(1) AGO.mut | (7) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (2) B-CELL | (20) BRAIN | (2) CELL-LINE | (3) DGCR8.mut | (6) EMBRYO | (8) ESC | (3) FIBROBLAST | (2) HEART | (1) KIDNEY | (9) LIVER | (1) LUNG | (8) OTHER | (9) OTHER.mut | (1) PIWI.mut | (3) SKIN | (3) SPLEEN | (14) TESTES | (9) TOTAL-RNA | (1) UTERUS |
CAGGTGTCGCAGGGCTAACTTGCCCGCCTCCCCAGTCTTCGAGCACTTCCGTGAGACTGGAGCTTGGTCTGCATGGGAGTGGGGCGGGGGGGGGGGGGCGTTTGGGGAGGGGAGAAGAAAAGCAGGTGGGTGGGGCTCGGGGAAGGTGTCAGGATCTGCACCCATCTGGGGACGAGGCATGAGGAATTTGGTGGCTTTGGGGAGGGGACAAGTTCCCAAGTGGTCCTGCCCTTTGACTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGGTGTCTGTCTCTCTAAGGAAGCAGAGCGGAAGCTGCTGACTTGGGAGTCT ...........................................................................................................................................................................................................((((.((((.((((.((..(((.........)))..)))))))))).))))...................................................... ....................................................................................................................................................................................................197..........................................................258................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR095855BC3(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM510454(GSM510454) newborn_rep10. (total RNA) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR037909(GSM510446) newborn_rep2. (total RNA) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR346414(SRX098255) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Spleen) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR553584(SRX182790) source: Heart. (Heart) | SRR039152(GSM471929) HL1_siNon_smallRNAseq. (muscle) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAG.................................................. | 22 | 1 | 94.00 | 94.00 | 25.00 | 11.00 | 10.00 | 4.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGA................................................. | 23 | 1 | 13.00 | 94.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................GAGGGGACAAGTTCCCAAGTGGT.................................................................................... | 23 | 1 | 11.00 | 11.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGT................................................. | 23 | 1 | 8.00 | 94.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................AGGGGACAAGTTCCCAAGTGG..................................................................................... | 21 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................GAGGGGACAAGTTCCCAAGTGGTC................................................................................... | 24 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCTGGGACTTGGCCCTGCAG.................................................. | 21 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................AGGGGACAAGTTCCCAAGTGGT.................................................................................... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................................................................................................................................................................................................................................TGGGACTTGGCCCTGCAG.................................................. | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................AGGGGACAAGTTCCCAAGTGGTC................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................AGGGGACAAGTTCCCAAGTGGTCT.................................................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................TGGGAGTGGGGCGGGACA......................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCTGGGACTTGGCCCTGCAGAAT............................................... | 24 | 1 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................GGGGACAAGTTCCCAAGTGGTC................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGAAA............................................... | 25 | 1 | 2.00 | 94.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................GTGGGGCGGGGGGGGCGG.................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................GTGAGACTGGAGCTTGGTC............................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAAA................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGAT................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 94.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................GAGGGGACAAGTTCCCAAGTGGTCT.................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................................................................................................................................................GCACCCATCTGGGGACGAGGCAT................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
............................................ACTTCCGTGAGACTGGAG...................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTGTCTCTCTAAGGAAGCAG.......................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCGGTA................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................................................................TGGGTGGGGCTCGGGGTT.................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGC.................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTCTCTCTAAGGAAG............................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTTCAG.................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.....................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGTCTCTCTAAGGAAGCAG.......................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................GGGAGTGGGGCGGGGCGTT....................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
...............................................................................TGGGGCGGGGGGGGGTGTT.................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................GCACTTCCGTGAGACTGTAG...................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................................................................................................................CCTGGGACTTGGCCCTGCAGA................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.............................................................................................................................................................................................................................................TCCTGGGACTTGGCCCTGCA................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................................GGGGACGAGGCATGAGGAATTT....................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................TTGCCCGCCTCCCCAACCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...............................................................................................................................................................................................TGGCTTTGGGGAGGGCGAG.................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
........................................................................................................................................................................................................GGAGGGGACAAGTTCCCAAGTGGTCT.................................................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................................GTTTGGGGAGGGGAGCGT............................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
........................................................................................................................................................................................................GGAGGGGACAAGTTCCCAAG........................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGTAA............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 94.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................GGGGACAAGTTCCCAAGTGGTT................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.....................................................................................................................................................................................................TGGGGAGGGGACAAGTTCT............................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
................AACTTGCCCGCCTCCCCAGT................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................TGGGGCGGGGGGGGGAGCC.................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...............................................................................................................................................................................................................................................CTGGGACTTGGCCCTGCAGA................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGAA................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 94.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................................................................................................................................TTGACTCCTGGGACTTGGC......................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................GTGGGGCGGGGGGGGGTTGA.................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................................................................................CCTGCAGGTGTCTGTCTCTCTAAGGAAGC............................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGCAGAGCGGAAGCTGCT............. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TGAGACTGGAGCTTGCATA.............................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCA................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAAT................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGCTGCTGACTTGGGAAAA. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.........................................................................................................................................................................................................GAGGGGACAAGTTCCCAAGTGG..................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGCGGAAGCTGCTGACGCTC...... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.......................................................................................................................................................................................................GGGAGGGGACAAGTTCCCAAGTGG..................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGATT............................................... | 25 | 1 | 1.00 | 94.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................CTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGTT................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 94.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCCTGCAGGTGTC............................................. | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
....................................................GAGACTGGAGCTTGGTCTG............................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
.........................................................................................................................................CGGGGAAGGTGTCAG............................................................................................................................................................ | 15 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
CAGGTGTCGCAGGGCTAACTTGCCCGCCTCCCCAGTCTTCGAGCACTTCCGTGAGACTGGAGCTTGGTCTGCATGGGAGTGGGGCGGGGGGGGGGGGGCGTTTGGGGAGGGGAGAAGAAAAGCAGGTGGGTGGGGCTCGGGGAAGGTGTCAGGATCTGCACCCATCTGGGGACGAGGCATGAGGAATTTGGTGGCTTTGGGGAGGGGACAAGTTCCCAAGTGGTCCTGCCCTTTGACTCCTGGGACTTGGCCCTGCAGGTGTCTGTCTCTCTAAGGAAGCAGAGCGGAAGCTGCTGACTTGGGAGTCT ...........................................................................................................................................................................................................((((.((((.((((.((..(((.........)))..)))))))))).))))...................................................... ....................................................................................................................................................................................................197..........................................................258................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverKO2() Liver Data. (Zcchc11 liver) | mjLiverWT1() Liver Data. (liver) | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR037912(GSM510449) newborn_rep5. (total RNA) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR390300(GSM849858) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastinfect. (ago2 fibroblast) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | GSM510450(GSM510450) newborn_rep6. (total RNA) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR346419(SRX098260) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Lung) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | SRR042457(GSM539849) mouse mast cells [09-002]. (bone marrow) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR095855BC3(SRX039178) sequencing of miRNA from wild type and diseas. (heart) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR306535(GSM750578) 19-24nt. (ago2 brain) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM510454(GSM510454) newborn_rep10. (total RNA) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | GSM510453(GSM510453) newborn_rep9. (total RNA) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR037909(GSM510446) newborn_rep2. (total RNA) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR346414(SRX098255) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Spleen) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR553584(SRX182790) source: Heart. (Heart) | SRR039152(GSM471929) HL1_siNon_smallRNAseq. (muscle) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | SRR206940(GSM723281) other. (brain) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
..............................................................................................................................................................................................................................................CCTGGGACTTGGCCCTGCAG.................................................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................................AGTGGTCCTGCCCTTTGACT...................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.................ACTTGCCCGCCTCCCCAGTCTTCGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................................................GACTCCTGGGACTTGGCCC....................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGCTGACTTGGGAGGT. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.....................................................................................................................................................................................................................................CCTTTGACTCCTGGGACTT............................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTGTCTCTCTAAACG............................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTGTCTCTCTAAGGAA.............................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................CCGCCTCCCCAGTCTTCGAGCACTT.................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................GCCTCCCCAGTCTTCGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |