mir-622
chr13:89681417-89681552
View MI0003636 at mirBase
 

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Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

Species Sequence
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view Chimp AGCUGGCUGGGAAGAACUGAGAGAAGCUGGACAAGU--------------AUU--------------------------------GGUCUCAGCAGAUU--------------GAAGAG-AGCA-----------------------CCA-----CAGUGGUCAUCACACAGU------------------------CUGCUGAGGUUG-----------GAG----------------------------------------CUGCU-----------------AAGAU-------GACGCUCACGGAGCUGAGACAUACAGAGCUGGCUGGGAAGAACUGAGAGAAGCUGGACAAGU--------------AUU--------------------------------GGUCUCAGCAGAUU--------------GAAGAG-AGCA-----------------------CCA-----CAGUGGUCAUCACACAGU------------------------CUGCUGAGGUUG-----------GAG----------------------------------------CUGCU-----------------AAGAU-------GACGCUCACGGAGCUGAGACAUACAGAGCUGGCUGGGAAGAACUGAGAGAAGCUGGACAAGU--------------AUU--------------------------------GGUCUCAGCAGAUU--------------GAAGAG-AGCA-----------------------CCA-----CAGUGGUCAUCACACAGU------------------------CUGCUGAGGUUG-----------GAG----------------------------------------CUGCU-----------------AAGAU-------GACGCUCACGGAGCUGAGACAUACAG
view Rhesus AGCUGGCUCGGAAGAACUGAGAGGAGCUGGACAAGU--------------ACU--------------------------------GGUGUCAGCAGAUU--------------GAAGAG-AGGA-----------------------CCA-----CAGUGGUCACUGUGCAGU------------------------CCACUGAGGUUG-----------GAG----------------------------------------CUGCU-----------------GAGAU-------GACACUCACAGAGCUGAGACAUACAGAGCUGGCUCGGAAGAACUGAGAGGAGCUGGACAAGU--------------ACU--------------------------------GGUGUCAGCAGAUU--------------GAAGAG-AGGA-----------------------CCA-----CAGUGGUCACUGUGCAGU------------------------CCACUGAGGUUG-----------GAG----------------------------------------CUGCU-----------------GAGAU-------GACACUCACAGAGCUGAGACAUACAGAGCUGGCUCGGAAGAACUGAGAGGAGCUGGACAAGU--------------ACU--------------------------------GGUGUCAGCAGAUU--------------GAAGAG-AGGA-----------------------CCA-----CAGUGGUCACUGUGCAGU------------------------CCACUGAGGUUG-----------GAG----------------------------------------CUGCU-----------------GAGAU-------GACACUCACAGAGCUGAGACAUACAG
view Bushbaby =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Tree Shrew =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Horse =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Armadillo =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Cat =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Dog =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Elephant =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Cow =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Rabbit =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Guinea Pig =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view HedgeHog =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Mouse =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Shrew =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Rat =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Tenrec =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Opossum =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Platypus CACUGGUGGAGAACAAUCGGAGAGAUGUGG---AGA--------------GCU--------------------------------GGUUU--------A--------------GAGGAGUUGAA-----------------------CCAGCAGGUGGUGACCAGCUCAGAG-------------------------CAGCUGCAGU---------------G----------------------------------------CUGCC-----------------AGGCA-------GAGA-UCAUCGAGCUGAGACGCACCGCACUGGUGGAGAACAAUCGGAGAGAUGUGG---AGA--------------GCU--------------------------------GGUUU--------A--------------GAGGAGUUGAA-----------------------CCAGCAGGUGGUGACCAGCUCAGAG-------------------------CAGCUGCAGU---------------G----------------------------------------CUGCC-----------------AGGCA-------GAGA-UCAUCGAGCUGAGACGCACCGCACUGGUGGAGAACAAUCGGAGAGAUGUGG---AGA--------------GCU--------------------------------GGUUU--------A--------------GAGGAGUUGAA-----------------------CCAGCAGGUGGUGACCAGCUCAGAG-------------------------CAGCUGCAGU---------------G----------------------------------------CUGCC-----------------AGGCA-------GAGA-UCAUCGAGCUGAGACGCACCG
view Chicken =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
view Lizard UCCUGGCUCAGAAGAAUCUCGAGGAUUUGGACAAGU--------------AUU--------------------------------GGAGCCAGCAGGU-----------------GGAG-AGCA-----------------------CCG-----UCGUCAUCACCGAGCAUU------------------------CCAAAGACAUUGA----------GAA----------------------------------------GGCCC-----------------GUGCC-------AACA-UCACUGACCUGCGCCGCUCUGUCCUGGCUCAGAAGAAUCUCGAGGAUUUGGACAAGU--------------AUU--------------------------------GGAGCCAGCAGGU-----------------GGAG-AGCA-----------------------CCG-----UCGUCAUCACCGAGCAUU------------------------CCAAAGACAUUGA----------GAA----------------------------------------GGCCC-----------------GUGCC-------AACA-UCACUGACCUGCGCCGCUCUGUCCUGGCUCAGAAGAAUCUCGAGGAUUUGGACAAGU--------------AUU--------------------------------GGAGCCAGCAGGU-----------------GGAG-AGCA-----------------------CCG-----UCGUCAUCACCGAGCAUU------------------------CCAAAGACAUUGA----------GAA----------------------------------------GGCCC-----------------GUGCC-------AACA-UCACUGACCUGCGCCGCUCUG
view Frog GACUGGCACAAAAGAACCGCGAUGAUGUUGAGAAGU--------------GGUAUCAGUCUAAGGUAAGUCUCUGCUUGAGGAGGGAUCUAGGCAGAAU--------------AAACGG-AGUAUUUUGUAUCGGAGAAUAGGUUCCCUU-----UGUUAAUCCCCAUUCGCU------------------------CUUUACAGGUGGAU---------GAGCACACAGUGCAAGUUAACCUAGAUACAGAAGCGCUGCACUCUGCA-----------------AAGAG-------UUCCGUAACUGAUCUGCGCCGCACUGGACUGGCACAAAAGAACCGCGAUGAUGUUGAGAAGU--------------GGUAUCAGUCUAAGGUAAGUCUCUGCUUGAGGAGGGAUCUAGGCAGAAU--------------AAACGG-AGUAUUUUGUAUCGGAGAAUAGGUUCCCUU-----UGUUAAUCCCCAUUCGCU------------------------CUUUACAGGUGGAU---------GAGCACACAGUGCAAGUUAACCUAGAUACAGAAGCGCUGCACUCUGCA-----------------AAGAG-------UUCCGUAACUGAUCUGCGCCGCACUGGACUGGCACAAAAGAACCGCGAUGAUGUUGAGAAGU--------------GGUAUCAGUCUAAGGUAAGUCUCUGCUUGAGGAGGGAUCUAGGCAGAAU--------------AAACGG-AGUAUUUUGUAUCGGAGAAUAGGUUCCCUU-----UGUUAAUCCCCAUUCGCU------------------------CUUUACAGGUGGAU---------GAGCACACAGUGCAAGUUAACCUAGAUACAGAAGCGCUGCACUCUGCA-----------------AAGAG-------UUCCGUAACUGAUCUGCGCCGCACUG
view Zebrafish AGAUGGCCCUGAAGAACCAGGAGGAGCUGAAGGCCUGGCAUGAAUCUCAG------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================AGAUGGCCCUGAAGAACCAGGAGGAGCUGAAGGCCUGGCAUGAAUCUCAG------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================AGAUGGCCCUGAAGAACCAGGAGGAGCUGAAGGCCUGGCAUGAAUCUCAG------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================
view Stickleback AGACGGCUCUGCAGAACCAGGAAGAACUGAAAACAU--------------------------------------------------------------U--------------GACAAG-GGAA-----------------------CUA-----------UCGUGACAUAGUUGUUGCAUUGUGUCCUUAAUGUAGUCGGAAGCACUGAACCAGGAGGUGGC----------------------------------------CAUCAACACCGAGGUCAUCAAUACGUCCAAGUCUGAGC-UCACAGAUCUGAAGCGGACUCAGACGGCUCUGCAGAACCAGGAAGAACUGAAAACAU--------------------------------------------------------------U--------------GACAAG-GGAA-----------------------CUA-----------UCGUGACAUAGUUGUUGCAUUGUGUCCUUAAUGUAGUCGGAAGCACUGAACCAGGAGGUGGC----------------------------------------CAUCAACACCGAGGUCAUCAAUACGUCCAAGUCUGAGC-UCACAGAUCUGAAGCGGACUCAGACGGCUCUGCAGAACCAGGAAGAACUGAAAACAU--------------------------------------------------------------U--------------GACAAG-GGAA-----------------------CUA-----------UCGUGACAUAGUUGUUGCAUUGUGUCCUUAAUGUAGUCGGAAGCACUGAACCAGGAGGUGGC----------------------------------------CAUCAACACCGAGGUCAUCAAUACGUCCAAGUCUGAGC-UCACAGAUCUGAAGCGGACUC
view Tetradon AGAUUGGAGCAAAGAAUGCAGAAGACCUUAAAAGAU--------------------------------------------------------------CUGGUUCUCCUCCUAGACUGA-AGAA-----------------------CUA-AACAAAGAAGUCG---------------------------------CCGCCAGCACCGAG---------GAC----------------------------------------CUUCA--------GUCUUC---GCGCUCA-----GAGA-UCACAGAGGUCAAGCGGGUGCAGAUUGGAGCAAAGAAUGCAGAAGACCUUAAAAGAU--------------------------------------------------------------CUGGUUCUCCUCCUAGACUGA-AGAA-----------------------CUA-AACAAAGAAGUCG---------------------------------CCGCCAGCACCGAG---------GAC----------------------------------------CUUCA--------GUCUUC---GCGCUCA-----GAGA-UCACAGAGGUCAAGCGGGUGCAGAUUGGAGCAAAGAAUGCAGAAGACCUUAAAAGAU--------------------------------------------------------------CUGGUUCUCCUCCUAGACUGA-AGAA-----------------------CUA-AACAAAGAAGUCG---------------------------------CCGCCAGCACCGAG---------GAC----------------------------------------CUUCA--------GUCUUC---GCGCUCA-----GAGA-UCACAGAGGUCAAGCGGGUGC
view Fugu AGAUUGGAGUGAAGAAUGCAGAGGAUCUCAAAAGAU--------------------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================AGAUUGGAGUGAAGAAUGCAGAGGAUCUCAAAAGAU--------------------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================AGAUUGGAGUGAAGAAUGCAGAGGAUCUCAAAAGAU--------------------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================
view Medaka AGAUAGCACUAAAGAACCAGCAGGAAGUGAAAGCAU--------------------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================AGAUAGCACUAAAGAACCAGCAGGAAGUGAAAGCAU--------------------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================AGAUAGCACUAAAGAACCAGCAGGAAGUGAAAGCAU--------------------------------------------------------------=================================================================================================================================================================================================================================

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