Conservation for mirtron-5


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

mir-1009   chr2R:19500633-19500734
Species Sequence
dm2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Sim1 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Sec1 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Yak2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGAGGAGTATCTCAAAAATTATTACATTTCAGGGCGATAGTTAC
Ere2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTGTTGAGTTACCCACGTAGAGTATCTCAAAATTTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAC
Ana3 CGATTCAAGATGTAAGTTTTGAATACTTC------TACTCTA---TCT------TGGAATGTCTCTCATAATTGTC-----CAT
dp4 CCATACAAGATGTAAGTTCGAGAATCCCAAACACATAAGTTC---TTT--------TTTAACATCCAAA------------TAT
Per1 CCATACAAGATGTAAGTTCGAGAATCCCAAAAACATAAGTTC---TTT--------TTTAACATCCAAA------------TAT
Wil1 CTATCCAGGATGTAAGTAT--------TT------AAAGTTA---TTTTCATAATGACGGGAAATCAATGATTTGCATTCACTC
Vir3 ====================================================================================
Moj3 CTCTACAGGAGGTAAGGACCAA--TTGGT------AAAGTGAGAAATT-----GGAAGAAATTTATTGAAATTTATAC---TCG
Gri2 ====================================================================================

mir-1009   chr2R:19500633-19500734
Species Sequence
dm2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
Sim1 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTCTTGAGTTACCCGCGATGAGTATCTCAAAAATTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAT
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Ere2 CCATTCAAGACGTAAGTGTAAGACTTTGTTGAGTTACCCACGTAGAGTATCTCAAAATTTGTTACATTTCAGAGCGATAGCTAC