chr12:116784163 116784412 -
(10)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(45)
TESTES

Sense strand
AGTGGGCCTGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTTCAAAGCTCTCCGCATTGAGCCCTTCTCCAGCCCTCCAGAGCTTCCAGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTACCCCCTAGAGACCCATTCCCCCAATTAAAAAAAATTGGCTGTCTAAAAAAAAATAATGATGTCTAGGGCAGATAAAAAGGATCCACTTATTGGCAAATGCC
................................................................................................................((((((......(((....)))..(((.(((((.......)))))...)))...................))))))..............................................................
................................................................................................................113....................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTA........................................................................................................... 26 5 16.20 16.20 2.60 - 2.00 2.60 0.80 1.20 1.20 - - - 0.40 0.40 0.40 0.80 1.00 0.40 0.20 - 0.40 0.20 - 0.20 0.20 - 0.20 0.40 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 0.20 - - - -
...............................................................................GATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGTGC....................................................................................................................... 52 4 11.75 11.75 - 11.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAG.......................................................................................................... 27 5 6.20 6.20 0.60 - 0.20 0.20 0.80 1.60 0.60 - - - - - - - 0.40 0.40 - - - 0.20 - - - - 0.20 0.20 0.20 - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGt................................................................................................................................................. 27 t 5.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGG.............................................................................................................................................. 27 5 4.80 4.80 1.20 - 0.60 0.40 0.40 - - - - - 0.20 0.20 - 0.20 - 0.20 0.20 - - 0.20 - 0.20 0.40 - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAG............................................................................................................................................... 26 6 3.50 3.50 0.33 - 0.33 0.67 0.33 - - 0.17 - - 0.33 - - 0.17 0.33 - - - - - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTTC........................................................................................................................................................................................................................ 26 4 3.25 3.25 1.50 - 1.00 - 0.25 - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATG................................................................................................................................... 26 7 3.14 3.14 0.86 - 0.71 - - - 0.43 0.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGt.................................................................................................................................. 27 t 2.57 3.14 1.43 - 0.71 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGC............................................................................................................................................. 28 5 2.40 2.40 - - - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - 0.60 0.40 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGC.............................................................................................................. 27 6 1.83 1.83 - - - - 0.17 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGA.................................................................................................................................. 27 7 1.57 1.57 0.57 - 0.86 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGTGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTG................................................................................................................... 26 6 1.33 1.33 - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGG............................................................................................................... 25 6 1.17 1.17 - - - - - - - - 1.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAG............................................................................................................................................... 27 6 1.17 1.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCT............................................................................................................ 25 6 1.17 1.17 - - - 0.33 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGA................................................................................................................................................ 25 6 1.17 1.17 0.17 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTG.......................................................................................................................... 26 7 1.14 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - 0.86 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAAT.................................................................................................................................... 25 7 1.14 1.14 - - - 0.14 0.14 - 0.14 0.29 - 0.14 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TAATGATGTCTAGGGCAGATAAAAAGGtt................... 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAt............................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGt........................................................................................................................................ 20 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGa.............................................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGcag............................................................................................................................................ 28 cag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTtt.................................................................................................... 33 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCtta........................................................................................................... 26 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCata........................................................................................................... 26 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TCCAGAGCTTCCAGATGTGATGAAtcc............................................................................................................................................................. 27 tcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACACCgtcg....................................................................................................................................................................................................................... 27 gtcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCt....................................................................................................................................... 21 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTtgag............................................................................................................................................... 26 tgag 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCatag.......................................................................................................... 27 atag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TAATGATGTCTAGGGCAGATAAAAAt...................... 26 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGta................................................................................................................................................ 28 ta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGgg................................................................................................................. 26 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TCCAGAGCTTCCAGATGTGATGAAGgc............................................................................................................................................................. 27 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAAa................................................................................................................................ 29 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CACAGGATTCTGGAGGCAGTGCa....................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGC........................................................................................................ 29 5 1.00 1.00 - - - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TAAAAAAAATTGGCTGTCTAgtg..................................................... 23 gtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGa................................................................................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................AGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTACa................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGGCCTGGCCTTCCGAGCAGATGACACC........................................................................................................................................................................................................................... 29 3 1.00 1.00 0.67 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGG................................................................................................................ 27 6 1.00 1.00 0.17 - 0.17 - 0.17 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGT.......................................................................................................................................... 19 7 0.71 0.71 - - - - - - - - 0.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAAC................................................................................................................................ 27 7 0.71 0.71 0.14 - 0.14 - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 -
.......................................................................................................................AACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTA........................................................................................................... 24 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGG................................................................................................................ 21 6 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAG............................................................................................................................................... 29 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................ATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCT............................................................................................................ 26 6 0.50 0.50 0.17 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGG............................................................................................................... 24 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGTGCCAATGAACAAGCTG.......................................................................................................................... 19 8 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCT............................................................................................................ 29 6 0.50 0.50 0.17 - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CAGTGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTG................................................................................................................... 27 6 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCC............................................................................................................. 27 6 0.50 0.50 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CTGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTTC........................................................................................................................................................................................................................ 27 4 0.50 0.50 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGA................................................................................................................................................ 28 6 0.50 0.50 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAa.......................................................................................................... 27 a 0.40 16.20 - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................ATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGG.............................................................................................................................................. 28 5 0.40 0.40 - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................ATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTA........................................................................................................... 27 5 0.40 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................AGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCT...................................................................................................... 25 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGCA............................................................................................................................................ 29 5 0.40 0.40 - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGt............................................................................................................................................. 28 t 0.40 4.80 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................AGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTACCC.................................................................................................. 29 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGC............................................................................................................................................. 24 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGC............................................................................................................................................. 27 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCCAGATGTGATGAAGCCACAGG........................................................................................................................................................ 23 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGGCCTGGCCTTCCGAGCAGATGACAC............................................................................................................................................................................................................................ 28 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................CACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAAT.................................................................................................................................... 26 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - -
................................................................................................................GCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGG................................................................................................................ 26 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CCACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATt................................................................................................................................... 28 t 0.33 0.33 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGC.............................................................................................................. 26 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGt................................................................................................................................................ 28 t 0.33 0.17 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCT............................................................................................................ 28 6 0.33 0.33 - - - - - - 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CCACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAAT.................................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 - - 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................AGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGTGCA...................................................................................................................... 27 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGATGAAGCCACAGGATT..................................................................................................................................................... 18 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCC............................................................................................................. 24 6 0.33 0.33 - - - - 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGGAGGCAGTGCCAATGAACAAGC............................................................................................................................ 27 7 0.29 0.29 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATG................................................................................................................................... 25 7 0.29 0.29 - - 0.14 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAAC................................................................................................................................ 29 7 0.29 0.29 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTG......................................................................................................................................... 20 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGtt................................................................................................................................. 28 tt 0.29 3.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGT......................................................................................................................... 27 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - -
................................................................................................................................................GCCTACCCCCTAGAGACCCATT.................................................................................... 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TCCAGAGCTTCCAGATGTGATGAAGCC............................................................................................................................................................. 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTTCt....................................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.25 3.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTTCgt...................................................................................................................................................................................................................... 28 gt 0.25 3.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGATGTCTAGGGCAGATAAAAAGGAT................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACAC............................................................................................................................................................................................................................ 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTACCCCCT............................................................................................... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGAT................................................................................................................................................................................................................................. 17 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTTa........................................................................................................................................................................................................................ 26 a 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACACCT.......................................................................................................................................................................................................................... 24 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTT......................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CTGGCCTTCCGAGCAGATG................................................................................................................................................................................................................................ 19 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGG.............................................................................................................................................. 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................AGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTACC................................................................................................... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGG.............................................................................................................................................. 26 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................ACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGG......................................................................................................... 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGCAGTGCC....................................................................................................................................... 33 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGG......................................................................................................... 28 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GCCCTCCAGAGCTTCCAGA......................................................................................................................................................................... 19 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTAC.................................................................................................... 33 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGCAt........................................................................................................................................... 30 t 0.20 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................ATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAG.......................................................................................................... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGac........................................................................................................ 29 ac 0.20 6.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTACCC.................................................................................................. 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCC....................................................................................................... 30 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGCCACAGGATTCTGGAGGCAG........................................................................................................................................... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................AATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCT............................................................................................................ 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGA.................................................................................................................. 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGAAGCCACAGGATTCTGGAG............................................................................................................................................... 21 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................AGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGG................................................................................................................................................. 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATT..................................................................................................................................................... 20 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTG................................................................................................................... 18 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGAACAAGCTGTGCAGTGAGGG............................................................................................................... 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGt.............................................................................................................................................. 27 t 0.17 3.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................CCACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATG................................................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGTGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGA.................................................................................................................. 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAt............................................................................................................................................... 26 t 0.17 1.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGTGC....................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGttt............................................................................................................. 30 ttt 0.17 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - -
...............................................................................................................TGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGC.............................................................................................................. 29 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCC............................................................................................................. 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGA................................................................................................................................................ 27 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CCAGATGTGATGAAGCCACAGGATTCT................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - -
...............................................................................................AGGATTCTGGAGGCAGT.......................................................................................................................................... 17 12 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GTGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGA.................................................................................................................. 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGA.................................................................................................................................. 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGAGGCAGTGCCAATGAACAAG............................................................................................................................. 23 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAA..................................................................................................................................... 23 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGT......................................................................................................................... 32 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGt.................................................................................................................................. 26 t 0.14 0.29 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AGGATTCTGGAGGCAGTGCCAA..................................................................................................................................... 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGC........................................................................................................................................ 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................GATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAA................................................................................................................................. 24 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGA.................................................................................................................................. 26 7 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAA................................................................................................................................. 27 7 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCCA...................................................................................................................................... 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATt................................................................................................................................... 26 t 0.14 1.14 - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AGGATTCTGGAGGCAGTGCCA...................................................................................................................................... 21 7 0.14 0.14 - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GGAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGTG........................................................................................................................ 27 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAt................................................................................................................................. 28 t 0.14 1.57 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAAC................................................................................................................................ 28 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGTGCCAATGAACAAGCTGTG........................................................................................................................ 21 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12
............................................................................................................CAGTGCCAATGAACAAGCTGTG........................................................................................................................ 22 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - -
...............................................................CCCTCCAGAGCTTCCAGA......................................................................................................................................................................... 18 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AGGATTCTGGAGGCAGTGg........................................................................................................................................ 19 g 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................AGGATTCTGGAGGCAGTG......................................................................................................................................... 18 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACAGGATTCTGGAGGCAG........................................................................................................................................... 18 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GCCACAGGATTCTGGAG............................................................................................................................................... 17 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGTGGGCCTGGCCTTCCGAGCAGATGACACCTTCAAAGCTCTCCGCATTGAGCCCTTCTCCAGCCCTCCAGAGCTTCCAGATGTGATGAAGCCACAGGATTCTGGAGGCAGTGCCAATGAACAAGCTGTGCAGTGAGGGCCTAGGCCTACCCCCTAGAGACCCATTCCCCCAATTAAAAAAAATTGGCTGTCTAAAAAAAAATAATGATGTCTAGGGCAGATAAAAAGGATCCACTTATTGGCAAATGCC
................................................................................................................((((((......(((....)))..(((.(((((.......)))))...)))...................))))))..............................................................
................................................................................................................113....................................................................................200................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
................................................................................................................................................GCCTACCCCCTAGAGACCCATT.................................................................................... 22 4 2.25 2.25 - - - - - 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................AGCCCTTCTCCAGCCCTCCAGAGCTTC............................................................................................................................................................................. 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - -
..TGGGCCTGGCCTTCCGAGCAG................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GCCCTCCAGAGCTTCCAGATGTGA.................................................................................................................................................................... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................TTCCAGATGTGATGAAGC.............................................................................................................................................................. 18 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - -