Conservation for mirtron-19


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

   chr2L:16674158-16674266
Species Sequence
dm2 AAGCACGTCATCGTAAGCATTGCAAAA---TG--TAGTTGTTAAATTCGCTCTTCAATCATTAACAACATTTACAATGTTTGCAGGCTGTCAACGT
Sim1 AAGCACGTCATCGTAAGCATTGCAAAA---TA--TAGTTGTTAAATTCGCTCTTCAATTATTTAC--------TATTGATTGCAGGCTGTCAACGT
Sec1 AAGCATGTTATCGTAAGCATTGCAAAA---TA--TAGTTCTTAAATTCGCTCTTCAATTATTTAC--------TATTGATTGCAGGCTGTCAACGT
Yak2 AAGCACGTCATCGTAAGCTTTGCTATA---TATGTAGATGTGAATTTCGAGCTTCAATTCTTTTC--------TATTCTCTTCAGGCTGTCAATGT
Ere2 AAGCACGTTATTGTAAGC-------TGCGCCATA---TAGT---------TCG----TAAATTCGAGCTTCAATTATGTTC--------TATTCTC
Ana3 AAGCAAGTGATTGTAAG---------ATGTAAAC---TCTTAGACCCTCCTAACTGCTA----CAAGCT--AATACTTTTG--------CTTTGAA
dp4 AAGCAGCTGATAGTGAGT-------ACTGGAAGCATTTA-----------TATCTCTGGAAAGCACT----AATTCTTTTT--------TTAATCT
Per1 AAGCAGCTGATAGTGAGTACTGGAAGCATTTA--TATCTCTGGAAAGCACT----AATTCTTTTT--------TGAATCTTCTAGGCTGTCGAATT
Wil1 AAAGAAGTGATTGTAGGTGTCAATGATTTCAAAC---TAACA--------TCAATTTTTTATTAACGTCTTTATTTTTTCC--------TATT---
Vir3 ================================================================================================
Moj3 ================================================================================================
Gri2 ================================================================================================

   chr2L:16674158-16674266
Species Sequence
dm2 AAGCACGTCATCGTAAGCATTGCAAAA---TG--TAGTTGTTAAATTCGCTCTTCAATCATTAACAACATTTACAATGTTTGCAGGCTGTCAACGT
Sim1 AAGCACGTCATCGTAAGCATTGCAAAA---TA--TAGTTGTTAAATTCGCTCTTCAATTATTTAC--------TATTGATTGCAGGCTGTCAACGT
Sec1 AAGCATGTTATCGTAAGCATTGCAAAA---TA--TAGTTCTTAAATTCGCTCTTCAATTATTTAC--------TATTGATTGCAGGCTGTCAACGT
Yak2 AAGCACGTCATCGTAAGCTTTGCTATA---TATGTAGATGTGAATTTCGAGCTTCAATTCTTTTC--------TATTCTCTTCAGGCTGTCAATGT
Per1 AAGCAGCTGATAGTGAGTACTGGAAGCATTTA--TATCTCTGGAAAGCACT----AATTCTTTTT--------TGAATCTTCTAGGCTGTCGAATT