Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
CUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCUCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGAAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCUCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGAAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCUCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGAAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCC |
| view | Chimp |
CUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCUGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCUGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCUGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACAGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGUGCAUCAUG--GAGAAACAUACAUCUUGGGGGCC |
| view | Rhesus |
CUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACGGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGCGCAUCACG--GAGAAACAUAUAUCUUGGAAGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACGGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGCGCAUCACG--GAGAAACAUAUAUCUUGGAAGCCCUGAGAGAGGUGUCUGC--------AGGAGAGC----------AUC-GUG---------CUUG--A----CCUU-----------CC-----ACGCUCCCGUGUCCACU--------------AGCAGGCAGGUUUUCUGACACGGGCUGCGGGAUUCAG-GACAGCGCAUCACG--GAGAAACAUAUAUCUUGGAAGCC |
| view | Bushbaby |
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| view | Tree Shrew |
CUGAUGGAGGUGUUGGC--------CGGAUGGC----------AGCAGAU---------CUUGUAA----CUCU-----------CC-----GUGUUCCUGUCUCAGCU--------------------CCUGUCUCC-----------ACUGGAGUCUG-GGCCGAGCGUCAUG--GA-AAGCACACCUCUUAGGGUGCCUGAUGGAGGUGUUGGC--------CGGAUGGC----------AGCAGAU---------CUUGUAA----CUCU-----------CC-----GUGUUCCUGUCUCAGCU--------------------CCUGUCUCC-----------ACUGGAGUCUG-GGCCGAGCGUCAUG--GA-AAGCACACCUCUUAGGGUGCCUGAUGGAGGUGUUGGC--------CGGAUGGC----------AGCAGAU---------CUUGUAA----CUCU-----------CC-----GUGUUCCUGUCUCAGCU--------------------CCUGUCUCC-----------ACUGGAGUCUG-GGCCGAGCGUCAUG--GA-AAGCACACCUCUUAGGGUGC |
| view | Horse |
CCGUUGGAAAUGUCCACCCGCUGCAGACGGAGA----------ACU-GCC---------CCAG--A----CCGU-----------CA-----GCAGUCCUGUCUCAGCUCCUGUCUCUCGGGUGGCAGGAAGGUUGUCUAACACACCCUCCAUG--UCAG-GGCAGA----------ACAUGUUGGGUCUCUGAGGAUUCCCGUUGGAAAUGUCCACCCGCUGCAGACGGAGA----------ACU-GCC---------CCAG--A----CCGU-----------CA-----GCAGUCCUGUCUCAGCUCCUGUCUCUCGGGUGGCAGGAAGGUUGUCUAACACACCCUCCAUG--UCAG-GGCAGA----------ACAUGUUGGGUCUCUGAGGAUUCCCGUUGGAAAUGUCCACCCGCUGCAGACGGAGA----------ACU-GCC---------CCAG--A----CCGU-----------CA-----GCAGUCCUGUCUCAGCUCCUGUCUCUCGGGUGGCAGGAAGGUUGUCUAACACACCCUCCAUG--UCAG-GGCAGA----------ACAUGUUGGGUCUCUGAGGAUUC |
| view | Armadillo |
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| view | Cat |
CUGACAGA----UCUAC--------AAGAGGGG=====================================================================================================UCCCUAACACAGGCUCCAGG--UCAG-GGCAGA-UGUCCCGGGAAAACAUAGAUCUCUAAGACCUACUGACAGA----UCUAC--------AAGAGGGG=====================================================================================================UCCCUAACACAGGCUCCAGG--UCAG-GGCAGA-UGUCCCGGGAAAACAUAGAUCUCUAAGACCUACUGACAGA----UCUAC--------AAGAGGGG=====================================================================================================UCCCUAACACAGGCUCCAGG--UCAG-GGCAGA-UGUCCCGGGAAAACAUAGAUCUCUAAGACCUA |
| view | Dog |
AUGAUAGAAAUGUCCAC--------AAGGGAGU----------GCU-GCC---------UCUG--G----CCAU-----------CCACGUUGCAUUCCUGUCUCAGCCCCUGUCCCCCAAG-AGCAGGAGUG-UUCCUGACAUAGCUUCCAGG--UCAG-ACCAGG-UGUCCUAG-AAAACCUAGAUCUCUAACACCUAAUGAUAGAAAUGUCCAC--------AAGGGAGU----------GCU-GCC---------UCUG--G----CCAU-----------CCACGUUGCAUUCCUGUCUCAGCCCCUGUCCCCCAAG-AGCAGGAGUG-UUCCUGACAUAGCUUCCAGG--UCAG-ACCAGG-UGUCCUAG-AAAACCUAGAUCUCUAACACCUAAUGAUAGAAAUGUCCAC--------AAGGGAGU----------GCU-GCC---------UCUG--G----CCAU-----------CCACGUUGCAUUCCUGUCUCAGCCCCUGUCCCCCAAG-AGCAGGAGUG-UUCCUGACAUAGCUUCCAGG--UCAG-ACCAGG-UGUCCUAG-AAAACCUAGAUCUCUAACACCUA |
| view | Elephant |
CUGGCAUAAAUGUCUGU--------AAGAGAG-UCAUGCUAAGAGA-GUGUAACCACAUCUUU--A----UUUC-----------CA-----GCAUUCAUGUCUCACCUCCUGUCUGUGAU--GGUAGAAAGGU-UCUCUACCCAUACUCCAGUUGUCAG-GGUAGCCCAUCAUGG-AAAAAAUAGAUCUCUGAGGAUCCCUGGCAUAAAUGUCUGU--------AAGAGAG-UCAUGCUAAGAGA-GUGUAACCACAUCUUU--A----UUUC-----------CA-----GCAUUCAUGUCUCACCUCCUGUCUGUGAU--GGUAGAAAGGU-UCUCUACCCAUACUCCAGUUGUCAG-GGUAGCCCAUCAUGG-AAAAAAUAGAUCUCUGAGGAUCCCUGGCAUAAAUGUCUGU--------AAGAGAG-UCAUGCUAAGAGA-GUGUAACCACAUCUUU--A----UUUC-----------CA-----GCAUUCAUGUCUCACCUCCUGUCUGUGAU--GGUAGAAAGGU-UCUCUACCCAUACUCCAGUUGUCAG-GGUAGCCCAUCAUGG-AAAAAAUAGAUCUCUGAGGAUCC |
| view | Cow |
-UGAGUGAGGCAACUGC-------------------------------CU---------CUUG--A----CCAU-----------UG-----GCAUUCCUGGGUCAGCUUCUGUCUCUGCCACGGCAGGAAGU-UUCCUAACACAGAGUCUACA--CUGG-GCCAGAAUGUCGUG--GGAACAGAGAUCUCUGAGGAUCU-UGAGUGAGGCAACUGC-------------------------------CU---------CUUG--A----CCAU-----------UG-----GCAUUCCUGGGUCAGCUUCUGUCUCUGCCACGGCAGGAAGU-UUCCUAACACAGAGUCUACA--CUGG-GCCAGAAUGUCGUG--GGAACAGAGAUCUCUGAGGAUCU-UGAGUGAGGCAACUGC-------------------------------CU---------CUUG--A----CCAU-----------UG-----GCAUUCCUGGGUCAGCUUCUGUCUCUGCCACGGCAGGAAGU-UUCCUAACACAGAGUCUACA--CUGG-GCCAGAAUGUCGUG--GGAACAGAGAUCUCUGAGGAUCU |
| view | Rabbit |
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| view | Guinea Pig |
CUGAUAAGGAUGUC-AA--------AGGAGAGC----------AGA-GUG---------CGUG--G-----CCC-----------AC-----AGCCUCUUAUCUCAAUA-----------------------------------CUGCUCCAGGAGUCAG-UGCAGAGCAUCACG--GGUAC-------CCCUAGUGCACCUGAUAAGGAUGUC-AA--------AGGAGAGC----------AGA-GUG---------CGUG--G-----CCC-----------AC-----AGCCUCUUAUCUCAAUA-----------------------------------CUGCUCCAGGAGUCAG-UGCAGAGCAUCACG--GGUAC-------CCCUAGUGCACCUGAUAAGGAUGUC-AA--------AGGAGAGC----------AGA-GUG---------CGUG--G-----CCC-----------AC-----AGCCUCUUAUCUCAAUA-----------------------------------CUGCUCCAGGAGUCAG-UGCAGAGCAUCACG--GGUAC-------CCCUAGUGCAC |
| view | HedgeHog |
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| view | Mouse |
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| view | Shrew |
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| view | Rat |
CUG-UGGAGAUGUCUGC--------AGCAAAGU----------GUA-GUA---------CCUG--GGUGUUCAU-----------CC-----UGCCUUGACUCCCAUUA-------------------------------------GCUCUGGGCAGCAGCUACCGUGUUCUGUG--GACAC----------UAGGGCAGCUG-UGGAGAUGUCUGC--------AGCAAAGU----------GUA-GUA---------CCUG--GGUGUUCAU-----------CC-----UGCCUUGACUCCCAUUA-------------------------------------GCUCUGGGCAGCAGCUACCGUGUUCUGUG--GACAC----------UAGGGCAGCUG-UGGAGAUGUCUGC--------AGCAAAGU----------GUA-GUA---------CCUG--GGUGUUCAU-----------CC-----UGCCUUGACUCCCAUUA-------------------------------------GCUCUGGGCAGCAGCUACCGUGUUCUGUG--GACAC----------UAGGGCAG |
| view | Tenrec |
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| view | Opossum |
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| view | Platypus |
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| view | Chicken |
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| view | Lizard |
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| view | Frog |
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| view | Zebrafish |
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| view | Stickleback |
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| view | Tetradon |
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| view | Fugu |
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| view | Medaka |
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