(2) AGO1.ip | (3) AGO2.ip | (2) AGO3.ip | (2) B-CELL | (11) BRAIN | (4) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (6) EMBRYO | (8) ESC | (2) FIBROBLAST | (1) KIDNEY | (1) LIVER | (2) LYMPH | (8) OTHER | (5) OTHER.mut | (3) PIWI.ip | (2) PIWI.mut | (6) SKIN | (2) SPLEEN | (22) TESTES | (2) TOTAL-RNA |
CAAAAATACCAACAGCAGTAACAATCTCACCAGATCCTGTGCTGATGAAGGCAAGTCTTGTTCTGTCTACTGCGGTGGCCACATGGGAAGAGGGCTCTTTGTCCTGGCTCCCCTTCTCAGTTAGCTTTGGATGATGGGGATTGAGGGAACCACTTCATCATATTTTCCTCTTCATAGATTAGACGAGGTAATACTGTTAGCTCCCTTACTCTACCTGGGGCCACCACCAGAGCCCCATGAGGACCAGGGATACGGGGATAATAGAGGAAACGGGCTGTCATGTGCCTGAGACACAGAATAAGGAAGACAGGAGGTGGCATGCGATAGTTTGAGACTGACCAAGTGGCTGCCACCTCTACCTTCCAGGCTTTTCCACTCCTTGTGCCTTTGTGGTTGCGGTGTCAGGAGCCAATGGC .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((...((((((((((.((.((.(((.......)))...)).))))))))))))..))))).................................................... ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................295....................................................................366................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (salivary gland) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR525242(SRA056111/SRX170318) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR553586(SRX182792) source: Testis. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR065054(SRR065054) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR042477(GSM539869) mouse brain tissue [09-002]. (brain) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR065045(SRR065045) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042468(GSM539860) mouse Th1 cells [09-002]. (lymph) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCACCTCTACCTTCCAGT................................................. | 21 | 22.00 | 0.00 | - | 7.00 | 3.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCACCTCTACCTTCCAGA................................................. | 21 | 18.00 | 0.00 | - | 6.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCCACCTCTACCTTCCAGT................................................. | 22 | 1 | 16.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
.................................ATCCTGTGCTGATGAAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 11.00 | 11.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................CCAGATCCTGTGCTGATGAAGGCTTT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 8.00 | 0.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCAT................................................................................................ | 21 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGC.............................................................................................. | 23 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCCACCTCTACCTTCCAGA................................................. | 22 | 1 | 4.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCACCTCTACCTTCCAGA................................................. | 20 | 4.00 | 0.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGGCATGCGA............................................................................................ | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGA.............................................................................................. | 23 | 1 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGCGAT........................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGGCATGT.............................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATG............................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGGCATGCG............................................................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCCACCTCTACCTTCCAG.................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCCACTCCTTGTGCCTTTGTGGTTGCGG................. | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCCACCTCTACCTTCCTGT................................................. | 22 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.............................CCAGATCCTGTGCTGATGAAGGCTTTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGCGA............................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGGCATGCGAT........................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGGCATGA.............................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................CTGTGCTGATGAAGGCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
......TACCAACAGCAGTAACAATCTCACCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTGGTTGCGGTGTCAGGAGCCA..... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................CAGATCCTGTGCTGATGAAGGCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCACTCCTTGTGCCTTTGTGGTTGC................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATTC.............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGCG............................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGACTGACCAAGTGGCTGCCACA.............................................................. | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.....ATACCAACAGCAGTAACAATCT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGCCTTTGTGGTTGCGGTGTCA............ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGTTGCGGTGTCAGGAGCCAA.... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCAAGTGGCTGCCACCTCTACCTTCCAG.................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................GTTAGCTTTGGATGATGGGGATTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCACCTCTACCTTCCAGTT................................................ | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGAT............................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGCTT............................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................GTTCTGTCTACTGCGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCCACCTCTACCTTCCAGTA................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................GGAAACGGGCTGTCATGTGC................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGGCATG............................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGT.............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATAAA............................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
..................................................GCAAGTCTTGTTCTGTCTACTGCGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................CCAGATCCTGTGCTGATGAAGGCTT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTTGAGACTGACCAAG......................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATGCAAT........................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
............................................................................................................................CTTTGGATGATGGGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGCCACCTCTACCTTCCAGA................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................TCTCACCAGATCCTGTGCTGATGAAGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGCCACCTCTACCTTCCATT................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTGCCACCTCTACCTTCCAG.................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGGCATGCT............................................................................................. | 23 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGAAGACAGGAGGTGGCATAT.............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................GGGAAGAGGGCTCTTTGTCCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTGCCTTTGTGGTTGCGGTGTCA............ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGCCTTTGTGGTTGCGGTGTCAGGAGC....... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGTTGCGGTGTCAGGAGCCA..... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............................................................................................................................TTTGGATGATGGGGATTGAGGGAAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..AAAATACCAACAGCAGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCACCTCTACCTTCC.................................................... | 18 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAAGACAGGAGGTGG................................................................................................... | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
CAAAAATACCAACAGCAGTAACAATCTCACCAGATCCTGTGCTGATGAAGGCAAGTCTTGTTCTGTCTACTGCGGTGGCCACATGGGAAGAGGGCTCTTTGTCCTGGCTCCCCTTCTCAGTTAGCTTTGGATGATGGGGATTGAGGGAACCACTTCATCATATTTTCCTCTTCATAGATTAGACGAGGTAATACTGTTAGCTCCCTTACTCTACCTGGGGCCACCACCAGAGCCCCATGAGGACCAGGGATACGGGGATAATAGAGGAAACGGGCTGTCATGTGCCTGAGACACAGAATAAGGAAGACAGGAGGTGGCATGCGATAGTTTGAGACTGACCAAGTGGCTGCCACCTCTACCTTCCAGGCTTTTCCACTCCTTGTGCCTTTGTGGTTGCGGTGTCAGGAGCCAATGGC .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((...((((((((((.((.((.(((.......)))...)).))))))))))))..))))).................................................... ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................295....................................................................366................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR279907(GSM689057) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR390297(GSM849855) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (fibroblast) | Ago3IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | GSM510456(GSM510456) newborn_rep12. (total RNA) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR042458(GSM539850) mouse basophil cells [09-002]. (b cell) | SRR037935(GSM510473) 293cand3. (cell line) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR279903(GSM689053) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402762(SRX117945) source: ES E14 male cells. (ESC) | SRR279905(GSM689055) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029123(GSM416611) NIH3T3. (cell line) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR346422(SRX098264) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Muscle) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR042471(GSM539863) mouse TFHS cells [09-002]. (spleen) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | GSM314557(GSM314557) ESC dgcr8 (Illumina). (ESC) | SRR042484(GSM539876) mouse salivary gland tissue [09-002]. (salivary gland) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR525242(SRA056111/SRX170318) Mus musculus domesticus miRNA sequencing. (ago2 Blood) | SRR039154(GSM471931) HL1_siSrf2_smallRNAseq. (muscle) | SRR346415(SRX098256) source: Testis. (Testes) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR553586(SRX182792) source: Testis. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR345207(SRX097268) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR039183(GSM485323) shLuc.1309 (-dox). (fibroblast) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR546155(SRX180174) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (ago2 Neuroblastoma) | SRR279906(GSM689056) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR065054(SRR065054) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (jejunum) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR042447(GSM539839) mouse mature B cells (spleen) replicate 2 [09-002]. (b cell) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR345199(SRX097260) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR037929(GSM510467) e7p5_rep3. (embryo) | SRR042477(GSM539869) mouse brain tissue [09-002]. (brain) | RuiDGCR8KO(Rui) DGCR8-dependent microRNA biogenesis is essent. (dgcr8 skin) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR346424(SRX098266) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Neuroblastoma) | SRR042469(GSM539861) mouse Th2 cells [09-002]. (lymph) | SRR037914(GSM510451) newborn_rep7. (total RNA) | GSM519104(GSM519104) mouse_granulocyte_nuclei_smallRNAs. (cell line) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | Ago2IP504(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago2 skin) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR059775(GSM562837) MEF_Drosha. (MEF) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR037906(GSM510442) brain_rep3. (brain) | SRR553585(SRX182791) source: Kidney. (Kidney) | SRR065045(SRR065045) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (liver) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR042468(GSM539860) mouse Th1 cells [09-002]. (lymph) | SRR279904(GSM689054) cell type: mouse embryonic stem cellcell line. (ESC) | SRR059772(GSM562834) CD4_Drosha. (spleen) |
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............................................................TTCTGTCTACTGCGGTAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCACCTCTACCTTCCAG.................................................. | 18 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGCTTTTCCACTCT..................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................................................................................................................................CCACCACCAGAGCCCGCTT................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | |
......................................................................................GAAGAGGGCTCTTTGTTGT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCTCTACCTTCCAAATG............................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTTTTCCACTC...................................... | 16 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |