| (1) AGO.mut | (2) AGO1.ip | (16) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (3) B-CELL | (27) BRAIN | (4) CELL-LINE | (2) DCR.mut | (3) DGCR8.mut | (11) EMBRYO | (9) ESC | (2) FIBROBLAST | (2) LIVER | (10) OTHER | (1) OTHER.mut | (1) PIWI.ip | (1) PIWI.mut | (5) SKIN | (3) SPLEEN | (9) TESTES | (1) TOTAL-RNA |
| TCAACATCCGAGAGAGCACTAGCTACATTGAAGAGCACATAGACCGGCAGGTGTGCACTGGGAGGCTGCGGATGAGGGCTAGAGGTGGGGCTGCCTGAGCAGGAAGAAGAGAAGACATGCATCCTGAAATGTCAGTCCTCTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGGTGTCGCCCATAGAGAGCCTACGCCTCATGTGCCTTTTGTCCATCACTGA ..........................................................................................((((....(((((((((((((((((..(((((......))).))....))))..)))))).))))))))))).................................................. ..........................................................................................91.....................................................................162................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR553603(SRX182809) source: Spermatids. (Spermatids) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR525243(SRA056111/SRX170319) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR525242(SRA056111/SRX170318) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR037930(GSM510468) e7p5_rep4. (embryo) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGT................................................. | 23 | 1 | 55.00 | 13.00 | 6.00 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCAG.................................................. | 22 | 1 | 13.00 | 13.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGT................................................. | 24 | 1 | 8.00 | 6.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAG.................................................. | 23 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TGAGCAGGAAGAAGAGAAGACA............................................................................................... | 22 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................CCTGAGCAGGAAGAAGAGAAGA................................................................................................. | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................CCTGAGCAGGAAGAAGAGAAG.................................................................................................. | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGC.................................................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCA................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................ACTCTTCCTTCCTGTGCAGTT................................................ | 21 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGTA................................................ | 24 | 1 | 3.00 | 13.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................TAGAGAGCCTACGCCTCATGTGCCTTTT............ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGC.................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGTT................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 13.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................AGCAGGAAGAAGAGAAGACATGT............................................................................................ | 23 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGCCGT................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................ACATTGAAGAGCACATAGACCGGCAGG................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGC................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGA................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................ACATTGAAGAGCACATAGACCGGCAG.................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................CTGGGAGGCTGCGGATGAGGGC..................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................AGCAGGAAGAAGAGAAGACATG............................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................TAGAGAGCCTACGCCTCATGTGCCTTTTGT.......... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TGAGCAGGAAGAAGAGAAGA................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................AGCAGGAAGAAGAGAAGACATGCATC......................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TACATTGAAGAGCACATAGACCGGCAGG................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................CCTGAGCAGGAAGAAGAGAAGACATG............................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................AGCAGGAAGAAGAGAAGACAT.............................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGA................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................AGAGGTGGGGCTGCCTGTG................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................CCTGAGCAGGAAGAAGAGAAGACA............................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................GCGGATGAGGGCTAGAGA............................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................GGGGCTGCCTGAGCAGGAAGAAGAGAAGACATGCA........................................................................................... | 35 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCAA.................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................CTGAGCAGGAAGAAGAGAAGA................................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGAA................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................CCTACGCCTCATGTGCCTTTTGT.......... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................TGAAGAGCACATAGACCGGCAGGTGTCGC........................................................................................................................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TTGACTCTTCCTTCCTGAGTT................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................ACTCTTCCTTCCTGTGCAGTTT............................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGAA................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................TTGAAGAGCACATAGACCGGCAGGGGTC............................................................................................................................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................TACATTGAAGAGCACC............................................................................................................................................................................. | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................CCTACGCCTCATGTGCCTTTTGTCCA....... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................AGCTACATTGAAGAGCACAT............................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......TCCGAGAGAGCACTAGCTACATTGAAGAGC................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................CAGGAAGAAGAGAAGACAT.............................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAT.................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................GCCTGAGCAGGAAGAAG....................................................................................................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................TGAGCAGGAAGAAGAGA.................................................................................................... | 17 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TGTGCACTGGGAGGCT................................................................................................................................................. | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGCCTGAGCAGGAAGA......................................................................................................... | 16 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TCAACATCCGAGAGAGCACTAGCTACATTGAAGAGCACATAGACCGGCAGGTGTGCACTGGGAGGCTGCGGATGAGGGCTAGAGGTGGGGCTGCCTGAGCAGGAAGAAGAGAAGACATGCATCCTGAAATGTCAGTCCTCTTGACTCTTCCTTCCTGTGCAGGTGTCGCCCATAGAGAGCCTACGCCTCATGTGCCTTTTGTCCATCACTGA ..........................................................................................((((....(((((((((((((((((..(((((......))).))....))))..)))))).))))))))))).................................................. ..........................................................................................91.....................................................................162................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR553603(SRX182809) source: Spermatids. (Spermatids) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR525243(SRA056111/SRX170319) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR023850(GSM307159) ZHBT-c40hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR525242(SRA056111/SRX170318) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR037930(GSM510468) e7p5_rep4. (embryo) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR685340(GSM1079784) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (dicer cell line) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................................................................................................................................AGAGCCTACGCCTCAGG.................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................GAAGAAGAGAAGACATAGT........................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................TGCAGGTGTCGCCCA........................................ | 15 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
| .........................................................................................................................TCCTGAAATGTCAGTC........................................................................... | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 |