Conservation for all officially named mirtrons


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

mir-1003   chr3R:20484306-20484402
Species Sequence
dm2 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Sim1 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Sec1 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Yak2 GCTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGTCGTGAGCT
Ere2 ACTGCGCAGAAGGTGGGTATC-TGGATGTGGTTGGCTCT--------------GGCGGTCCTCTCACATTTACATATTCACAGGCGCCGTGAGCT
Ana3 GCTACGCCGAAGGTGAGTATAGTGGATGTGGGTGGCTCTTATTT--------GGCCGGTCCTCTCACATCTCCATATTCACAGGCGTCGAGAGCT
dp4 GCTACGTAGAAGGTGGGTATCGTGCTTGTGGGTGGCTCT----T--------GGTCAGTCCTCTCACATCTCTATATTCACAGGCGCCGCGAGTT
Per1 GCTACGTAGAAGGTGGGTATCGTGCTTGTGGGTGGCTCT----T--------GGTCAGTCCTCTCACATCTCTATATTCACAGGCGCCGCGAGTT
Wil1 GTTGCGCCGTAGGTGAGTATC-GGGTTGTGATTGGCTCC--TTG--------TGGTAGTCCTCTCACATCTCTATATTCACAGGCGTCGCGAGCT
Vir3 GCTGCGTCGTAGGTGAGTAAT-CAGTTGTGGGTGGCTTT----T--------TGAAAGCCCTCTCACATCTCTTTATTCACAGGCGGCGTGAGTT
Moj3 GCTGCGGCGCAGGTGAGTAAT-CAGTTGTGGGTGGCTCT----A--------GTGAAGCCCTCTCACATCTCTTTATTCACAGGCGGCGAGAGTT
Gri2 ATTGCGGCGCAGGTGAGTAAT-CAGTTGTGGGTGGCTTT----TGTTCTTAGGGAAAGCCCTCTCACATCTCTTTATTCACAGGCGGCGCGAATT

mir-1014   chr3R:27579225-27579333
Species Sequence
dm2 CCTTTTCTCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCAGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTTACTGGATACA
Sim1 CCTTCTCCCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCTGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTTACCGGATACA
Sec1 CCTTCTCCCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCTGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTTACCGGATACA
Yak2 CCTTTTCCCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCAGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTCACCGGATACA
Ere2 CCTTTTCGCAAGGTATAATGGAAATAGAT----TTTAATCGCAGGCGCGTCAGTGGTTGAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTCACCGGATACA
Ana3 CATTCTCCCAAGGTATAATGAAAATTGAT----TTTAATCACACGGATCGGAGTGGCAAAATTAAAATTCATTTTCATTTGCAGTCACGGGATACA
dp4 CCTTCTCCCAAGGTACAATGGAAATAGAT----TTTAATCGGGTTTCGTTTGGCGGTGAAATTAAAATTCATTTTCATTTACAGTGACCGGCATCA
Per1 CCTTCTCCCAAGGTACAATGGAAATAGAT----TTTAATCGTGTTTCGTTTGGCGGTGAAATTAAAATTCATTTTCATTTACAGTGACCGGCATCA
Wil1 CTTTTTCTCAAGGTAAAGTACTAATAGATAAGATTAAAGCAC-----------TTTTAAGGACGCAATTTGTATACCTATGCAGTGACTGGCTTTA
Vir3 CATTCTCTCAAGGTATGT---ACATATTT----TTAAA------------------TTTAACCAGTATTTACTTTTGTTCACAGTGACCGGCATAA
Moj3 CCTTCTCTCAAGGTAAGT---GCTT--TGAC----TTAGCTCTCTG------------------------CTTTCGTTTCATCCA----------C
Gri2 CCTTTTCACAGGGTATGCAGAGCTTGATTAT----TTGA-CATTTTACACat------tataaataaattatatatatatataCATATGTTATTGC

mir-1005   chr2L:4343675-4343776
Species Sequence
dm2 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGGTTTTGGCACACGAATATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Sim1 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGTTTTTGGC-CACAAATATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Sec1 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGGTTTTGGCACACAAATGTAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Yak2 CCATTCTGACCTGTGAGTTGATCGATTTCGAGGTTTTGGCAGCCAAAAATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Ere2 CCATTCTGACCTGTGAGTTCATCGATTTCGAGG-TTTGCCAGCCAAAAATAATCTGGAATCTTTAATTCGCAGTTCCCACCGAAA
Ana3 CGGTTTTGACTTGTAA--GAACCAAAACTACTT---TCTGT---ATCAAAG-----------CCAGA--------AACTAATCGT
dp4 CCATTTTGACATGTAA--G------------TG---TCCATATCCTCGAGGCTCctgcaatgcactg--------caatgcac--
Per1 CCATTTTGACATGTAA--G------------TG---TCCATATCCTCGAGGCTCctgcaatgcactg--------caatgcac--
Wil1 CAATTCTATCATGTAA--G------------TTAAAACGAT---T---AAGTAATTTCA---CACTT--------ACATATAT--
Vir3 TGGTATTGACCTGTAAGT--------------================================================-----
Moj3 CCATATTGCTCTGCG-----------------================================================-----
Gri2 CCATTCTGACATGTAA-----------------CCACTGAT---CCTGATCCTTGATTG---CACTGCCCATTTTGAATG-----

mir-1004   chr2L:3767601-3767709
Species Sequence
dm2 GCTGGACAAAAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCACGGTGCTT
Sim1 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
Sec1 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCTGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
Yak2 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGATGTTT
Ere2 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAA--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
Ana3 GCTGGACAAGAGGT-GA--GATAACACGTTCTAACCAACTGATAT--GAA----------ACTACGAATGT----TTTTATCGCTGTCGATTCGAACGA--TCTC
dp4 GCTGGACAAGAGGTGTGTGGGATACTGATTTTAGAG--AAAAAAAAAACCATTAACGTGAGGCTTCGTTTCTCACATCATTTTCCCCTCACAGTGCCCGGTGCCT
Per1 GCTGGACAAGAGGTGTGTGGGATACTGATTTTAGAG----AAAAATAACCATTAACGTGAGGCTTCGTTTCTCACATCATTTTCCCCTCACAGTGCCCGGTGCCT
Wil1 GTTGGATAAAAGGT--GGGGTACAACAACAACAAAAATACGAATATAATGGTAAACTCTCTCTCT--CATCTCTTATCATTTTCTCCTCACAGTGCGCGTTCACT
Vir3 GCTGGACAAAAGGT-TG--GGGCAC------------ATTGATCTTCAAGAAACTCACAGCCAGCTCATTT----ACTCACT--------------CTC--TCTC
Moj3 GCTGGACAAGAGGT----------A------------ATTGATC--------ACTCcta------tctctg----tctctct--------------ttc--tctt
Gri2 GCTGGACAAAAGGT-AGGAGAGCAC------------ATTGATCTTGAAGAAACTTGCAGAAAACTCTCTAATACTCTCACT--------------CCA--TTTC

mir-1006   chr2L:16720703-16720807
Species Sequence
dm2 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Sim1 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Sec1 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Yak2 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Ere2 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Ana3 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTCCAATACCAG
dp4 ACTTTCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGTG--CCAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Per1 ACTTTCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGTG--CCAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Wil1 ATTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGCCTAAATTGTTTTGTGTACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATATCAA
Vir3 ACTTTCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATATGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Moj3 ACTTCCAGGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGGT--ACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG
Gri2 ATTTCCAAGTGAGTTTGAAATTGAAATGTGTAAATTGTTTGGT--CCAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAGGTGCAATACCAG

mir-1013   chr3R:26617337-26617438
Species Sequence
dm2 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATAGGATCGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Sim1 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATAGGATCGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Sec1 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATAGGATCGGCCGTTAATAAAAGTTTGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Yak2 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATTGGGACGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Ere2 GTGCTGGAGAGGTGAGTTTCGTACACTTAATTAATTGGAGCGGCCGTTAATAAAAGTATGCCGAACTCGCAGGCGACGGATG
Ana3 GTGCTGGAGAGGTAATCTTTGAATAATTATCTGTGAGTTGTGGCATCTAAT--------------GATTGTT-----ATCTT
dp4 GTGCTGGAGCGGTAAGTCC----------ATGAATTGCATCCCCCTTTGATTATTCTTTAATCTGGAAATCCCTGTGATCCC
Per1 GTGCTGGAGCGGTAAGTCC----------ATGAATTGCATCCCCCTTTGATTATTCTTTAATCTGGAAATCCCTGTGATCCC
Wil1 GTATTAGAAAGGTATAATGAATAAACCAATTTGAATAGCAAACCATTAAAT--------------CAATTTCCTTTTTTGTC
Vir3 GTGCTGGAGAGGTCAGCTG----------CTTGATAACCATTT--GTAAAT--------------GT----AACTCGTTTGA
Moj3 GTGCTGGAGAGGT==========================================================AATTCCTTTGT
Gri2 GTGCTGGAAAGGTAATCTT----------CTTAAATATTATTTTCGCTAAT--------------GCTATTACTCGCTTTGA

mir-1011   chr3R:16679006-16679100
Species Sequence
dm2 CTGACCGTGCACGTGAGTTTTTGAGCCAGGAATATAGTTCTTATTATTGGTTCAAATCGCTCGCAGAATCCACCCTGG
Sim1 CTGACCGTGCACGTGAGTTTTTGAGCCAGGAATATAGT----T--------CT-TAT-----TAT-TGGTTCAAATCG
Sec1 CTGACCGTGCACGTGAGTTTTTGAGCCAGGAATATAGT----T--------CT-TAT-----TAT-TGGTTCAAATCG
Yak2 CTGACCGTGCATGTGAGTTTTTGAGCCAGGAATATAAT----T--------CT-TAT-----TAT-TGGTTCAAATCG
Ere2 CTGACCGTCCACGTGAGTTTTTGAGCCATGAATATAAT----T--------CT-TAT-----TAT-TGGTTCAAATCG
Ana3 GTGACGGTGCATGTGAGTCTTTGAACCAGGAATATAAT----T--------TG-TAT----ATAT-TGGTTCAAATCG
dp4 GTGACGATGCATGTGAGATTTTGAATCTAATATATAATATAAT--------CCGTACGTGTATATATGGTTCAAATTA
Per1 GTGACGATGCATGTGAGATTTTGAATCTAATATATAATATAAT--------CT-TACATGTATATATGGTTCAAATAA
Wil1 CTGACCGTACATGTGAGTCTTTGAATCAGGAATATATTAT--C--------AT-TAT----ATAT-TGGTTCGAAATG
Vir3 GTCACGGTGCATGTGAGTCATTGAACCAGGAATATATG----TATGTAATTCT-TAT----ATAT-TGGTTCAAATTT
Moj3 GTGACAGTGCATGTGAGTCTTTGAGCCAGGAATATATG----TTCAT----CT-TAT-----TAT-TGGTTCAAATCT
Gri2 GTCACTGAGCATGTGAGTCTTTGAGCCAGGAATATAAT----T--------GT-TAT----ATAT-TGGTTCAAACAA

mir-1010   chr3R:18118580-18118691
Species Sequence
dm2 TGTGCTCAACGGGTAAGTGGTGTAGATGAAACAAATTTACCAACAATTTTGTTGGATTGTTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGACCT
Sim1 CGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGACCT
Sec1 CGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGACCT
Yak2 TGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGACCT
Ere2 TGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGACCT
Ana3 CGTGCTTAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTATGAGGACCT
dp4 CGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGGTACGAGGATCT
Per1 CGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGGTACGAGGATCT
Wil1 CGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGATACGAGGATCT
Vir3 TGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGATCT
Moj3 TGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGGTACGAGGATTT
Gri2 CGTGCTCAACGGGTAAGTG========================================TTTCACCTATCGTTCCATTTGCAGCTACGAGGATCT

mir-1015   chr3R:20164933-20165038
Species Sequence
dm2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Sim1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Sec1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGTCTGAGTGAGACTTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Yak2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGACTGGGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Ere2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGGCTGAGTGAGGACTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAAATCCTAA
Ana3 TGGGCTACGACAGTGAGT--GATGCT-CCAGATAGGT--TGGCTTAGGAAGTCATT--AAAG----CCCTGGGATG----T--CTCTC
dp4 TGGGCTACGATGGTAAGA--GCTA-G-CCACACAAAT--T------ATTAGT-ATTTCTATT----TCTCAAAATATTTCT--TTCTT
Per1 TGGGCTACGATGGTAAGA--GCTA-G-CCACACAAAT--T------ATTAGT-ATTTCTATT----TCTCAAAATATTCCT--TTCTT
Wil1 TGGGTTATGACAGTAAGTTAGCTGGT-AAAGTTGATT--TCTTTTAACTAAT-GTG--TA--------------------T--ATTTA
Vir3 TGGGCTACGAAAGTAAGT--ATTTAC-TTGATAACTCGTTAAACCTAAAGTC-TGT--TAACCACTCTTATAACTA----TG-CATCT
Moj3 TGGGCTACGATGGTAAAT--GCTGATGTTCATGAATATTTATCCAAGTAATT-TCT--TTAC----GTTGT------------CTTCT
Gri2 TGGGCTATGATAGTGAGT----TGAT-TCTATTGTAA--TAATCAAATCGTT-TTTG-TTAT----TTTATAAACA----TGCCATTT

mir-1009   chr2R:19500633-19500734
Species Sequence
dm2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Sim1 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Sec1 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Yak2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGAGGAGTATCTCAAAAATTATTACATTTCAGGGCGATAGTTAC
Ere2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTGTTGAGTTACCCACGTAGAGTATCTCAAAATTTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAC
Ana3 CGATTCAAGATGTAAGTTTTGAATACTTC------TACTCTA---TCT------TGGAATGTCTCTCATAATTGTC-----CAT
dp4 CCATACAAGATGTAAGTTCGAGAATCCCAAACACATAAGTTC---TTT--------TTTAACATCCAAA------------TAT
Per1 CCATACAAGATGTAAGTTCGAGAATCCCAAAAACATAAGTTC---TTT--------TTTAACATCCAAA------------TAT
Wil1 CTATCCAGGATGTAAGTAT--------TT------AAAGTTA---TTTTCATAATGACGGGAAATCAATGATTTGCATTCACTC
Vir3 ====================================================================================
Moj3 CTCTACAGGAGGTAAGGACCAA--TTGGT------AAAGTGAGAAATT-----GGAAGAAATTTATTGAAATTTATAC---TCG
Gri2 ====================================================================================

mir-1008   chr2R:6401419-6401516
Species Sequence
dm2 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAATGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sim1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sec1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Yak2 TTCCTGATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAATA
Ere2 TTCCTCATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Ana3 TTTCTTATCTACGTAA-GGAACTCAATTTTTACATTAAACCGAAGCAATTT----------AACAC--------GTTTCT
dp4 TTTCTCATTTATGTAA-GGGATCGGCG-AGAGT-TTTTCCCACGGAATATCATTA--TATTATATT--------GTTATG
Per1 TTTCTCATTTATGTAA-GGGATCGGCG-AGAGT-TTTTCCCACGGAATATCATTA--TATTATATT--------GTTATG
Wil1 TTTCTTATCTATGTAAGACAATCCACGAGGTGG-TTGG--GAAGACAAATTTTGAATAATTGGATT--------TTGATT
Vir3 TTTCTCATCTATGTAA-GTGATGAT---------GCGTCCATTGGGAATAT------CATTTAATT------------TG
Moj3 TTTCTCATCTATGTAA-GTAGTAATAG-------GTGTTTGTAGACATATT------CAGTTAATTTTCGC--ATTTGTG
Gri2 TTTCTCATCTATGTAA-GTGAT------------GCAAATGAATAAATATT------AATCATATTGCCTTTAATCAATG

mir-1012   chr3R:22687050-22687149
Species Sequence
dm2 TCCAAAAGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGAAAAATATTAGTCAAA-GATTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Sim1 TCCAAAAGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGAGAA-TATTAGTCAAA-GATTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Sec1 TCCAAAGGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGAGAA-TATTAGTCAAA-GATTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Yak2 TCCAAAAGAACGGTGGGTAGAACTTTGATTAATATTGCTTGCAAGATATTAGTCAAAGGTTTTTCCCCATAGATTTATCAATTT
Ere2 TCCAAAAGAACGGTGGGTAAATCTTTGATTAGTATTGGTTTCAATATATTAGTCAAATGTTTTTCCCACTAGATTTATCAATCT
Ana3 TATAAAAAAGCGGT-------------A-GGT-----TTCAACCAAATTTCCTTTGAGA--------GTTC---AGTTAACTTT
dp4 TAATTCAGAGCGGT-------------G-GGTAG-TCTCTCATATATAGTTATAAAAGAACGAACACCAGT---GGTTAA-GCA
Per1 TAATTCAGAGCGGT-------------G-GGTAG-TCTCTCATATATAGTTATAAAAGAACGAACACCAGT---GGTAAA-GCA
Wil1 TTTGTCAGAACGGT-------------ATGGTAG---------------TGCAAGAAAGC-------CGAA---ATTCAA----
Vir3 TCTAAAGAAACGGT-----------ACG-GATTGTTTATTTA-------------------------AATG---CTTTAT----
Moj3 TTTAAAAAAACGGTGTGT---AAATATG-GATTATT-ATTTATAAATT---ATCGAAAA-----CTTAACT---TCTAAT----
Gri2 TATCAAGAAGCGGTACGTTCTACATTTG-GTTGAACTATTCTTGAACTTGAGCCGAAAAA--ACTTTAGCTGTATTTTAA----

mir-1007   chrX:21107040-21107145
Species Sequence
dm2 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGGATC
Sim1 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Sec1 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Yak2 AATCTGTTCAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-AGGAT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Ere2 AATCTGTTCAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-GGGAT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Ana3 AATCCGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGAA--T---AGC------TCC-------CGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
dp4 AATCGATACAGTGTAAGCAGCGATTGA--TCAATCaat-tgaat--c---gaa------tcgaatcgaatGATAAACTCCATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
Per1 AATCGATACAGTGTAAGCAGCGATTGA--TCAATCaat-tgaat--c---gaa------tcgaatcgaatGATAAACTCCATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
Wil1 AATCCATGCAATGTGAGT--TTTTTGATTT---TC--T-TGTTT------AAT------TTC-------GAAAAACTTTAATCGACTGTATTCTATCAGCTGATGG
Vir3 AATCAATGAAATGTAAGCAGTGCTTGAGCTTATTC--TCTGGCTTCATTTGAC--CATTTTC-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGATGCCGCC
Moj3 AGTCCATGAAATGTAAGCAGTGTTTGAACTAAATC--TCTGGCT--ACTTGGC--CGTATAT-------TGATAAGCTCAACTAACTGTTTGCAGCGGACACCTAT
Gri2 AATCAATACAATGTAAGCAGTGTTTGAACTGAATA--TCTGGTT--ATCCGACTTCATATAC-------TGATAAGCTCAATTCACTGTTTGCAGCGGATGGCGTC