(1) AGO1.ip | (3) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (4) B-CELL | (5) BRAIN | (8) BREAST | (21) CELL-LINE | (4) CERVIX | (6) HEART | (2) HELA | (2) LIVER | (3) OTHER | (9) SKIN | (1) UTERUS | (1) XRN.ip |
AACACCACATACCAGCTCCGGGTCAGCCGCATGGACGATTTTGTGCTCAGGTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCACGGGGGCTGGTTCTTCCCCAGGCTCCGGGGGTGACTGGTGGGGGCTCTTCTCTGCCCTGCAGGACTGGGGAGCAGTTCAGCTTCAATACCACAGCAGCACAGCCCCAGGTAA ...................................................(((((...)))))..(((..((((.(((((.((((.......)))).))))).((....))......)).))..)))............................................................ ..................................................51............................................................................129......................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR326282(GSM769512) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, to. (cell line) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR326281(GSM769511) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, cy. (cell line) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR040012(GSM532897) G648N. (cervix) | DRR000557(DRX000315) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189784 | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191613(GSM715723) 66genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR191594(GSM715704) 70genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR060983(GSM569187) Human pre-germinal center B cell [09-001]. (cell line) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | GSM450607(GSM450607) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040014(GSM532899) G623N. (cervix) | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330921(SRX091759) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR191499(GSM715609) 6genomic small RNA (size selected RNA from to. (breast) | SRR033716(GSM497061) Mentle Cell Lymphoma (MCL114). (B cell) | SRR189786 | GSM532885(GSM532885) G850N. (cervix) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR001486(DRX001040) Hela long cytoplasmic cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR189787 | DRR001489(DRX001043) Hela short nuclear cell fraction, control. (hela) | DRR000562(DRX000320) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago3 cell line) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000561(DRX000319) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago2 cell line) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR033726(GSM497071) Mututated CLL (CLLM633). (B cell) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR040022(GSM532907) G575N. (cervix) | DRR000558(DRX000316) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAC.................................................................................................................. | 24 | 1 | 34.00 | 34.00 | 15.00 | 10.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGA................................................................................................................... | 23 | 1 | 33.00 | 33.00 | 5.00 | 1.00 | 4.00 | 2.00 | 15.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGG...................................................................................................................... | 20 | 1 | 18.00 | 18.00 | 6.00 | 4.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGG...................................................................................................................... | 19 | 1 | 15.00 | 15.00 | 4.00 | 3.00 | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAC.................................................................................................................. | 23 | 1 | 12.00 | 12.00 | 6.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACC................................................................................................................. | 24 | 1 | 11.00 | 11.00 | 5.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAT.................................................................................................................. | 24 | 1 | 9.00 | 33.00 | 1.00 | - | 3.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAA.................................................................................................................. | 24 | 1 | 7.00 | 33.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGG.................................................................................................................... | 21 | 1 | 7.00 | 7.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGA................................................................................................................... | 22 | 1 | 6.00 | 6.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAG....................................................................................................................... | 19 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGA...................................................................................................................... | 19 | 1 | 6.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGG..................................................................................................................... | 20 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAG....................................................................................................................... | 18 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACT................................................................................................................. | 25 | 1 | 4.00 | 34.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGG.................................................................................................................... | 22 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................CTGCAGGGTAGAGTGAGGGGA................................................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACA................................................................................................................. | 25 | 1 | 3.00 | 34.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGA........................................................................................................................ | 18 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACA................................................................................................................. | 24 | 1 | 3.00 | 12.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGA...................................................................................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 6.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................................................................CCGGGGGTGACTGGTGGGGGCTCTG............................................................... | 25 | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................................................CTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACC................................................................................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGTTT................................................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 15.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGT................................................................................................................... | 23 | 1 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.................................GACGATTTTGTGCTCAG.......................................................................................................................................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAAA...................................................................................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAT.................................................................................................................. | 23 | 1 | 2.00 | 6.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..............................................................................................................CTGGTGGGGGCTCTTCTCTGCCCTGCA................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACC................................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGA.................................................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAG.................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 33.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCACGGGGGCTGGTTCTTCCCCAGGCTCCGGGGGTGACTGGTGGGGGCTCTTCTCTGCCCTGCA................................................... | 87 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGA........................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGA.................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................GTGCTCAGGTCTGCATCGC............................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAAC...................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGAGA................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................................TCTTCTCTGCCCTGCATT................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.............AGCTCCGGGTCAGCCGCATGG.......................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGG..................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGT...................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGAA................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................GGGTGACTGGTGGGGGCTC................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................TGGACGATTTTGTGCTC............................................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................TCCGGGGGTGACTGGTGGGGGCT.................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACAA................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 34.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGAAGC.................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 18.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGAG................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGT.................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGAA..................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAAT................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGAT.................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 15.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCA................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.........................................................................................................GGTGACTGGTGGGGGC................................................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGA..................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCA................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
....................................................CTGCAGGGTAGAGTGAGA...................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGTA.................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGAAA.................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAA.................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...............................................................................................AGGCTCCGGGGGTGACTAGGC........................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCACGG............................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACT................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..........................................................................................................................................................AGCTTCAATACCACAGCAGCATA........... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................................................................................GACTGGTGGGGGCTCTTCTCTGC......................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................................................................................................................GGCTCTTCTCTGCCCTGCAGTTT............................................... | 23 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
....................................................................................................................................................CAGTTCAGCTTCAATACCACAGCAG............... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGTT.................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 18.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.............AGCTCCGGGTCAGCCGCATGGAC........................................................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGCCT................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAAGAA.................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAA....................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGT.......................................................................................................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
......................TCAGCCGCATGGACGATTTTGTGCTCAG.......................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................................................................................GGGGGCTCTTCTCTGCCCTGCATTT................................................ | 25 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACG................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.......................................................................................................................................................TTCAGCTTCAATACCACAGC................. | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAAG................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 33.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTG......................................................................................................................... | 16 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGAAT.................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAAG...................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................................GAGGGGACCACGGGGGCTGG...................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
............CAGCTCCGGGTCAGCCGCATGGACGATT.................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGAAA.................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...................................................TCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACAA................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCACG.............................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCACGGGG........................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGAAA.................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................ATTTTGTGCTCAGGTCTGC.................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................CTCTTCTCTGCCCTGCATCTT............................................... | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
.....................GTCAGCCGCATGGAC........................................................................................................................................................ | 15 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGAAAAA............................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 33.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
........................................................................................................................CTCTTCTCTGCCCTGCAGTT................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
..................................................GTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGATA................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 33.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
...........................................................................................CCCCAGGCTCCGGGGG................................................................................. | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
.....................................................TGCAGGGTAGAGTGAG....................................................................................................................... | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 |
AACACCACATACCAGCTCCGGGTCAGCCGCATGGACGATTTTGTGCTCAGGTCTGCAGGGTAGAGTGAGGGGACCACGGGGGCTGGTTCTTCCCCAGGCTCCGGGGGTGACTGGTGGGGGCTCTTCTCTGCCCTGCAGGACTGGGGAGCAGTTCAGCTTCAATACCACAGCAGCACAGCCCCAGGTAA ...................................................(((((...)))))..(((..((((.(((((.((((.......)))).))))).((....))......)).))..)))............................................................ ..................................................51............................................................................129......................................................... | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR326282(GSM769512) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, to. (cell line) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR326281(GSM769511) Dicer mRNA was knocked down using siDicer, cy. (cell line) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR330905(SRX091743) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR040012(GSM532897) G648N. (cervix) | DRR000557(DRX000315) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR033727(GSM497072) HIV-positive DL (HIV412). (B cell) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | TAX577738(Rovira) total RNA. (breast) | SRR189784 | SRR189779(GSM714639) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | SRR191613(GSM715723) 66genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | TAX577590(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR191594(GSM715704) 70genomic small RNA (size selected RNA from t. (breast) | SRR387910(GSM843862) antibody for ip: Ago2. (ago2 cell line) | SRR060983(GSM569187) Human pre-germinal center B cell [09-001]. (cell line) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | GSM450607(GSM450607) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040014(GSM532899) G623N. (cervix) | SRR330916(SRX091754) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330921(SRX091759) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR191499(GSM715609) 6genomic small RNA (size selected RNA from to. (breast) | SRR033716(GSM497061) Mentle Cell Lymphoma (MCL114). (B cell) | SRR189786 | GSM532885(GSM532885) G850N. (cervix) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR001486(DRX001040) Hela long cytoplasmic cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR189787 | DRR001489(DRX001043) Hela short nuclear cell fraction, control. (hela) | DRR000562(DRX000320) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago3 cell line) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | GSM450605(GSM450605) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330881(SRX091719) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | DRR000561(DRX000319) Isolation of RNA following immunoprecipitatio. (ago2 cell line) | SRR094130(GSM651906) small RNA(18-35nt)small RNA deep sequencing o. (uterus) | SRR033726(GSM497071) Mututated CLL (CLLM633). (B cell) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR040022(GSM532907) G575N. (cervix) | DRR000558(DRX000316) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR330886(SRX091724) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
.....................................................................................................................................................AGTTCAGCTTCAATACCACAGCAGCCTG........... | 28 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...............................................CAGGTCTGCAGGGTATGT........................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
............................................GCTCAGGTCTGCAGGGTATTGT.......................................................................................................................... | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
...............................................................................................................TGGTGGGGGCTCTTCT............................................................. | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |