Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
GC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGGGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACCGC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGGGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACCGC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGGGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACC |
| view | Chimp |
GC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGGGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCGA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGCGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACCGC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGGGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCGA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGCGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACCGC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGGGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCGA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGCGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACC |
| view | Rhesus |
GC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGAGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACCGC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGAGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACCGC-AG---------------------GCUCAGGUUGGGA--GGAGUGGAGAGCCUGGUUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGCC--AC-------------------------------ACU---CUCCCUC-----CUCUGGUG-----AU--GUG--ACC |
| view | Bushbaby |
GA-AG---------------------ACGCAGGUAAGGA--GGAGUGAGAAGCUGGGUCA------GACC-UGGCUCA-GACUUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUAAGUCAGGGGCC--AA-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCC--CU-----GU--GUG--ACCGA-AG---------------------ACGCAGGUAAGGA--GGAGUGAGAAGCUGGGUCA------GACC-UGGCUCA-GACUUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUAAGUCAGGGGCC--AA-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCC--CU-----GU--GUG--ACCGA-AG---------------------ACGCAGGUAAGGA--GGAGUGAGAAGCUGGGUCA------GACC-UGGCUCA-GACUUCAGCUACACAAGCUGAUGGACUAAGUCAGGGGCC--AA-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCC--CU-----GU--GUG--ACC |
| view | Tree Shrew |
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| view | Horse |
GC-UG---------------------ACUCAGGUUGAGA--GGAG-GGGGAGCC-AGUAA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGUCCAAG-------------------------------GCU---CUCCCUU-----CUCCAGCU-----GU--GUG--ACCGC-UG---------------------ACUCAGGUUGAGA--GGAG-GGGGAGCC-AGUAA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGUCCAAG-------------------------------GCU---CUCCCUU-----CUCCAGCU-----GU--GUG--ACCGC-UG---------------------ACUCAGGUUGAGA--GGAG-GGGGAGCC-AGUAA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUACAAGCUGAUGGACUGAGUCAGGGGUCCAAG-------------------------------GCU---CUCCCUU-----CUCCAGCU-----GU--GUG--ACC |
| view | Armadillo |
GC-AG---------------------GCUCAAGUCAGGA--GGAGCAGGGAGCCUAGCCA------GACC-CAGCUCA-GACCUCAGCUAGGCAUGCCGAGGGGCUGAAUUGGG-GGCCAAG-------------------------------GCUUCCCACCCUC-----CUUCAGCC-----AU--GUG--GCCGC-AG---------------------GCUCAAGUCAGGA--GGAGCAGGGAGCCUAGCCA------GACC-CAGCUCA-GACCUCAGCUAGGCAUGCCGAGGGGCUGAAUUGGG-GGCCAAG-------------------------------GCUUCCCACCCUC-----CUUCAGCC-----AU--GUG--GCCGC-AG---------------------GCUCAAGUCAGGA--GGAGCAGGGAGCCUAGCCA------GACC-CAGCUCA-GACCUCAGCUAGGCAUGCCGAGGGGCUGAAUUGGG-GGCCAAG-------------------------------GCUUCCCACCCUC-----CUUCAGCC-----AU--GUG--GCC |
| view | Cat |
GC-UG---------------------ACUCGGGCUGAGA--GAAG-GGGGAGCC-UGGUC------AACU-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUAUA-GCUGAUGGGCUGAGUCAGAGGGCCGAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GUGCAUG--CCCGC-UG---------------------ACUCGGGCUGAGA--GAAG-GGGGAGCC-UGGUC------AACU-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUAUA-GCUGAUGGGCUGAGUCAGAGGGCCGAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GUGCAUG--CCCGC-UG---------------------ACUCGGGCUGAGA--GAAG-GGGGAGCC-UGGUC------AACU-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUAUA-GCUGAUGGGCUGAGUCAGAGGGCCGAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GUGCAUG--CCC |
| view | Dog |
GU-GG---------------------ACCCCGGCUGCGA--CGAG-GGGGAGCC-UGGCC------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCCCCAUA-GCUGAUGGGCUGAGUCAG-GGGCCAAG-------------------------------GCU---C-CCCUC-----GUCCAG-----------GCG--CCCGU-GG---------------------ACCCCGGCUGCGA--CGAG-GGGGAGCC-UGGCC------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCCCCAUA-GCUGAUGGGCUGAGUCAG-GGGCCAAG-------------------------------GCU---C-CCCUC-----GUCCAG-----------GCG--CCCGU-GG---------------------ACCCCGGCUGCGA--CGAG-GGGGAGCC-UGGCC------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCCCCAUA-GCUGAUGGGCUGAGUCAG-GGGCCAAG-------------------------------GCU---C-CCCUC-----GUCCAG-----------GCG--CCC |
| view | Elephant |
AC-AG---------------------GCUCAGAUUGGGA--GCAGG-GGGAGCCUGGCUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUAUAAGCUGAUGAACUGAGUCAGGGAGCCAAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CCCCAGCU-----GU--GUG--ACCAC-AG---------------------GCUCAGAUUGGGA--GCAGG-GGGAGCCUGGCUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUAUAAGCUGAUGAACUGAGUCAGGGAGCCAAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CCCCAGCU-----GU--GUG--ACCAC-AG---------------------GCUCAGAUUGGGA--GCAGG-GGGAGCCUGGCUA------GACC-UGGCCCA-GACCUCAGCUAUAUAAGCUGAUGAACUGAGUCAGGGAGCCAAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CCCCAGCU-----GU--GUG--ACC |
| view | Cow |
GG-GG---------------------ACUUAGGCUGGGA--GGAG-GGGGAGCCCAGUUA------GACC-UGGCUUA-GACCUCAGCUUCACAAGCUGAUAGACUGAGUCAGGGGGCCAAA-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GU--GUG--ACCGG-GG---------------------ACUUAGGCUGGGA--GGAG-GGGGAGCCCAGUUA------GACC-UGGCUUA-GACCUCAGCUUCACAAGCUGAUAGACUGAGUCAGGGGGCCAAA-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GU--GUG--ACCGG-GG---------------------ACUUAGGCUGGGA--GGAG-GGGGAGCCCAGUUA------GACC-UGGCUUA-GACCUCAGCUUCACAAGCUGAUAGACUGAGUCAGGGGGCCAAA-------------------------------GCU---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GU--GUG--ACC |
| view | Rabbit |
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| view | Guinea Pig |
CU-GA---------------------CUCUGGG------------CAGAAAGCGUGG---------GACC-UGGUCCACAGCUGUAACUG-----------------AGUCAGA-GUC--AA-------------------------------GCU---CCCCCCCUGCCACUCA---------UU--GUGUCAU-CU-GA---------------------CUCUGGG------------CAGAAAGCGUGG---------GACC-UGGUCCACAGCUGUAACUG-----------------AGUCAGA-GUC--AA-------------------------------GCU---CCCCCCCUGCCACUCA---------UU--GUGUCAU-CU-GA---------------------CUCUGGG------------CAGAAAGCGUGG---------GACC-UGGUCCACAGCUGUAACUG-----------------AGUCAGA-GUC--AA-------------------------------GCU---CCCCCCCUGCCACUCA---------UU--GUGUCAU- |
| view | HedgeHog |
GUCAG---------------------ACUUAAGCUCGAG--GGGG-GGAAGUCU-GGUUG------GACC-UGGCCCU-GACCACAGCGACAUCAACUGCUGGACAAGGUCAGGCUACCAAG-------------------------------GCU---CUCCCCC-----CUCCAGCU-----AU--GUG--GCCGUCAG---------------------ACUUAAGCUCGAG--GGGG-GGAAGUCU-GGUUG------GACC-UGGCCCU-GACCACAGCGACAUCAACUGCUGGACAAGGUCAGGCUACCAAG-------------------------------GCU---CUCCCCC-----CUCCAGCU-----AU--GUG--GCCGUCAG---------------------ACUUAAGCUCGAG--GGGG-GGAAGUCU-GGUUG------GACC-UGGCCCU-GACCACAGCGACAUCAACUGCUGGACAAGGUCAGGCUACCAAG-------------------------------GCU---CUCCCCC-----CUCCAGCU-----AU--GUG--GCC |
| view | Mouse |
GU-CG---------------------UGUGGGGU-GGGA--GGAACAGUGAGCCUGGUUC------AACC-UGAUCCA-GGC-----------------------------------C--AC-------------------------------ACU---GCCUCCU-----CUCA---------CU--GUG--AC-GU-CG---------------------UGUGGGGU-GGGA--GGAACAGUGAGCCUGGUUC------AACC-UGAUCCA-GGC-----------------------------------C--AC-------------------------------ACU---GCCUCCU-----CUCA---------CU--GUG--AC-GU-CG---------------------UGUGGGGU-GGGA--GGAACAGUGAGCCUGGUUC------AACC-UGAUCCA-GGC-----------------------------------C--AC-------------------------------ACU---GCCUCCU-----CUCA---------CU--GUG--AC- |
| view | Shrew |
GU-AC---------------------ACUCGGGCAGAAG--UGGG-GAA--CCU-GGUUA------GACCCUGGCUCU-GACCUCAGCUACAGAGGCUGAUGGACAGAGUGGCGUGGUGGAGAGCGGGGGUAGGGAGUGGGGGGUGGGGGCAAGCC---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GU--GUG--GCUGU-AC---------------------ACUCGGGCAGAAG--UGGG-GAA--CCU-GGUUA------GACCCUGGCUCU-GACCUCAGCUACAGAGGCUGAUGGACAGAGUGGCGUGGUGGAGAGCGGGGGUAGGGAGUGGGGGGUGGGGGCAAGCC---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GU--GUG--GCUGU-AC---------------------ACUCGGGCAGAAG--UGGG-GAA--CCU-GGUUA------GACCCUGGCUCU-GACCUCAGCUACAGAGGCUGAUGGACAGAGUGGCGUGGUGGAGAGCGGGGGUAGGGAGUGGGGGGUGGGGGCAAGCC---CUCCCUC-----CUCCAGCU-----GU--GUG--GCU |
| view | Rat |
GU-CU---------------------UGUGAGGU-GGGA--GGAACAGAGAGCCUGGUUC------AACC-UGAUUCG-GGUCUCAGCUAAAGAAACUGAUAGACAGAGUCAG--GCC--AC-------------------------------ACU---GCCUCCU-----CCCA---------CU--GUG--AC-GU-CU---------------------UGUGAGGU-GGGA--GGAACAGAGAGCCUGGUUC------AACC-UGAUUCG-GGUCUCAGCUAAAGAAACUGAUAGACAGAGUCAG--GCC--AC-------------------------------ACU---GCCUCCU-----CCCA---------CU--GUG--AC-GU-CU---------------------UGUGAGGU-GGGA--GGAACAGAGAGCCUGGUUC------AACC-UGAUUCG-GGUCUCAGCUAAAGAAACUGAUAGACAGAGUCAG--GCC--AC-------------------------------ACU---GCCUCCU-----CCCA---------CU--GUG--AC- |
| view | Tenrec |
=====------------------------------------------GGGAGCCGGGCAA------G-CC-UGGCCCA-AGCCUCAGCUACAC--GCUGAUGCGCAGAGCCAGG-CUCAGAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----UCCCAGCU-----GU--GUG--ACU=====------------------------------------------GGGAGCCGGGCAA------G-CC-UGGCCCA-AGCCUCAGCUACAC--GCUGAUGCGCAGAGCCAGG-CUCAGAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----UCCCAGCU-----GU--GUG--ACU=====------------------------------------------GGGAGCCGGGCAA------G-CC-UGGCCCA-AGCCUCAGCUACAC--GCUGAUGCGCAGAGCCAGG-CUCAGAG-------------------------------GCU---CUCCCUC-----UCCCAGCU-----GU--GUG--ACU |
| view | Opossum |
UC-AG---------------------GCCC---------------------UCCUAGUCACCGGGGGACC-UGGAUUU-AACCCUAACUCUGUG-GCUA--------ACUCGUGGACAUUCC-------------------------------GCU---UCCUUUC-----CUUAAGCCUCCUCUU--CUG--G--UC-AG---------------------GCCC---------------------UCCUAGUCACCGGGGGACC-UGGAUUU-AACCCUAACUCUGUG-GCUA--------ACUCGUGGACAUUCC-------------------------------GCU---UCCUUUC-----CUUAAGCCUCCUCUU--CUG--G--UC-AG---------------------GCCC---------------------UCCUAGUCACCGGGGGACC-UGGAUUU-AACCCUAACUCUGUG-GCUA--------ACUCGUGGACAUUCC-------------------------------GCU---UCCUUUC-----CUUAAGCCUCCUCUU--CUG--G-- |
| view | Platypus |
GC-AG===============================================================================================================================================================================================GC-AG===============================================================================================================================================================================================GC-AG=============================================================================================================================================================================================== |
| view | Chicken |
AA-AG---------------------UCUCCAGCCAGAGCCUGGGCCAGGGGCU--GUCA------GGUC----CUUG-UCCCUCAGCUCCCUGCCCUG--------=========================================================================================AA-AG---------------------UCUCCAGCCAGAGCCUGGGCCAGGGGCU--GUCA------GGUC----CUUG-UCCCUCAGCUCCCUGCCCUG--------=========================================================================================AA-AG---------------------UCUCCAGCCAGAGCCUGGGCCAGGGGCU--GUCA------GGUC----CUUG-UCCCUCAGCUCCCUGCCCUG--------========================================================================================= |
| view | Lizard |
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| view | Frog |
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| view | Zebrafish |
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| view | Stickleback |
=====AUUCAGCGUG----------------------------------------------------------================================================================================================================================AUUCAGCGUG----------------------------------------------------------================================================================================================================================AUUCAGCGUG----------------------------------------------------------=========================================================================================================================== |
| view | Tetradon |
=====ACC-------ACAGCAGAGGAAUGCAGACCUG------------------------------------================================================================================================================================ACC-------ACAGCAGAGGAAUGCAGACCUG------------------------------------================================================================================================================================ACC-------ACAGCAGAGGAAUGCAGACCUG------------------------------------=========================================================================================================================== |
| view | Fugu |
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| view | Medaka |
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