| (1) AGO.mut | (2) AGO1.ip | (6) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (18) BRAIN | (2) CELL-LINE | (1) DCR.mut | (2) DGCR8.mut | (11) EMBRYO | (1) ESC | (2) FIBROBLAST | (1) HEART | (1) KIDNEY | (8) LIVER | (3) OTHER | (4) OTHER.mut | (1) PANCREAS | (1) PIWI.ip | (3) SKIN | (8) TESTES | (1) UTERUS |
| GGCTTGTGGAATGGTTGACAGTATCAAAGCCCAGCAGGAGGAAAAGATTTCATCCTCCCCAGTGACTCAATGTGTCTCTTAAATAAGGTGCAGCTCTTCTCATGGGCAACCTACCTGGAAACAAGAAGGTCTTGTCCTGGCTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTTGAGGACTAATGAAGCTCTCTGCTTGCTCACCTAGGACTGTCCCCAGCTCGTGCCCACGGAGGAGATTCTGATCCCAGTTGGGGA ........................................................................................................................................((((....((..((.(((((((((..((((...))))...)).))))))).))..))...)))).................................................. ........................................................................................................................................137............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR553584(SRX182790) source: Heart. (Heart) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | GSM640577(GSM640577) small RNA in the liver with paternal control . (liver) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | GSM261958(GSM261958) oocytesmallRNA-24to30. (oocyte) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGT..................................................................................... | 24 | 1 | 53.00 | 53.00 | - | - | 4.00 | 12.00 | 5.00 | 3.00 | - | 2.00 | 2.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTCAGGTGAGGAGAGAGCTCT......................................................................................... | 21 | 1 | 25.00 | 25.00 | 20.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGA....................................................................................... | 22 | 1 | 17.00 | 17.00 | - | 6.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAG...................................................................................... | 23 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGT..................................................................................... | 23 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTT.................................................................................... | 25 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTT.................................................................................... | 24 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTTA....................................................................................... | 23 | 1 | 7.00 | 25.00 | - | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTTGAGGACTAATGAAGCTCTCTGCTTGCTCACCTAG.................................................. | 59 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGA..................................................................................... | 24 | 1 | 4.00 | 10.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GAGTTGAGGACTAATGAAGCTCT.................................................................. | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................TGAAGCTCTCTGCTTGCTCACCT.................................................... | 23 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTAAT...................................................................................... | 24 | 1 | 3.00 | 25.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTTGAGGACTAATGAAGCTCTCTGCTTGCTCACCTAGA................................................. | 60 | 1 | 3.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................AGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTT.................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGA....................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTA........................................................................................ | 22 | 1 | 2.00 | 25.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................TGAAGCTCTCTGCTTGCTCACCTAGT................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................CTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTAAA...................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 25.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGGTTGACAGTATCAAA.............................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................CGTGCCCACGGAGGAG.................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................AGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGT..................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................CCAGCTCGTGCCCACGGA........................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................AAGGTGCAGCTCTTCGGC.................................................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................................................................ACGGAGGAGATTCTGATCCC......... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGA..................................................................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................TGAAGCTCTCTGCTTGCTCA....................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAA...................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................GTCCCCAGCTCGTGCCCACGGAGGAGA................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................CTCTCTGCTTGCTCACCTAGA................................................. | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................................GCCCACGGAGGAGATTCTGAT............ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TGAGGAGAGAGCTCTGAGTTGAGTTT.............................................................................. | 26 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTG........................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAGGTGAGGAGAGAGCTTT......................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................TGGCTCAGGTGAGGAAGGC.............................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................TGGCTCAGGTGAGGAGGAAC............................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .......................................................................................................................................................................AGGACTAATGAAGCTCTCT................................................................ | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................TCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTA.................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 53.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................GGAGATTCTGATCCCAGTTGGGGA | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................AAAGATTTCATCCTCGATA............................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .........................................................................................................................................................................................................................GCCCACGGAGGAGATTCT............... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTTGAGGACTAATGAAGCTCTCTGCTTGCTCACCTAG.................................................. | 58 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................GCTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTAG....................................................................................... | 24 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....TGTGGAATGGTTGACCTCG................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............................................................................................................................................CAGGTGAGGAGAGAGCTCTG........................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................AAGCCCAGCAGGAGGAAA.............................................................................................................................................................................................................. | 18 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |
| ....................................................................................................................................................................TTGAGGACTAATGAAG...................................................................... | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 |
| GGCTTGTGGAATGGTTGACAGTATCAAAGCCCAGCAGGAGGAAAAGATTTCATCCTCCCCAGTGACTCAATGTGTCTCTTAAATAAGGTGCAGCTCTTCTCATGGGCAACCTACCTGGAAACAAGAAGGTCTTGTCCTGGCTCAGGTGAGGAGAGAGCTCTGAGTTGAGGACTAATGAAGCTCTCTGCTTGCTCACCTAGGACTGTCCCCAGCTCGTGCCCACGGAGGAGATTCTGATCCCAGTTGGGGA ........................................................................................................................................((((....((..((.(((((((((..((((...))))...)).))))))).))..))...)))).................................................. ........................................................................................................................................137............................................................200................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjLiverWT2() Liver Data. (liver) | mjLiverKO1() Liver Data. (Zcchc11 liver) | SRR391848(GSM852143) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR394084(GSM855970) background strain: C57BL6/SV129cell type: KRa. (dicer cell line) | SRR391849(GSM852144) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391850(GSM852145) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR346421(SRX098263) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (mixture) | SRR391852(GSM852147) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR391847(GSM852142) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR391845(GSM852140) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR391846(GSM852141) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-tis. (embryo) | SRR685339(GSM1079783) Small RNAs (15-50 nts in length) from immorta. (cell line) | SRR391853(GSM852148) gender: femalegenotype/variation: ADAR2-/-/AD. (embryo) | SRR345198(SRX097259) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | SRR040488(GSM533911) E18.5 wild type LIVER small RNA. (liver) | SRR553582(SRX182788) source: Brain. (Brain) | SRR390299(GSM849857) cell line: NIH-3T3cell type: fibroblastip ant. (ago2 fibroblast) | SRR038742(GSM527277) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | SRR345200(SRX097261) source: size fractionated RNA from mouse hipp. (brain) | Ago3IP805(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago3 skin) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | Ago1IP812(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR391851(GSM852146) gender: femalegenotype/variation: wild typeti. (embryo) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR553584(SRX182790) source: Heart. (Heart) | SRR206942(GSM723283) other. (brain) | SRR346416(SRX098257) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Kidney) | SRR306528(GSM750571) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR346417(SRX098258) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR306542(GSM750585) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR402766(SRX117949) source: ES PGK female cells. (ESC) | SRR065058(SRR065058) Tissue-specific Regulation of Mouse MicroRNA . (pancreas) | SRR306543(GSM750586) 19-24nt. (ago2 brain) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR038741(GSM527276) small RNA-Seq. (brain) | SRR037925(GSM510463) e9p5_rep3. (embryo) | SRR346423(SRX098265) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Brain) | SRR206939(GSM723280) other. (brain) | SRR077864(GSM637801) 18-30 nt small RNAs. (liver) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR206941(GSM723282) other. (brain) | GSM640578(GSM640578) small RNA in the liver with paternal control. (liver) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR553602(SRX182808) source: Sertoli cells. (Sertoli cells) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM510444(GSM510444) brain_rep5. (brain) | GSM640577(GSM640577) small RNA in the liver with paternal control . (liver) | SRR038745(GSM527280) small RNA-Seq. (dgcr8 brain) | GSM640579(GSM640579) small RNA in the liver with paternal Low pro. (liver) | GSM261958(GSM261958) oocytesmallRNA-24to30. (oocyte) | SRR306541(GSM750584) 19-24nt. (ago2 brain) | SRR039184(GSM485324) shLuc.1309 (+dox). (fibroblast) | SRR040489(GSM533912) E18.5 Ago2 catalytically inactive LIVER small RNA. (ago2 liver) | SRR039610(GSM527274) small RNA-Seq. (brain) | SRR306534(GSM750577) 19-24nt. (ago2 brain) | Ago1IP517(Rui) Quantitative functions of Argonaute proteins . (ago1 skin) | SRR037928(GSM510466) e7p5_rep2. (embryo) | SRR346420(SRX098261) Global profiling of miRNA and the hairpin pre. (Uterus) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ................................................TTCATCCTCCCCAGTGGG........................................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..................................................................................................................................................................................................ACCTAGGACTGTCCCC........................................ | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................ATGAAGCTCTCTGCTT............................................................ | 16 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |