Conservation for mir-1043


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

   chr2R:16832007-16832142
Species Sequence
dm2 aa---caa-------cagaag------caactggccagtgcgcagctgcctgtgccgctgtcgcccttgccgcaac---aacaacagcaaacggcagaggcaacggca---g---------cagcagcag---caCCCGCCCACTCCAACGTA----------------------TCCGTT---TC---------CTCCAGCA
Sim1 aa---caa-------cagaag------caactggccagtgcgcagctgcctgtgccgctgtcgcccttgccgcaac---aacaacagcaaacggcagaggcaacggca---g---------cagcagcag---caCCCGCCCACTCCAACGTATCCACC----------------TCCGTT---TC---------CTCCAGCA
Sec1 aa---caa-------cagaag------caactggccagtgcgcagctgcctgtgccgctgtcgcccttgccgcaac---aacaacagcaaacggcagaggcaacggca---g---------cagcagcag---caCCCGCCCACTCCAACGTATCCACC----------------TCCGTT---TC---------CTCCAGCA
Yak2 AA---CAA-------CAGAAG------CAACTGGCCAGTGCGCAGCTGCCTGTGCCGCTGTCGCCCTTgccgcaac---aacaacagcaaacggcagaggcaacggca---g---------cagcagcag---caCCCGCCCACTCCAACGTATCAACC----------------TCCGTT---TC---------CTCCAGCA
Ere2 AG---CAA-------CAGAAG------CAACTGGCCAGTGCGCAGCTGCCTGTGCCGCTGTCGCCCTTgccgcaac---aacaacagcaaacggcagaggcaacggca---g---------cagcagcag---caCCCGCCCACTCCAACGTATCCACC----------------TCCGGT---TC---------CCTTAGCA
Ana3 AA---CAG-------CAGCAGAAGCCCCAGCTGCCCAGTGCGCAGCTGCCTGTGCCGCTGTCGCCTTTGCCG---C---AACAACAGCAAACGACAGAGGCAACGGCA---GCC---ACGCCAGCGGCAGAGACACCCGCCC------AAGCATCAACT----------------TCCACC---TCCACCAGTAGCACCAGCA
dp4 AACACCAA-------CAGCAG------CAGCTGCCCAGTGCGCAGCTGCCTGTGCCGCTGTCGCCCTTGCCG---C---CACAACAGCAAACGACAGAGGCAACGGCA---GCC---ACGCCAGTAGCAG---CA-CCACCTACAACCACAACCACACTCGTCTCA---------TCCGCC---AC---------CACGAGCA
Per1 AACACCAA-------CAGCAG------CAGCTGCCCAGTGCGCAGCTGCCTGTGCCGCTGTCGCCCTTGCCG---C---CACAACAGCAAACGACAGAGGCAACGGCA---GCC---ACGCCAGTAGCAG---CA-CCACCTACAACCACAAACACACTCGTCTCATCCGCCCACTCCGCC---AC---------CACGAGCA
Wil1 -----CGG-------TAGCAG------T--TCGTCCAATAACAA------------GCTGTTGCCCCTGCCACAACAAAAACAACAGCAACACACAGAGGCAACAACT---T---------CTGGAACTG---CCGTCACC---------GCATCA-------------------TCCCAA---TC---------------CA
Vir3 aacaacaaccacaaccagcag------cagctgctcagtgcgcagctgcctgtgccgctgtcgaacttgtcg---------------------acagaggcaacggca---gcagcaacgccagcagcag---cttcca------------cata---c----------------tccaat---ac-------------agca
Moj3 aacaacaacaacaa-cagcag------cagctgcTCAGTGCGCAGCTGCCTGTGCCGCTGTCGAACTTGTCG---------------------ACAGAGGCAACGGCA---GCCGCAACGCCAGCAGCAG---CTTCCA------------CATACTCC----------------TCCAAT---TC-------------AGCA
Gri2 aacaccaa-------cagcag------cagctgcccagtgcGCAGCTGCCTGTGCCGCTGTCGAACTTGTCG---------------------ACAGAGGCAACGGCAGCGGCAGCAACGCCAGCAGCTG---CTTCCACC-ACATCA--TCATCATCA----------------TCCAATCCATC-------------AATA

   chr2R:16832007-16832142
Species Sequence