| (2) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (2) B-CELL | (7) BRAIN | (8) BREAST | (32) CELL-LINE | (2) FIBROBLAST | (1) HELA | (1) KIDNEY | (1) LIVER | (1) OTHER | (1) RRP40.ip | (16) SKIN | (1) UTERUS | (1) XRN.ip |
| ACGGGTGGCCACGGAAAGAGGCTACACGGCCCAGGGAGAGATGTTCTCAGGTGAGCTGGGTGACTGCATGCTCCATCATCTCTTCATGAGGCTGGGACCAGAGAGGCTGGGTGGGATGCTGGCAGCCGTGTGTCAGGGTGTCTCATTCCATTCTTTGGGCCCTTCCCACTGCCCAGTAGAGCAGAGAGGTTACAAGATGGACTTGAGCTGGCTGCCTAGGTTGCAAACCCAGCTCTGCCACCTCTTCGCTGGGGCCATGGACAAGCCACTCACGCTCTTTGTGCCTCATTTTCTGCATTTGTACCAAGGGGTGGAAGGTCATGGTGAGGGTTGGAAGCATCGCCCACTGTGAGCCCTCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAGCAAGCCCCCTCTGTGTGCTCTCACCCTGCAGTGGCCGATATGGGCAGGCTGGCCCAGGAGGTGCTGGGCTGCCAGGCCAAG .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((.((((..(((((((((.((........)).))))))))).)))).))).................................................... ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................352.........................................................412................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR387909(GSM843861) specific-host: Homo sapienshost cell line: Su. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR189786 | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR189782 | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR095854(SRX039177) "miRNA were isolated from FirstChoice Human B. (brain) | SRR330875(SRX091713) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR189784 | SRR015358(GSM380323) NaÌøve B Cell (Naive39). (B cell) | SRR189785 | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330891(SRX091729) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR330912(SRX091750) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038862(GSM458545) MM472. (cell line) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR039193(GSM494812) HL60 cell line is derived from acute promyelo. (cell line) | SRR330860(SRX091698) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000562(DRX000320) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago3 cell line) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR363674(GSM830251) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR191602(GSM715712) 60genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR094132(GSM651908) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330869(SRX091707) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR037876(GSM522374) fibroblasts_cell_culture. (fibroblast) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR037933(GSM510471) 293cand4_rep2. (cell line) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR191416(GSM715526) 34genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189787 | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR191608(GSM715718) 193genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR330919(SRX091757) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGT................................................. | 22 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGA................................................. | 22 | 1 | 8.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAG.................................................. | 21 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCA.................................................................................. | 24 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGAAA............................................... | 24 | 1 | 5.00 | 6.00 | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCACGGTGCTGGGCACATGCA.................................................................................. | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................AGATGGACTTGAGCTGGCTGCCTA.................................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 4.00 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGAAT............................................... | 24 | 1 | 3.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACGGTGCTGGGCACATGCAG................................................................................. | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAGTT............................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAGT................................................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGTGCTCTCACCCTGCAG.................................................. | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGTAT............................................... | 24 | 1 | 2.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGA................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................CTGGGACCAGAGAGGCTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................GTGTGTCAGGGTGTCCGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGAC................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACGGTGCTGGGCACATGCAGA................................................................................ | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCACGGTGCTGGGCACATGCAT................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGTAA............................................... | 24 | 1 | 1.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGTGCTCTCACCCTGCAGAA................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGAGCCCTCAGCACGGTGCTGG........................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAGC................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCACGGTGCTGGGCACATGCAGC................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................ACCCAGCTCTGCCACTGTC......................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCACGGTGCTGGGCACAAGAA.................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGAA................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTG..................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCCGT................................................................................ | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCACGGTGCTGGGCACATGCAG................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................AGGGAGAGATGTTCTCAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................CTCATTCCATTCTTTGATTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACGGTGCTGGGCACACG.................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................GTGACTGCATGCTCCAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................GTGACTGCATGCTCCACGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAGTC............................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGAAA................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................ACCCAGCTCTGCCACCTCTTCGCGGGG................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCACGGTGCTGGGCACATGC................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGAGGTGCTGGGCTGGTTT...... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATG.................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGTGCTCTCACCCTGCAGTT................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................TGGGACCAGAGAGGCTTAGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................CACGGCCCAGGGAGAGATG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGTGCTCTCACCCTGCAGT................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAG................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TACACGGCCCAGGGAGAGATGTT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................AGAGAGGCTGGGTGGGGTAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACAT..................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................AGAGGCTGGGTGGGATGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAT................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TACACGGCCCAGGGAGAGATGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCACGGTGCTGGGCACATGCC.................................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................GGGTGGGATGCTGGCAGTGCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................CTTCGCTGGGGCCATGGA......................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTACCAAGGGGTGG.................................................................................................................................................... | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................CCTCTTCGCTGGGG................................................................................................................................................................................................................ | 14 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGCTGGGCTGCCAGG..... | 17 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAGGCTGGCCCA......................... | 16 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGCCCAGGAGGTGC................. | 16 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................GTGACTGCATGCTCCCCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................GTGACTGCATGCTCCCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - |
| ...........................................................GTGACTGCATGCTCC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................GTGACTGCATGCTCCCCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 |
| ACGGGTGGCCACGGAAAGAGGCTACACGGCCCAGGGAGAGATGTTCTCAGGTGAGCTGGGTGACTGCATGCTCCATCATCTCTTCATGAGGCTGGGACCAGAGAGGCTGGGTGGGATGCTGGCAGCCGTGTGTCAGGGTGTCTCATTCCATTCTTTGGGCCCTTCCCACTGCCCAGTAGAGCAGAGAGGTTACAAGATGGACTTGAGCTGGCTGCCTAGGTTGCAAACCCAGCTCTGCCACCTCTTCGCTGGGGCCATGGACAAGCCACTCACGCTCTTTGTGCCTCATTTTCTGCATTTGTACCAAGGGGTGGAAGGTCATGGTGAGGGTTGGAAGCATCGCCCACTGTGAGCCCTCAGCACGGTGCTGGGCACATGCAGCAAGCCCCCTCTGTGTGCTCTCACCCTGCAGTGGCCGATATGGGCAGGCTGGCCCAGGAGGTGCTGGGCTGCCAGGCCAAG .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((.((((..(((((((((.((........)).))))))))).)))).))).................................................... ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................352.........................................................412................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR037941(GSM510479) 293DroshaTN. (cell line) | SRR387909(GSM843861) specific-host: Homo sapienshost cell line: Su. (cell line) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR037944(GSM510482) 293DcrTN_cand5. (cell line) | SRR189786 | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR189782 | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR095854(SRX039177) "miRNA were isolated from FirstChoice Human B. (brain) | SRR330875(SRX091713) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | DRR000558(DRX000316) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM416733(GSM416733) HEK293. (cell line) | SRR189784 | SRR015358(GSM380323) NaÌøve B Cell (Naive39). (B cell) | SRR189785 | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330891(SRX091729) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR037931(GSM510469) 293GFP. (cell line) | SRR330912(SRX091750) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | DRR001489(DRX001043) "Hela short nuclear cell fraction, control". (hela) | TAX577580(Rovira) total RNA. (breast) | SRR038862(GSM458545) MM472. (cell line) | DRR000555(DRX000313) "THP-1 whole cell RNA, no treatment". (cell line) | DRR000557(DRX000315) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR330889(SRX091727) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR039193(GSM494812) HL60 cell line is derived from acute promyelo. (cell line) | SRR330860(SRX091698) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000562(DRX000320) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago3 cell line) | SRR330884(SRX091722) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR363674(GSM830251) cell type: human foreskin fibroblasts (HFF)tr. (fibroblast) | SRR037934(GSM510472) 293cand4_rep3. (cell line) | SRR191602(GSM715712) 60genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR094132(GSM651908) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | TAX577741(Rovira) total RNA. (breast) | SRR029126(GSM416755) 143B. (cell line) | SRR330863(SRX091701) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | TAX577746(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330915(SRX091753) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330869(SRX091707) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | DRR000556(DRX000314) "THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment . (cell line) | SRR326282(GSM769512) "Dicer mRNA was knocked down using siDicer, t. (cell line) | SRR037876(GSM522374) fibroblasts_cell_culture. (fibroblast) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR037933(GSM510471) 293cand4_rep2. (cell line) | SRR330903(SRX091741) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR037936(GSM510474) 293cand1. (cell line) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR191416(GSM715526) 34genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR189787 | SRR037943(GSM510481) 293DcrTN. (cell line) | SRR029130(GSM416759) DLD2. (cell line) | SRR191608(GSM715718) 193genomic small RNA (size selected RNA from . (breast) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR029125(GSM416754) U2OS. (cell line) | SRR330919(SRX091757) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR330874(SRX091712) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .....................CTACACGGCCCAGGGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTCTCACCCTGCAAGGC............................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................GGCTGGGTGGGATGCGGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................AGCCGTGTGTCAGGGTGTCTCATTCCATTCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................GGGTGGGATGCTGGCATGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................CCTTCCCACTGCCCAGTCATA......................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACCCTGCAGTGGGGC............................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCCAGGAGGTGCTGGGCC........... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................................GCTCTGCCACCTCTTCGG..................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................GAGGCTGGGACCAGAGAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CCATTCTTTGGGCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 15 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - |
| ...................................................................................................AGAGAGGCTGGGTGGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - |