(1) AGO.mut | (2) AGO1.ip | (4) AGO2.ip | (2) AGO3.ip | (1) B-CELL | (6) BRAIN | (4) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (4) EMBRYO | (11) ESC | (1) KIDNEY | (2) LIVER | (1) LYMPH | (9) OTHER | (3) OTHER.mut | (1) PANCREAS | (5) PIWI.ip | (2) PIWI.mut | (9) SKIN | (2) SPLEEN | (20) TESTES | (5) TOTAL-RNA | (1) UTERUS |
CGCCGTTTCTTCTTCCGGGTGTCTGATGAGCTGCGACAGCAGCAGCGCAGGTGCTCGAGTGTGGCGTGGCTCTGGCTGCTGGGTGGGACTTTCTATTCTTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGCTAGCCCTGCACCTACACACCCTCTGCCTCCAGGGAGATGCTGAAGGACCCTTTTGTGCGCTCCAAGTTCATCTCGCCGCCCA ...................................................................................................((((((((((((((((..((((.........)))))))...))))))..)))))))................................................... .............................................................................................94............................................................156................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314559(GSM314559) ESC dgcr8 (454). (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR065054(SRR065054) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR037909(GSM510446) newborn_rep2. (total RNA) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR037923(GSM510461) e9p5_rep1. (embryo) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | RuiDcrWT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR042451(GSM539843) mouse B cells activated in vitro with LPS/aIgD-Dextran [09-002]. (b cell) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (salivary gland) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | RuiDGCR8WT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR065045(SRR065045) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCAGT................................................. | 25 | 1 | 21.00 | 8.00 | 3.00 | 8.00 | 1.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCC.................................................... | 22 | 1 | 19.00 | 19.00 | 9.00 | 3.00 | 4.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCCAGT................................................. | 24 | 1 | 19.00 | 5.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGCTAGCCCTGCACCTACACACCCTCTGCCTCCAGT................................................. | 59 | 15.00 | 0.00 | - | - | - | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCA................................................... | 23 | 1 | 12.00 | 12.00 | 4.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCAG.................................................. | 24 | 1 | 8.00 | 8.00 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGC...................................................................................... | 22 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTC..................................................... | 21 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCT...................................................... | 20 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCCAG.................................................. | 23 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
................GGGTGTCTGATGAGCTGCGACAGCAGCA.................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCAGA................................................. | 25 | 1 | 3.00 | 8.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCCAGA................................................. | 24 | 1 | 3.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTTT.................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 6.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................TGGGGGCGGGGTGAGGCTTGC...................................................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCAGC................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCAT.................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 12.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................GGGAGATGCTGAAGGACCC................................ | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCA..................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCCCGT................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................TCTGATGAGCTGCGACAGCAGCAGCGCA............................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCT......................................................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGATGGT......................................................................................... | 19 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCCA................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................ACCCTTTTGTGCGCTCCAAGTTC............. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................TTCTTGGGGGCGGGGTGGCTT.......................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGACT...................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............TTCCGGGTGTCTGATGAGCTGCGAC......................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCATT................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 12.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCCAT.................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................CTACACACCCTCTGCCTCCAGTA................................................ | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCT.................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCAGTA................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 8.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCAAGT................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................TGGGGGCGGGGTGAGGCTTGT...................................................................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTA....................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCCCGC................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............TCCGGGTGTCTGATGAGCTGCGACAGC...................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................................................TGCTGAAGGACCCTTTTGTGCGCTCC................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
................GGGTGTCTGATGAGCTGCGAC......................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................GTGGGACTTTCTATTCTTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGCTAGCCCTGCACCTACACACCCTCTGCCTCCAG.................................................. | 74 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCAT................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGCTAGCCCTGCACCTACACACCCTCTGCCTCCAGA................................................. | 59 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.GCCGTTTCTTCTTCCCCT........................................................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............CCGGGTGTCTGATGAGCTGC............................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................CACCTACACACCCTCTGCCTCCAGTTA............................................... | 27 | 1 | 1.00 | 8.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................................CTTGCATGCTAGCCCTGT......................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | |
....................................................................................................................................................................TGAAGGACCCTTTTGTGCGC...................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGCTAGCCCTGCACCTACACACCCTCTGCCTCCATT................................................. | 59 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................................TGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCAT.................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................................................................................................................................CCTACACACCCTCTGCCTCCAGT................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................TGGGACTTTCTATTCTTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGCTAGCCCTGCACCTACACACCCTCTGCCTCCAG.................................................. | 73 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................TTCTTGGGGGCGGGGTGC............................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.....................................................................................................................................ACCTACACACCCTCTGCCTCC.................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTG....................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................GTGTCTGATGAGCTGCGACAGCAGCAGCGCAGG........................................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGC.................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................GGGAGATGCTGAAGGACC................................. | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................................................TTGGGGGCGGGGTGAGGCTT........................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
CGCCGTTTCTTCTTCCGGGTGTCTGATGAGCTGCGACAGCAGCAGCGCAGGTGCTCGAGTGTGGCGTGGCTCTGGCTGCTGGGTGGGACTTTCTATTCTTGGGGGCGGGGTGAGGCTTGCATGCTAGCCCTGCACCTACACACCCTCTGCCTCCAGGGAGATGCTGAAGGACCCTTTTGTGCGCTCCAAGTTCATCTCGCCGCCCA ...................................................................................................((((((((((((((((..((((.........)))))))...))))))..)))))))................................................... .............................................................................................94............................................................156................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | Ago2IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR402760(SRX117943) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR023852(GSM307161) ZHBT-c424hsmallrna_rep1. (cell line) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR116846(GSM678422) Small RNA deep sequencing from mouse epididym. (epididymis) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM314559(GSM314559) ESC dgcr8 (454). (ESC) | GSM314552(GSM314552) ESC wild type (Illumina). (ESC) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR065054(SRR065054) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR037909(GSM510446) newborn_rep2. (total RNA) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR553583(SRX182789) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR037923(GSM510461) e9p5_rep1. (embryo) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | GSM510452(GSM510452) newborn_rep8. (total RNA) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR042467(GSM539859) mouse T cells activated in vitro with Concanavalin A [09-002]. (spleen) | RuiDcrWT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR042451(GSM539843) mouse B cells activated in vitro with LPS/aIgD-Dextran [09-002]. (b cell) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR037937(GSM510475) 293cand2. (cell line) | GSM510455(GSM510455) newborn_rep11. (total RNA) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (salivary gland) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | GSM314553(GSM314553) ESC dcr (Illumina). (ESC) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | RuiDGCR8WT(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (skin) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR345197(SRX097258) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR059768(GSM562830) Treg_control. (spleen) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR065045(SRR065045) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR073954(GSM629280) total RNA. (blood) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) |
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....................................................................GCTCTGGCTGCTGGGTGGGACTTTCTA............................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................GACCCTTTTGTGCGCTCCAAGTTCA............ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................................................................................................................TTTTGTGCGCTCCAAGTTCA............ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................................AGGACCCTTTTGTGCGCTCCAAGTTCA............ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..CCGTTTCTTCTTCCGGTCAT........................................................................................................................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....GTTTCTTCTTCCGGGAA......................................................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................CTAGCCCTGCACCTACACACCCTCT.......................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................................................................................................GGGCGGGGTGAGGCTTGGC..................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.GCCGTTTCTTCTTCCGGGTGTCTGATGA................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....GTTTCTTCTTCCGGGTGTCTGATGAGC............................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................AGCAGCAGCGCAGGTGCTCGAGTGT................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............CCGGGTGTCTGATGAGCTGCGACA........................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....TTTCTTCTTCCGGGTGAAAA..................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................................................................................................................................................ACCCTTTTGTGCGCTCCAAGT............... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................................................................GGACCCTTTTGTGCGCTCCAAGTTCA............ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........CTTCTTCCGGGTGTCTGATGAGCTGC............................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................................................................................................................................................................CTTTTGTGCGCTCCAAGTTCAT........... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................TGGCTCTGGCTGCTGGGTGGGACTTTCTA............................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................GGCTGCTGGGTGGGACCCC.................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.................................................................................................................................................................................TGTGCGCTCCAAGTTCATCTCGCCG.... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................................................................................................................................CCTACACACCCTCTGCCTCCAGGGAGA............................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..CCGTTTCTTCTTCCGGGTGTCTG..................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................................................................................................................GCATGCTAGCCCTGCAC....................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
......................................................................................................................GCATGCTAGCCCTGCACCT..................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |