(6) AGO2.ip | (4) B-CELL | (14) BRAIN | (3) CELL-LINE | (2) DCR.mut | (1) DGCR8.mut | (7) EMBRYO | (9) ESC | (1) FIBROBLAST | (1) KIDNEY | (1) LIVER | (2) LYMPH | (2) OTHER | (1) OTHER.ip | (3) OTHER.mut | (2) PIWI.ip | (3) PIWI.mut | (7) SPLEEN | (21) TESTES |
ATGGCGTGGCACTTCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAACTGGACAAGGTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTCCTCGCCTCTTTGTGGGAAGGGTTGCTCCTGAGCTCAGTCCAGTCATGCTTCTCTTTCAGGGCCTGGGTGGATTTAACGGATTCATCATCTCCATGCTGGTTGCCTTCCT ...................................................((((((..(((..((((...((((.(((......)))))))))))..)))...))))))......................................................................... ..................................................51...............................................................116................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. (blood) | SRR306540(GSM750583) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR042468(GSM539860) mouse Th1 cells [09-002]. (lymph) | SRR059769(GSM562831) Treg_Drosha. (spleen) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR042454(GSM539846) mouse germinal center B cells (lymph node) [09-002]. (b cell) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | SRR402761(SRX117944) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR042487(GSM539879) mouse BclXL B activated with LPS/IL4 [BalbC] [09-002]. (spleen) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
.........................................................................................GAAGGGTTGCTCCTGAGCTCAGT....................................................................... | 23 | 1 | 18.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................GAAGGGTTGCTCCTGAGCTCA......................................................................... | 21 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................AGCGGGAACTGGACAAG..................................................................................................................................... | 17 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTC............................................................................................................. | 24 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTCC............................................................................................................ | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................TGGCTGAGGCAGCGGGAACTG........................................................................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................CAGCGGGAACTGGACAAG..................................................................................................................................... | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................TTGGCTGAGGCAGCGGGAACAA........................................................................................................................................... | 22 | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.........................................................................................GAAGGGTTGCTCCTGAGCTCAGTCC..................................................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................................................GCCTGGTTTCCTCGCCTCTTTGTGGGA............................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................GAAGGGTTGCTCCTGAGCTCAGTCT..................................................................... | 25 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | |
....................GTTTGGCTGAGGCAGCGGGAACTGGA......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................GAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAACT............................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTT.............................................................................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................AGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAAC............................................................................................................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................................ACGGATTCATCATCTCCATGCTGG.......... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........GCACTTCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGA............................................................................................................................................... | 32 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................CAGTCCAGTCATGCTTCTCTTTCAG.................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......GGCACTTCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGA............................................................................................................................................... | 33 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................................TCCAGTCATGCTTCTCTTTCAG.................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................TGGCTGAGGCAGCGGGAAC............................................................................................................................................. | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................TTGGCTGAGGCAGCGGGAACTT........................................................................................................................................... | 22 | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........CTTCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGG................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................GAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAA.............................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............TGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAA.............................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................GAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGG................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTTT............................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTAA.............................................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................GTTTGGCTGAGGCAGCGGGAACTGGAC........................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................AACGGATTCATCATCTCCATGCTGGTTGCC..... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................GGATTCATCATCTCCAT............... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............TGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGACATC........................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............TGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGA............................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................GGGCCTGGGTGGATTTAAC................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................................................................................................CCAGTCATGCTTCTCTTTCAG.................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
.............TCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGG................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTCACA.......................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................GCGGGAACTGGACAAGGGCCT................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............TTCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCG.................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................................................................................................................................TTCAGGGCCTGGGTGGGAGA................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTCCAAAA........................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................GAAGGGTTGCTCCTGAGCTCTGT....................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................GCGGGAACTGGACAAGG.................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCT................................................................................................................... | 18 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
................GAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAATT............................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................GAAGGGTTGCTCCTGAGCTCCGT....................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............TTCTGAAGGTTTGGCTGA......................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............TGAAGGTTTGGCTGAGGCA..................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTTAT........................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............TTCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGG................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............TCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGTT.............................................................................................................................................. | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTAG............................................................................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............CTGAAGGTTTGGCTGAGGC...................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTA.............................................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
................GAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAACTG........................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............TGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGG................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................TGGCTGAGGCAGCGGGAACTGGACAAG..................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTGAGTTGTGGGTGGCCTC.................................................................................................................. | 19 | 2 | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
....................................................................................................................................GGGCCTGGGTGGATT.................................... | 15 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................................................................TAACGGATTCATC....................... | 13 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
ATGGCGTGGCACTTCTGAAGGTTTGGCTGAGGCAGCGGGAACTGGACAAGGTGAGTTGTGGGTGGCCTGGTTTCCTCGCCTCTTTGTGGGAAGGGTTGCTCCTGAGCTCAGTCCAGTCATGCTTCTCTTTCAGGGCCTGGGTGGATTTAACGGATTCATCATCTCCATGCTGGTTGCCTTCCT ...................................................((((((..(((..((((...((((.(((......)))))))))))..)))...))))))......................................................................... ..................................................51...............................................................116................................................................. | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR345204(SRX097265) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR345196(SRX097257) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR345201(SRX097262) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR306544(GSM750587) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR059771(GSM562833) CD4_control. (spleen) | SRR042449(GSM539841) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR306533(GSM750576) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042474(GSM539866) mouse embryonic stem cells [09-002]. (ESC) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR306531(GSM750574) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR042459(GSM539851) mouse neutrophil cells replicate 1 [09-002]. 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(spleen) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR345203(SRX097264) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR038743(GSM527278) small RNA-Seq. (dicer brain) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | SRR039185(GSM485325) shLuc.1309;ROSA-rtTA (-dox). (fibroblast) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR042488(GSM539880) mouse BclXL germinal center B cells [BalbC] [09-002]. (B cell) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR042450(GSM539842) mouse B cells activated in vitro with LPS/IL4 replicate 3 [09-002]. (b cell) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) |
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