Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
CGAGCUGGC-CCAGGGUGGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------CCCUG--ACGGUGGGG--UGGCUGCGGGCCUUCUGAAG---GUCUCCCACGUUGUGGCCCAGCAGC---------GCAGUCACGUUGCCAACAUCC---AGGCUCUGC-GGA-----------------------CGAGCUGGC-CCAGGGUGGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------CCCUG--ACGGUGGGG--UGGCUGCGGGCCUUCUGAAG---GUCUCCCACGUUGUGGCCCAGCAGC---------GCAGUCACGUUGCCAACAUCC---AGGCUCUGC-GGA-----------------------CGAGCUGGC-CCAGGGUGGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------CCCUG--ACGGUGGGG--UGGCUGCGGGCCUUCUGAAG---GUCUCCCACGUUGUGGCCCAGCAGC---------GCAGUCACGUUGCCAACAUCC---AGGCUCUGC-GGA----------------------- |
| view | Chimp |
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| view | Rhesus |
CCAGCUGGC-CCAGGGCGGAGCUG-UUGAGGCUGUACAGCCAGG----------------ACCUG--ACGGUGGGG--UGGCUUCGGGCCUUCUGCAG---GUCUCCCACGUUGUGGCCCAGCAGC---------GCAGUCACGUUGCUGACAUCC---AGGCUCUGC-GGG-----------------------CCAGCUGGC-CCAGGGCGGAGCUG-UUGAGGCUGUACAGCCAGG----------------ACCUG--ACGGUGGGG--UGGCUUCGGGCCUUCUGCAG---GUCUCCCACGUUGUGGCCCAGCAGC---------GCAGUCACGUUGCUGACAUCC---AGGCUCUGC-GGG-----------------------CCAGCUGGC-CCAGGGCGGAGCUG-UUGAGGCUGUACAGCCAGG----------------ACCUG--ACGGUGGGG--UGGCUUCGGGCCUUCUGCAG---GUCUCCCACGUUGUGGCCCAGCAGC---------GCAGUCACGUUGCUGACAUCC---AGGCUCUGC-GGG----------------------- |
| view | Bushbaby |
CCAGCAUGCGGCAGGGCUGAUCUGUUUGAGGCUGUGUAGCCAGG----------------AGCUG--ACAGUGGGG--UGGCUGCGAGCCUUCCGCAG---GUACCCCACGAUCUGCCCCAGCAGC---------GUGGUCACAUAGCCGACACUC---AGGGUCUGC-AAAGGAAAUGAGGGGGCCGUGAGGAUCCAGCAUGCGGCAGGGCUGAUCUGUUUGAGGCUGUGUAGCCAGG----------------AGCUG--ACAGUGGGG--UGGCUGCGAGCCUUCCGCAG---GUACCCCACGAUCUGCCCCAGCAGC---------GUGGUCACAUAGCCGACACUC---AGGGUCUGC-AAAGGAAAUGAGGGGGCCGUGAGGAUCCAGCAUGCGGCAGGGCUGAUCUGUUUGAGGCUGUGUAGCCAGG----------------AGCUG--ACAGUGGGG--UGGCUGCGAGCCUUCCGCAG---GUACCCCACGAUCUGCCCCAGCAGC---------GUGGUCACAUAGCCGACACUC---AGGGUCUGC-AAAGGAAAUGAGGGGGCCGUGAGGAU |
| view | Tree Shrew |
CCAGCUCAC-CCAGGGCCGAGCUG-UCGAGGCUGCGUAGCCAGG----------------AGCUG--ACGGCUGGG--UGGCUGCGGGCCUUCUGCAG---GUCUCCCACGUUAGGGCCCAGCAGU---------GUGGCCACGCUGCCCACGCUC---AGGUUCUGU-GAG-----------------------CCAGCUCAC-CCAGGGCCGAGCUG-UCGAGGCUGCGUAGCCAGG----------------AGCUG--ACGGCUGGG--UGGCUGCGGGCCUUCUGCAG---GUCUCCCACGUUAGGGCCCAGCAGU---------GUGGCCACGCUGCCCACGCUC---AGGUUCUGU-GAG-----------------------CCAGCUCAC-CCAGGGCCGAGCUG-UCGAGGCUGCGUAGCCAGG----------------AGCUG--ACGGCUGGG--UGGCUGCGGGCCUUCUGCAG---GUCUCCCACGUUAGGGCCCAGCAGU---------GUGGCCACGCUGCCCACGCUC---AGGUUCUGU-GAG----------------------- |
| view | Horse |
CCAGCUCGC-CGAGGGCUGAGCUG-UUGAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGAGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACAUUCUGGCCCAGCAGC---------GUCGUCACGUUGCCCACACUC---AGGCUCUGU-GCG-----------------------CCAGCUCGC-CGAGGGCUGAGCUG-UUGAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGAGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACAUUCUGGCCCAGCAGC---------GUCGUCACGUUGCCCACACUC---AGGCUCUGU-GCG-----------------------CCAGCUCGC-CGAGGGCUGAGCUG-UUGAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGAGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACAUUCUGGCCCAGCAGC---------GUCGUCACGUUGCCCACACUC---AGGCUCUGU-GCG----------------------- |
| view | Armadillo |
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| view | Cat |
CCAGCUCGC-CAAGGGCCGACCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAAG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUCCGUGCCUUCUGUAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUCGUCACAUUGCCGACACUC---AGGCUCUGC-GAG-----------------------CCAGCUCGC-CAAGGGCCGACCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAAG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUCCGUGCCUUCUGUAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUCGUCACAUUGCCGACACUC---AGGCUCUGC-GAG-----------------------CCAGCUCGC-CAAGGGCCGACCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAAG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUCCGUGCCUUCUGUAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUCGUCACAUUGCCGACACUC---AGGCUCUGC-GAG----------------------- |
| view | Dog |
CCAGCUCUC-CUAGGGCCGACGUG-UUCAAGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUGCGCGCCUUCCGCAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUUGUCACAUUGCCCACACUC---AGGUUCUGU-GAG-----------------------CCAGCUCUC-CUAGGGCCGACGUG-UUCAAGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUGCGCGCCUUCCGCAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUUGUCACAUUGCCCACACUC---AGGUUCUGU-GAG-----------------------CCAGCUCUC-CUAGGGCCGACGUG-UUCAAGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUGCGCGCCUUCCGCAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUUGUCACAUUGCCCACACUC---AGGUUCUGU-GAG----------------------- |
| view | Elephant |
CCAGCUCAC-CCAGGGCUGAGUGG-UUCAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGCACCUUCUGUAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUCGUCACGUUGUCCACACUG---AGGCUCUGCAGGG-----------------------CCAGCUCAC-CCAGGGCUGAGUGG-UUCAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGCACCUUCUGUAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUCGUCACGUUGUCCACACUG---AGGCUCUGCAGGG-----------------------CCAGCUCAC-CCAGGGCUGAGUGG-UUCAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGCACCUUCUGUAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUCGUCACGUUGUCCACACUG---AGGCUCUGCAGGG----------------------- |
| view | Cow |
CCAGCUCGC-UCAGGGCUGACCGA-UUGAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGAUGGGG--UGGCUCCGAGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACGUUCGGACCCAGCAGC---------GUCGUCACGUUGCCCACGGUC---AGGCUCUGC-GGG-----------------------CCAGCUCGC-UCAGGGCUGACCGA-UUGAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGAUGGGG--UGGCUCCGAGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACGUUCGGACCCAGCAGC---------GUCGUCACGUUGCCCACGGUC---AGGCUCUGC-GGG-----------------------CCAGCUCGC-UCAGGGCUGACCGA-UUGAGGCUGCGGAGCCAGG----------------AGCUG--AUGAUGGGG--UGGCUCCGAGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACGUUCGGACCCAGCAGC---------GUCGUCACGUUGCCCACGGUC---AGGCUCUGC-GGG----------------------- |
| view | Rabbit |
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| view | Guinea Pig |
CCAGCUCAC-CCAGGGCCGACCUG-UUGAGGCUGCGUAGCCAGA----------------AGCUG--ACAGUCGGA--UGGCUGCGGGCCUUCUGCAG---AUCCCCCACAUUCUGGCCCAGUAGC---------GUGGUCACACUGCCAACGCUC---AGACACUGU-GAG--------GGAAGCCGGGGGGCUCCAGCUCAC-CCAGGGCCGACCUG-UUGAGGCUGCGUAGCCAGA----------------AGCUG--ACAGUCGGA--UGGCUGCGGGCCUUCUGCAG---AUCCCCCACAUUCUGGCCCAGUAGC---------GUGGUCACACUGCCAACGCUC---AGACACUGU-GAG--------GGAAGCCGGGGGGCUCCAGCUCAC-CCAGGGCCGACCUG-UUGAGGCUGCGUAGCCAGA----------------AGCUG--ACAGUCGGA--UGGCUGCGGGCCUUCUGCAG---AUCCCCCACAUUCUGGCCCAGUAGC---------GUGGUCACACUGCCAACGCUC---AGACACUGU-GAG--------GGAAGCCGGGGGGCU |
| view | HedgeHog |
===GCUCAC-CCAGGGAUGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGACUUCGUGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACAUUCUGGCCCAGCAGC---------GUGGUCACGUUGUCCAGGCUC---AGGCUCUAG-GAG-----------------------===GCUCAC-CCAGGGAUGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGACUUCGUGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACAUUCUGGCCCAGCAGC---------GUGGUCACGUUGUCCAGGCUC---AGGCUCUAG-GAG-----------------------===GCUCAC-CCAGGGAUGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGACUUCGUGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACAUUCUGGCCCAGCAGC---------GUGGUCACGUUGUCCAGGCUC---AGGCUCUAG-GAG----------------------- |
| view | Mouse |
CCAUAUCAG-ACAGGUCUGUCAUG-UUGUGGCUGUGCAUCCACA----------------GGAUG--ACAUUUGGG--UGGUUGCGGGCCUUCCGCAG---AUCUCCCAGGUUCUGGCCCAGCAGA---------UUCCUCACACUGUCCACUCCC---AUGCUCUGC-AAA--------UGAAGCCAGAGGUUUCCAUAUCAG-ACAGGUCUGUCAUG-UUGUGGCUGUGCAUCCACA----------------GGAUG--ACAUUUGGG--UGGUUGCGGGCCUUCCGCAG---AUCUCCCAGGUUCUGGCCCAGCAGA---------UUCCUCACACUGUCCACUCCC---AUGCUCUGC-AAA--------UGAAGCCAGAGGUUUCCAUAUCAG-ACAGGUCUGUCAUG-UUGUGGCUGUGCAUCCACA----------------GGAUG--ACAUUUGGG--UGGUUGCGGGCCUUCCGCAG---AUCUCCCAGGUUCUGGCCCAGCAGA---------UUCCUCACACUGUCCACUCCC---AUGCUCUGC-AAA--------UGAAGCCAGAGGUUU |
| view | Shrew |
CCAGCUCCC-CCAGGGCUGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUGCGCGCCUUCCGCAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUGGUCACAUUGUCCAGGCUC---AGGCUCUGC-GGG-----------------------CCAGCUCCC-CCAGGGCUGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUGCGCGCCUUCCGCAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUGGUCACAUUGUCCAGGCUC---AGGCUCUGC-GGG-----------------------CCAGCUCCC-CCAGGGCUGAGCUG-UUGAGGCUGCGCAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUCGGG--UGGCUGCGCGCCUUCCGCAG---GUCCCCCACGUUCUGGCCCAGCAGU---------GUGGUCACAUUGUCCAGGCUC---AGGCUCUGC-GGG----------------------- |
| view | Rat |
CCAUCUCAG-ACAGAUCCGACAUG-UUGUGACUGUGCAUCCACA----------------GGAUG--ACGUUUGGA--UGGUUUCGGGCCUUCUGCAG---AUCCCCCACGUUCUGGCCUAGCAGA---------CUUCUUACACUGUCCACACCC---AUGCUCUGC-AAA--------UGAAGCCAGAGGUUUCCAUCUCAG-ACAGAUCCGACAUG-UUGUGACUGUGCAUCCACA----------------GGAUG--ACGUUUGGA--UGGUUUCGGGCCUUCUGCAG---AUCCCCCACGUUCUGGCCUAGCAGA---------CUUCUUACACUGUCCACACCC---AUGCUCUGC-AAA--------UGAAGCCAGAGGUUUCCAUCUCAG-ACAGAUCCGACAUG-UUGUGACUGUGCAUCCACA----------------GGAUG--ACGUUUGGA--UGGUUUCGGGCCUUCUGCAG---AUCCCCCACGUUCUGGCCUAGCAGA---------CUUCUUACACUGUCCACACCC---AUGCUCUGC-AAA--------UGAAGCCAGAGGUUU |
| view | Tenrec |
CCAGCUCGC-CCAGGGCCGAGCUG-CUCAGACUGCGAAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGUGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACGUUCUGACCCAGCAGC---------GUGGUCACAUUGCCCACACUG---AGGCUCUGU-GGG-----------------------CCAGCUCGC-CCAGGGCCGAGCUG-CUCAGACUGCGAAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGUGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACGUUCUGACCCAGCAGC---------GUGGUCACAUUGCCCACACUG---AGGCUCUGU-GGG-----------------------CCAGCUCGC-CCAGGGCCGAGCUG-CUCAGACUGCGAAGCCAGG----------------AGCUG--AUGGUGGGG--UGGCUGCGUGCCUUCUGCAG---GUCCCCCACGUUCUGACCCAGCAGC---------GUGGUCACAUUGCCCACACUG---AGGCUCUGU-GGG----------------------- |
| view | Opossum |
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| view | Platypus |
C---CUGGC-CCUGGGC--------UUCCGGGUGUGGAGCCGGGCACGGGACUGGGACUCAGCAG--ACAGUGACGCCCGCCUGCCGCCCACCUGCAGGAAGCUUUCUUCGGGAAGGCCCUGCUG---------------------GACCUGAGUCGGAAGGCUUUAC-AGG-----------------CCGCUGC---CUGGC-CCUGGGC--------UUCCGGGUGUGGAGCCGGGCACGGGACUGGGACUCAGCAG--ACAGUGACGCCCGCCUGCCGCCCACCUGCAGGAAGCUUUCUUCGGGAAGGCCCUGCUG---------------------GACCUGAGUCGGAAGGCUUUAC-AGG-----------------CCGCUGC---CUGGC-CCUGGGC--------UUCCGGGUGUGGAGCCGGGCACGGGACUGGGACUCAGCAG--ACAGUGACGCCCGCCUGCCGCCCACCUGCAGGAAGCUUUCUUCGGGAAGGCCCUGCUG---------------------GACCUGAGUCGGAAGGCUUUAC-AGG-----------------CCGCUG |
| view | Chicken |
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| view | Lizard |
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| view | Frog |
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| view | Zebrafish |
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| view | Stickleback |
CAAGCUCGC-CGAAGGCCCGCACC------ACGGCGGCGCCCUG----------------CACCGUCUCGUUGAGG--UGGCUGUAGACCGGCGAGCG---GCUCACGGCCUCCAGACGCCGCAGCUGACAUGAGGACGCCACGUAG------------AAGCUCUGA-GCA-----------------------CAAGCUCGC-CGAAGGCCCGCACC------ACGGCGGCGCCCUG----------------CACCGUCUCGUUGAGG--UGGCUGUAGACCGGCGAGCG---GCUCACGGCCUCCAGACGCCGCAGCUGACAUGAGGACGCCACGUAG------------AAGCUCUGA-GCA-----------------------CAAGCUCGC-CGAAGGCCCGCACC------ACGGCGGCGCCCUG----------------CACCGUCUCGUUGAGG--UGGCUGUAGACCGGCGAGCG---GCUCACGGCCUCCAGACGCCGCAGCUGACAUGAGGACGCCACGUAG------------AAGCUCUGA-GCA----------------------- |
| view | Tetradon |
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| view | Fugu |
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| view | Medaka |
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