Conservation for all officially named mirtrons (showing only valid orthologous sequences)


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

mir-1003   chr3R:20484306-20484402
Species Sequence
dm2 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Sim1 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Sec1 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Yak2 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGTCGTGAGCT
Ere2 ACTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Ana3 GCTACGCCGAAGGTGAGTATAGTGGATGTGGGTGGCTCTTATTT--------GGCCGGTCCTCTCACATCTCCATATTCACAGGCGTCGAGAGCT
dp4 GCTACGTAGAAGGTGGGTATCGTGCTTGTGGGTGGCTCT----T--------GGTCAGTCCTCTCACATCTCTATATTCACAGGCGCCGCGAGTT
Per1 GCTACGTAGAAGGTGGGTATCGTGCTTGTGGGTGGCTCT----T--------GGTCAGTCCTCTCACATCTCTATATTCACAGGCGCCGCGAGTT
Wil1 GTTGCGCCGTAGGTGAGTATC-GGGTTGTGATTGGCTCC--TTG--------TGGTAGTCCTCTCACATCTCTATATTCACAGGCGTCGCGAGCT
Vir3 GCTGCGTCGTAGGTGAGTAAT-CAGTTGTGGGTGGCTTT----T--------TGAAAGCCCTCTCACATCTCTTTATTCACAGGCGGCGTGAGTT
Moj3 GCTGCGGCGCAGGTGAGTAAT-CAGTTGTGGGTGGCTCT----A--------GTGAAGCCCTCTCACATCTCTTTATTCACAGGCGGCGAGAGTT
Gri2 ATTGCGGCGCAGGTGAGTAAT-CAGTTGTGGGTGGCTTT----TGTTCTTAGGGAAAGCCCTCTCACATCTCTTTATTCACAGGCGGCGCGAATT

mir-1014   chr3R:27579225-27579333
Species Sequence
dm2 CCTTTTCTCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCAGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTTACTGGATACA
Sim1 CCTTCTCCCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCTGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTTACCGGATACA
Sec1 CCTTCTCCCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCTGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTTACCGGATACA
Yak2 CCTTTTCCCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCAGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTCACCGGATACA
Ere2 CCTTTTCGCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCAGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTCACCGGATACA
Ana3 CATTCTCCCAAGGTATAATGAAAATTGAT----TTTAATCACACGGATCGGAGTGGCAAAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTCACGGGATACA
dp4 CCTTCTCCCAAGGTACAATGGAAATAGAT----TTTAATCGGGTTTCGTTTGGCGGTGAAATTAAAATTCATTTTCATTTACAGTGACCGGCATCA
Per1 CCTTCTCCCAAGGTACAATGGAAATAGAT----TTTAATCGTGTTTCGTTTGGCGGTGAAATTAAAATTCATTTTCATTTACAGTGACCGGCATCA
Wil1 CTTTTTCTCAAGGTAAAGTACTAATAGATAAGATTAAAGCAC-----------TTTTAAGGACGCAATTTGTATACCTATGCAGTGACTGGCTTTA
Vir3 CATTCTCTCAAGGTATGT---ACATATTT----TTAAA------------------TTTAACCAGTATTTACTTTTGTTCACAGTGACCGGCATAA

mir-1005   chr2L:4343675-4343776
Species Sequence
dm2 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGGTTTTGGCACACGAATATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Sim1 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGTTTTTGGC-CACAAATATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Sec1 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGGTTTTGGCACACAAATGTAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Yak2 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGGTTTTGGCAGCCAAAAATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Ere2 CCATTCTGACCTGTGAGTTCATCGATTTCGAGG-TTTGCCAGCCAAAAATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA

mir-1004   chr2L:3767601-3767709
Species Sequence
dm2 GCTGGACAAAAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCACGGTGCTT
Sim1 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
Sec1 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCTGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
Yak2 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGATGTTT
Ere2 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAA--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
dp4 GCTGGACAAGAGGTGTGTGGGATACTGATTTTAGAG--AAAAAAAAAACCATTAACGTGAGGCTTCGTTTCTCACATCATTTTCCCCTCACAGTGCCCGGTGCCT
Per1 GCTGGACAAGAGGTGTGTGGGATACTGATTTTAGAG----AAAAATAACCATTAACGTGAGGCTTCGTTTCTCACATCATTTTCCCCTCACAGTGCCCGGTGCCT
Wil1 GTTGGATAAAAGGT--GGGGTACAACAACAACAAAAATACGAATATAATGGTAAACTCTCTCTCT--CATCTCTTATCATTTTCTCCTCACAGTGCGCGTTCACT

mir-1006   chr2L:16720703-16720807
Species Sequence
dm2 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Sim1 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Sec1 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Yak2 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Ere2 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Ana3 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTCCAATACCAG
dp4 ACTTTCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGTG--CCAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Per1 ACTTTCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGTG--CCAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Wil1 ATTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCCTAAATTGTTTTGTGTACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATATCAA
Vir3 ACTTTCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATATGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Moj3 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Gri2 ATTTCCAAGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGGT--CCAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG

mir-1013   chr3R:26617337-26617438
Species Sequence
dm2 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATAGGATCGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Sim1 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATAGGATCGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Sec1 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATAGGATCGGCCGTTAATAAAAGTTTGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Yak2 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATTGGGACGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Ere2 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATTGGAGCGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG

mir-1011   chr3R:16679006-16679100
Species Sequence
dm2 CTGACCGTGCACGTGAGTTTTTGAGCCAGGAATATAGTTCTTATTATTGGTTCAAATCGCTCGCAGAATCCACCCTGG

mir-1010   chr3R:18118580-18118691
Species Sequence
dm2 TGTGCTCAACGGGTAAGTGGTGTAGATGAAACAAATTTACCAACAATTTTGTTGGATTGTTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGACCT

mir-1015   chr3R:20164933-20165038
Species Sequence
dm2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Sim1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Sec1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGTCTGAGTGAGACTTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Yak2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGACTGGGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Ere2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGGCTGAGTGAGGACTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAAATCCTAA

mir-1009   chr2R:19500633-19500734
Species Sequence
dm2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Sim1 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Sec1 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Yak2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGAGGAGTATCTCAAAAATTATTACATTTCAGGGCGATAGTTAC
Ere2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTGTTGAGTTACCCACGTAGAGTATCTCAAAATTTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAC

mir-1008   chr2R:6401419-6401516
Species Sequence
dm2 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAATGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sim1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sec1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Yak2 TTCCTGATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAATA
Ere2 TTCCTCATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA

mir-1012   chr3R:22687050-22687149
Species Sequence
dm2 TCCAAAAGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGAAAAATATTAGTCAAA-GATTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Sim1 TCCAAAAGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGAGAA-TATTAGTCAAA-GATTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Sec1 TCCAAAGGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGAGAA-TATTAGTCAAA-GATTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Yak2 TCCAAAAGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGCAAGATATTAGTCAAAGGTTTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Ere2 TCCAAAAGAACGGTGGGTAAATCTTTGATTAGTATTGGTTTCAATATATTAGTCAAATGTTTTTCCCACTAGATTTATCAATCT

mir-1007   chrX:21107040-21107145
Species Sequence
dm2 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGGATC
Sim1 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Sec1 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Yak2 AATCTGTTCAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-AGGAT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Ere2 AATCTGTTCAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-GGGAT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Ana3 AATCCGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGAA--T---AGC------TCC-------CGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
dp4 AATCGATACAGTGTAAGCAGCGATTGA--TCAATCaat-tgaat--c---gaa------tcgaatcgaatGATAAACTCCATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
Per1 AATCGATACAGTGTAAGCAGCGATTGA--TCAATCaat-tgaat--c---gaa------tcgaatcgaatGATAAACTCCATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
Vir3 AATCAATGAAATGTAAGCAGTGCTTGAGCTTATTC--TCTGGCTTCATTTGAC--CATTTTC-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGATGCCGCC
Moj3 AGTCCATGAAATGTAAGCAGTGTTTGAACTAAATC--TCTGGCT--ACTTGGC--CGTATAT-------TGATAAGCTCAACTAACTGTTTGCAGCGGACACCTAT
Gri2 AATCAATACAATGTAAGCAGTGTTTGAACTGAATA--TCTGGTT--ATCCGACTTCATATAC-------TGATAAGCTCAATTCACTGTTTGCAGCGGATGGCGTC