Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
Species | Sequence | |
---|---|---|
view | Human |
CUGGGGAGCCGAGAGUGAU-----A-----GUGUAGUAGAGCUAGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACCGG-UCCGGG----------------------UGGGUUCC--GGCAGGUUC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCCUCUGCA-CUGUAACAU-----------UUGAGGCCCUGGGGAGCCGAGAGUGAU-----A-----GUGUAGUAGAGCUAGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACCGG-UCCGGG----------------------UGGGUUCC--GGCAGGUUC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCCUCUGCA-CUGUAACAU-----------UUGAGGCCCUGGGGAGCCGAGAGUGAU-----A-----GUGUAGUAGAGCUAGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACCGG-UCCGGG----------------------UGGGUUCC--GGCAGGUUC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCCUCUGCA-CUGUAACAU-----------UUGAGGCC |
view | Chimp |
CUGGGGAGCCGAGAGUGAU-----A-----GUGUAGUAGAGCUAGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACCGG-UCCGGG----------------------AGGGUUCC--GGCAGGUUC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCCUCUGCA-CUGUAACAU-----------UUGAGGCCCUGGGGAGCCGAGAGUGAU-----A-----GUGUAGUAGAGCUAGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACCGG-UCCGGG----------------------AGGGUUCC--GGCAGGUUC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCCUCUGCA-CUGUAACAU-----------UUGAGGCCCUGGGGAGCCGAGAGUGAU-----A-----GUGUAGUAGAGCUAGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACCGG-UCCGGG----------------------AGGGUUCC--GGCAGGUUC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCCUCUGCA-CUGUAACAU-----------UUGAGGCC |
view | Rhesus |
CUGGGAAGCCGAGGGUGAU-----G-----GUAUAGCAGGGCUGGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACGGC-UCCAGG----------------------UGGGUUCU--GGCAGGUCC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCAUCUGCA-UUGUAACAU-----------UGGAGGCCCUGGGAAGCCGAGGGUGAU-----G-----GUAUAGCAGGGCUGGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACGGC-UCCAGG----------------------UGGGUUCU--GGCAGGUCC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCAUCUGCA-UUGUAACAU-----------UGGAGGCCCUGGGAAGCCGAGGGUGAU-----G-----GUAUAGCAGGGCUGGGAGG---------------------------------------------------------------------A-GAGG----------GUC-------------CUGGAGAA-------------------------GCGUG-------------GACGGC-UCCAGG----------------------UGGGUUCU--GGCAGGUCC----------UCAC--------------CCUCUCUAG---------GCCCCAUU---CUCAUCUGCA-UUGUAACAU-----------UGGAGGCC |
view | Bushbaby |
-UGAAAAGC--AGGGAAGC-----A-----GACUGGCACCAGUGAAGGG---------------------------------------------------------------------C-AAGA----------GGU-------------GUGGGGGG-------------------------UCCAG-------------GGCUGG-CCGGCA---------GUGCCUUCU----AGGGCUCCCAGGUGGGCUC----------CAGC--------------CCUCUCU-----------GCCCUUUUUUCCUCAUCUGCA-CUAUAAUGC-----------CACAGGCC-UGAAAAGC--AGGGAAGC-----A-----GACUGGCACCAGUGAAGGG---------------------------------------------------------------------C-AAGA----------GGU-------------GUGGGGGG-------------------------UCCAG-------------GGCUGG-CCGGCA---------GUGCCUUCU----AGGGCUCCCAGGUGGGCUC----------CAGC--------------CCUCUCU-----------GCCCUUUUUUCCUCAUCUGCA-CUAUAAUGC-----------CACAGGCC-UGAAAAGC--AGGGAAGC-----A-----GACUGGCACCAGUGAAGGG---------------------------------------------------------------------C-AAGA----------GGU-------------GUGGGGGG-------------------------UCCAG-------------GGCUGG-CCGGCA---------GUGCCUUCU----AGGGCUCCCAGGUGGGCUC----------CAGC--------------CCUCUCU-----------GCCCUUUUUUCCUCAUCUGCA-CUAUAAUGC-----------CACAGGCC |
view | Tree Shrew |
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view | Horse |
CCAGGGAGCUGAGGGUGAC-----A-----GUGUGGUG--GCUGGAAAG----GCUGCAGUGUCCCUGGGCUGGCUCUCCCCUGAGGGACGGGUCAGCAGACUGGUGUCUGAGGAGAAG-CAGG----------GGCGU---GGGCCGGGCAGAGGAG----------------------------GG-------------GACCCA-GUGCAGCUG-GGCCACGUC--UUCGAGGAGGGGCCCUGGGCAUGCUC----------UAGC--------------CCUCGCUGG---------GCCCCCUCUUCCUCACGUGCG-UUGUAACAU-----------UUGAGGCCCCAGGGAGCUGAGGGUGAC-----A-----GUGUGGUG--GCUGGAAAG----GCUGCAGUGUCCCUGGGCUGGCUCUCCCCUGAGGGACGGGUCAGCAGACUGGUGUCUGAGGAGAAG-CAGG----------GGCGU---GGGCCGGGCAGAGGAG----------------------------GG-------------GACCCA-GUGCAGCUG-GGCCACGUC--UUCGAGGAGGGGCCCUGGGCAUGCUC----------UAGC--------------CCUCGCUGG---------GCCCCCUCUUCCUCACGUGCG-UUGUAACAU-----------UUGAGGCCCCAGGGAGCUGAGGGUGAC-----A-----GUGUGGUG--GCUGGAAAG----GCUGCAGUGUCCCUGGGCUGGCUCUCCCCUGAGGGACGGGUCAGCAGACUGGUGUCUGAGGAGAAG-CAGG----------GGCGU---GGGCCGGGCAGAGGAG----------------------------GG-------------GACCCA-GUGCAGCUG-GGCCACGUC--UUCGAGGAGGGGCCCUGGGCAUGCUC----------UAGC--------------CCUCGCUGG---------GCCCCCUCUUCCUCACGUGCG-UUGUAACAU-----------UUGAGGCC |
view | Armadillo |
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view | Cat |
CUGGGGAGCUGAGGGUGAG-----G-----GCGUAGUG--GGCGGGAAGGAAGCCUGCAGUGGCCCUGG-CUGGCUCGUGCCCGGAA--CGGGUCAGCAGAC--------GUUGAGCCA-CUGG----------GGU-------------CAGGAGAG----------------------------GG-------------GUCCGG-UAACGGCGG-GGCAGUGCC--UUC-ACGAGGGCCCUGUGGCCUGCCC----------CGGC--------------CCUUUCUGG---------GCCUCGCUUUCCUUGUCUGCA-UUGUAACAU-----------UCGAGGCCCUGGGGAGCUGAGGGUGAG-----G-----GCGUAGUG--GGCGGGAAGGAAGCCUGCAGUGGCCCUGG-CUGGCUCGUGCCCGGAA--CGGGUCAGCAGAC--------GUUGAGCCA-CUGG----------GGU-------------CAGGAGAG----------------------------GG-------------GUCCGG-UAACGGCGG-GGCAGUGCC--UUC-ACGAGGGCCCUGUGGCCUGCCC----------CGGC--------------CCUUUCUGG---------GCCUCGCUUUCCUUGUCUGCA-UUGUAACAU-----------UCGAGGCCCUGGGGAGCUGAGGGUGAG-----G-----GCGUAGUG--GGCGGGAAGGAAGCCUGCAGUGGCCCUGG-CUGGCUCGUGCCCGGAA--CGGGUCAGCAGAC--------GUUGAGCCA-CUGG----------GGU-------------CAGGAGAG----------------------------GG-------------GUCCGG-UAACGGCGG-GGCAGUGCC--UUC-ACGAGGGCCCUGUGGCCUGCCC----------CGGC--------------CCUUUCUGG---------GCCUCGCUUUCCUUGUCUGCA-UUGUAACAU-----------UCGAGGCC |
view | Dog |
CCGAGGGGU---------------G-----GCUCAGUG--GGCAGGGGG--------------------------------UCGGAAGCCAGGACAACAG--------------------CAGG----------GGU-------------CAGGAGGG----------------------------AG-------------G---GG-CUCCAGCAG-GGCCGUCC-----------GGGCCCCCGUGCGUGCUC----------CCGC--------------CCUCCCUGG---------GCCUCAUUUUCCUUGUCUGUG-GUGUAGCGU-----------GUGCGGCCCCGAGGGGU---------------G-----GCUCAGUG--GGCAGGGGG--------------------------------UCGGAAGCCAGGACAACAG--------------------CAGG----------GGU-------------CAGGAGGG----------------------------AG-------------G---GG-CUCCAGCAG-GGCCGUCC-----------GGGCCCCCGUGCGUGCUC----------CCGC--------------CCUCCCUGG---------GCCUCAUUUUCCUUGUCUGUG-GUGUAGCGU-----------GUGCGGCCCCGAGGGGU---------------G-----GCUCAGUG--GGCAGGGGG--------------------------------UCGGAAGCCAGGACAACAG--------------------CAGG----------GGU-------------CAGGAGGG----------------------------AG-------------G---GG-CUCCAGCAG-GGCCGUCC-----------GGGCCCCCGUGCGUGCUC----------CCGC--------------CCUCCCUGG---------GCCUCAUUUUCCUUGUCUGUG-GUGUAGCGU-----------GUGCGGCC |
view | Elephant |
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view | Cow |
C-AGGGAGUGGAGGGUGGC-----A-----GUGUAGUG--GGCUGGAGC--AGACUGCUGUGUCCCCGGGCUGGCUUGCCC------------------------------CCAAGGGA-CAGGUCAGCAGACUGGUGUCUGAGGAGAAGCAGGGGAG----------------------------UG-------------GAUCGGCUUCCAGUGA-GGGAGGCCCCGUCCAAGGAGGGCCCUCGGGUACCUUG----------CAGC--------------CGGCCCUGG---------GCCUUGGGUCCCUUGUCUGCA-UUCUAAAGU-----------GUGUUGCCC-AGGGAGUGGAGGGUGGC-----A-----GUGUAGUG--GGCUGGAGC--AGACUGCUGUGUCCCCGGGCUGGCUUGCCC------------------------------CCAAGGGA-CAGGUCAGCAGACUGGUGUCUGAGGAGAAGCAGGGGAG----------------------------UG-------------GAUCGGCUUCCAGUGA-GGGAGGCCCCGUCCAAGGAGGGCCCUCGGGUACCUUG----------CAGC--------------CGGCCCUGG---------GCCUUGGGUCCCUUGUCUGCA-UUCUAAAGU-----------GUGUUGCCC-AGGGAGUGGAGGGUGGC-----A-----GUGUAGUG--GGCUGGAGC--AGACUGCUGUGUCCCCGGGCUGGCUUGCCC------------------------------CCAAGGGA-CAGGUCAGCAGACUGGUGUCUGAGGAGAAGCAGGGGAG----------------------------UG-------------GAUCGGCUUCCAGUGA-GGGAGGCCCCGUCCAAGGAGGGCCCUCGGGUACCUUG----------CAGC--------------CGGCCCUGG---------GCCUUGGGUCCCUUGUCUGCA-UUCUAAAGU-----------GUGUUGCC |
view | Rabbit |
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view | Guinea Pig |
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view | HedgeHog |
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view | Mouse |
CUGGGGACU--GGGAUG-------------GUGGAGUGUAGUCGGAAGG---------------------------------------------------------------------GUGAGG----------GUC-------------CUGAGAGGACACUGCAGACUCUCUGC-UCCAUGGCUUGUUGGCCCUUGUUGGGCAGA-UCAGACAGA-GGGUGGAGCGGGUU----AGGGCUCU--GGUGCAGUUAGACAGCACUUUGCUGGGGGGGGGGGGUCGUCCUUGAGCAUCUUUUGCCUGAUU---UUCACAUGCA-UUG--AAGU-----------UUGAAGUCCUGGGGACU--GGGAUG-------------GUGGAGUGUAGUCGGAAGG---------------------------------------------------------------------GUGAGG----------GUC-------------CUGAGAGGACACUGCAGACUCUCUGC-UCCAUGGCUUGUUGGCCCUUGUUGGGCAGA-UCAGACAGA-GGGUGGAGCGGGUU----AGGGCUCU--GGUGCAGUUAGACAGCACUUUGCUGGGGGGGGGGGGUCGUCCUUGAGCAUCUUUUGCCUGAUU---UUCACAUGCA-UUG--AAGU-----------UUGAAGUCCUGGGGACU--GGGAUG-------------GUGGAGUGUAGUCGGAAGG---------------------------------------------------------------------GUGAGG----------GUC-------------CUGAGAGGACACUGCAGACUCUCUGC-UCCAUGGCUUGUUGGCCCUUGUUGGGCAGA-UCAGACAGA-GGGUGGAGCGGGUU----AGGGCUCU--GGUGCAGUUAGACAGCACUUUGCUGGGGGGGGGGGGUCGUCCUUGAGCAUCUUUUGCCUGAUU---UUCACAUGCA-UUG--AAGU-----------UUGAAGUC |
view | Shrew |
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view | Rat |
CUGGGGAUU--GGGAUGAC-----AAUGUGGUGUACUGGGGUCAGAAGG---------------------------------------------------------------------UUGAGG----------GCC-------------CUGAUAGGACACUGCAGACACACUUUGUCUGUGGCUUG-------------GGCAGA-UUAGGAAGA-GGGCAGAGGGGGCU----AGGGCUCU--GGUGAGGUC----------UUGCUGGGGGGG------UGUCCUUGAUCAUCUUUUGCCUGAGU---UUCACAUGCA-UUGCCAAGU-----------GUACCGCCCUGGGGAUU--GGGAUGAC-----AAUGUGGUGUACUGGGGUCAGAAGG---------------------------------------------------------------------UUGAGG----------GCC-------------CUGAUAGGACACUGCAGACACACUUUGUCUGUGGCUUG-------------GGCAGA-UUAGGAAGA-GGGCAGAGGGGGCU----AGGGCUCU--GGUGAGGUC----------UUGCUGGGGGGG------UGUCCUUGAUCAUCUUUUGCCUGAGU---UUCACAUGCA-UUGCCAAGU-----------GUACCGCCCUGGGGAUU--GGGAUGAC-----AAUGUGGUGUACUGGGGUCAGAAGG---------------------------------------------------------------------UUGAGG----------GCC-------------CUGAUAGGACACUGCAGACACACUUUGUCUGUGGCUUG-------------GGCAGA-UUAGGAAGA-GGGCAGAGGGGGCU----AGGGCUCU--GGUGAGGUC----------UUGCUGGGGGGG------UGUCCUUGAUCAUCUUUUGCCUGAGU---UUCACAUGCA-UUGCCAAGU-----------GUACCGCC |
view | Tenrec |
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view | Opossum |
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view | Platypus |
CCGGGGAAC------UAAUCCCCAG-----GUCUGGAA--GCAGGAGAC---UUCGACCGUAUGCCCAGU------------------------------------------------G-CCAG----------GGC-------------CGGGGCAA----------------------------UG-------------ACCCGG-CCGCCGCAGUGACUGGCACAGGCAC------GUCAC--AGCGGGGAC----------------------------UCCCCCCGC---------CCCCCAAU---CCCCCCAGCAACUGGAACCCCCUUGCCUUUCCUGAGAACCCGGGGAAC------UAAUCCCCAG-----GUCUGGAA--GCAGGAGAC---UUCGACCGUAUGCCCAGU------------------------------------------------G-CCAG----------GGC-------------CGGGGCAA----------------------------UG-------------ACCCGG-CCGCCGCAGUGACUGGCACAGGCAC------GUCAC--AGCGGGGAC----------------------------UCCCCCCGC---------CCCCCAAU---CCCCCCAGCAACUGGAACCCCCUUGCCUUUCCUGAGAACCCGGGGAAC------UAAUCCCCAG-----GUCUGGAA--GCAGGAGAC---UUCGACCGUAUGCCCAGU------------------------------------------------G-CCAG----------GGC-------------CGGGGCAA----------------------------UG-------------ACCCGG-CCGCCGCAGUGACUGGCACAGGCAC------GUCAC--AGCGGGGAC----------------------------UCCCCCCGC---------CCCCCAAU---CCCCCCAGCAACUGGAACCCCCUUGCCUUUCCUGAGAAC |
view | Chicken |
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view | Lizard |
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view | Frog |
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view | Zebrafish |
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view | Stickleback |
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view | Tetradon |
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view | Fugu |
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view | Medaka |
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