view | Zebrafish |
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view | Stickleback |
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view | Tetradon |
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view | Fugu |
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view | Medaka |
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