Conservation for mirtron-4


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

mir-1015   chr3R:20164933-20165038
Species Sequence
dm2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Sim1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Sec1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGTCTGAGTGAGACTTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Yak2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGACTGGGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Ere2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGGCTGAGTGAGGACTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAAATCCTAA
Ana3 TGGGCTACGACAGTGAGT--GATGCT-CCAGATAGGT--TGGCTTAGGAAGTCATT--AAAG----CCCTGGGATG----T--CTCTC
dp4 TGGGCTACGATGGTAAGA--GCTA-G-CCACACAAAT--T------ATTAGT-ATTTCTATT----TCTCAAAATATTTCT--TTCTT
Per1 TGGGCTACGATGGTAAGA--GCTA-G-CCACACAAAT--T------ATTAGT-ATTTCTATT----TCTCAAAATATTCCT--TTCTT
Wil1 TGGGTTATGACAGTAAGTTAGCTGGT-AAAGTTGATT--TCTTTTAACTAAT-GTG--TA--------------------T--ATTTA
Vir3 TGGGCTACGAAAGTAAGT--ATTTAC-TTGATAACTCGTTAAACCTAAAGTC-TGT--TAACCACTCTTATAACTA----TG-CATCT
Moj3 TGGGCTACGATGGTAAAT--GCTGATGTTCATGAATATTTATCCAAGTAATT-TCT--TTAC----GTTGT------------CTTCT
Gri2 TGGGCTATGATAGTGAGT----TGAT-TCTATTGTAA--TAATCAAATCGTT-TTTG-TTAT----TTTATAAACA----TGCCATTT

mir-1015   chr3R:20164933-20165038
Species Sequence
dm2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Sim1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGGCTGAGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Sec1 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGTTAGCTTGTCTGAGTGAGACTTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTAA
Yak2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGACTGGGTGAGGATTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAGATCCTGA
Ere2 TGGGCTACGACGGTGAGTGATGCTCCAGATAGCTTGGCTGAGTGAGGACTTAAGTCCTGGGACATCTCTCTTGCAGTCAAAATCCTAA