Color Code: mir sequence mir* sequence predicted mir* mutation
| Species | Sequence | |
|---|---|---|
| view | Human |
GGGGCUCC-GC-----------------GCUCCU------AGUCUCCACUGCUGCCG---------CCGUC----------GCCGC---------------C---------ACCCG--AGCCGGAGCGGGCUGGGCCGCC------AAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUUG-AGGUGUCUGA |
| view | Chimp |
GGGGCUCC-GC-----------------GCACCG------AGUCUCCACUGCUGCCA---------CCGUC----------GCCGC---------------C---------ACCCG--AGCCGGAGCGGGCUGGGCCGCC------AAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUUG-AGGUGUCUGA |
| view | Rhesus |
GGGGCUCC-GC-----------------GCACCA------AGUCUCCAGCGCCGCCG---------CCGUC----------GCCGC---------------C---------AACCG--AGCCGUAGCGGGCUGGGCCGCC------AAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUUG-AGGUGUCUGA |
| view | Bushbaby |
GGAGCUCC-UC-----------------G-ACAG------UGUCUUGGGUACUCCCU---------CCACC----------GCCGC---------------C---------ACCGG--AGCCUUAGCGGGCUGGGCCGCU------GAGGC------------------AAGAUGGUUGGACUACAGCGUGUGGGGACCACAUCGGAGGUGUCUGA |
| view | Tree Shrew |
GGGGCUCC-GA-----------------GGGCCG------AGUUUCCAGAACUGCCG---------CCGCC----------GCCGCUGCUGCCGCCGCUGCC---------AGCGG--AGCCUGACCAAGCUGGGCCGCC------GAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUAUAGUGUGUGGG-ACCACAUCG-AGGUGUCGGA |
| view | Horse |
GGGGCUCG-GC-----------------GGGCAG------AGCCUCCAGCGCUGCAG---------CCGCC----------GCCGC---------------CGGAGCCGGAGCCGG--AGCCGGAGCGGGCUGGGCCGCC------GAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUCG-AGGUGUCUGA |
| view | Armadillo |
======================================================================================================================================================================================================================== |
| view | Cat |
====NUCC-CC-----------------UUCC----------UUUCCC------CCU---------CCCCC----------CCUCC---------------C------------------CCGGCCCGGG====================================================================================== |
| view | Dog |
GGGGCUCC-GC-----------------AGGCCG------AGUCUCCC------CCG---------CUGCC----------GCCGC---------------CAGAGUCAGACCCGG--AGCCGGAGCGGGCUGAGCCGCC------GAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUCG-AGGUGUCUGA |
| view | Elephant |
GGGGCCCC-GC-----------------G-GCCG------UGUCUUCACCGCUGCAG---------CCGCC----------ACCGC---------------C---------GCGGG--AGCCGGAGCGGGCUGGGCCGCU------GAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUCG-AAGUAUCUGA |
| view | Cow |
======================================================================================================================================================================================================================== |
| view | Rabbit |
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| view | Guinea Pig |
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| view | HedgeHog |
======================================================================================================================================================================================================================== |
| view | Mouse |
GGGGCUCG-CC-----------------GAGCGG------ACUCUCUAGCCCUUGUGGGUCCCUGUUCAGC----------GCCGA---------------G---------CCCCG--GGAGCCAGU---CCGGGCCUCC------GAAGC-----------------GAAGAUGGU-GGACUACAGCGUUUGGG-AUCACAUCG-AGGUGUCGGA |
| view | Shrew |
======================================================================================================================================================================================================================== |
| view | Rat |
GGGGCGGG-GC-----------------GAGCGG------ACUCUCUAGCCCUUGUGGGUCCCUGUUCAGC----------GCCGA---------------G---------ACCCG--GGAGCCAGU---CCGGGCCUCC------GAGGC-----------------GAAGAUGGU-GGACUACAGCGUUUGGG-AUCACAUCG-AGGUGUCGGA |
| view | Tenrec |
GGGGUUCCAGU-----------------G-GCCG------AGUCUCC----------------------------------GUCGC---------------C---------GCGGG--AGCCGUAGCGGACAGGGCCGCU------GAGGC------------------AAGAUGGU-GGACUACAGUGUGUGGA-ACCACAUCG-AGGUGUCAGA |
| view | Opossum |
GGGCUGGG-GCCAAGCUGGAGCGAGUGGGGGCCG------G---------GCCGGAG---------GCGCC----------GCAGC---------------C---------GCUGGGAAGCCGAGCUAGGUCGGUCUG--------GCGCC------------------AAGAUGGU-GGAUUACAGCGUGUGGG-ACCACAUCG-AGGUGUCGGA |
| view | Platypus |
GGGG-----GC-----------------GGGGCC------AGGAUCAAGCUCCAGCU---------CUUGC----------UCCGC---------------U----------CCGG--AGGCGC------CUCGGCCGCU------AGGAGCGGCUCCGCAGCCCGACGAAGAUGGU-GGACUACAGCGUGUGGG-AUCACAUCG-AGGUGUCGGA |
| view | Chicken |
======================================================================================================================================================================================================================== |
| view | Lizard |
====================================================================================GA---------------C---------GCACG--AGGCAUAGCGGAACGAGCCGCCCUAGCUACAGC------------------GCCAUGGU-GGAUUACAGCGUGUGGG-AUCACAUCG-AGGUGUCCGA |
| view | Frog |
==================================================================================================================================--------------------C------------------ACAAUGGU-GGAUUAUAGCGUGUGGG-ACCACAUUG-AAGUUUCUGA |
| view | Zebrafish |
====================================================================================GC---------------G---------ACUCA--CGCCACAACCGACCAUG-----------ACGAC-------------------------U-CGACUACAGUGUGUGGG-AUCAUAUCG-AGGUGUCCGA |
| view | Stickleback |
GGGU--CU-UC-----------------GUUCGGCCCAGUAACUUC-----------------------CCCGCUAGCCGAGCCAU---------------C---------UCCGA--AGCUAACGCUGCUCGGUCCUC-------ACUGG---------------------AGAAU-AGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUUG-AGGUGUCGGA |
| view | Tetradon |
====--CC-UC-----------------G-----------AACUUC-----------------------CC----------GUCAC---------------U---------UCUCA--UGCUAACGUCGCCUGUGCUUCCU-----GCAGG----------------------------GAUUACAGCGUCUGGG-AUCACAUUU-ACGUGUCCGA |
| view | Fugu |
============================================================================================================================================================================---AU-AGACUACAGCGUGUGGG-ACCACAUUG-AGGUGUCAGA |
| view | Medaka |
============================================================================================================================================================================AGGAU-AGAUUACAGCGUGUGGG-AUCACAUUG-AGGUAUCGGA |
