Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
Species | Sequence | |
---|---|---|
view | Human |
UUC-CGU---------CGUCU------------GGUCAG-CCA--AGG----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUGCACU------------------------CACUUCCUUCAGCCCCAGGAA-------GC-C-UUGGU---CGGGGGCAGG------AGGGAGGGUCAGGCAGGGCUGGGG---------------GCCU----GAC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CGU---------CGUCU------------GGUCAG-CCA--AGG----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUGCACU------------------------CACUUCCUUCAGCCCCAGGAA-------GC-C-UUGGU---CGGGGGCAGG------AGGGAGGGUCAGGCAGGGCUGGGG---------------GCCU----GAC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CGU---------CGUCU------------GGUCAG-CCA--AGG----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUGCACU------------------------CACUUCCUUCAGCCCCAGGAA-------GC-C-UUGGU---CGGGGGCAGG------AGGGAGGGUCAGGCAGGGCUGGGG---------------GCCU----GAC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAG |
view | Chimp |
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view | Rhesus |
UUC-CAU---------CGUCU------------GGUCAG-CUG--AGA----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUCCACU------------------------CACUUCCAUCAGCCCCAGAAA-------GC-C-UUGGU---GGGGGGCAGG------AGGGAGGGCCAGGCAGGGCUGGGG---------------ACCU----GGC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CAU---------CGUCU------------GGUCAG-CUG--AGA----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUCCACU------------------------CACUUCCAUCAGCCCCAGAAA-------GC-C-UUGGU---GGGGGGCAGG------AGGGAGGGCCAGGCAGGGCUGGGG---------------ACCU----GGC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAGUUC-CAU---------CGUCU------------GGUCAG-CUG--AGA----------------AAGUGU-------UGGCCUG-UGGCUCCACU------------------------CACUUCCAUCAGCCCCAGAAA-------GC-C-UUGGU---GGGGGGCAGG------AGGGAGGGCCAGGCAGGGCUGGGG---------------ACCU----GGC--------------CGCCCACA------------------------------------CU-CCU------CCUCAG |
view | Bushbaby |
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view | Tree Shrew |
UCCACGC---------CCUCCCUGCCCGCCAGCAGCCAG-CCG--GGAUACACAACCAGGCUGCAGGUGC-------UGGUGUGGUGGCUCCAC----------------------------------------CAGACA-------GC-G-CCAGC------------------------------GCCAGAGCUGAGG----------------CUG----GGC--------------CUCCC-----------------------------------------------------====UCCACGC---------CCUCCCUGCCCGCCAGCAGCCAG-CCG--GGAUACACAACCAGGCUGCAGGUGC-------UGGUGUGGUGGCUCCAC----------------------------------------CAGACA-------GC-G-CCAGC------------------------------GCCAGAGCUGAGG----------------CUG----GGC--------------CUCCC-----------------------------------------------------====UCCACGC---------CCUCCCUGCCCGCCAGCAGCCAG-CCG--GGAUACACAACCAGGCUGCAGGUGC-------UGGUGUGGUGGCUCCAC----------------------------------------CAGACA-------GC-G-CCAGC------------------------------GCCAGAGCUGAGG----------------CUG----GGC--------------CUCCC-----------------------------------------------------==== |
view | Horse |
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view | Armadillo |
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view | Cat |
UCC-CCU---------UCUCU------------GGCCAG-CCA--CGG----------------AAGUGG-------UGGCUGG-UGGCCGCUCGU-----------------------C---UCUGUCAGCCCCAGGAA-----GUGU-UGCUGGU---GGGCGGUCGGCGGC--GGGGACAGGCCUCGGAGAGCAAAG---------------CCUCCAGGGGU--------------CCCCCAGU----------------------------CGCCC-GCCA-CCUGCCUCUCUUCAGUCC-CCU---------UCUCU------------GGCCAG-CCA--CGG----------------AAGUGG-------UGGCUGG-UGGCCGCUCGU-----------------------C---UCUGUCAGCCCCAGGAA-----GUGU-UGCUGGU---GGGCGGUCGGCGGC--GGGGACAGGCCUCGGAGAGCAAAG---------------CCUCCAGGGGU--------------CCCCCAGU----------------------------CGCCC-GCCA-CCUGCCUCUCUUCAGUCC-CCU---------UCUCU------------GGCCAG-CCA--CGG----------------AAGUGG-------UGGCUGG-UGGCCGCUCGU-----------------------C---UCUGUCAGCCCCAGGAA-----GUGU-UGCUGGU---GGGCGGUCGGCGGC--GGGGACAGGCCUCGGAGAGCAAAG---------------CCUCCAGGGGU--------------CCCCCAGU----------------------------CGCCC-GCCA-CCUGCCUCUCUUCAG |
view | Dog |
-UC-CCU---------UCUCU------------GGCC----------G----------------AGGUGG-------CGGCUGC-GGGC-----------------------------------------GCGCAGGGCA------------CAGGC---GGGUGGCCGG------GGGGCU--GCGGCGGAGCGCAGAG---------------CCUC----GGU--------------CUCCCUGC----------------------------CGCCCCGCCA-CCUGCCUCUUCUCAG-UC-CCU---------UCUCU------------GGCC----------G----------------AGGUGG-------CGGCUGC-GGGC-----------------------------------------GCGCAGGGCA------------CAGGC---GGGUGGCCGG------GGGGCU--GCGGCGGAGCGCAGAG---------------CCUC----GGU--------------CUCCCUGC----------------------------CGCCCCGCCA-CCUGCCUCUUCUCAG-UC-CCU---------UCUCU------------GGCC----------G----------------AGGUGG-------CGGCUGC-GGGC-----------------------------------------GCGCAGGGCA------------CAGGC---GGGUGGCCGG------GGGGCU--GCGGCGGAGCGCAGAG---------------CCUC----GGU--------------CUCCCUGC----------------------------CGCCCCGCCA-CCUGCCUCUUCUCAG |
view | Elephant |
UUC-CGU---------CCUCU------------GGUCAGACCC--AGG----------------AAGUGGGUCAGGGAGGGCAG-GGACCACAGUCCCAGCUCCCGCCCAGGCUGGCCACGCCACCUCUGCCCACAGAAAGCAGAG---=========================================================================================================================================================UUC-CGU---------CCUCU------------GGUCAGACCC--AGG----------------AAGUGGGUCAGGGAGGGCAG-GGACCACAGUCCCAGCUCCCGCCCAGGCUGGCCACGCCACCUCUGCCCACAGAAAGCAGAG---=========================================================================================================================================================UUC-CGU---------CCUCU------------GGUCAGACCC--AGG----------------AAGUGGGUCAGGGAGGGCAG-GGACCACAGUCCCAGCUCCCGCCCAGGCUGGCCACGCCACCUCUGCCCACAGAAAGCAGAG---========================================================================================================================================================= |
view | Cow |
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view | Rabbit |
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view | Guinea Pig |
UUC-CAU---------UCUCU------------GGUCUC-CCA--AGG----------------AAGUGG-------UGGCCAG-UACCUCCCGU------------------------UGCCUCUUUCAGUCACAGGAA-------GU-GGCUAGC------G-GCAGG------AGGGAAGG======================================================================================================================UUC-CAU---------UCUCU------------GGUCUC-CCA--AGG----------------AAGUGG-------UGGCCAG-UACCUCCCGU------------------------UGCCUCUUUCAGUCACAGGAA-------GU-GGCUAGC------G-GCAGG------AGGGAAGG======================================================================================================================UUC-CAU---------UCUCU------------GGUCUC-CCA--AGG----------------AAGUGG-------UGGCCAG-UACCUCCCGU------------------------UGCCUCUUUCAGUCACAGGAA-------GU-GGCUAGC------G-GCAGG------AGGGAAGG====================================================================================================================== |
view | HedgeHog |
UUC-CCU-----------CCU------------GGGCAG-CCC--AGG----------------AAAUGG-------AGGCCAG-CAGCCACAUGC-----------------------CCACCCCUGCAGCCCAGGAAGU--GAGGCU-UGCAUGG---GUGAGGGGGAUAGUUGGGGGAUGGGCCUGAGAGGGUGAGGC--------------UCUC----AGA--------------UGCAAAGA----------------------------UGCACAGCUGGUCUGUGUUUCCCCAGUUC-CCU-----------CCU------------GGGCAG-CCC--AGG----------------AAAUGG-------AGGCCAG-CAGCCACAUGC-----------------------CCACCCCUGCAGCCCAGGAAGU--GAGGCU-UGCAUGG---GUGAGGGGGAUAGUUGGGGGAUGGGCCUGAGAGGGUGAGGC--------------UCUC----AGA--------------UGCAAAGA----------------------------UGCACAGCUGGUCUGUGUUUCCCCAGUUC-CCU-----------CCU------------GGGCAG-CCC--AGG----------------AAAUGG-------AGGCCAG-CAGCCACAUGC-----------------------CCACCCCUGCAGCCCAGGAAGU--GAGGCU-UGCAUGG---GUGAGGGGGAUAGUUGGGGGAUGGGCCUGAGAGGGUGAGGC--------------UCUC----AGA--------------UGCAAAGA----------------------------UGCACAGCUGGUCUGUGUUUCCCCAG |
view | Mouse |
UUC-CAU---------UUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUGGU---GACUAGUGAG-UGGCCCACCUC-----------------------AGUCUCCUUCAACUCCAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCAGCUGGGUGUGGGU---------------AGUG----CUC--------------CACCCUCAGGCGCCAAGGCUGUCAGUGCCAAGACUGCUUCCAGCCU-CCUG-----CCUCAAUUC-CAU---------UUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUGGU---GACUAGUGAG-UGGCCCACCUC-----------------------AGUCUCCUUCAACUCCAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCAGCUGGGUGUGGGU---------------AGUG----CUC--------------CACCCUCAGGCGCCAAGGCUGUCAGUGCCAAGACUGCUUCCAGCCU-CCUG-----CCUCAAUUC-CAU---------UUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUGGU---GACUAGUGAG-UGGCCCACCUC-----------------------AGUCUCCUUCAACUCCAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCAGCUGGGUGUGGGU---------------AGUG----CUC--------------CACCCUCAGGCGCCAAGGCUGUCAGUGCCAAGACUGCUUCCAGCCU-CCUG-----CCUCAA |
view | Shrew |
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view | Rat |
UUG-CAU---------CUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUG--------UGGCUAG-UGGCCCACUU------------------------GGUCUCCUUCAACUCUAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCGGCUGGGUGUGGGU---------------GGUG----UCC--------------CACCCUCAGGUGCCAAGGCCGUCAGUGCCAAGACUGCUGCCAGCCU-CCUG-----CCUGGAUUG-CAU---------CUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUG--------UGGCUAG-UGGCCCACUU------------------------GGUCUCCUUCAACUCUAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCGGCUGGGUGUGGGU---------------GGUG----UCC--------------CACCCUCAGGUGCCAAGGCCGUCAGUGCCAAGACUGCUGCCAGCCU-CCUG-----CCUGGAUUG-CAU---------CUUCU------------GGCCAG-CCA--AGG----------------AAGUG--------UGGCUAG-UGGCCCACUU------------------------GGUCUCCUUCAACUCUAGGAA-------GC-UACUGGU------GAGCAGG------AGGGAAAAGCGGCUGGGUGUGGGU---------------GGUG----UCC--------------CACCCUCAGGUGCCAAGGCCGUCAGUGCCAAGACUGCUGCCAGCCU-CCUG-----CCUGGA |
view | Tenrec |
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view | Opossum |
UUC-CAU---------UCAUU------------GGUCAG-CCACCAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCCAAG------------------------UACCUUCUUCAGACACAGGAAG--------=========================================================================================================================================================UUC-CAU---------UCAUU------------GGUCAG-CCACCAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCCAAG------------------------UACCUUCUUCAGACACAGGAAG--------=========================================================================================================================================================UUC-CAU---------UCAUU------------GGUCAG-CCACCAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCCAAG------------------------UACCUUCUUCAGACACAGGAAG--------========================================================================================================================================================= |
view | Platypus |
UUC-CAU---------UCGUU------------GGUCAG-CCACAAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCAGAG------------------------UACCUGCUUCAGACACAGGAAG-------C=====================================================================================================================================================UAAUUUC-CAU---------UCGUU------------GGUCAG-CCACAAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCAGAG------------------------UACCUGCUUCAGACACAGGAAG-------C=====================================================================================================================================================UAAUUUC-CAU---------UCGUU------------GGUCAG-CCACAAGG----------------AAGUGG-------UGGCAGG-AAGCCCAGAG------------------------UACCUGCUUCAGACACAGGAAG-------C=====================================================================================================================================================UAAU |
view | Chicken |
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view | Lizard |
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view | Frog |
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view | Zebrafish |
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view | Stickleback |
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view | Tetradon |
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view | Fugu |
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view | Medaka |
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