| (1) AGO.mut | (1) AGO1.ip | (8) AGO2.ip | (2) AGO3.ip | (16) BRAIN | (1) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (7) EMBRYO | (7) ESC | (5) FIBROBLAST | (1) KIDNEY | (3) LIVER | (10) OTHER | (3) OTHER.mut | (4) SKIN | (5) SPLEEN | (7) TESTES | (1) THYMUS | (2) TOTAL-RNA | (1) TRIM32.ip | (1) UTERUS |
| GTGACCTTGGGCCTGGATCATCCCTCTGGCCCTGATGGGCTACAGGGCTGGGCTGGGGATGGTGCGACATCAGTGAGGAGGAGGGTGGCAAATCGCTGGTTAGGCAGTTTTGTACTTTGCTCTCTAACTAGAGGAGTGTGTGTGTGTTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTGGACTGGGCTGTGACTCTCTGCTTCCCCCCAGTGTTCATCTCCAGTTACATGGTGTTGGCACCAGTGTTTGGCTACCTGGGT .....................................................................................................................................................(((((..((.(((((.(((.....)))......))))).))..)))))..................................................... .............................................................................................................................................142.......................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR032477(GSM485235) sRNA_activation_deep_sequencing. (uterus) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR525243(SRA056111/SRX170319) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM317184(GSM317184) TRIM32 IP small RNAs from mouse brain. (trim32 brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR553604(SRX182810) source: Spermatocytes. (Spermatocytes) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGT................................................. | 22 | 1 | 18.00 | 18.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCT.................................................................................. | 22 | 1 | 16.00 | 16.00 | 13.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGA................................................. | 22 | 14.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGA..................................................................................... | 19 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................ACATGGTGTTGGCACCAGTGT.............. | 21 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................GTGACTCTCTGCTTCCCCCCAGT................................................. | 23 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................TTGCTGAGGGACCTGGACTG............................................................................ | 20 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................ACATGGTGTTGGCACCAGT................ | 19 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GACCTTGGGCCTGGACGGG..................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGAC.................................................................................... | 20 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAGGGGGTTGCTGAGGGACC................................................................................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAGGGGGTTGCTGAGGGACCTGA................................................................................ | 23 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................GACTCTCTGCTTCCCCCCAGT................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................AGAGGAGTGTGTGTGTGCACT.................................................................................................... | 21 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGTA................................................ | 23 | 1 | 2.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGTT................................................ | 23 | 1 | 2.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTACT............................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAGGGGGTTGCTGAGGGACCT.................................................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TGTGTGTGTTAGGGGAAGC............................................................................................. | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGAAGA.................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................CCTGATGGGCTACAGTTCC......................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................................................ACATGGTGTTGGCACCAGTGTTT............ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................GAGTGTGTGTGTGTTAGTAA................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTT................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGAACT.................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGTAA............................................... | 24 | 1 | 1.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTTA................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................CTGGACTGGGCTGTGCGGG................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................TGTGACTCTCTGCTTCCCCCCAG.................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................TGGGGATGGTGCGACTCCA.................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................GTGTGTGTGTTAGGGGAAGT............................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................TACATGGTGTTGGCACCAGTGTTTGGCT........ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGTAC............................................... | 24 | 1 | 1.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAGGGGGTTGCTGAGGGACCTGT................................................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGTTTGGCTACCTGGGTGTAT | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACT................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAGGGGGTTGCTGAGGGACCTGGAC.............................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................TGGGGATGGTGCGACAT.................................................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGAAA................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TACAGGGCTGGGCTGGGGATGGTGCG........................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ............................................................................................................................................TGTGTGTTAGGGGGTTGCT........................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTAT................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGG................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCCGA................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................TGCGACATCAGTGAGGTCGT........................................................................................................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTATT............................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................TGGGGATGGTGCGACCCT................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTTTAA.............................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................CCTGATGGGCTACAGC............................................................................................................................................................................................................ | 16 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACC................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAGGGGGTTGCTGAGGGACCA.................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................TACATGGTGTTGGCACCAGTGTTTGGCTA....... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TAGGGGGTTGCTGAGGGCC.................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................AGGAGTGTGTGTGTGTAGTC................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................GTGACTCTCTGCTTCCCCCCAGA................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTAA................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................TGGGGATGGTGCGACGG.................................................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................TTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTA................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCCCCAGAA................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................AGGAGTGTGTGTGTGTTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTGGACTGGGCTGTGACTCTCTGCTTCCCCCCA................................................... | 68 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................CAAATCGCTGGTTA.................................................................................................................................................... | 14 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................CTCTCTGCTTCCCCCCAGT................................................. | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
| ...................................................................................................................................................................................TGACTCTCTGCTTCCCC...................................................... | 17 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GTGACCTTGGGCCTGGATCATCCCTCTGGCCCTGATGGGCTACAGGGCTGGGCTGGGGATGGTGCGACATCAGTGAGGAGGAGGGTGGCAAATCGCTGGTTAGGCAGTTTTGTACTTTGCTCTCTAACTAGAGGAGTGTGTGTGTGTTAGGGGGTTGCTGAGGGACCTGGACTGGGCTGTGACTCTCTGCTTCCCCCCAGTGTTCATCTCCAGTTACATGGTGTTGGCACCAGTGTTTGGCTACCTGGGT .....................................................................................................................................................(((((..((.(((((.(((.....)))......))))).))..)))))..................................................... .............................................................................................................................................142.......................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345205(SRX097266) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR059765(GSM562827) DN3_control. (thymus) | SRR032477(GSM485235) sRNA_activation_deep_sequencing. (uterus) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR525243(SRA056111/SRX170319) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR306537(GSM750580) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM317184(GSM317184) TRIM32 IP small RNAs from mouse brain. (trim32 brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR553604(SRX182810) source: Spermatocytes. (Spermatocytes) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR042463(GSM539855) mouse natural killer cells [09-002]. (spleen) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) |
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| ............................................................................................................................................................................................GCTTCCCCCCAGTGTTGCGG.......................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ........................................................................................................................................................................................CTCTGCTTCCCCCCAGCG................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................................CAGTGTTCATCTCCACTAA.................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |