Conservation for mirtron-16


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

   chr3R:24819391-24819491
Species Sequence
dm2 AAACCCAGGTAGGTTTACAATATATTTAATTTAAGCGTGCTACAACTACTTGAATTGTTCACCTACAGAATGATGAAGA
Sim1 AAGCCCAGGTGGGTTTAC--AATTTATTCAATTTAAGCATGCTCCAACTAC-TTGAATTGTTCACCCACAGAATGATGA
Sec1 AAGCCCAGGTGGGTTTAC--AATTTATTTAATTTAAGCATGCTCCAACTAC-TTGAATTGTTCACCCACAGAATGATGA
Yak2 AAGCCCAGGTGCGTTTAC--AATTTATTTCATTTAAACATACTGCAACTAC-TTGAATGGCTCACCCACAGAATGATGA
Ere2 AAGCCCAGGTGGGTTTAC--AATTCAATTCATTTAAGCATGTTTCAACTAC-TTGATTGACTCACCCGCAGAATGATGA
Ana3 AAGCCAAGGTAGGTTTTCTTGATTTTCTTTGTGAAAGTGTGttttaaatttattttttattttatCATTAGAATGATGA
dp4 AAACCAAGGTAAGTGCCT--ACGAGGATTCTTTAGAGGGTCTCTTGACT-T-ACGCTCTGTCTTCCCTTAGAATGATGA
Per1 AAACCAAGGTAAGTGCCT--AAGAGGATTCTTTAGAGGGTCTCTTGACT-T-ACGCTCTGTCTTCCCTTAGAATGATGA
Wil1 GCGTCT--GCGGGGACAG--AAGTCAC---------GCATGCTCAAGCTAT-ATGATAAGGT--CCACAAAAATATTGT
Vir3 AAACCCAGGTATTTATTA--GAC----------CTTTTGCAATGGCA---T-TTGCTTTTCTTTTCTGCAGAATGATGA
Moj3 AAGCCAAGGTAGCTGTGT--GAT=================================ATTCCATCCATTCAGAATGATGA
Gri2 AAACCGAGGTATGTTTCA--AT-----------TAATTGCACTCGCAACAC-TTGCTTTCTTCATTTGCAGAATGTTGA

   chr3R:24819391-24819491
Species Sequence
dm2 AAACCCAGGTAGGTTTACAATATATTTAATTTAAGCGTGCTACAACTACTTGAATTGTTCACCTACAGAATGATGAAGA