mir-661
chr8:145091327-145091455
View MI0003669 at mirBase
 

  ▼▲   Show/Hide Alignment

Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

Species Sequence
view Human CCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCUGC-GCGUGACUUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCUGC-GCGUGACUUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCUGC-GCGUGACUUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGG
view Chimp CCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGACGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCCAC-GCGUGACCUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGACGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCCAC-GCGUGACCUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGACGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCCAC-GCGUGACCUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGG
view Rhesus CCCA---GAUUC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCU----GGCCUGGGU---GGCCUGAGCCCUGAUUUUGGGCUGCCUGGGUAUCU---G-----------GCCCGU-GCGUGACCUUGGGG------CGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUUC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCU----GGCCUGGGU---GGCCUGAGCCCUGAUUUUGGGCUGCCUGGGUAUCU---G-----------GCCCGU-GCGUGACCUUGGGG------CGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUUC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCU----GGCCUGGGU---GGCCUGAGCCCUGAUUUUGGGCUGCCUGGGUAUCU---G-----------GCCCGU-GCGUGACCUUGGGG------CGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGG
view Bushbaby CCCA-------C-CCACGACACCAG---------------GAGG----GGUUUGGGGUGGGAGGUGCAGCCCUGUGCU-GU---GGGGCAGGCUCU----UGUUGUGGU---GGCUGGGGCCCUGAUUCUGCGCUCCCUGGGUCUCU---G-----------GCCAGCAGCGUGACCUUGGAG------AUGCCAUCC-UG----UCCA--CCC-UGGGGCCCA-------C-CCACGACACCAG---------------GAGG----GGUUUGGGGUGGGAGGUGCAGCCCUGUGCU-GU---GGGGCAGGCUCU----UGUUGUGGU---GGCUGGGGCCCUGAUUCUGCGCUCCCUGGGUCUCU---G-----------GCCAGCAGCGUGACCUUGGAG------AUGCCAUCC-UG----UCCA--CCC-UGGGGCCCA-------C-CCACGACACCAG---------------GAGG----GGUUUGGGGUGGGAGGUGCAGCCCUGUGCU-GU---GGGGCAGGCUCU----UGUUGUGGU---GGCUGGGGCCCUGAUUCUGCGCUCCCUGGGUCUCU---G-----------GCCAGCAGCGUGACCUUGGAG------AUGCCAUCC-UG----UCCA--CCC-UGGGG
view Tree Shrew UCCA---GACCCUCUGGGACAGUAGAGAGGCCUGAGGAAGGAGG----GG---------------------CAGUUCU-GUCUGGGGGCACUCGCACAGUGGCCUG------------GGCCCCG-UUGUGAGUAGCCCGG-UCCCU---G-----------GCAGGCAGGGUGACCUUGGGA-------GGCUGUCC-UG----UCCA--UC--CUGGGUCCA---GACCCUCUGGGACAGUAGAGAGGCCUGAGGAAGGAGG----GG---------------------CAGUUCU-GUCUGGGGGCACUCGCACAGUGGCCUG------------GGCCCCG-UUGUGAGUAGCCCGG-UCCCU---G-----------GCAGGCAGGGUGACCUUGGGA-------GGCUGUCC-UG----UCCA--UC--CUGGGUCCA---GACCCUCUGGGACAGUAGAGAGGCCUGAGGAAGGAGG----GG---------------------CAGUUCU-GUCUGGGGGCACUCGCACAGUGGCCUG------------GGCCCCG-UUGUGAGUAGCCCGG-UCCCU---G-----------GCAGGCAGGGUGACCUUGGGA-------GGCUGUCC-UG----UCCA--UC--CUGGG
view Horse -------GGCAC-CAGGAGUGGCCU---------------GGGG----GCC----------------------------GG---GGGGUGGGCA--------UUCACGU---GGCCCAG--CCUGAUUUGGGACUGUCUUGGUUUCU---G-----------GCAGGUGGUGUGACCUUGAGC------GAGCUGUCC-CA----UC----CCU-CGGGG-------GGCAC-CAGGAGUGGCCU---------------GGGG----GCC----------------------------GG---GGGGUGGGCA--------UUCACGU---GGCCCAG--CCUGAUUUGGGACUGUCUUGGUUUCU---G-----------GCAGGUGGUGUGACCUUGAGC------GAGCUGUCC-CA----UC----CCU-CGGGG-------GGCAC-CAGGAGUGGCCU---------------GGGG----GCC----------------------------GG---GGGGUGGGCA--------UUCACGU---GGCCCAG--CCUGAUUUGGGACUGUCUUGGUUUCU---G-----------GCAGGUGGUGUGACCUUGAGC------GAGCUGUCC-CA----UC----CCU-CGGGG
view Armadillo ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Cat ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Dog -------GGC-C-UGGGAACAGCCU---------------GGGGCAGGGCCCU------------ACAGCCCUGUGCUGGG---GGGGCUGGCAAG----UGUUCACGU---GGCUCAG--CCCGGUUUGGGGCAACCUGGAUGCCU---G-----------GCUAGUGCUGUGACCUUGGG-------GAGCUAUUC-UG----UCU---CCC-CUGGG-------GGC-C-UGGGAACAGCCU---------------GGGGCAGGGCCCU------------ACAGCCCUGUGCUGGG---GGGGCUGGCAAG----UGUUCACGU---GGCUCAG--CCCGGUUUGGGGCAACCUGGAUGCCU---G-----------GCUAGUGCUGUGACCUUGGG-------GAGCUAUUC-UG----UCU---CCC-CUGGG-------GGC-C-UGGGAACAGCCU---------------GGGGCAGGGCCCU------------ACAGCCCUGUGCUGGG---GGGGCUGGCAAG----UGUUCACGU---GGCUCAG--CCCGGUUUGGGGCAACCUGGAUGCCU---G-----------GCUAGUGCUGUGACCUUGGG-------GAGCUAUUC-UG----UCU---CCC-CUGGG
view Elephant ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Cow -------GGCAC-CUGG-GCAUCCU---------------GGGU----UGC----------------------------GG---GGGA------------------------GGCCCGG--CCCGAU------------------CU---G-----------GCCUGAGACCUGACCUUGGG-------AGGCCGUCC-CG----CCCGUCCGU-CUGGG-------GGCAC-CUGG-GCAUCCU---------------GGGU----UGC----------------------------GG---GGGA------------------------GGCCCGG--CCCGAU------------------CU---G-----------GCCUGAGACCUGACCUUGGG-------AGGCCGUCC-CG----CCCGUCCGU-CUGGG-------GGCAC-CUGG-GCAUCCU---------------GGGU----UGC----------------------------GG---GGGA------------------------GGCCCGG--CCCGAU------------------CU---G-----------GCCUGAGACCUGACCUUGGG-------AGGCCGUCC-CG----CCCGUCCGU-CUGGG
view Rabbit ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Guinea Pig ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view HedgeHog ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Mouse UCUG--UAAUUC-UUGGGGUACCAG---------------GAGA----GGCCUGGGGUGGGAGGAGCAGUCCGAUGGG-UA---GAGGUAGGUGAA----UGCUCAUGC---CACUUAGGCCCUGGGUUUGGGUUGCCCAGGUCUCU---G-----------ACUGGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGUCUG--UAAUUC-UUGGGGUACCAG---------------GAGA----GGCCUGGGGUGGGAGGAGCAGUCCGAUGGG-UA---GAGGUAGGUGAA----UGCUCAUGC---CACUUAGGCCCUGGGUUUGGGUUGCCCAGGUCUCU---G-----------ACUGGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGUCUG--UAAUUC-UUGGGGUACCAG---------------GAGA----GGCCUGGGGUGGGAGGAGCAGUCCGAUGGG-UA---GAGGUAGGUGAA----UGCUCAUGC---CACUUAGGCCCUGGGUUUGGGUUGCCCAGGUCUCU---G-----------ACUGGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGG
view Shrew ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Rat CCUG--UAACUC-CUGGGGUAUCAG---------------GAGA----GUC----GGUGGGCGGUGCAUCCUGAUGGG-UA---CAGGUGGGCGAG----UGCUCUUGU---GGCUUAGGCUCCAGUUUUGGGUUGCCUGGGUCUCU---G-----------ACUUGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGCCUG--UAACUC-CUGGGGUAUCAG---------------GAGA----GUC----GGUGGGCGGUGCAUCCUGAUGGG-UA---CAGGUGGGCGAG----UGCUCUUGU---GGCUUAGGCUCCAGUUUUGGGUUGCCUGGGUCUCU---G-----------ACUUGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGCCUG--UAACUC-CUGGGGUAUCAG---------------GAGA----GUC----GGUGGGCGGUGCAUCCUGAUGGG-UA---CAGGUGGGCGAG----UGCUCUUGU---GGCUUAGGCUCCAGUUUUGGGUUGCCUGGGUCUCU---G-----------ACUUGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGG
view Tenrec ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Opossum ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Platypus CCUGGCUGGUCC-UCUGAGCAUCAA---------------CGGC----GC-----------------------------UG---UGGGCUGUCUGG----CGCCUGGGA---GGAGCUGGACUGCACUGCAGUGUGUGUGUGUGUGU---GUGUGUGUGUGUGUGUGU-GUGUGUGUUUGUGCGAGUACACGCAGGCU-UGGGGGUCUG--CCU-GGGAGCCUGGCUGGUCC-UCUGAGCAUCAA---------------CGGC----GC-----------------------------UG---UGGGCUGUCUGG----CGCCUGGGA---GGAGCUGGACUGCACUGCAGUGUGUGUGUGUGUGU---GUGUGUGUGUGUGUGUGU-GUGUGUGUUUGUGCGAGUACACGCAGGCU-UGGGGGUCUG--CCU-GGGAGCCUGGCUGGUCC-UCUGAGCAUCAA---------------CGGC----GC-----------------------------UG---UGGGCUGUCUGG----CGCCUGGGA---GGAGCUGGACUGCACUGCAGUGUGUGUGUGUGUGU---GUGUGUGUGUGUGUGUGU-GUGUGUGUUUGUGCGAGUACACGCAGGCU-UGGGGGUCUG--CCU-GGGAG
view Chicken ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Lizard CUUG------CC-CGGAUGCUCCAG---------------AGGA----GG-----------------------------AG---GGGGAGGCUGCG----------------------CAACACGGUGGUGUCUCAAGGGGGGAACG---G-----------GCAGCGAGGGCACACACAGGG----------------CG----CCCG--CCU-GGAAGCUUG------CC-CGGAUGCUCCAG---------------AGGA----GG-----------------------------AG---GGGGAGGCUGCG----------------------CAACACGGUGGUGUCUCAAGGGGGGAACG---G-----------GCAGCGAGGGCACACACAGGG----------------CG----CCCG--CCU-GGAAGCUUG------CC-CGGAUGCUCCAG---------------AGGA----GG-----------------------------AG---GGGGAGGCUGCG----------------------CAACACGGUGGUGUCUCAAGGGGGGAACG---G-----------GCAGCGAGGGCACACACAGGG----------------CG----CCCG--CCU-GGAAG
view Frog ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Zebrafish ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Stickleback ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Tetradon CCAG---GACACGCUGGAGUACAAG---------------AAGA----AG-----------------------------CA---GAGGCCCCUGAA----GAUCCGCAUGCUGGACGGCACCGUGAAGACGGUCAUGGUGGACGACUCCAA-----------GAUCGU-CAGCGACAUGCUGA------UGACCAUCUGCG----CCCG--CAU---AGGCCAG---GACACGCUGGAGUACAAG---------------AAGA----AG-----------------------------CA---GAGGCCCCUGAA----GAUCCGCAUGCUGGACGGCACCGUGAAGACGGUCAUGGUGGACGACUCCAA-----------GAUCGU-CAGCGACAUGCUGA------UGACCAUCUGCG----CCCG--CAU---AGGCCAG---GACACGCUGGAGUACAAG---------------AAGA----AG-----------------------------CA---GAGGCCCCUGAA----GAUCCGCAUGCUGGACGGCACCGUGAAGACGGUCAUGGUGGACGACUCCAA-----------GAUCGU-CAGCGACAUGCUGA------UGACCAUCUGCG----CCCG--CAU---AGG
view Fugu ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Medaka ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================

There are no comments yet

Leave a Comment


?
?

Powered by TalkBack