Conservation for mirtron-6


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

mir-1008   chr2R:6401419-6401516
Species Sequence
dm2 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAATGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sim1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sec1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Yak2 TTCCTGATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAATA
Ere2 TTCCTCATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Ana3 TTTCTTATCTACGTAA-GGAACTCAATTTTTACATTAAACCGAAGCAATTT----------AACAC--------GTTTCT
dp4 TTTCTCATTTATGTAA-GGGATCGGCG-AGAGT-TTTTCCCACGGAATATCATTA--TATTATATT--------GTTATG
Per1 TTTCTCATTTATGTAA-GGGATCGGCG-AGAGT-TTTTCCCACGGAATATCATTA--TATTATATT--------GTTATG
Wil1 TTTCTTATCTATGTAAGACAATCCACGAGGTGG-TTGG--GAAGACAAATTTTGAATAATTGGATT--------TTGATT
Vir3 TTTCTCATCTATGTAA-GTGATGAT---------GCGTCCATTGGGAATAT------CATTTAATT------------TG
Moj3 TTTCTCATCTATGTAA-GTAGTAATAG-------GTGTTTGTAGACATATT------CAGTTAATTTTCGC--ATTTGTG
Gri2 TTTCTCATCTATGTAA-GTGAT------------GCAAATGAATAAATATT------AATCATATTGCCTTTAATCAATG

mir-1008   chr2R:6401419-6401516
Species Sequence
dm2 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAATGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sim1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Sec1 TTCCTCATCTATGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA
Yak2 TTCCTGATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAATA
Ere2 TTCCTCATATACGTAAATATCTAAAGTTGAACTTGGCCAACGGCAAGTCACAGCTTTTTGTGTTTACAGGAGAACGAGTA