| (1) AGO1.ip | (1) AGO1.ip OTHER.mut | (2) AGO2.ip | (1) AGO3.ip | (11) B-CELL | (12) BRAIN | (4) BREAST | (36) CELL-LINE | (2) CERVIX | (9) HEART | (4) HELA | (1) KIDNEY | (5) LIVER | (3) OTHER | (1) RRP40.ip | (15) SKIN | (1) TESTES | (1) XRN.ip |
| CAGGACAGGCTGGCAGAGAGGAAAGCGCTGCTGCTGCAGGCTGTGCAGAGGTGAGTTGGGGGGAGCGGGGCTTGCTTCCCTTACCCCTTGGCCTCCATGGCCTCAGCTCAGAGCCTGGGCAGGCCCTGCCCCACCCTGAGGAGCAAGACATCCGAATGTCCTCCCAGCTAAGGAGGGCAGCATGGCTCAGGGTGCAGAGAAGGGGTTCAGGGACGGACATGCGAAGCTGGAGGCGGGTGGGGGATGGAACTGCCCGGCCCTGCTCCTGGCCCCCTGGAAACCAGGCAGCCCCCCTCCCCCAGCCAATACGAAGAGAAGGACAAGGCCTTCAAGGAGCAGCTCTCTCACTTGG .......................................................................................................................................................................................................................................((.(((.(((((.((.........((((........)))).(((((...)))))))..))))).))))).................................................... .......................................................................................................................................................................................................................................232...................................................................302................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR207114(GSM721076) IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown. (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR314796(SRX084354) Total RNA, fractionated (15-30nt). (cell line) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR553574(SRX182780) source: Heart. (Heart) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | DRR001488(DRX001042) Hela short nuclear cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR033716(GSM497061) Mentle Cell Lymphoma (MCL114). (B cell) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR033725(GSM497070) Unmutated CLL (CLLU626). (B cell) | SRR189782 | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR189787 | SRR033730(GSM497075) Lymphoblastic (ALL411). (B cell) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR039615(GSM531978) Severe Chronic Hepatitis B Liver Tissue. (liver) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR330860(SRX091698) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | SRR033729(GSM497074) splenic MZL (Splenic414). (B cell) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | GSM450604(GSM450604) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR033715(GSM497060) Mantle Cell Lymphoma (Mino122). (B cell) | GSM450610(GSM450610) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR039193(GSM494812) HL60 cell line is derived from acute promyelo. (cell line) | SRR039621(GSM531984) HBV(+) HCC Tissue Sample 2. (liver) | SRR015362(GSM380327) Naïve B Cell (Naive138). (B cell) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR189786 | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040036(GSM532921) G243N. (cervix) | GSM450607(GSM450607) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR444042(SRX128890) Sample 3cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC C. (skin) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR038858(GSM458541) MEL202. (cell line) | GSM1105753INPUT(GSM1105753) small RNA sequencing data. (hela) | SRR330888(SRX091726) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR343335 | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | DRR000557(DRX000315) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | DRR000555(DRX000313) THP-1 whole cell RNA, no treatment. (cell line) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR033731(GSM497076) h929 Cell line (h929). (B cell) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM956925Ago2PAZ(GSM956925) cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip . (ago2 cell line) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR444065(SRX128913) Sample 22cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (cell line) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330873(SRX091711) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM956925PazD5(GSM956925) cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip . (cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | DRR000558(DRX000316) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR343333(GSM796036) KSHV (HHV8). (cell line) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR039636(GSM518473) THP1_cyto_sRNAs. (cell line) | GSM1105750AGO3(GSM1105750) small RNA sequencing data. (ago3 hela) | SRR038862(GSM458545) MM472. (cell line) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330867(SRX091705) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR001489(DRX001043) Hela short nuclear cell fraction, control. (hela) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330871(SRX091709) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGC.............................................................................................. | 22 | 1 | 117.00 | 117.00 | 6.00 | 18.00 | 15.00 | 8.00 | 14.00 | - | 2.00 | 5.00 | 4.00 | 3.00 | 3.00 | 4.00 | - | 2.00 | - | 3.00 | 2.00 | 2.00 | - | 4.00 | - | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGC.............................................................................................. | 21 | 1 | 84.00 | 84.00 | 5.00 | 2.00 | 2.00 | 8.00 | - | - | 6.00 | 3.00 | - | 6.00 | 6.00 | 2.00 | 3.00 | 1.00 | 3.00 | - | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | 3.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGG............................................................................................... | 20 | 1 | 17.00 | 17.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGG............................................................................................... | 21 | 1 | 16.00 | 16.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCATC........................................................................................... | 24 | 1 | 8.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCA............................................................................................. | 22 | 1 | 4.00 | 84.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGCAT............................................................................................ | 24 | 1 | 4.00 | 117.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCAT............................................................................................ | 23 | 1 | 4.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGCATC........................................................................................... | 25 | 1 | 4.00 | 117.00 | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGCA............................................................................................. | 23 | 1 | 4.00 | 117.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCG................................................................................................ | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGT.............................................................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 17.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGCTA............................................................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 117.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCAA............................................................................................ | 23 | 1 | 2.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGT.............................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 16.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCT............................................................................................. | 22 | 1 | 2.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCC................................................................................................. | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGCC.............................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCAAT........................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCTGC.............................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGA.............................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................GGCAGCATGGCTCAGGGCAAT............................................................................................................................................................ | 21 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCC................................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................GAGCGGGGCTTGCTTCTTAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGCTCTCTCACTTTTGA | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGA.............................................................................................. | 21 | 1 | 1.00 | 17.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................GGGGGATGGAACTGCCCGA............................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..........................................................................CTTCCCTTACCCCTTGATG................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ..............AGAGAGGAAAGCGCTGCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCAGCCCCCCTCCCCCAGT................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ......................................................GTTGGGGGGAGCGGGGGAAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................AGGGTGCAGAGAAGGAGGC................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGTC.............................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................GGGGATGGAACTGCCGT................................................................................................ | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .AGGACAGGCTGGCAGGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGCC............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCAC............................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTGGAGGCCCT................................................................................................................... | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCATAT.......................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 84.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGAATA........................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCAGGC.............................................................................................. | 22 | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGCAGCTCTCTCACTT.. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGCAA............................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 117.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................GGTGGGGGATGGAACTGCCCGG............................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................CAGAGAAGGGGTTCAAT............................................................................................................................................. | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGG.............................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 16.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGATGGAACTGCCCGGCTA............................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................GGTGGGGGATGGAACTGCCCGGC.............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................GGTGGGGGATGGAACTGCCCGGCAT............................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................GGGGGATGGAACTGCCCGG............................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................CTCAGAGCCTGGGCACC..................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAATACGAAGAGAAGGACAAGGCC......................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGATGGAACTGCCCGGCT............................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 117.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................TTACCCCTTGGCCTCCTGTC............................................................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................GGTGGGGGATGGAACTGCCCGGAA............................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................GAGGTGAGTTGGGGGTATG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ....................................................................................................................................................................................................................ACGGACATGCGAAGCTGGA......................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGGAGCAGCTCTCTC...... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................AGGCTGTGCAGAGGTGAG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GGACAGGCTGGCAGAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................................TGGAACTGCCCGGC.............................................................................................. | 14 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CAGGACAGGCTGGCAGAGAGGAAAGCGCTGCTGCTGCAGGCTGTGCAGAGGTGAGTTGGGGGGAGCGGGGCTTGCTTCCCTTACCCCTTGGCCTCCATGGCCTCAGCTCAGAGCCTGGGCAGGCCCTGCCCCACCCTGAGGAGCAAGACATCCGAATGTCCTCCCAGCTAAGGAGGGCAGCATGGCTCAGGGTGCAGAGAAGGGGTTCAGGGACGGACATGCGAAGCTGGAGGCGGGTGGGGGATGGAACTGCCCGGCCCTGCTCCTGGCCCCCTGGAAACCAGGCAGCCCCCCTCCCCCAGCCAATACGAAGAGAAGGACAAGGCCTTCAAGGAGCAGCTCTCTCACTTGG .......................................................................................................................................................................................................................................((.(((.(((((.((.........((((........)))).(((((...)))))))..))))).))))).................................................... .......................................................................................................................................................................................................................................232...................................................................302................................................ | Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR033722(GSM497067) KMS12 cell line (KMS12). (B cell) | SRR207113(GSM721075) IP against AGO 1 & 2. (ago1/2 cell line) | SRR207114(GSM721076) IP against AGO 1 & 2, RRP40 knockdown. (ago1/2 RRP40 cell line) | SRR553572(SRX182778) source: Frontal Cortex. (Frontal Cortex) | SRR207116(GSM721078) Nuclear RNA. (cell line) | SRR314796(SRX084354) Total RNA, fractionated (15-30nt). (cell line) | SRR342894(SRX096790) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR553574(SRX182780) source: Heart. (Heart) | SRR207110(GSM721072) Nuclear RNA. (cell line) | SRR342896(SRX096792) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | DRR001488(DRX001042) Hela short nuclear cell fraction, LNA(+). (hela) | SRR326279(GSM769509) cytoplasmic fraction was isolated using PARIS. (cell line) | SRR553573(SRX182779) source: Cerebellum. (Cerebellum) | GSM450608(GSM450608) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR342900(SRX096796) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR039190(GSM494809) PBMCs were isolated by ficoll gradient from t. (blood) | SRR342898(SRX096794) small RNA seq of Right atrial tissue. (heart) | SRR033724(GSM497069) L428 cell line (L428). (B cell) | SRR038859(GSM458542) MM386. (cell line) | SRR033723(GSM497068) L1236 cell line (L1236). (B cell) | SRR342899(SRX096795) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR342895(SRX096791) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | GSM450602(GSM450602) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR033716(GSM497061) Mentle Cell Lymphoma (MCL114). (B cell) | SRR207112(GSM721074) RRP40 knockdown. (RRP40 cell line) | SRR033725(GSM497070) Unmutated CLL (CLLU626). (B cell) | SRR189782 | SRR342901(SRX096797) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | SRR038860(GSM458543) MM426. (cell line) | RoviraIPAgo2(Rovira) total RNA. (ago2 breast) | SRR038863(GSM458546) MM603. (cell line) | SRR189781(GSM714641) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM450609(GSM450609) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR189787 | SRR033730(GSM497075) Lymphoblastic (ALL411). (B cell) | SRR330885(SRX091723) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR326280(GSM769510) total cell content of unperturbed cells was s. (cell line) | SRR039615(GSM531978) Severe Chronic Hepatitis B Liver Tissue. (liver) | SRR060169(GSM565979) 5-8F_cytoplasm. (cell line) | SRR330860(SRX091698) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR060168(GSM565978) 5-8F_nucleus. (cell line) | SRR033729(GSM497074) splenic MZL (Splenic414). (B cell) | SRR342897(SRX096793) small RNA seq of Left atrial tissue. (heart) | GSM450604(GSM450604) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR330878(SRX091716) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR033715(GSM497060) Mantle Cell Lymphoma (Mino122). (B cell) | GSM450610(GSM450610) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR207115(GSM721077) XRN1&2 knockdown. (XRN1/XRN2 cell line) | GSM450600(GSM450600) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR029054(GSM402329) MCF7_smallRNAseq. (cell line) | SRR039193(GSM494812) HL60 cell line is derived from acute promyelo. (cell line) | SRR039621(GSM531984) HBV(+) HCC Tissue Sample 2. (liver) | SRR015362(GSM380327) Naïve B Cell (Naive138). (B cell) | SRR107296(GSM677703) 18-30nt fraction of small RNA. (cell line) | SRR189786 | SRR039616(GSM531979) HBV(+) Distal Tissue Sample 1. (liver) | SRR033717(GSM497062) Mentle Cell Lymphoma (MCL112). (B cell) | SRR039622(GSM531985) HCV(+) Adjacent Tissue Sample. (liver) | SRR038861(GSM458544) MM466. (cell line) | SRR553576(SRX182782) source: Testis. (testes) | SRR189780(GSM714640) cell line: HEK293clip variant: PAR-CLIPenzyma. (cell line) | GSM450601(GSM450601) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR040036(GSM532921) G243N. (cervix) | GSM450607(GSM450607) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039623(GSM531986) HCV(+) HCC Tissue Sample. (liver) | SRR553575(SRX182781) source: Kidney. (Kidney) | SRR444042(SRX128890) Sample 3cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC C. (skin) | GSM450598(GSM450598) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR039637(GSM518474) THP1_total_sRNAs. (cell line) | SRR039192(GSM494811) K562 cell line is derived from a CML patient . (cell line) | SRR038858(GSM458541) MEL202. (cell line) | GSM1105753INPUT(GSM1105753) small RNA sequencing data. (hela) | SRR330888(SRX091726) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR343335 | TAX577745(Rovira) total RNA. (breast) | DRR000557(DRX000315) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | DRR000555(DRX000313) THP-1 whole cell RNA, no treatment. (cell line) | SRR330872(SRX091710) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR060981(GSM569185) Human centroblast [09-001]. (cell line) | SRR029129(GSM416758) SW480. (cell line) | SRR033731(GSM497076) h929 Cell line (h929). (B cell) | SRR330920(SRX091758) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | GSM956925Ago2PAZ(GSM956925) cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip . (ago2 cell line) | GSM450603(GSM450603) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | GSM450597(GSM450597) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | SRR444065(SRX128913) Sample 22cDNABarcode: AF-PP-335: ACG CTC TTC . (cell line) | SRR038852(GSM458535) QF1160MB. (cell line) | TAX577744(Rovira) total RNA. (breast) | SRR330873(SRX091711) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM956925PazD5(GSM956925) cell line: HEK293 cell linepassages: 15-20ip . (cell line) | TAX577742(Rovira) total RNA. (breast) | SRR040008(GSM532893) G727N. (cervix) | DRR000558(DRX000316) THP-1 whole cell RNA, after 3 day treatment w. (cell line) | SRR343333(GSM796036) KSHV (HHV8). (cell line) | SRR029131(GSM416760) MCF7. (cell line) | SRR039636(GSM518473) THP1_cyto_sRNAs. (cell line) | GSM1105750AGO3(GSM1105750) small RNA sequencing data. (ago3 hela) | SRR038862(GSM458545) MM472. (cell line) | SRR330911(SRX091749) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330867(SRX091705) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | GSM450599(GSM450599) miRNA sequencing raw reads from post-mortem s. (brain) | DRR001489(DRX001043) Hela short nuclear cell fraction, control. (hela) | SRR330877(SRX091715) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330914(SRX091752) tissue: normal skindisease state: normal. (skin) | SRR330871(SRX091709) tissue: skin psoriatic involveddisease state:. (skin) | SRR330902(SRX091740) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) | SRR330896(SRX091734) tissue: skin psoriatic uninvolveddisease stat. (skin) |
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| ..................................................................................ACCCCTTGGCCTCCATGTG........................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGCCTTCAAGGAGCAGCTCTCTCA..... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................................ACCCCTTGGCCTCCATTG............................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGGAGGCGGGTGGGGGA............................................................................................................ | 17 | 3 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | 0.33 | - |
| ....................................................................GGCTTGCTTCCCTTACC........................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATACGAAGAGAAGG................................. | 15 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 |
| ......................................................................................................TCAGCTCAGAGCCTGGG......................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCAGCCCCCCTC........................................................ | 16 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |