dme-mir-318

Species Chrom Pos Ref base Type A C G T RNAseq Total A C G T Trace Total Decision Partition
droSim1chr3R15159188A3000000.400.6020 Genomic Error Loop

Corrected Alignment

dme-mir-318

Species Coordinate Alignment
dm3 chr3R:6234009-6234106 + G-------TCCTT--CGGTTTCAGTTTATGGGATACACACAGTTCAGTTTTGTCACAC-T--TCAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATGAGAGCGAAATTTATTCA
droSim1 chr3R:15159142-15159239 - G-------TCCTT--CGGTTTCAGTTTATGGGATACACACAGTTCAGTTTTGTCACAC-T--TCAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATGAGAGCGAAATTTATTCA
droSec1 super_0:15709308-15709405 - G-------TCCTT--CGGTTTCAGTTTATGGGATACACACAGTTCAGTTTTGTCACAC-T--TCAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATGAGAGCGAAATTTATTCA
droYak2 chr3R:10262524-10262621 + G-------TCCTC--CGGTTTCAGTTTATGGGATACACACAGTTCAGTTTTGTCGCAC-T--ACAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATGAGAGCGAAATTTGTTCA
droEre2 scaffold_4770:15383893-15383990 - G-------TCCTC--CGGTTTCAGTTTATGGGATACACACAGTTCAGTTTTGTCACAC-T--TCAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATGAGAGCGAAATTTGTTCA
droAna3 scaffold_13340:867198-867296 - G-------TCCTC--CGGTTTCAATTTGTGGGATACACACGGTTCAGTTGTGTCACTTTT--GCGAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAAGACTGAAATTTGTTCA
dp4 chr2:7233334-7233438 - CGTGTGCCTCTTT--TGGTTTCAATTTATGGGATGCACCAAGTTCAGTTTTGTCACAT-T--TCGAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAAGAGCGAAATTGATTCA
droPer1 super_0:1094016-1094113 - C-------TCTTT--TGGTTTCAATTTATGGGATGCACCAAGTTCAGTTTTGTCACAT-T--TCGAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAAGAGCGAAATTGATTCA
droWil1 scaffold_181108:652-751 + G-------TCAGA--CGGTTTCAATTTATGGGATACACCAAGTTCAGTTTTGTCGCAT-TCCACGAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAAAGGAGAAATGAATACA
droVir3 scaffold_13047:1194317-1194415 + T-------GATTT--GGATTTCAATTTATGGGATACACCAAGTTCAGTTTTGTCAGATGT--CCAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAAGAGTGAAATTTGTTCA
droMoj3 scaffold_6540:5225327-5225427 + G-------TGATTAAGGATTTCAATTTATGGGATACACTAAGTTCAGTTTTGTCAGATGT--CCAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAAGAGCGAAATTTGTTCA
droGri2 scaffold_14906:5077291-5077389 - G-------ATTTC--GGATTTCAATTTATGGGATACACCAAGTTCAGTTTTGTCAGATGT--CCAAGCATCACTGGGCTTTGTTTATCTCATAAGAGCGAAATTAGTTCA