| (1) AGO.mut | (5) AGO2.ip | (3) B-CELL | (19) BRAIN | (2) CELL-LINE | (2) DGCR8.mut | (6) EMBRYO | (2) ESC | (2) FIBROBLAST | (8) LIVER | (2) LYMPH | (13) OTHER | (3) OTHER.mut | (1) PANCREAS | (1) PIWI.ip | (3) SPLEEN | (3) TESTES |
| TGGAAATTGTGGCCCCCTCGAGGATTTTGGCTAGGCACGGGCTAGCATCTGCTCAAACCTCTTCCTTTCTGTCTTGTTTTCCTGGGGAAATTGCTTGTGTGTGTGGGGGGGGGTGTCCTGCTGGGAAGGCAATGCCTGCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAACACCCACTCCCCAGAGCTTTCCTTTCCCCACCTCCCCAGACTTCGAGCAGGAGTCCGGCCTTGAGACGGCCATGCGGTTCATCCCTGAT ...........................................................................................................................................(((((((..((((((.((((((......(((....)))..))))))))))))..))))))).................................................. .....................................................................................................................................134...............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042461(GSM539853) mouse dendritic cells [09-002]. (bone marrow) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042462(GSM539854) mouse macrophages [09-002]. (bone marrow) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR065047(SRR065047) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042455(GSM539847) mouse plasma cells [09-002]. (blood) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059774(GSM562836) MEF_control. (MEF) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR525238(SRA056111/SRX170314) Second IgG control. (Blood) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR042454(GSM539846) mouse germinal center B cells (lymph node) [09-002]. (b cell) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAAT........................................................................................ | 24 | 1 | 9.00 | 7.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TTCCTTTCCCCACCTCCCCAGT................................................. | 22 | 8.00 | 0.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAA......................................................................................... | 23 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGATTT....................................................................................... | 26 | 1 | 5.00 | 4.00 | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGA.......................................................................................... | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GGAGTCCGGCCTTGAGAC...................... | 18 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGG........................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAA......................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGA.......................................................................................... | 22 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTGGGGACCTGGGGGTGAGGAAT........................................................................................ | 23 | 1 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAAA........................................................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 7.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTGGGGACCTGGGGGTGAGGAA......................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TGGGGACCTGGGGGTGAGGAAT........................................................................................ | 22 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TGAGACGGCCATGCGGTTCATCCCTGA. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGACTTCGAGCAGGATAT.................................. | 18 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................GCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAG......................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TTCCTTTCCCCACCTCCCCAGA................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................TGCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGA.......................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................TCCTGGGGAAATTGCTTGTGTGTGTGT................................................................................................................................................ | 27 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................AGGAGTCCGGCCTTGAGAC...................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTGGGGACCTGGGGGTGAA............................................................................................ | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................GCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAAT........................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................CCTGCTGGGAAGGCAATGCCTGCCTGGGG......................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAATA....................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GGAGTCCGGCCTTGAGACGGCCATGCG............. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................AGTCCGGCCTTGAGACGGCCAT................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................CCTTTCCCCACCTCCCCAGAC................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAG............................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GCCTGGGGACCTGGGGGTGAGG........................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCGGTTCATCCCTGAT | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................CTTTCCCCACCTCCCCAGTTT............................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................GGAACACCCACTCCCCGGC.......................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................TTTCCTTTCCCCACCTCCCCAAGT................................................ | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGATG........................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAAC........................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................AGGAGTCCGGCCTTGAGACGGCCA................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................CTGGGGACCTGGGGGTGAGGAAA........................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TTCCTTTCCCCACCTCCCCAGTAA............................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTTCCCCACCTCCCCAGT................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................TTTCCTTTCCCCACCTCCCCAGA................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................GGAGTCCGGCCTTGAGACGGC................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................TTTCCTTTCCCCACCTCCCCAGAT................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAATAAA..................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TTCCTTTCCCCACCTCCCCAGTTT............................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................TCCTTTCCCCACCTCCCCAGA................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................TTCCTTTCCCCACCTCCCCAGTT................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TGGGGACCTGGGGGTGAG............................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................CAGGAGTCCGGCCTTGAGCC...................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................................TCCGGCCTTGAGACGGCCATGCGGTTCA........ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................CAGGAGTCCGGCCTTGAGACGGTT.................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................TTCCTTTCCCCACCTCCCCAGC................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................TGGGGACCTGGGGGTGAGGAAC........................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................CCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAAAT....................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................TGGGGACCTGGGGGTGAGGAAA........................................................................................ | 22 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .....................................................................................................................................................................................CCTTTCCCCACCTCCCCAGAGT............................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................................................................................................................................................................AGACTTCGAGCAGGAGATT................................. | 19 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGACTTCGAGCAGGAGATA................................. | 19 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGACTTCGAGCAGGAG.................................... | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................GAGGAACACCCACTC................................................................................ | 15 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 |
| TGGAAATTGTGGCCCCCTCGAGGATTTTGGCTAGGCACGGGCTAGCATCTGCTCAAACCTCTTCCTTTCTGTCTTGTTTTCCTGGGGAAATTGCTTGTGTGTGTGGGGGGGGGTGTCCTGCTGGGAAGGCAATGCCTGCCTGGGGACCTGGGGGTGAGGAACACCCACTCCCCAGAGCTTTCCTTTCCCCACCTCCCCAGACTTCGAGCAGGAGTCCGGCCTTGAGACGGCCATGCGGTTCATCCCTGAT ...........................................................................................................................................(((((((..((((((.((((((......(((....)))..))))))))))))..))))))).................................................. .....................................................................................................................................134...............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR306532(GSM750575) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042461(GSM539853) mouse dendritic cells [09-002]. (bone marrow) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042462(GSM539854) mouse macrophages [09-002]. (bone marrow) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR038744(GSM527279) small RNA-Seq. (brain) | SRR060845(GSM561991) total RNA. (brain) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR065059(SRR065059) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR039186(GSM485326) shLuc.1309;ROSA-rtTA (+dox). (fibroblast) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR059776(GSM562838) MEF_Dicer. (MEF) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346425(SRX098267) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | mjLiverWT3() Liver Data. (liver) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | mjLiverKO3() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | GSM640580(GSM640580) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR042472(GSM539864) mouse iTreg cells [09-002]. (lymph) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR065047(SRR065047) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042455(GSM539847) mouse plasma cells [09-002]. (blood) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059774(GSM562836) MEF_control. (MEF) | SRR345202(SRX097263) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR073955(GSM629281) total RNA. (blood) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR525238(SRA056111/SRX170314) Second IgG control. (Blood) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | SRR042454(GSM539846) mouse germinal center B cells (lymph node) [09-002]. (b cell) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................................................................................................................................................................................CATGCGGTTCATCCCC... | 16 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................................TTTCCCCACCTCCCCAAA................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................AACCTCTTCCTTTCTGCT................................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......TGTGGCCCCCTCGAGGAT................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................GACTTCGAGCAGGAGCCA................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................TGGGAAGGCAATGCCTAG............................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................TCCCCACCTCCCCAGTGGA.............................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | |
| ........GTGGCCCCCTCGAGGATCT............................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................GGAACACCCACTCCCCAT........................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................AAACCTCTTCCTTTCTGT.................................................................................................................................................................................. | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |