Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
Species | Sequence | |
---|---|---|
view | Human |
CUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCUCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGAAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCUCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGAAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCUCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGAAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCC |
view | Chimp |
CUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCUGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCUGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCUGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCC |
view | Rhesus |
CUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACGGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGCGCAUCACG--GAGAAACAUAUAUCUUGGAAGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACGGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGCGCAUCACG--GAGAAACAUAUAUCUUGGAAGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACGGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGCGCAUCACG--GAGAAACAUAUAUCUUGGAAGCC |
view | Bushbaby |
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view | Tree Shrew |
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view | Horse |
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view | Armadillo |
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view | Cat |
CUGACAGA----UCUAC--------AAGAGGGG=====================================================================================================UCCCUAACACAGGCUCCAGG--UCAG-GGCAGA-UGUCCCGGGAAAACAUAGAUCUCUAAGACCUACUGACAGA----UCUAC--------AAGAGGGG=====================================================================================================UCCCUAACACAGGCUCCAGG--UCAG-GGCAGA-UGUCCCGGGAAAACAUAGAUCUCUAAGACCUACUGACAGA----UCUAC--------AAGAGGGG=====================================================================================================UCCCUAACACAGGCUCCAGG--UCAG-GGCAGA-UGUCCCGGGAAAACAUAGAUCUCUAAGACCUA |
view | Dog |
AUGAUAGAAAUGUCCAC--------AAGGGAGU----------GCU-GCC---------UCUG--G----CCAU-----------CCACGUUGCAUUCCUGUCUCAGCCCCUGUCCCCCAAG-AGCAGGAGUG-UUCCUGACAUAGCUUCCAGG--UCAG-ACCAGG-UGUCCUAG-AAAACCUAGAUCUCUAACACCUAAUGAUAGAAAUGUCCAC--------AAGGGAGU----------GCU-GCC---------UCUG--G----CCAU-----------CCACGUUGCAUUCCUGUCUCAGCCCCUGUCCCCCAAG-AGCAGGAGUG-UUCCUGACAUAGCUUCCAGG--UCAG-ACCAGG-UGUCCUAG-AAAACCUAGAUCUCUAACACCUAAUGAUAGAAAUGUCCAC--------AAGGGAGU----------GCU-GCC---------UCUG--G----CCAU-----------CCACGUUGCAUUCCUGUCUCAGCCCCUGUCCCCCAAG-AGCAGGAGUG-UUCCUGACAUAGCUUCCAGG--UCAG-ACCAGG-UGUCCUAG-AAAACCUAGAUCUCUAACACCUA |
view | Elephant |
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view | Cow |
-UGAGUGAGGCAACUGC-------------------------------CU---------CUUG--A----CCAU-----------UG-----GCAUUCCUGGGUCAGCUUCUGUCUCUGCCACGGCAGGAAGU-UUCCUAACACAGAGUCUACA--CUGG-GCCAGAAUGUCGUG--GGAACAGAGAUCUCUGAGGAUCU-UGAGUGAGGCAACUGC-------------------------------CU---------CUUG--A----CCAU-----------UG-----GCAUUCCUGGGUCAGCUUCUGUCUCUGCCACGGCAGGAAGU-UUCCUAACACAGAGUCUACA--CUGG-GCCAGAAUGUCGUG--GGAACAGAGAUCUCUGAGGAUCU-UGAGUGAGGCAACUGC-------------------------------CU---------CUUG--A----CCAU-----------UG-----GCAUUCCUGGGUCAGCUUCUGUCUCUGCCACGGCAGGAAGU-UUCCUAACACAGAGUCUACA--CUGG-GCCAGAAUGUCGUG--GGAACAGAGAUCUCUGAGGAUCU |
view | Rabbit |
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view | Guinea Pig |
CUGAUAAGGAUGUC-AA--------AGGAGAGC----------AGA-GUG---------CGUG--G-----CCC-----------AC-----AGCCUCUUAUCUCAAUA-----------------------------------CUGCUCCAGGAGUCAG-UGCAGAGCAUCACG--GGUAC-------CCCUAGUGCACCUGAUAAGGAUGUC-AA--------AGGAGAGC----------AGA-GUG---------CGUG--G-----CCC-----------AC-----AGCCUCUUAUCUCAAUA-----------------------------------CUGCUCCAGGAGUCAG-UGCAGAGCAUCACG--GGUAC-------CCCUAGUGCACCUGAUAAGGAUGUC-AA--------AGGAGAGC----------AGA-GUG---------CGUG--G-----CCC-----------AC-----AGCCUCUUAUCUCAAUA-----------------------------------CUGCUCCAGGAGUCAG-UGCAGAGCAUCACG--GGUAC-------CCCUAGUGCAC |
view | HedgeHog |
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view | Mouse |
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view | Shrew |
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view | Rat |
CUG-UGGAGAUGUCUGC--------AGCAAAGU----------GUA-GUA---------CCUG--GGUGUUCAU-----------CC-----UGCCUUGACUCCCAUUA-------------------------------------GCUCUGGGCAGCAGCUACCGUGUUCUGUG--GACAC----------UAGGGCAGCUG-UGGAGAUGUCUGC--------AGCAAAGU----------GUA-GUA---------CCUG--GGUGUUCAU-----------CC-----UGCCUUGACUCCCAUUA-------------------------------------GCUCUGGGCAGCAGCUACCGUGUUCUGUG--GACAC----------UAGGGCAGCUG-UGGAGAUGUCUGC--------AGCAAAGU----------GUA-GUA---------CCUG--GGUGUUCAU-----------CC-----UGCCUUGACUCCCAUUA-------------------------------------GCUCUGGGCAGCAGCUACCGUGUUCUGUG--GACAC----------UAGGGCAG |
view | Tenrec |
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view | Opossum |
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view | Platypus |
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view | Chicken |
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view | Lizard |
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view | Frog |
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view | Zebrafish |
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view | Stickleback |
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view | Tetradon |
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view | Fugu |
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view | Medaka |
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