(1) AGO.mut | (11) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (18) BRAIN | (4) CELL-LINE | (2) DCR.mut | (1) DGCR8.mut | (8) EMBRYO | (6) ESC | (4) FIBROBLAST | (4) LIVER | (1) LYMPH | (12) OTHER | (2) OTHER.mut | (1) OVARY | (1) PIWI.ip | (2) SKIN | (1) SPLEEN | (7) TESTES | (1) THYMUS |
GTTGATGCCTGCTCAGGCTTTGTCTCAGGTTCTCTAAAGTGCTTTCTGCCCCAGGGCAAGCATATTCCTCTTTTAGTCCACATATCATGTCCTGCCCCATCTCAGTAGACTCCAGTGCAGGACTAAGCCCTCCGTGGTGCCGTGAAGCAGAGCTGGAGAAAGGTCGCACCACATGCCATATGTGTGTCCTTTCTCCCCAGGTAATTAAGAACCGTTTCCACCGTGTTTTCTTGCCCTCCCACTCACTGGA ..........................................................................................................................................................(((((((((.(((((............))))).)))))))))...................................................... ..................................................................................................................................................147..................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR685340(GSM1079784) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (dicer cell line) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR525242(SRA056111/SRX170318) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR065056(SRR065056) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM314559(GSM314559) ESC dgcr8 (454). (ESC) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR065049(SRR065049) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR525238(SRA056111/SRX170314) Second IgG control. (Blood) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCACAT............................................................................ | 23 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCACATGCC......................................................................... | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCACCACAT............................................................................ | 21 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCACCACATGC.......................................................................... | 23 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................................................................................................................................................AAGAACCGTTTCCACCGT.......................... | 18 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCACA............................................................................. | 22 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................................................................................................AAAGGTCGCACCACATGCCATATGTGTGTCC............................................................. | 31 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCAC.............................................................................. | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
..............................................................................................................................................................................................................AAGAACCGTTTCCACCGTGT........................ | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCACCACATGT.......................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................TGTGTGTCCTTTCTCCCCAGTAT............................................... | 23 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................TGTGTGTCCTTTCTCCCCAGA................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCACCACA............................................................................. | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCACCACATGCC......................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCACATGC.......................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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........................................................................................................................................................CTGGAGAAAGGTCGCACCACATGCC......................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................................................CTGGAGAAAGGTCGCACCACA............................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................................AGCAGAGCTGGAGAACGG....................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
........................................................................................................................................................CTGGAGAAAGGTCGCACCACATG........................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCACATG........................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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.....................................................................................................................................................................................GTGTGTCCTTTCTCCCCAGAAA............................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................................................................................................................................................TATGTGTGTCCTTTCTCCCCAGT................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................................................................................CAGAGCTGGAGAAAGGTCG.................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................................................CTGGAGAAAGGTCGCACCACATGAT......................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
...................................................................................................................................................................................ATGTGTGTCCTTTCTCCCCAG.................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................................GTGCAGGACTAAGCCCTCCGTGGTGCCGTGAAGCAGAGCTGGAGAAAGGTCGCACCACATGCCATATGTGTGTCCTTTCTCCCCAG.................................................. | 86 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................TGTGTGTCCTTTCTCCCCAGTAG............................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................................GAGCTGGAGAAAGGTGGTA.................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................................................................................................................ATGTGTGTCCTTTCTCCCCAGTT................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................................................................................................................................................AGCTGGAGAAAGGTCGCACCACA............................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................................................................................................................................AAGCAGAGCTGGAGAAAGGTCGCACC................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCACCACATGA.......................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................................................................................................TATGTGTGTCCTTTCTCCCCT................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................................................................................AAGAACCGTTTCCACCGTGTTTTCTT.................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCAGT................................................................................ | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.................................................................................................................................................................................ATATGTGTGTCCTTTCTCCCCATT................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................................ATTAAGAACCGTTTCCACCGTG......................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................TGTGTGTCCTTTCTCCCCAGTAA............................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................................................................ATATGTGTGTCCTTTCTCCCTT................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.........................................................................................................................................................TGGAGAAAGGTCGCACCACATTTT......................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCACATGA.......................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................................................................................................ATGTGTGTCCTTTCTCCCCAGC................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................GCTGGAGAAAGGTCGCACCACATGCCA........................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................................................................................................TATGTGTGTCCTTTCTCC...................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................TGTGTGTCCTTTCTCCCCAG.................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................................................CTGGAGAAAGGTCGCTGA................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................................................................................AAGAACCGTTTCCACCGTGTTTT..................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................AATTAAGAACCGTTTCCACCGT.......................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................................................CTGGAGAAAGGTCGCACCACCT............................................................................ | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
........................................................................................................................................................CTGGAGAAAGGTCGCACCACAT............................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................AGACTCCAGTGCAGGACT.............................................................................................................................. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
GTTGATGCCTGCTCAGGCTTTGTCTCAGGTTCTCTAAAGTGCTTTCTGCCCCAGGGCAAGCATATTCCTCTTTTAGTCCACATATCATGTCCTGCCCCATCTCAGTAGACTCCAGTGCAGGACTAAGCCCTCCGTGGTGCCGTGAAGCAGAGCTGGAGAAAGGTCGCACCACATGCCATATGTGTGTCCTTTCTCCCCAGGTAATTAAGAACCGTTTCCACCGTGTTTTCTTGCCCTCCCACTCACTGGA ..........................................................................................................................................................(((((((((.(((((............))))).)))))))))...................................................... ..................................................................................................................................................147..................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR685340(GSM1079784) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (dicer cell line) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR306530(GSM750573) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR525242(SRA056111/SRX170318) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR065056(SRR065056) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR023849(GSM307158) NPCsmallrna_rep1. (cell line) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR346418(SRX098259) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Liver) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR059767(GSM562829) DN3_Dicer. (thymus) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM314559(GSM314559) ESC dgcr8 (454). (ESC) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR306539(GSM750582) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR065049(SRR065049) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039153(GSM471930) HL1_siSrf1_smallRNAseq. (muscle) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR525238(SRA056111/SRX170314) Second IgG control. (Blood) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) |
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..................................................................CCTCTTTTAGTCCACATATCATGTCC.............................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................TGTCCTGCCCCATCTCAGT................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................TAGTCCACATATCATTATA.............................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................................................................................................................................................TATGTGTGTCCTTTCATGA..................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.........................CAGGTTCTCTAAAGTGCGC.............................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
........................................................................................................................................................................................TGTCCTTTCTCCCCAGTAA............................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
................................................................................................................................................................................................................................GTTTTCTTGCCCTCCCAA........ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | |
.......................................................................TTTAGTCCACATATCGT.................................................................................................................................................................. | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................CCTTTCTCCCCAGGTAG.............................................. | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
........................................................................................GTCCTGCCCCATCTCAGTTT.............................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
................................................................................................CCATCTCAGTAGACTCCTCG...................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |