| (1) B-CELL | (3) BRAIN | (8) CELL-LINE | (2) CERVIX | (1) LIVER | (2) OTHER | (2) SKIN |
| CAAGGGTTAGTTTCCAGGTGTTTGATAGGAAGCTTTCATCCCAAGTGGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTCGGGGGGAGTTTGTTGCATTATTTGACCAAGGACAGTGTTGACCACCTCCGGTTTCTACTTCTCTTTCGAAGTTTATTTTATGTTTTGTTGTGGTTTTCAGATTTCTCATGGTTTGGATTTGGGAAAGTAAAATCAAGACAAGGTGTTGGT ..................................................................................................(((((((..(((....(((((.(((......))).))))).)))..))))))).....(((((......))))).............................................................................. ...............................................................................................96......................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189784 | SRR343334 | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | SRR330883(SRX091721) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040016(GSM532901) G645N. (cervix) | SRR330910(SRX091748) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM532874(GSM532874) G699T. (cervix) | SRR343333(GSM796036) KSHV (HHV8). (cell line) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................................TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCAG.......................................................................................................................................................... | 34 | 12.00 | 0.00 | 6.00 | - | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATCATG............................................................................................................................................................. | 26 | 10.00 | 0.00 | 5.00 | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCAG.................................................................................................................................................................. | 33 | 9.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTCG......................................................................................................................................................... | 33 | 8.00 | 0.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCG.......................................................................................................................................................... | 32 | 8.00 | 0.00 | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATCATG................................................................................................................................................................. | 28 | 5.00 | 0.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATCTCG................................................................................................................................................................. | 28 | 5.00 | 0.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................TTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTGC............................................................................................................................................................. | 29 | 5.00 | 0.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCCAG..................................................................................................................................................... | 30 | 4.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................TATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTGC..................................................................................................................................................................... | 31 | 4.00 | 0.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTCG..................................................................................................................................................................... | 30 | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTGC..................................................................................................................................................................... | 30 | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCGGT............................................................................................................................................................. | 30 | 4.00 | 0.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCG.......................................................................................................................................................... | 33 | 3.00 | 0.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................TTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCAG.......................................................................................................................................................... | 35 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAACAG...................................................................................................................................................................... | 35 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCC.................................................................................................................................................................. | 33 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCCTG............................................................................................................................................................. | 34 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTAG......................................................................................................................................................................... | 32 | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................TATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCCAG..................................................................................................................................................... | 31 | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................TGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTCAAG....................................................................................................................................................................... | 33 | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................TTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTCGAG........................................................................................................................................................................... | 31 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................TGGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATC................................................................................................................................................................................ | 29 | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCACG..................................................................................................................................................... | 30 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................AGACAAGGTGTTGGTTGAT | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
| ...................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCCAG..................................................................................................................................................... | 34 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TGTTTTGTTGTGGTTTTCCCC................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | |
| ...................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCATG..................................................................................................................................................... | 34 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................TATTTTTGTCGGGGGGAGTTTGTTGC...................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCG....................................................................................................................................................................... | 32 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATCAAG............................................................................................................................................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTCAG..................................................................................................................................................................... | 34 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................TATGTTTTGTTGTGGGTG...................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................TGGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTTTAT............................................................................................................................................................................... | 30 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................GGGGGGAGTTTGTTGAACT................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | |
| ..............................................GGTTTGTTTATTTATTCTGC........................................................................................................................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................TGGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTC.............................................................................................................................................................................. | 31 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................GGGGGGAGTTTGTTGTAA.................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTCGAG................................................................................................................................................... | 32 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTCATG..................................................................................................................................................... | 30 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTTATCTAG............................................................................................................................................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................TGGTTTGTTTATTTATC............................................................................................................................................................................................ | 17 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................TTGTTTATTTATTTATTTATTCTTG................................................................................................................................................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................GTTTGTTTATTTATTTATTTATCC................................................................................................................................................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....GGTTAGTTTCCAGGTATTG................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................GGGGGGAGTTTGTTGTGT.................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................TTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTGGG............................................................................................................................................................................. | 29 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................TGGTTTGTTTATTTATTTATC........................................................................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................GTTTATTTATTTATTTATTTAACAG.............................................................................................................................................................................. | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................AGACAAGGTGTTGGTTG | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................................................CAAGACAAGGTGTTGGT | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................AAGTTTATTTTATGTTCTGC.............................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................GTTTGTTTATTTATTTATTTATTTAATG............................................................................................................................................................................... | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................ATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGGGGC.................................................................................................................................................... | 31 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................GTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTCG............................................................................................................................................................................. | 30 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................TTTATGTTTTGTTGTCGT........................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................GTTTATTTATTTATTTATTTATTTACAAG.......................................................................................................................................................................... | 29 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................................ATGGTTTGGATTTGGGA.......................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
| .............................................TGGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTAT............................................................................................................................................................................. | 32 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CAAGGGTTAGTTTCCAGGTGTTTGATAGGAAGCTTTCATCCCAAGTGGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTCGGGGGGAGTTTGTTGCATTATTTGACCAAGGACAGTGTTGACCACCTCCGGTTTCTACTTCTCTTTCGAAGTTTATTTTATGTTTTGTTGTGGTTTTCAGATTTCTCATGGTTTGGATTTGGGAAAGTAAAATCAAGACAAGGTGTTGGT ..................................................................................................(((((((..(((....(((((.(((......))).))))).)))..))))))).....(((((......))))).............................................................................. ...............................................................................................96......................................................................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR189777(GSM714637) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189775(GSM714635) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189778(GSM714638) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189776(GSM714636) cell line: HEK293clip variant: CLIPenzymatic . (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR189784 | SRR343334 | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | SRR330883(SRX091721) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040016(GSM532901) G645N. (cervix) | SRR330910(SRX091748) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM532874(GSM532874) G699T. (cervix) | SRR343333(GSM796036) KSHV (HHV8). (cell line) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................GTTTGTTTATTTATTTGATG....................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................GTTTTGTTGTGGTTTTCG................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................TGCAACAAACTCCCCC..................................................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................ATCTGAAAACCACAAC................................................ | 16 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................ATAAAATAAACTTCG..................................................................... | 15 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |