Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
C-----CCCAGU-U---UGUCUGUAGAACAG----------UAUCAUG-----------------AA-----------------------------------------------UUAGA--------------------------------------------------------AA----------------------------------CCU---ACUUAUU----------------------ACAU-AGUUUA--------CAUA--------------AGAAGCGUGAUGAU-GCUG-------------CUG---------------------------------------AUG------CUGUAAUA-UCUAGUCUCU-GUUGAU |
| view | Chimp |
U-----CCUAGU-U---UGUCUGUAGAACAG----------UAUCAUG-----------------AA-----------------------------------------------UUAGA--------------------------------------------------------AA----------------------------------CCU---ACUUAUU----------------------ACAU-AGUUUA--------CAUA--------------AGAAGCGUGAUGAU-GCUG-------------CUG---------------------------------------AUG------CUGUGAUA-UCUAGUCUCU-GUUGAU |
| view | Rhesus |
C-----CCCAGU-UGUUUGCCUGUAGAACAG----------UAUCAUG-----------------AA-----------------------------------------------UUAGA--------------------------------------------------------AA----------------------------------CCU---ACUUAUU----------------------ACAU-AGUAUA--------CAUA--------------AGAAGCAUGAUGAU-GAUG-------------CUG---------------------------------------AUG------CUGUCAUA-UCUAGUCUCU-ACCGAU |
| view | Bushbaby |
C-----CCCAGA-UGUUUUCCUAUAGAACAG----------UGUCAUG-----------------AA-----------------------------------------------UUAAA--------------------------------------------------------UG--------------------------------UGCUU---UCCAGCU----------------------ACAA-GGUCUA--------CGGAGAACUUAAAGUCAAACAAGUUUGGUGAC-GAUU-------------------------------------------------------AUG------GUGUGAAG-CUCAGUCU--------- |
| view | Tree Shrew |
C-----CCCAGA-UGUUUCCCCAUCAAACAG----------UACCAUG-----------------CA-----------------------------------------------GUAAA--------------------------------------------------------UGCACUUUCUA--------------------GCAUGUUU---AUUAAUC----------------------ACAU-AGUGAA-G-----GCAUG--------------ACAAGUAUGACGAC-GAU-----------------------------------------------------------------------UA-CCUAGUCACCAGCUGAU |
| view | Horse |
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| view | Armadillo |
C-----CCAUAA-UGUAUUCC--------------------CACAGUG---------CACCGUCCAG-----------------------------------------------UUGCA--------------------------------------------------------CA--------------------------------GACCU---GUUUAUG----------------------CUGU-AAUACA-UUUAAAGUGUG------------------AUAUUAUAAU-A-----------------------------------------------------------UU------CUCUGAUA-CCUAAUUACCAUUUGUU |
| view | Cat |
C-----CCCAGA-UGUUUUCCCAUAGAAUAA----------UAUUAUGCAUU-------------AA-----------------------------------------------GUACA------------------------------------------------CUUUCCA-GGCAC--------------------------AAAAGCUU---AUUUGUU----------------------GCAU-ACUAUA-CUUCAAGUAUA-----------------AAUGUGAUGAU-AAUC-------------------------------------------------------CUG------UUGUGCUA-UCUAGUCACCAUAUGAU |
| view | Dog |
C-----CCCCCA-UGUUUUCCUAUGGAACAG----------UAUUGUGUAUU-------------AA-----------------------------------------------GUACA------------------------------------------------CUUUCCA-GGUA----------------------------AAAGCCU---ACUUAUU----------------------ACAU-ACUA------CAAGUAUA-----------------AAUAUGAAUGU-AAUC-------------------------------------------------------CUA------UUGUGGUAAUCUAGAUACCAUAUGAU |
| view | Elephant |
C-----CUGAAA-UGUUUUCU-GUAGAACAG----------CAUAGUGAAUUAAGUGUACUUUCCAU-----------------------------------------------CCACA--------------------------------------------------------AA--------------------------------AGCCU---GUUUAUU----------------------AUAU-AAUAUA-UUUAAAGUGGA------------------GUAUUAUGAU-AAGU-------------------------------------------------------GUG------CUGUGAUA-CCUAAUCAUCAUUUGAU |
| view | Cow |
C-----CCCAGA-UAUUUUCCCAU-----------------UGUCAUGUAUU-------------AA-----------------------------------------------GCAUA------------------------------------------------CUUCCCA-GGUAU--------------------------AAACCCCU---GUUUAUC----------------------AUAUUAAUAUA-CUUAAAGUAUA-----------------AGUAUGAUGAU-AAUU-------------------------------------------------------AUG------UUA------UCUAGUCACCUUGUGAU |
| view | Rabbit |
CAGUUACCCAGA-UG--GUUUUCCCAAACAG----------CAUCAUGAAUUAAAUGUGCAUUCCAG-----------------------------------------------CCACA--------------------------------------------------------AA-----------------------------------AUUGUAUUUAUU----------------------ACAC-AGUAUA-CU----GUGUA--------------UAAGGUAUAGUAAG-UCUG-------------CUG---------------------------------------GUGAUAAUGGUGUGAUA-CCUGGUCACCAUUUGAU |
| view | Guinea Pig |
G------CCAGCCUC--UUCCCAUAGAAC------------------------------------AG-----------------------------------------------CCACA------------------------------------------------U-------GG-----------------------------------CU---UUUUAUG----------------------ACAU-AGCACA-CCUGCAGUACA--------------CUGCACAUGGUGAU-GCUG-------------CUG------------------------------------------------CUGGGACA-UCCGGCCAC-AUCUGAU |
| view | HedgeHog |
U-----CCCCAA-GUGCUUCACAUAGAAUAUCUGUUCAUUUUACUUUAUUUU-------------AAUUUUUUAUUUGUGAUUAUAGUGGGUCACAGGAUUGUAGGAUUACAGGGUAUAGUUCCACACCACACCCACCACCCAAAUUUUGUGUCCCCUCCCUCCUACCUUCCCAAGGUAACUACCAUAGUUUUCAUAAAUCUUAGAAACAGUUU---GCUUAUUUCUAUUUUUGUUUAGCAAGUUCCCAU-AGGAUUUCUUGAAGUAUA-----------------UGUAUUUUUUU-UUUUUAGUCACAAAAGCCUAUUUAUCACCUGAUACACUCAAAGUAUAAAUAUUAUAAUUAUG------UGGUGGUA------GCACCAUUUUAU |
| view | Mouse |
C------UCAGA-UG--UUUCUGUAGAAU------------------------------------GG-----------------------------------------------CCACA--------------------------------------------------------AG-----------------------------------CU---AUUUAUU----------------------ACAU-GCUGUA-UUUCGUGUGCG--------------CUAGGUGUGAUGGUUACUG-------------CU-------------------------------------------------CUGUGGUA-UCCAUACACUAUUUAAU |
| view | Shrew |
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| view | Rat |
C------UCAGC-UG--UUUCUGUAGAA-------------------------------------GG-----------------------------------------------CCACA--------------------------------------------------------AG-----------------------------------CU---AUUUCUU----------------------ACAU-GCUGUA-CUUCGUGUGUG--------------CGAGGUGUAAUGGUUACUG-------------UU-------------------------------------------------CUGCAGUA-UCCAUUCACUCUUUGAU |
| view | Tenrec |
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| view | Opossum |
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| view | Platypus |
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| view | Chicken |
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| view | Lizard |
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| view | Frog |
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| view | Zebrafish |
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| view | Stickleback |
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| view | Tetradon |
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| view | Fugu |
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| view | Medaka |
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