Conservation for mirtron-12


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

mir-1004   chr2L:3767601-3767709
Species Sequence
dm2 GCTGGACAAAAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCACGGTGCTT
Sim1 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
Sec1 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCTGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAT--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
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Ere2 GCTGGACAAGAGGT-TGGGGGACATTGATCTCGGAG--------ACGGCGGTTTAACTGATCCAA--TCTCTCACATCACT--TCCCTCACAGTGCGCGGTGCTT
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dp4 GCTGGACAAGAGGTGTGTGGGATACTGATTTTAGAG--AAAAAAAAAACCATTAACGTGAGGCTTCGTTTCTCACATCATTTTCCCCTCACAGTGCCCGGTGCCT
Per1 GCTGGACAAGAGGTGTGTGGGATACTGATTTTAGAG----AAAAATAACCATTAACGTGAGGCTTCGTTTCTCACATCATTTTCCCCTCACAGTGCCCGGTGCCT
Wil1 GTTGGATAAAAGGT--GGGGTACAACAACAACAAAAATACGAATATAATGGTAAACTCTCTCTCT--CATCTCTTATCATTTTCTCCTCACAGTGCGCGTTCACT
Vir3 GCTGGACAAAAGGT-TG--GGGCAC------------ATTGATCTTCAAGAAACTCACAGCCAGCTCATTT----ACTCACT--------------CTC--TCTC
Moj3 GCTGGACAAGAGGT----------A------------ATTGATC--------ACTCcta------tctctg----tctctct--------------ttc--tctt
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