Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
Species | Sequence | |
---|---|---|
view | Human |
CCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCUGC-GCGUGACUUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCUGC-GCGUGACUUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCUGC-GCGUGACUUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGG |
view | Chimp |
CCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGACGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCCAC-GCGUGACCUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGACGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCCAC-GCGUGACCUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUCC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGACGCA----GGCCUG------------AGCCCUGGUUUCGGGCUGCCUGGGUCUCU---G-----------GCCCAC-GCGUGACCUUGGGG------UGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGG |
view | Rhesus |
CCCA---GAUUC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCU----GGCCUGGGU---GGCCUGAGCCCUGAUUUUGGGCUGCCUGGGUAUCU---G-----------GCCCGU-GCGUGACCUUGGGG------CGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUUC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCU----GGCCUGGGU---GGCCUGAGCCCUGAUUUUGGGCUGCCUGGGUAUCU---G-----------GCCCGU-GCGUGACCUUGGGG------CGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGGCCCA---GAUUC-CUGGGACCCCAG---------------GAGA----GG---------------------CUGUGCU-GU---GGGGCAGGCGCU----GGCCUGGGU---GGCCUGAGCCCUGAUUUUGGGCUGCCUGGGUAUCU---G-----------GCCCGU-GCGUGACCUUGGGG------CGGCUGUCC-CG----GCCA--CCGGUGGGG |
view | Bushbaby |
CCCA-------C-CCACGACACCAG---------------GAGG----GGUUUGGGGUGGGAGGUGCAGCCCUGUGCU-GU---GGGGCAGGCUCU----UGUUGUGGU---GGCUGGGGCCCUGAUUCUGCGCUCCCUGGGUCUCU---G-----------GCCAGCAGCGUGACCUUGGAG------AUGCCAUCC-UG----UCCA--CCC-UGGGGCCCA-------C-CCACGACACCAG---------------GAGG----GGUUUGGGGUGGGAGGUGCAGCCCUGUGCU-GU---GGGGCAGGCUCU----UGUUGUGGU---GGCUGGGGCCCUGAUUCUGCGCUCCCUGGGUCUCU---G-----------GCCAGCAGCGUGACCUUGGAG------AUGCCAUCC-UG----UCCA--CCC-UGGGGCCCA-------C-CCACGACACCAG---------------GAGG----GGUUUGGGGUGGGAGGUGCAGCCCUGUGCU-GU---GGGGCAGGCUCU----UGUUGUGGU---GGCUGGGGCCCUGAUUCUGCGCUCCCUGGGUCUCU---G-----------GCCAGCAGCGUGACCUUGGAG------AUGCCAUCC-UG----UCCA--CCC-UGGGG |
view | Tree Shrew |
UCCA---GACCCUCUGGGACAGUAGAGAGGCCUGAGGAAGGAGG----GG---------------------CAGUUCU-GUCUGGGGGCACUCGCACAGUGGCCUG------------GGCCCCG-UUGUGAGUAGCCCGG-UCCCU---G-----------GCAGGCAGGGUGACCUUGGGA-------GGCUGUCC-UG----UCCA--UC--CUGGGUCCA---GACCCUCUGGGACAGUAGAGAGGCCUGAGGAAGGAGG----GG---------------------CAGUUCU-GUCUGGGGGCACUCGCACAGUGGCCUG------------GGCCCCG-UUGUGAGUAGCCCGG-UCCCU---G-----------GCAGGCAGGGUGACCUUGGGA-------GGCUGUCC-UG----UCCA--UC--CUGGGUCCA---GACCCUCUGGGACAGUAGAGAGGCCUGAGGAAGGAGG----GG---------------------CAGUUCU-GUCUGGGGGCACUCGCACAGUGGCCUG------------GGCCCCG-UUGUGAGUAGCCCGG-UCCCU---G-----------GCAGGCAGGGUGACCUUGGGA-------GGCUGUCC-UG----UCCA--UC--CUGGG |
view | Horse |
-------GGCAC-CAGGAGUGGCCU---------------GGGG----GCC----------------------------GG---GGGGUGGGCA--------UUCACGU---GGCCCAG--CCUGAUUUGGGACUGUCUUGGUUUCU---G-----------GCAGGUGGUGUGACCUUGAGC------GAGCUGUCC-CA----UC----CCU-CGGGG-------GGCAC-CAGGAGUGGCCU---------------GGGG----GCC----------------------------GG---GGGGUGGGCA--------UUCACGU---GGCCCAG--CCUGAUUUGGGACUGUCUUGGUUUCU---G-----------GCAGGUGGUGUGACCUUGAGC------GAGCUGUCC-CA----UC----CCU-CGGGG-------GGCAC-CAGGAGUGGCCU---------------GGGG----GCC----------------------------GG---GGGGUGGGCA--------UUCACGU---GGCCCAG--CCUGAUUUGGGACUGUCUUGGUUUCU---G-----------GCAGGUGGUGUGACCUUGAGC------GAGCUGUCC-CA----UC----CCU-CGGGG |
view | Armadillo |
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view | Cat |
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view | Dog |
-------GGC-C-UGGGAACAGCCU---------------GGGGCAGGGCCCU------------ACAGCCCUGUGCUGGG---GGGGCUGGCAAG----UGUUCACGU---GGCUCAG--CCCGGUUUGGGGCAACCUGGAUGCCU---G-----------GCUAGUGCUGUGACCUUGGG-------GAGCUAUUC-UG----UCU---CCC-CUGGG-------GGC-C-UGGGAACAGCCU---------------GGGGCAGGGCCCU------------ACAGCCCUGUGCUGGG---GGGGCUGGCAAG----UGUUCACGU---GGCUCAG--CCCGGUUUGGGGCAACCUGGAUGCCU---G-----------GCUAGUGCUGUGACCUUGGG-------GAGCUAUUC-UG----UCU---CCC-CUGGG-------GGC-C-UGGGAACAGCCU---------------GGGGCAGGGCCCU------------ACAGCCCUGUGCUGGG---GGGGCUGGCAAG----UGUUCACGU---GGCUCAG--CCCGGUUUGGGGCAACCUGGAUGCCU---G-----------GCUAGUGCUGUGACCUUGGG-------GAGCUAUUC-UG----UCU---CCC-CUGGG |
view | Elephant |
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view | Cow |
-------GGCAC-CUGG-GCAUCCU---------------GGGU----UGC----------------------------GG---GGGA------------------------GGCCCGG--CCCGAU------------------CU---G-----------GCCUGAGACCUGACCUUGGG-------AGGCCGUCC-CG----CCCGUCCGU-CUGGG-------GGCAC-CUGG-GCAUCCU---------------GGGU----UGC----------------------------GG---GGGA------------------------GGCCCGG--CCCGAU------------------CU---G-----------GCCUGAGACCUGACCUUGGG-------AGGCCGUCC-CG----CCCGUCCGU-CUGGG-------GGCAC-CUGG-GCAUCCU---------------GGGU----UGC----------------------------GG---GGGA------------------------GGCCCGG--CCCGAU------------------CU---G-----------GCCUGAGACCUGACCUUGGG-------AGGCCGUCC-CG----CCCGUCCGU-CUGGG |
view | Rabbit |
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view | Guinea Pig |
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view | HedgeHog |
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view | Mouse |
UCUG--UAAUUC-UUGGGGUACCAG---------------GAGA----GGCCUGGGGUGGGAGGAGCAGUCCGAUGGG-UA---GAGGUAGGUGAA----UGCUCAUGC---CACUUAGGCCCUGGGUUUGGGUUGCCCAGGUCUCU---G-----------ACUGGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGUCUG--UAAUUC-UUGGGGUACCAG---------------GAGA----GGCCUGGGGUGGGAGGAGCAGUCCGAUGGG-UA---GAGGUAGGUGAA----UGCUCAUGC---CACUUAGGCCCUGGGUUUGGGUUGCCCAGGUCUCU---G-----------ACUGGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGUCUG--UAAUUC-UUGGGGUACCAG---------------GAGA----GGCCUGGGGUGGGAGGAGCAGUCCGAUGGG-UA---GAGGUAGGUGAA----UGCUCAUGC---CACUUAGGCCCUGGGUUUGGGUUGCCCAGGUCUCU---G-----------ACUGGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGG |
view | Shrew |
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view | Rat |
CCUG--UAACUC-CUGGGGUAUCAG---------------GAGA----GUC----GGUGGGCGGUGCAUCCUGAUGGG-UA---CAGGUGGGCGAG----UGCUCUUGU---GGCUUAGGCUCCAGUUUUGGGUUGCCUGGGUCUCU---G-----------ACUUGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGCCUG--UAACUC-CUGGGGUAUCAG---------------GAGA----GUC----GGUGGGCGGUGCAUCCUGAUGGG-UA---CAGGUGGGCGAG----UGCUCUUGU---GGCUUAGGCUCCAGUUUUGGGUUGCCUGGGUCUCU---G-----------ACUUGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGGCCUG--UAACUC-CUGGGGUAUCAG---------------GAGA----GUC----GGUGGGCGGUGCAUCCUGAUGGG-UA---CAGGUGGGCGAG----UGCUCUUGU---GGCUUAGGCUCCAGUUUUGGGUUGCCUGGGUCUCU---G-----------ACUUGUAGUCUGACCUUGGAG------ACACAGUCC-UG----UCUG--CCC-UGGGG |
view | Tenrec |
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view | Opossum |
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view | Platypus |
CCUGGCUGGUCC-UCUGAGCAUCAA---------------CGGC----GC-----------------------------UG---UGGGCUGUCUGG----CGCCUGGGA---GGAGCUGGACUGCACUGCAGUGUGUGUGUGUGUGU---GUGUGUGUGUGUGUGUGU-GUGUGUGUUUGUGCGAGUACACGCAGGCU-UGGGGGUCUG--CCU-GGGAGCCUGGCUGGUCC-UCUGAGCAUCAA---------------CGGC----GC-----------------------------UG---UGGGCUGUCUGG----CGCCUGGGA---GGAGCUGGACUGCACUGCAGUGUGUGUGUGUGUGU---GUGUGUGUGUGUGUGUGU-GUGUGUGUUUGUGCGAGUACACGCAGGCU-UGGGGGUCUG--CCU-GGGAGCCUGGCUGGUCC-UCUGAGCAUCAA---------------CGGC----GC-----------------------------UG---UGGGCUGUCUGG----CGCCUGGGA---GGAGCUGGACUGCACUGCAGUGUGUGUGUGUGUGU---GUGUGUGUGUGUGUGUGU-GUGUGUGUUUGUGCGAGUACACGCAGGCU-UGGGGGUCUG--CCU-GGGAG |
view | Chicken |
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view | Lizard |
CUUG------CC-CGGAUGCUCCAG---------------AGGA----GG-----------------------------AG---GGGGAGGCUGCG----------------------CAACACGGUGGUGUCUCAAGGGGGGAACG---G-----------GCAGCGAGGGCACACACAGGG----------------CG----CCCG--CCU-GGAAGCUUG------CC-CGGAUGCUCCAG---------------AGGA----GG-----------------------------AG---GGGGAGGCUGCG----------------------CAACACGGUGGUGUCUCAAGGGGGGAACG---G-----------GCAGCGAGGGCACACACAGGG----------------CG----CCCG--CCU-GGAAGCUUG------CC-CGGAUGCUCCAG---------------AGGA----GG-----------------------------AG---GGGGAGGCUGCG----------------------CAACACGGUGGUGUCUCAAGGGGGGAACG---G-----------GCAGCGAGGGCACACACAGGG----------------CG----CCCG--CCU-GGAAG |
view | Frog |
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view | Zebrafish |
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view | Stickleback |
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view | Tetradon |
CCAG---GACACGCUGGAGUACAAG---------------AAGA----AG-----------------------------CA---GAGGCCCCUGAA----GAUCCGCAUGCUGGACGGCACCGUGAAGACGGUCAUGGUGGACGACUCCAA-----------GAUCGU-CAGCGACAUGCUGA------UGACCAUCUGCG----CCCG--CAU---AGGCCAG---GACACGCUGGAGUACAAG---------------AAGA----AG-----------------------------CA---GAGGCCCCUGAA----GAUCCGCAUGCUGGACGGCACCGUGAAGACGGUCAUGGUGGACGACUCCAA-----------GAUCGU-CAGCGACAUGCUGA------UGACCAUCUGCG----CCCG--CAU---AGGCCAG---GACACGCUGGAGUACAAG---------------AAGA----AG-----------------------------CA---GAGGCCCCUGAA----GAUCCGCAUGCUGGACGGCACCGUGAAGACGGUCAUGGUGGACGACUCCAA-----------GAUCGU-CAGCGACAUGCUGA------UGACCAUCUGCG----CCCG--CAU---AGG |
view | Fugu |
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view | Medaka |
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