Conservation for mirtron-8


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

mir-1007   chrX:21107040-21107145
Species Sequence
dm2 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGGATC
Sim1 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Sec1 AATCTGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGTT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Yak2 AATCTGTTCAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-AGGAT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Ere2 AATCTGTTCAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-GGGAT--CTTGGAC------TCT-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGACGGCATC
Ana3 AATCCGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGAA--T---AGC------TCC-------CGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
dp4 AATCGATACAGTGTAAGCAGCGATTGA--TCAATCaat-tgaat--c---gaa------tcgaatcgaatGATAAACTCCATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
Per1 AATCGATACAGTGTAAGCAGCGATTGA--TCAATCaat-tgaat--c---gaa------tcgaatcgaatGATAAACTCCATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
Wil1 AATCCATGCAATGTGAGT--TTTTTGATTT---TC--T-TGTTT------AAT------TTC-------GAAAAACTTTAATCGACTGTATTCTATCAGCTGATGG
Vir3 AATCAATGAAATGTAAGCAGTGCTTGAGCTTATTC--TCTGGCTTCATTTGAC--CATTTTC-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGATGCCGCC
Moj3 AGTCCATGAAATGTAAGCAGTGTTTGAACTAAATC--TCTGGCT--ACTTGGC--CGTATAT-------TGATAAGCTCAACTAACTGTTTGCAGCGGACACCTAT
Gri2 AATCAATACAATGTAAGCAGTGTTTGAACTGAATA--TCTGGTT--ATCCGACTTCATATAC-------TGATAAGCTCAATTCACTGTTTGCAGCGGATGGCGTC

mir-1007   chrX:21107040-21107145
Species Sequence
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Ana3 AATCCGTACAGTGTAAGCAGTGTTTGAACTCGATC--T-TGGAA--T---AGC------TCC-------CGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
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Per1 AATCGATACAGTGTAAGCAGCGATTGA--TCAATCaat-tgaat--c---gaa------tcgaatcgaatGATAAACTCCATTAACTGTTTGCAGCCGATGGCATC
Vir3 AATCAATGAAATGTAAGCAGTGCTTGAGCTTATTC--TCTGGCTTCATTTGAC--CATTTTC-------TGATAAGCTCAATTAACTGTTTGCAGCGGATGCCGCC
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Gri2 AATCAATACAATGTAAGCAGTGTTTGAACTGAATA--TCTGGTT--ATCCGACTTCATATAC-------TGATAAGCTCAATTCACTGTTTGCAGCGGATGGCGTC