| (1) AGO.mut | (2) AGO1.ip | (19) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (29) BRAIN | (5) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (8) EMBRYO | (7) ESC | (5) FIBROBLAST | (1) KIDNEY | (5) LIVER | (6) OTHER | (6) OTHER.mut | (4) PIWI.ip | (2) PIWI.mut | (5) SKIN | (2) SPLEEN | (20) TESTES | (2) THYMUS | (8) TOTAL-RNA |
| GGCTTCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAGGCTGCGCTGCCCCCAAGAGGTCAGTGTTGGCCCATGTGGGGGTGTTCAAGACTTGGGAACCTGGCTGATTTCTTACCTGGTTTCTGACCTGGATCCCCAGGGCTGTGGGGCTGCCTTCTCCAGCCTCATGGGTTATCAATACCACCAGCG .....................................................................((((.(((((....(((((((((.((.(((....))))).)))))))))..))))))))).................................................... ..............................................................63..................................................................131................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM510454(GSM510454) newborn_rep10. (total RNA) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR394084(GSM855970) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (dicer cell line) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR014237(GSM319961) 10 dpp MILI-KO total. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | RuiDcrWT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR306538(GSM750581) 19-24nt. (ago2 brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGA................................................. | 21 | 1 | 15.00 | 11.00 | 2.00 | - | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAG.................................................. | 20 | 1 | 11.00 | 11.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTA................................................ | 22 | 1 | 9.00 | 11.00 | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGA........................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGA........................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAAT................................................. | 21 | 5.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCATT................................................. | 21 | 5.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTT................................................ | 22 | 1 | 4.00 | 11.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................TGGGGGTGTTCAAGACTTGGGAACC......................................................................................... | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGG......................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGC................................................. | 21 | 1 | 3.00 | 11.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAGGC.................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTAT............................................... | 23 | 1 | 3.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGCA................................................ | 22 | 1 | 2.00 | 11.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGT........................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTTT............................................... | 23 | 1 | 2.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................TGGCTGATTTCTTACCTGG...................................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGAAT............................................... | 23 | 1 | 2.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................CAAGACTTGGGAACCTGGCTGA.................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAAA................................................. | 21 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGCAAA.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................CAGATGGGAAGGCTGGGG............................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTAGT.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTCAGTGTTGGCCCATGTGGGGGGGTT........................................................................................................ | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....CGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAGT..................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................AAGACTTGGGAACCTGGCT.................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................TGGTTTCTGACCTGGATCCCCAGT................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............CTGAAGCAGATGGGAAGGCTGC................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....CGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAG...................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TCAAGACTTGGGAACCTGGC..................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGAG................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........GGTGCTGAAGCAGATGGGAAGGCTGCGC............................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................GGTGTTCAAGACTTGGGAACC......................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAA....................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................ACCTGGCTGATTTCTCTAT......................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................GTGGGGGTGTTCAAGACTTGGGA............................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................AGATGGGAAGGCTGCGCTGCCCCC........................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTTA............................................... | 23 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....CGAAAGGTGCTGAAGCAGAT............................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCGGA................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTAGA.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....CGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAGGC.................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................TGGGGGTGTTCAAGACTTGGGAACCT........................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTTAT.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGAA................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCGAAAGGTGCTGAAGC................................................................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCAAGT................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....TCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAG...................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................TGGTTTCTGACCTGGATCCCCAG.................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGCAT............................................... | 23 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................TCAAGACTTGGGAACCTGGCTGA.................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAGGC.................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......GAAAGGTGCTGAAGCAGAT............................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGAAGA.............................................. | 24 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAA.................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................GCTGTGGGGCTGCCTTCTCCAGC.......................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................TTTCTGACCTGGATCCCCAGTAA............................................... | 23 | 1 | 1.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TCGAAAGGTGCTGAAGCAGA............................................................................................................................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GGCTTCGAAAGGTGCTGAAGCAGATGGGAAGGCTGCGCTGCCCCCAAGAGGTCAGTGTTGGCCCATGTGGGGGTGTTCAAGACTTGGGAACCTGGCTGATTTCTTACCTGGTTTCTGACCTGGATCCCCAGGGCTGTGGGGCTGCCTTCTCCAGCCTCATGGGTTATCAATACCACCAGCG .....................................................................((((.(((((....(((((((((.((.(((....))))).)))))))))..))))))))).................................................... ..............................................................63..................................................................131................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR306536(GSM750579) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | GSM510454(GSM510454) newborn_rep10. (total RNA) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR394084(GSM855970) "background strain: C57BL6/SV129cell type: KR. (dicer cell line) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR685339(GSM1079783) "Small RNAs (15-50 nts in length) from immort. (cell line) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR014237(GSM319961) 10 dpp MILI-KO total. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | SRR306526(GSM750569) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | RuiDcrWT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR037920(GSM510458) e12p5_rep2. (embryo) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR023851(GSM307160) ZHBT-c412hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR306529(GSM750572) 19-24nt. (ago2 brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR306538(GSM750581) 19-24nt. (ago2 brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................................................GTCAGTGTTGGCCCATTAG................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................GAAGGCTGCGCTGCCGCA........................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................GTCAGTGTTGGCCCAACTG................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |