Conservation for mirtron-18


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

   chrX:2082363-2082457
Species Sequence
dm2 ACAGCATTATTGGTGAGTGGTGCTTCT----TGTGCACACGTGCTATAGCCTAAGAACT--------CCTC-----TTCGCAGATCTCAAGGTCG
Sim1 ACAGCATTATTGGTGAGTGGTTCTTC-----CGTGCTCACGTGCCATAGCCTAAGAACT--------TCTT-----TTCGCAGATCTCAAAGTCG
Sec1 ACAGCATTATTGGTGAGTGGTTCTTC-----TGTGCTCACGTGCCATAGCCTAAGAACT--------TCTT-----TTCGCAGATCTCAAAGTCG
Yak2 ACAGCATTATCGGTGAGTTGTTCTTCT----TGCGGCCTCGTCCCATAGCCTAAGAACT--------CTTC-----TTTGCAGATCTCAAGGTCG
Ere2 ACAGCATTATTGGTGAGTTTTACTTAT----TGTGGCCTCGTCCCATTGCCTAAGAACT--------CTTC-----TTCGCAGATCTCAAGGTCG
Ana3 ACAGCATTATTGGTATGTATATCCTTT----GGTTTAATCCTCTGAAGCCTTATGGAATGTGTCCTCTTTC-----TTTGAAGATCTCAAGGTCG
dp4 ACAGTATCATTGGTGAGTCGCACAGCTCCACTGTCGGTTTGTTC---AACTTACTCGTT--------CCTCGGCTGCTTGCAGATCTCAAGGTTG
Per1 ACAGTATCATTGGT=================================================================================
Wil1 ACAGTATAATTGGTAAGCGATCCCGTTGAATCC-----------------------CGGCCAACCATT-----CCATCCATCTAA----------
Vir3 ACAGCATTATTGGTAAGCATGCCCAGC-----------------------------AACATGTCCATAG----CCCT-AACCCAA----------
Moj3 ATAGCATTATAGGTAGGCGAAGCGCAT-----------------------------AGCATATATA-------CCAT-GTTTCTA----------
Gri2 ACAGCATTATTGGTACGTAAAAAAAATATATATATGCCATAGGGTTTGCTCGAGAAAatatatgtatgggtatacat-atgtcgatatatatata

   chrX:2082363-2082457
Species Sequence
dm2 ACAGCATTATTGGTGAGTGGTGCTTCT----TGTGCACACGTGCTATAGCCTAAGAACT--------CCTC-----TTCGCAGATCTCAAGGTCG
Sim1 ACAGCATTATTGGTGAGTGGTTCTTC-----CGTGCTCACGTGCCATAGCCTAAGAACT--------TCTT-----TTCGCAGATCTCAAAGTCG
Sec1 ACAGCATTATTGGTGAGTGGTTCTTC-----TGTGCTCACGTGCCATAGCCTAAGAACT--------TCTT-----TTCGCAGATCTCAAAGTCG
Yak2 ACAGCATTATCGGTGAGTTGTTCTTCT----TGCGGCCTCGTCCCATAGCCTAAGAACT--------CTTC-----TTTGCAGATCTCAAGGTCG
Ere2 ACAGCATTATTGGTGAGTTTTACTTAT----TGTGGCCTCGTCCCATTGCCTAAGAACT--------CTTC-----TTCGCAGATCTCAAGGTCG
Ana3 ACAGCATTATTGGTATGTATATCCTTT----GGTTTAATCCTCTGAAGCCTTATGGAATGTGTCCTCTTTC-----TTTGAAGATCTCAAGGTCG
dp4 ACAGTATCATTGGTGAGTCGCACAGCTCCACTGTCGGTTTGTTC---AACTTACTCGTT--------CCTCGGCTGCTTGCAGATCTCAAGGTTG