Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
UA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-CUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGAAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCACCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACAUA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-CUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGAAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCACCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACAUA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-CUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGAAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCACCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACA |
| view | Chimp |
UA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-CUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGGAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCACCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACAUA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-CUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGGAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCACCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACAUA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-CUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGGAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCACCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACA |
| view | Rhesus |
UA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUCUG------UGA-----------------------------------------------ACGUA--UUCUUGUGUU-CUGU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGAAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCAUCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACAUA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUCUG------UGA-----------------------------------------------ACGUA--UUCUUGUGUU-CUGU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGAAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCAUCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACAUA-AGUAAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUCUG------UGA-----------------------------------------------ACGUA--UUCUUGUGUU-CUGU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AGAAAAUUUGUGUGAUCUA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCAUCUGCAG-ACUGGUGCCAGUCCACA |
| view | Bushbaby |
UG-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------UAGAAAGUCUUG--------------------------------------------------------AAGAG--UCCUUGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGUUUAC-------------------AAAAAUAUGGU-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGGCUG--G-ACUGCUGCCAGUCCACAUG-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------UAGAAAGUCUUG--------------------------------------------------------AAGAG--UCCUUGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGUUUAC-------------------AAAAAUAUGGU-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGGCUG--G-ACUGCUGCCAGUCCACAUG-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------UAGAAAGUCUUG--------------------------------------------------------AAGAG--UCCUUGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGUUUAC-------------------AAAAAUAUGGU-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGGCUG--G-ACUGCUGCCAGUCCACA |
| view | Tree Shrew |
AA-AAUGAUG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUCAUG--------------------------------------------------------AGGUA--UUCUUAU--U-UUUU----------------------AAAUUA---------GUGCCUUU-------------------UAAAAUGUGGU------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UUCUG--G-GCAGGUAUUAGUCUUCUAA-AAUGAUG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUCAUG--------------------------------------------------------AGGUA--UUCUUAU--U-UUUU----------------------AAAUUA---------GUGCCUUU-------------------UAAAAUGUGGU------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UUCUG--G-GCAGGUAUUAGUCUUCUAA-AAUGAUG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUCAUG--------------------------------------------------------AGGUA--UUCUUAU--U-UUUU----------------------AAAUUA---------GUGCCUUU-------------------UAAAAUGUGGU------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UUCUG--G-GCAGGUAUUAGUCUUCU |
| view | Horse |
UGCAAUGAGA-------------UUUUC---------------------------CAAGAAGU-------------------------------------------------------------------UUCUUGCAUU-AUCU----------------------ACAUCU---------CU-CCUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UAAAAUACGGU--------------------CUAUGG-ACUGAUGCUACUCCAUAUGCAAUGAGA-------------UUUUC---------------------------CAAGAAGU-------------------------------------------------------------------UUCUUGCAUU-AUCU----------------------ACAUCU---------CU-CCUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UAAAAUACGGU--------------------CUAUGG-ACUGAUGCUACUCCAUAUGCAAUGAGA-------------UUUUC---------------------------CAAGAAGU-------------------------------------------------------------------UUCUUGCAUU-AUCU----------------------ACAUCU---------CU-CCUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UAAAAUACGGU--------------------CUAUGG-ACUGAUGCUACUCCAUA |
| view | Armadillo |
GG-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAAAAGGUUAUU------UCA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA------------GCUUU-------------------CAAAAAAGGG-U-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGG-ACUGAUUCCAGUCCAUAGG-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAAAAGGUUAUU------UCA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA------------GCUUU-------------------CAAAAAAGGG-U-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGG-ACUGAUUCCAGUCCAUAGG-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAAAAGGUUAUU------UCA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA------------GCUUU-------------------CAAAAAAGGG-U-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGG-ACUGAUUCCAGUCCAUA |
| view | Cat |
GG-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUAGUA------UUA-----------------------------------------------AGGUA--UUUUUUCAUU-UUCU----------------------AUAUCC---------GUGCUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UAAAAUAUGGC--------------------CCAUGG-ACUGGUACUAGUCCAGAGG-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUAGUA------UUA-----------------------------------------------AGGUA--UUUUUUCAUU-UUCU----------------------AUAUCC---------GUGCUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UAAAAUAUGGC--------------------CCAUGG-ACUGGUACUAGUCCAGAGG-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUAGUA------UUA-----------------------------------------------AGGUA--UUUUUUCAUU-UUCU----------------------AUAUCC---------GUGCUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UAAAAUAUGGC--------------------CCAUGG-ACUGGUACUAGUCCAGA |
| view | Dog |
GG-AACGAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUAGUAUCCUUA-----------------------------------------------CUAUAACUCCUUUCAUU-UUCU----------------------AGAUCA---------GUGUUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGAACAUGGA--------------------CUAUAG-AAUGCUACUAAUCCACAGG-AACGAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUAGUAUCCUUA-----------------------------------------------CUAUAACUCCUUUCAUU-UUCU----------------------AGAUCA---------GUGUUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGAACAUGGA--------------------CUAUAG-AAUGCUACUAAUCCACAGG-AACGAGG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUAUAGUAUCCUUA-----------------------------------------------CUAUAACUCCUUUCAUU-UUCU----------------------AGAUCA---------GUGUUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAGAACAUGGA--------------------CUAUAG-AAUGCUACUAAUCCACA |
| view | Elephant |
GG-GAGUCUG-------------UCCCUGUAACAAUUUACAGCCUUGGAAAACU-UAUGGGGCACUU------CUACUCUGUCAUAUAGGGUCAGUGUGACUCGGAAUUGACUUGACAGCCACAGGUU--UGGUUUUGGUUAUAUCAAAAAUACGUGGGAGGGAGGGAGAUUUUCCGAAAGGUU-CUCUU-------------------CAAAAUAUGG-U-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGG-ACUUGUGCCAGUCCACAGG-GAGUCUG-------------UCCCUGUAACAAUUUACAGCCUUGGAAAACU-UAUGGGGCACUU------CUACUCUGUCAUAUAGGGUCAGUGUGACUCGGAAUUGACUUGACAGCCACAGGUU--UGGUUUUGGUUAUAUCAAAAAUACGUGGGAGGGAGGGAGAUUUUCCGAAAGGUU-CUCUU-------------------CAAAAUAUGG-U-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGG-ACUUGUGCCAGUCCACAGG-GAGUCUG-------------UCCCUGUAACAAUUUACAGCCUUGGAAAACU-UAUGGGGCACUU------CUACUCUGUCAUAUAGGGUCAGUGUGACUCGGAAUUGACUUGACAGCCACAGGUU--UGGUUUUGGUUAUAUCAAAAAUACGUGGGAGGGAGGGAGAUUUUCCGAAAGGUU-CUCUU-------------------CAAAAUAUGG-U-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGG-ACUUGUGCCAGUCCACA |
| view | Cow |
GG-AGUGAUG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUUUA------UUA-----------------------------------------------AGGUA--UCCUUGCAUU-AUCU----------------------AGAGUA---------GAGCUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UGAAACGUAGU--------------------CUGUGG-ACCAGUGCUCGUCCACAGG-AGUGAUG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUUUA------UUA-----------------------------------------------AGGUA--UCCUUGCAUU-AUCU----------------------AGAGUA---------GAGCUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UGAAACGUAGU--------------------CUGUGG-ACCAGUGCUCGUCCACAGG-AGUGAUG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAGUUUUA------UUA-----------------------------------------------AGGUA--UCCUUGCAUU-AUCU----------------------AGAGUA---------GAGCUUUU-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------UGAAACGUAGU--------------------CUGUGG-ACCAGUGCUCGUCCACA |
| view | Rabbit |
AA-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------CGAAAAGUUAUA------UAA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-AUCU----------------------ACAUCA---------GU============================================================================================================================================================================================CUGUGG-ACUGGGGUCAGUUCUCAAA-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------CGAAAAGUUAUA------UAA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-AUCU----------------------ACAUCA---------GU============================================================================================================================================================================================CUGUGG-ACUGGGGUCAGUUCUCAAA-AGUGAGG-------------UUUUC---------------------------CGAAAAGUUAUA------UAA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUUGUGUU-AUCU----------------------ACAUCA---------GU============================================================================================================================================================================================CUGUGG-ACUGGGGUCAGUUCUCA |
| view | Guinea Pig |
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| view | HedgeHog |
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| view | Mouse |
GA-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAAGUGUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUGGUAUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AAAAAUAAAGU--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCGCAG-ACCAAUGCCAGUCCACAGA-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAAGUGUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUGGUAUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AAAAAUAAAGU--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCGCAG-ACCAAUGCCAGUCCACAGA-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAAAAAAGUGUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUGGUAUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGCUUUU-------------------AAAAAUAAAGU--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCGCAG-ACCAAUGCCAGUCCACA |
| view | Shrew |
GG-AGAGAGG-------------UUUUC---------------------------CCAAAAGUAGCA------UUA-----------------------------------------------AGGU---UUCAUGUGUU-AUCU----------------------AGAGAA---------GUGUUUUUAUGAUACAAGGUUAAUAGUGGAGAACAGAUGUAGCUUGGUGGUAGAACACAUACUUUGCCUGUAUAAGUUCUUGAUUUUAGUUCUAGCCGCCACCUUCUCCCCCCAGAUGAAUGGAUUAGAACUACAGGCAAUAACAUUAAUACACCCCAAUAAAAUGGGAU--------------------UUAU-G-AGUGGUACUAAUCCACAGG-AGAGAGG-------------UUUUC---------------------------CCAAAAGUAGCA------UUA-----------------------------------------------AGGU---UUCAUGUGUU-AUCU----------------------AGAGAA---------GUGUUUUUAUGAUACAAGGUUAAUAGUGGAGAACAGAUGUAGCUUGGUGGUAGAACACAUACUUUGCCUGUAUAAGUUCUUGAUUUUAGUUCUAGCCGCCACCUUCUCCCCCCAGAUGAAUGGAUUAGAACUACAGGCAAUAACAUUAAUACACCCCAAUAAAAUGGGAU--------------------UUAU-G-AGUGGUACUAAUCCACAGG-AGAGAGG-------------UUUUC---------------------------CCAAAAGUAGCA------UUA-----------------------------------------------AGGU---UUCAUGUGUU-AUCU----------------------AGAGAA---------GUGUUUUUAUGAUACAAGGUUAAUAGUGGAGAACAGAUGUAGCUUGGUGGUAGAACACAUACUUUGCCUGUAUAAGUUCUUGAUUUUAGUUCUAGCCGCCACCUUCUCCCCCCAGAUGAAUGGAUUAGAACUACAGGCAAUAACAUUAAUACACCCCAAUAAAAUGGGAU--------------------UUAU-G-AGUGGUACUAAUCCACA |
| view | Rat |
GA-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAGAAA-GUGUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUGGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGAUUUU-------------------AAAAAUAAAGU--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGCAG-ACUAAUGCCAGUCCACCGA-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAGAAA-GUGUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUGGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGAUUUU-------------------AAAAAUAAAGU--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGCAG-ACUAAUGCCAGUCCACCGA-AGGGAAG-------------UUUUC---------------------------CAGAAA-GUGUG------UGA-----------------------------------------------AGGUA--UUCUGGUGUU-AUCU----------------------AGAUCA---------GUGAUUUU-------------------AAAAAUAAAGU--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGCAG-ACUAAUGCCAGUCCACC |
| view | Tenrec |
GG-AGAAAAGACCUGGCAGUUUGUUCUUGUAAAGAUCGACAACCUUGGGAGCCUGCAGGGGGCAAUU------CUACCUUGUGCUGUCGAGUUGCUCUGAGUCCGAACCCACUGGCCAGAGAGAGGUC--UGGUUUGGGU-GUAUCAGAAA---GUGUGUGCUGAGGGGAUUU-----GGAGGU-UGUUU-------------------CCAAAUAGGGGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGGGACUUGCGCCAGUCCCCAGG-AGAAAAGACCUGGCAGUUUGUUCUUGUAAAGAUCGACAACCUUGGGAGCCUGCAGGGGGCAAUU------CUACCUUGUGCUGUCGAGUUGCUCUGAGUCCGAACCCACUGGCCAGAGAGAGGUC--UGGUUUGGGU-GUAUCAGAAA---GUGUGUGCUGAGGGGAUUU-----GGAGGU-UGUUU-------------------CCAAAUAGGGGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGGGACUUGCGCCAGUCCCCAGG-AGAAAAGACCUGGCAGUUUGUUCUUGUAAAGAUCGACAACCUUGGGAGCCUGCAGGGGGCAAUU------CUACCUUGUGCUGUCGAGUUGCUCUGAGUCCGAACCCACUGGCCAGAGAGAGGUC--UGGUUUGGGU-GUAUCAGAAA---GUGUGUGCUGAGGGGAUUU-----GGAGGU-UGUUU-------------------CCAAAUAGGGGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CUGUGGGACUUGCGCCAGUCCCCA |
| view | Opossum |
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| view | Platypus |
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| view | Chicken |
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| view | Lizard |
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| view | Frog |
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| view | Zebrafish |
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| view | Stickleback |
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| view | Tetradon |
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| view | Fugu |
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| view | Medaka |
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