Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
A--------------CCCU--CCCCUUCUUGGCUCCGCCUCCUACCGCAG-UGCUUGACGGGAGGCG--GAGC--GGG-------GAACGAG---GCCGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGC-----------UUCCUGU-GGGACGUGGUGG----------UAGC--CGUUGGGU----UGGGAA----------AGUGAGGGA--------------------A--------------CCCU--CCCCUUCUUGGCUCCGCCUCCUACCGCAG-UGCUUGACGGGAGGCG--GAGC--GGG-------GAACGAG---GCCGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGC-----------UUCCUGU-GGGACGUGGUGG----------UAGC--CGUUGGGU----UGGGAA----------AGUGAGGGA--------------------A--------------CCCU--CCCCUUCUUGGCUCCGCCUCCUACCGCAG-UGCUUGACGGGAGGCG--GAGC--GGG-------GAACGAG---GCCGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGC-----------UUCCUGU-GGGACGUGGUGG----------UAGC--CGUUGGGU----UGGGAA----------AGUGAGGGA-------------------- |
| view | Chimp |
A--------------CCCU--CCCCUUCUUGGCUCCGCCUCCUACCGCAG-UGCUUGACGGGAGGCG--GAGC--GGG-------GAACGAG---GCCGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGC-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------UAGC--CGUUGGGU----CGGGAA----------AGUGAGGGA--------------------A--------------CCCU--CCCCUUCUUGGCUCCGCCUCCUACCGCAG-UGCUUGACGGGAGGCG--GAGC--GGG-------GAACGAG---GCCGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGC-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------UAGC--CGUUGGGU----CGGGAA----------AGUGAGGGA--------------------A--------------CCCU--CCCCUUCUUGGCUCCGCCUCCUACCGCAG-UGCUUGACGGGAGGCG--GAGC--GGG-------GAACGAG---GCCGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGC-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------UAGC--CGUUGGGU----CGGGAA----------AGUGAGGGA-------------------- |
| view | Rhesus |
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| view | Bushbaby |
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| view | Tree Shrew |
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| view | Horse |
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| view | Armadillo |
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| view | Cat |
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| view | Dog |
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| view | Elephant |
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| view | Cow |
ACCCCUCCCCCCCACCCCC-GCCCCUGCUUGGCACCUCCUCCGGCCGCAG-AGCCUGACGGGAGACA--GAGC--AGC-------GAGCGAA---GGCGUCGGCCA-UUUUGUGGAUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------UGGC--GGUUGGGU----UGGAAG----------AGUGAGCUG--------------------ACCCCUCCCCCCCACCCCC-GCCCCUGCUUGGCACCUCCUCCGGCCGCAG-AGCCUGACGGGAGACA--GAGC--AGC-------GAGCGAA---GGCGUCGGCCA-UUUUGUGGAUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------UGGC--GGUUGGGU----UGGAAG----------AGUGAGCUG--------------------ACCCCUCCCCCCCACCCCC-GCCCCUGCUUGGCACCUCCUCCGGCCGCAG-AGCCUGACGGGAGACA--GAGC--AGC-------GAGCGAA---GGCGUCGGCCA-UUUUGUGGAUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------UGGC--GGUUGGGU----UGGAAG----------AGUGAGCUG-------------------- |
| view | Rabbit |
A--------------CCCU--CCCUGGCCUGGCCCCGCCUCCCGCCGCAG-UGCCCGACGGGAGGCG--GAGC--CGC-------GAACGAG---GGUGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------GAGC--CGUUGGGU----CGCGGA----------AUUGAGCG---CUC---------------A--------------CCCU--CCCUGGCCUGGCCCCGCCUCCCGCCGCAG-UGCCCGACGGGAGGCG--GAGC--CGC-------GAACGAG---GGUGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------GAGC--CGUUGGGU----CGCGGA----------AUUGAGCG---CUC---------------A--------------CCCU--CCCUGGCCUGGCCCCGCCUCCCGCCGCAG-UGCCCGACGGGAGGCG--GAGC--CGC-------GAACGAG---GGUGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGUGG----------GAGC--CGUUGGGU----CGCGGA----------AUUGAGCG---CUC--------------- |
| view | Guinea Pig |
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| view | HedgeHog |
A--------------CUCU--UUCCGCUUUAUCUCCGCCCCUGGUCGCGG-UGCCUGCCGGGAGGUA--GAGC--GCC-------GAACGGG---AGCUUCGGCUCAUUUUGUGCCUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGCGG----------UGGC--AGCUGGUU----CGGAAG----------AGUGAGCG---------------------A--------------CUCU--UUCCGCUUUAUCUCCGCCCCUGGUCGCGG-UGCCUGCCGGGAGGUA--GAGC--GCC-------GAACGGG---AGCUUCGGCUCAUUUUGUGCCUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGCGG----------UGGC--AGCUGGUU----CGGAAG----------AGUGAGCG---------------------A--------------CUCU--UUCCGCUUUAUCUCCGCCCCUGGUCGCGG-UGCCUGCCGGGAGGUA--GAGC--GCC-------GAACGGG---AGCUUCGGCUCAUUUUGUGCCUGU-----------UUCCUGU-GGGACGCGGCGG----------UGGC--AGCUGGUU----CGGAAG----------AGUGAGCG--------------------- |
| view | Mouse |
A--------------CCC-------------GC-ACAGCUCUCACCGCGG-UGGCUGAUGGGAGGUG--GAGA--UA--------GAACGAG---GGUGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGC-GGGACGCGCUGG----------UGGC--GGUUGGUG----UGGAGA----------ACUCUGCGAGUCUC--------UUGGGUUA--------------CCC-------------GC-ACAGCUCUCACCGCGG-UGGCUGAUGGGAGGUG--GAGA--UA--------GAACGAG---GGUGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGC-GGGACGCGCUGG----------UGGC--GGUUGGUG----UGGAGA----------ACUCUGCGAGUCUC--------UUGGGUUA--------------CCC-------------GC-ACAGCUCUCACCGCGG-UGGCUGAUGGGAGGUG--GAGA--UA--------GAACGAG---GGUGUCGGCCA-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGC-GGGACGCGCUGG----------UGGC--GGUUGGUG----UGGAGA----------ACUCUGCGAGUCUC--------UUGGGUU |
| view | Shrew |
A--------------------UCACCCGCCGGCACCGCCCCUGGCCGCAGUUGGCCGACGGGAGGCA--GAGC--GCC-------GAGCGAG---GGUGUCGGCUU-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGUGGGGGGGCGGUGG----------UGGC--CGUUGAGU----CGGAAG----------AGUGGGCGC--------------------A--------------------UCACCCGCCGGCACCGCCCCUGGCCGCAGUUGGCCGACGGGAGGCA--GAGC--GCC-------GAGCGAG---GGUGUCGGCUU-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGUGGGGGGGCGGUGG----------UGGC--CGUUGAGU----CGGAAG----------AGUGGGCGC--------------------A--------------------UCACCCGCCGGCACCGCCCCUGGCCGCAGUUGGCCGACGGGAGGCA--GAGC--GCC-------GAGCGAG---GGUGUCGGCUU-UUUUGUGUCUGU-----------UUCCUGUGGGGGGGCGGUGG----------UGGC--CGUUGAGU----CGGAAG----------AGUGGGCGC-------------------- |
| view | Rat |
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| view | Tenrec |
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| view | Opossum |
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| view | Platypus |
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| view | Chicken |
A--------------GCCC----CCCUUCCCGCCGCA-------GCGCGG-UGCGCGCUGGGAGCUCGGGGGC--GGCCGUGCCAGGAGGUG---CGUGGCGGCCA-UUUUGUGCCUGCUUGGGUCUGCGCGGCCGC-GACU-GCGGGCG----------CUGC--GGCUCGGC----GGGGAA---------------------------------------A--------------GCCC----CCCUUCCCGCCGCA-------GCGCGG-UGCGCGCUGGGAGCUCGGGGGC--GGCCGUGCCAGGAGGUG---CGUGGCGGCCA-UUUUGUGCCUGCUUGGGUCUGCGCGGCCGC-GACU-GCGGGCG----------CUGC--GGCUCGGC----GGGGAA---------------------------------------A--------------GCCC----CCCUUCCCGCCGCA-------GCGCGG-UGCGCGCUGGGAGCUCGGGGGC--GGCCGUGCCAGGAGGUG---CGUGGCGGCCA-UUUUGUGCCUGCUUGGGUCUGCGCGGCCGC-GACU-GCGGGCG----------CUGC--GGCUCGGC----GGGGAA--------------------------------------- |
| view | Lizard |
U--------------CUCC----CAACACUGUCCGCACGCCU--GCGCAU-UGCAUUCUGGGAAUCCGAGAGUUAGGC-------GGAGG--------AGCGGCCA-UUUUGUGGAUGU-----------CGGCGGA-GAGA-GCGGGAGGGUAACUUUUGUGU--AGCUGGUC----------GUCGUCAGAU-----------------------------U--------------CUCC----CAACACUGUCCGCACGCCU--GCGCAU-UGCAUUCUGGGAAUCCGAGAGUUAGGC-------GGAGG--------AGCGGCCA-UUUUGUGGAUGU-----------CGGCGGA-GAGA-GCGGGAGGGUAACUUUUGUGU--AGCUGGUC----------GUCGUCAGAU-----------------------------U--------------CUCC----CAACACUGUCCGCACGCCU--GCGCAU-UGCAUUCUGGGAAUCCGAGAGUUAGGC-------GGAGG--------AGCGGCCA-UUUUGUGGAUGU-----------CGGCGGA-GAGA-GCGGGAGGGUAACUUUUGUGU--AGCUGGUC----------GUCGUCAGAU----------------------------- |
| view | Frog |
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| view | Zebrafish |
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| view | Stickleback |
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| view | Tetradon |
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| view | Fugu |
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| view | Medaka |
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