Conservation for mir-1004


Color Code:    mir sequence   mir* sequence   predicted mir*   mutation

   chr3L:22878937-22879065
Species Sequence
dm2 TCTGCCA------------------AGAAACG--CTATCCAAGTAT--TTTGgtacgtatgtatgtatgtacataca--tgtgtatatg-------gtacat---tcatgtagt--------------------acatacatacatatgtatgcaagtacgtacgAACGC------------TCG---------ACAA---TTCCT-------
Sim1 TCTGCCA------------------AGAAACG--CTATCCAAGTCG--TTTGgtac----atatgtatgtacatgca--tgtgtatatg-------gtacat---tcatgtag----------------------------tacatatgtatgcaagtacgtacgGACGC------------TCG---------ACAA---TTCCT-------
Sec1 TCTGCCA------------------AGAAACG--CTATCCAAGTCG--TTTGgtac----atatgtatgtacatgca--tgtgtatatg-------gtacat---tcatgtag------------------------tacatacatatgtatGCAAGTACGTACGGACGC------------TCG---------ACAA---TTCCT-------
Yak2 ATTGCCA------------------AGAAACG--CTATCCAAGTAG---TTGGTAC----at----atgtacatgca--tgtgtatatg-------gtacat---tcatatac-------------------------------atatgtacatacatacgtaCGTTCGC------------TCG---------ACAA---TTCCT-------
Ere2 TTTGTCA------------------AGAAACG--CTATCCAAGT-----TTGGtac----atataaatgtacgtcca--tgtgtatatg-------gtacat---tcatatac-----------------------atatttatatatgtacatacatacgtacgtacGC------------TCG---------ACAA---TTCCT-------
Ana3 GTTGATA------------------AAAAAAAACCtataca--------tacatac----atatgtacaaatatacaactatatttatgattatatgtatgt---ttgtgtatt------------atatcaagacatacatatgtacgtgcataaataactacatatgt------------acatatatgtatataaatTTCCCT-------
dp4 TTTGGCCaaataaattaatcaatacataaata--ataaaataatatGTAGATGTAT----GGATGTATGTACATATG--TGCATCGATC-------ATGAAC---TAAGCGGCTCTCAGCTGTAGGGTATTGCATTGCCATCGC---TGTCGCCAA----GAAGAAACGGCGAACCGAACCCTCA---------ACAA---TTCGTCCATCGG
Per1 -------------------------ACAAACA--AGAA----------Atatgtat----gtatgtatgtacatata--tatgtaGAT--------GTGTACATTTCAGACACACAAAACCAAAACAAAACGCTTTATTTTTACATATGTATGTAA--------------------------TCA---------ACAA---TTCGTCCATCGG
Wil1 =====================================================================================================================================================================================================================
Vir3 =====================================================================================================================================================================================================================
Moj3 =====================================================================================================================================================================================================================
Gri2 =====================================================================================================================================================================================================================

   chr3L:22878937-22879065
Species Sequence