(1) AGO1.ip OTHER.mut | (2) AGO2.ip | (1) B-CELL | (4) BRAIN | (9) BREAST | (31) CELL-LINE | (2) CERVIX | (5) HEART | (2) OTHER | (1) RRP40.ip | (25) SKIN | (1) TESTES |
GGCGCAAGCTGAAGCCGCAGGCCCGGCCTGTCTGTGGCCTGCACAGCGTGGTGAGGCCTGACCCTTTCCTCCTGCAGGAAACAGGACTTTTTCCTGCCTCCCCAGCACAGCCCCCCTGGTCTCCAGCGTATCTGGAAGGGGCAGGATGACAAGGGGAGGTGGGGGCTGTCTCCTGGGGGGAGGAGACCCTGCTCTCCCTGGCAGCAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGATTAGCCCATCGGATGGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAGGTGAAGAACTG .........................................................................((((((...(((.......((..(((((((....((.(((((((....(((((.....))))))))))..)).))....)))))))..)).((((((....((((((((.((...)).))))))))))))))...))).)))))).......................................................... .......................................................................72........................................................................................................................................................226................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189782 | SRR207114(GSM721076) IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown. (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189786 | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330883(SRX091721) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR189784 | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | SRR033712(GSM497057) Burkitt Lymphoma (BL510). (B cell) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | DRR000556(DRX000314) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR330913(SRX091751) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR330922(SRX091760) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | DRR000557(DRX000315) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR330879(SRX091717) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330860(SRX091698) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR038855(GSM458538) D10. (cell line) | SRR330917(SRX091755) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR040009(GSM532894) G727T. (cervix) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR095854(SRX039177) miRNA were isolated from FirstChoice Human Br. (brain) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR189783 | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | SRR330906(SRX091744) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR444058(SRX128906) Sample 16cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (skin) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR191499(GSM715609) 6genomic small RNA (size selected RNA from to. (breast) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR191604(GSM715714) 74genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | DRR000559(DRX000317) THP-1 whole cell RNA, no treatment. (cell line) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR060982(GSM569186) Human centrocyte [09-001]. (cell line) | SRR060983(GSM569187) Human pre-germinal center B cell [09-001]. (cell line) | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR038856(GSM458539) D11. (cell line) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR107297(GSM677704) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR314796(SRX084354) Total RNA, fractionated (15-30nt). (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330907(SRX091745) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR330904(SRX091742) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR029128(GSM416757) H520. (cell line) | SRR444057(SRX128905) Sample 15cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC . (skin) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGT................................................. | 23 | 1 | 35.00 | 12.00 | 1.00 | - | 8.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGTT................................................ | 24 | 1 | 26.00 | 12.00 | - | 11.00 | - | - | - | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................GGAAACAGGACTTTTACTG..................................................................................................................................................................................... | 19 | 20.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAG.................................................. | 22 | 1 | 12.00 | 12.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................TCCTGGGGGGAGGAGACCCTGCT................................................................................... | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................CTGGGGGGAGGAGACCCTGCT................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................CTGGGGGGAGGAGACCCTGCTA.................................................................................. | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................................................................................TGGGGGCTGTCTCCTGGGGGGA............................................................................................... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCATT................................................. | 23 | 1 | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................CCTGGGGGGAGGAGACCCTGAA................................................................................... | 22 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCA................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAT.................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGCT................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 12.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCCGT................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................ATCTGGAAGGGGCAGGACGAC.............................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.............................................................................................................................................................................TGGGGGGAGGAGACCCTGCTGAAA............................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................CAACTTTGGGCAGGTGA....... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................GGAAACAGGACTTTTACT...................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
........................................................................................TTTTCCTGCCTCCCCTCG.......................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................CCTGTCTGTGGCCTGCTTT....................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGTTT............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTAAAA.................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................................................................................................................................................TCCTGGGGGGAGGAGACCCTGC.................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................................................................................................................................GGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAGGTGAAGA.... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................CCTGGGGGGAGGAGACCCTGAAA.................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................................................................................................................................................TCCTGGGGGGAGGAGACCCTGCTAAG................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................TCCTGGGGGGAGGAGACCCT...................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGA................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................CTGGGGGGAGGAGACCCTGCTT.................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................ACAAGGGGAGGTGGGGGCTGTCTCCTG..................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................................................................................................................................................................TGGGGGGAGGAGACCCTGCT................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCC.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................................................................................................................................................................................................ACTTTGGGCAGGTGAAGAACCGTG | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................................................................................................................................................................TCCCTGGCAGCAAGCCTCTCCTTA.......................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................................................................................................................................................................................................................ATCGGATGGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAGGT......... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTCCAG................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................................................................................................................................................................................................................................................AGGATCCTCAACTTTGGGCAGGGG........ | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.................................GTGGCCTGCACAGCGTG.................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................CTGGGGGGAGGAGACCCTGCTCGT................................................................................ | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................................................................................................................................................................................................................ATCGGATGGAAGGATCCTCC...................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................................................................TCGGATGGAAGGATCCTCAACTTTGGGC............. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CGGATGGAAGGATC.......................... | 14 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................................................................................................................................GGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAG........... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................................................................................................................................................................ATGGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAG........... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TGAGGCCTGACCCTTTCCTCCTG.......................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................................................................................TGGGGGCTGTCTCCTGGGAAA................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.............................................................................................................................................................................................................AAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGACT............................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................CCTGGGGGGAGGAGACCCTGCTTT................................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.................................................................................................................................................................GGGGCTGTCTCCTGGGGGGAGGA............................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................CTGGGGGGAGGAGACCCTGCTTCT................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCATT.................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................................................................................................................................................................TCCCTGGCAGCAAGCCTCCCCT............................................................ | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................CAAGCCTCTCCTGCCCTTCCTTT................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................CTGGGGGGAGGAGACCCTGCTAT................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................................................................CTCAACTTTGGGCAGG.......... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................................................................................................................................................................................................................................................AACTTTGGGCAGGTGAAGA.... | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
..............................................................................................................................CGTATCTGGAAGGGGC...................................................................................................................................... | 16 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
......................................................................................................................................GAAGGGGCAGGATGACA............................................................................................................................. | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................GGGCAGGATGACAAGG.......................................................................................................................... | 16 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.40 |
.................................................................................................................................................................................................................CTCTCCTGCCCTTCCAG.................................................. | 17 | 4 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
GGCGCAAGCTGAAGCCGCAGGCCCGGCCTGTCTGTGGCCTGCACAGCGTGGTGAGGCCTGACCCTTTCCTCCTGCAGGAAACAGGACTTTTTCCTGCCTCCCCAGCACAGCCCCCCTGGTCTCCAGCGTATCTGGAAGGGGCAGGATGACAAGGGGAGGTGGGGGCTGTCTCCTGGGGGGAGGAGACCCTGCTCTCCCTGGCAGCAAGCCTCTCCTGCCCTTCCAGATTAGCCCATCGGATGGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAGGTGAAGAACTG .........................................................................((((((...(((.......((..(((((((....((.(((((((....(((((.....))))))))))..)).))....)))))))..)).((((((....((((((((.((...)).))))))))))))))...))).)))))).......................................................... .......................................................................72........................................................................................................................................................226................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189782 | SRR207114(GSM721076) IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown. (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189786 | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR037942(GSM510480) 293DroshaTN_cand5. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330883(SRX091721) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR189784 | SRR037938(GSM510476) 293Red. (cell line) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR189787 | SRR033712(GSM497057) Burkitt Lymphoma (BL510). (B cell) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | DRR000556(DRX000314) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR330858(SRX091696) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330861(SRX091699) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR330913(SRX091751) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR330922(SRX091760) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | DRR000557(DRX000315) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR330879(SRX091717) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR207111(GSM721073) Whole cell RNA. (cell line) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577743(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330860(SRX091698) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR038855(GSM458538) D10. (cell line) | SRR330917(SRX091755) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR040009(GSM532894) G727T. (cervix) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR095854(SRX039177) miRNA were isolated from FirstChoice Human Br. (brain) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR189783 | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | SRR330906(SRX091744) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330887(SRX091725) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR444058(SRX128906) Sample 16cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (skin) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR191499(GSM715609) 6genomic small RNA (size selected RNA from to. (breast) | SRR330868(SRX091706) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR191604(GSM715714) 74genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | DRR000559(DRX000317) THP-1 whole cell RNA, no treatment. (cell line) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR060982(GSM569186) Human centrocyte [09-001]. (cell line) | SRR060983(GSM569187) Human pre-germinal center B cell [09-001]. (cell line) | SRR330862(SRX091700) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR038856(GSM458539) D11. (cell line) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR107297(GSM677704) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR314796(SRX084354) Total RNA, fractionated (15-30nt). (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | TAX577740(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330907(SRX091745) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR330904(SRX091742) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR029128(GSM416757) H520. (cell line) | SRR444057(SRX128905) Sample 15cDNABarcode: AF-PP-334: ACG CTC TTC . (skin) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
..............................................................................................................................................AGGATGACAAGGGGATCG.................................................................................................................... | 18 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................AGGATGACAAGGGGATCGC................................................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................................CCCCAGCACAGCCCCCCTGGCC........................................................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.................................................................................................CTCCCCAGCACAGCCCCCCAG.............................................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................AGGATGACAAGGGGAATG.................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................................................................................................CCAGATTAGCCCATCGTG.................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................AGGATGACAAGGGGAGATGC.................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................AGGATGACAAGGGGAATGC................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................AGGATGACAAGGGGATCGA................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................CCTGCTCTCCCTGGCAGCA...................................................................... | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |