mir-647
chr20:62044408-62044543
View MI0003662 at mirBase
 

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Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

Species Sequence
view Human UUC-CGU---------CGUCU------------GGUCAG-CCA--AGG----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUGCACU------------------------CACUUCCUUCAGCCCCAGGAA-------GC-C-UUGGU---CGGGGGCAGG------AGGGAGGGUCAGGCAGGGCUGGGG---------------GCCU----GAC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CGU---------CGUCU------------GGUCAG-CCA--AGG----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUGCACU------------------------CACUUCCUUCAGCCCCAGGAA-------GC-C-UUGGU---CGGGGGCAGG------AGGGAGGGUCAGGCAGGGCUGGGG---------------GCCU----GAC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CGU---------CGUCU------------GGUCAG-CCA--AGG----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUGCACU------------------------CACUUCCUUCAGCCCCAGGAA-------GC-C-UUGGU---CGGGGGCAGG------AGGGAGGGUCAGGCAGGGCUGGGG---------------GCCU----GAC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAG
view Chimp ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Rhesus UUC-CAU---------CGUCU------------GGUCAG-CUG--AGA----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUCCACU------------------------CACUUCCAUCAGCCCCAGAAA-------GC-C-UUGGU---GGGGGGCAGG------AGGGAGGGCCAGGCAGGGCUGGGG---------------ACCU----GGC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CAU---------CGUCU------------GGUCAG-CUG--AGA----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUCCACU------------------------CACUUCCAUCAGCCCCAGAAA-------GC-C-UUGGU---GGGGGGCAGG------AGGGAGGGCCAGGCAGGGCUGGGG---------------ACCU----GGC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CAU---------CGUCU------------GGUCAG-CUG--AGA----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUCCACU------------------------CACUUCCAUCAGCCCCAGAAA-------GC-C-UUGGU---GGGGGGCAGG------AGGGAGGGCCAGGCAGGGCUGGGG---------------ACCU----GGC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAG
view Bushbaby ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Tree Shrew UCCACGC---------CCUCCCUGCCCGCCAGCAGCCAG-CCG--GGAUACACAACCAGGCUGCAGGUGC-------UGGUGUGGUGGCUCCAC----------------------------------------CAGACA-------GC-G-CCAGC------------------------------GCCAGAGCUGAGG----------------CUG----GGC--------------CUCCC-----------------------------------------------------====UCCACGC---------CCUCCCUGCCCGCCAGCAGCCAG-CCG--GGAUACACAACCAGGCUGCAGGUGC-------UGGUGUGGUGGCUCCAC----------------------------------------CAGACA-------GC-G-CCAGC------------------------------GCCAGAGCUGAGG----------------CUG----GGC--------------CUCCC-----------------------------------------------------====UCCACGC---------CCUCCCUGCCCGCCAGCAGCCAG-CCG--GGAUACACAACCAGGCUGCAGGUGC-------UGGUGUGGUGGCUCCAC----------------------------------------CAGACA-------GC-G-CCAGC------------------------------GCCAGAGCUGAGG----------------CUG----GGC--------------CUCCC-----------------------------------------------------====
view Horse ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Armadillo ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Cat UCC-CCU---------UCUCU------------GGCCAG-CCA--CGG----------------AAGUGG-------UGGCUGG-UGGCCGCUCGU-----------------------C---UCUGUCAGCCCCAGGAA-----GUGU-UGCUGGU---GGGCGGUCGGCGGC--GGGGACAGGCCUCGGAGAGCAAAG---------------CCUCCAGGGGU--------------CCCCCAGU----------------------------CGCCC-GCCA-CCUGCCUCUCUUCAGUCC-CCU---------UCUCU------------GGCCAG-CCA--CGG----------------AAGUGG-------UGGCUGG-UGGCCGCUCGU-----------------------C---UCUGUCAGCCCCAGGAA-----GUGU-UGCUGGU---GGGCGGUCGGCGGC--GGGGACAGGCCUCGGAGAGCAAAG---------------CCUCCAGGGGU--------------CCCCCAGU----------------------------CGCCC-GCCA-CCUGCCUCUCUUCAGUCC-CCU---------UCUCU------------GGCCAG-CCA--CGG----------------AAGUGG-------UGGCUGG-UGGCCGCUCGU-----------------------C---UCUGUCAGCCCCAGGAA-----GUGU-UGCUGGU---GGGCGGUCGGCGGC--GGGGACAGGCCUCGGAGAGCAAAG---------------CCUCCAGGGGU--------------CCCCCAGU----------------------------CGCCC-GCCA-CCUGCCUCUCUUCAG
view Dog -UC-CCU---------UCUCU------------GGCC----------G----------------AGGUGG-------CGGCUGC-GGGC-----------------------------------------GCGCAGGGCA------------CAGGC---GGGUGGCCGG------GGGGCU--GCGGCGGAGCGCAGAG---------------CCUC----GGU--------------CUCCCUGC----------------------------CGCCCCGCCA-CCUGCCUCUUCUCAG-UC-CCU---------UCUCU------------GGCC----------G----------------AGGUGG-------CGGCUGC-GGGC-----------------------------------------GCGCAGGGCA------------CAGGC---GGGUGGCCGG------GGGGCU--GCGGCGGAGCGCAGAG---------------CCUC----GGU--------------CUCCCUGC----------------------------CGCCCCGCCA-CCUGCCUCUUCUCAG-UC-CCU---------UCUCU------------GGCC----------G----------------AGGUGG-------CGGCUGC-GGGC-----------------------------------------GCGCAGGGCA------------CAGGC---GGGUGGCCGG------GGGGCU--GCGGCGGAGCGCAGAG---------------CCUC----GGU--------------CUCCCUGC----------------------------CGCCCCGCCA-CCUGCCUCUUCUCAG
view Elephant UUC-CGU---------CCUCU------------GGUCAGACCC--AGG----------------AAGUGGGUCAGGGAGGGCAG-GGACCACAGUCCCAGCUCCCGCCCAGGCUGGCCACGCCACCUCUGCCCACAGAAAGCAGAG---=========================================================================================================================================================UUC-CGU---------CCUCU------------GGUCAGACCC--AGG----------------AAGUGGGUCAGGGAGGGCAG-GGACCACAGUCCCAGCUCCCGCCCAGGCUGGCCACGCCACCUCUGCCCACAGAAAGCAGAG---=========================================================================================================================================================UUC-CGU---------CCUCU------------GGUCAGACCC--AGG----------------AAGUGGGUCAGGGAGGGCAG-GGACCACAGUCCCAGCUCCCGCCCAGGCUGGCCACGCCACCUCUGCCCACAGAAAGCAGAG---=========================================================================================================================================================
view Cow GGA-CUUGGCGGGUGCUCGCA------------GGCC--------CAG----------------GGGUGC-------GAGCUGC-AGGG----------------------------------UCUUCCUGCC----------------===================================-------------------------------CCUC-----------------------CCUCCU----------------------------CCCCCAGCCU-CCUGCUCUUCCCCAGGGA-CUUGGCGGGUGCUCGCA------------GGCC--------CAG----------------GGGUGC-------GAGCUGC-AGGG----------------------------------UCUUCCUGCC----------------===================================-------------------------------CCUC-----------------------CCUCCU----------------------------CCCCCAGCCU-CCUGCUCUUCCCCAGGGA-CUUGGCGGGUGCUCGCA------------GGCC--------CAG----------------GGGUGC-------GAGCUGC-AGGG----------------------------------UCUUCCUGCC----------------===================================-------------------------------CCUC-----------------------CCUCCU----------------------------CCCCCAGCCU-CCUGCUCUUCCCCAG
view Rabbit ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Guinea Pig UUC-CAU---------UCUCU------------GGUCUC-CCA--AGG----------------AAGUGG-------UGGCCAG-UACCUCCCGU------------------------UGCCUCUUUCAGUCACAGGAA-------GU-GGCUAGC------G-GCAGG------AGGGAAGG======================================================================================================================UUC-CAU---------UCUCU------------GGUCUC-CCA--AGG----------------AAGUGG-------UGGCCAG-UACCUCCCGU------------------------UGCCUCUUUCAGUCACAGGAA-------GU-GGCUAGC------G-GCAGG------AGGGAAGG======================================================================================================================UUC-CAU---------UCUCU------------GGUCUC-CCA--AGG----------------AAGUGG-------UGGCCAG-UACCUCCCGU------------------------UGCCUCUUUCAGUCACAGGAA-------GU-GGCUAGC------G-GCAGG------AGGGAAGG======================================================================================================================
view HedgeHog UUC-CCU-----------CCU------------GGGCAG-CCC--AGG----------------AAAUGG-------AGGCCAG-CAGCCACAUGC-----------------------CCACCCCUGCAGCCCAGGAAGU--GAGGCU-UGCAUGG---GUGAGGGGGAUAGUUGGGGGAUGGGCCUGAGAGGGUGAGGC--------------UCUC----AGA--------------UGCAAAGA----------------------------UGCACAGCUGGUCUGUGUUUCCCCAGUUC-CCU-----------CCU------------GGGCAG-CCC--AGG----------------AAAUGG-------AGGCCAG-CAGCCACAUGC-----------------------CCACCCCUGCAGCCCAGGAAGU--GAGGCU-UGCAUGG---GUGAGGGGGAUAGUUGGGGGAUGGGCCUGAGAGGGUGAGGC--------------UCUC----AGA--------------UGCAAAGA----------------------------UGCACAGCUGGUCUGUGUUUCCCCAGUUC-CCU-----------CCU------------GGGCAG-CCC--AGG----------------AAAUGG-------AGGCCAG-CAGCCACAUGC-----------------------CCACCCCUGCAGCCCAGGAAGU--GAGGCU-UGCAUGG---GUGAGGGGGAUAGUUGGGGGAUGGGCCUGAGAGGGUGAGGC--------------UCUC----AGA--------------UGCAAAGA----------------------------UGCACAGCUGGUCUGUGUUUCCCCAG
view Mouse UUC-CAU---------UUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUGGU---GACUAGUGAG-UGGCCCACCUC-----------------------AGUCUCCUUCAACUCCAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCAGCUGGGUGUGGGU---------------AGUG----CUC--------------CACCCUCAGGCGCCAAGGCUGUCAGUGCCAAGACUGCUUCCAGCCU-CCUG-----CCUCAAUUC-CAU---------UUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUGGU---GACUAGUGAG-UGGCCCACCUC-----------------------AGUCUCCUUCAACUCCAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCAGCUGGGUGUGGGU---------------AGUG----CUC--------------CACCCUCAGGCGCCAAGGCUGUCAGUGCCAAGACUGCUUCCAGCCU-CCUG-----CCUCAAUUC-CAU---------UUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUGGU---GACUAGUGAG-UGGCCCACCUC-----------------------AGUCUCCUUCAACUCCAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCAGCUGGGUGUGGGU---------------AGUG----CUC--------------CACCCUCAGGCGCCAAGGCUGUCAGUGCCAAGACUGCUUCCAGCCU-CCUG-----CCUCAA
view Shrew ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Rat UUG-CAU---------CUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUG--------UGGCUAG-UGGCCCACUU------------------------GGUCUCCUUCAACUCUAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCGGCUGGGUGUGGGU---------------GGUG----UCC--------------CACCCUCAGGUGCCAAGGCCGUCAGUGCCAAGACUGCUGCCAGCCU-CCUG-----CCUGGAUUG-CAU---------CUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUG--------UGGCUAG-UGGCCCACUU------------------------GGUCUCCUUCAACUCUAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCGGCUGGGUGUGGGU---------------GGUG----UCC--------------CACCCUCAGGUGCCAAGGCCGUCAGUGCCAAGACUGCUGCCAGCCU-CCUG-----CCUGGAUUG-CAU---------CUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUG--------UGGCUAG-UGGCCCACUU------------------------GGUCUCCUUCAACUCUAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCGGCUGGGUGUGGGU---------------GGUG----UCC--------------CACCCUCAGGUGCCAAGGCCGUCAGUGCCAAGACUGCUGCCAGCCU-CCUG-----CCUGGA
view Tenrec ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Opossum UUC-CAU---------UCAUU------------GGUCAG-CCACCAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCCAAG------------------------UACCUUCUUCAGACACAGGAAG--------=========================================================================================================================================================UUC-CAU---------UCAUU------------GGUCAG-CCACCAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCCAAG------------------------UACCUUCUUCAGACACAGGAAG--------=========================================================================================================================================================UUC-CAU---------UCAUU------------GGUCAG-CCACCAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCCAAG------------------------UACCUUCUUCAGACACAGGAAG--------=========================================================================================================================================================
view Platypus UUC-CAU---------UCGUU------------GGUCAG-CCACAAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCAGAG------------------------UACCUGCUUCAGACACAGGAAG-------C=====================================================================================================================================================UAAUUUC-CAU---------UCGUU------------GGUCAG-CCACAAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCAGAG------------------------UACCUGCUUCAGACACAGGAAG-------C=====================================================================================================================================================UAAUUUC-CAU---------UCGUU------------GGUCAG-CCACAAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCAGAG------------------------UACCUGCUUCAGACACAGGAAG-------C=====================================================================================================================================================UAAU
view Chicken ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Lizard ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Frog ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Zebrafish ==========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Stickleback ========================================================================================================================================================================================----------GUAGAGUUGUCGAGCUGUC--GCUC----UCU---------CUCCCCCCC------------------------------------------------------============================================================================================================================================================================================----------GUAGAGUUGUCGAGCUGUC--GCUC----UCU---------CUCCCCCCC------------------------------------------------------============================================================================================================================================================================================----------GUAGAGUUGUCGAGCUGUC--GCUC----UCU---------CUCCCCCCC------------------------------------------------------====
view Tetradon =====================================================================================================================================================-U-CAGGU--------GAAGGUGCA----------GCAG------UAGGAGCAGGAGACCUGCUGGGUUU----UAUUAGAAACCGCUUGGCUCC------------------------------------------------------=========================================================================================================================================================-U-CAGGU--------GAAGGUGCA----------GCAG------UAGGAGCAGGAGACCUGCUGGGUUU----UAUUAGAAACCGCUUGGCUCC------------------------------------------------------=========================================================================================================================================================-U-CAGGU--------GAAGGUGCA----------GCAG------UAGGAGCAGGAGACCUGCUGGGUUU----UAUUAGAAACCGCUUGGCUCC------------------------------------------------------====
view Fugu =====================================================================================================================================================GU-CAGCCUCCUGUUGGAGGGUGGU----------UCAU------CUGGAG---------------GUUC----UAU---AAACUGGUCAGCUCC------------------------------------------------------=========================================================================================================================================================GU-CAGCCUCCUGUUGGAGGGUGGU----------UCAU------CUGGAG---------------GUUC----UAU---AAACUGGUCAGCUCC------------------------------------------------------=========================================================================================================================================================GU-CAGCCUCCUGUUGGAGGGUGGU----------UCAU------CUGGAG---------------GUUC----UAU---AAACUGGUCAGCUCC------------------------------------------------------====
view Medaka ========================================================================================================================================================================================--------------------------------------------------------CUCC------------------------------------------------------============================================================================================================================================================================================--------------------------------------------------------CUCC------------------------------------------------------============================================================================================================================================================================================--------------------------------------------------------CUCC------------------------------------------------------====

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