| Gene: abParts | ID: uc009vaj.1_intron_517_0_chr12_116354462_r.3p | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(1) OTHER.ip |
(4) OTHER.mut |
(7) PIWI.ip |
(1) PIWI.mut |
(23) TESTES |
| TGATTTTCTGTAGTCCACCTTATTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTGCCCTATCTTATTTACGATAGGTAAAGATCCAGAAACTTAAAATACCCAAGATACAAGATACAATTTGCAAAACACATGAAACTCAAGAACGAATACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGGAACAAAACACCCATGGGAGGAGTTACAGAGACAAAATTTGGAGCTGTGACAAAAGGATGGACCAT .............................................................................................................................(((((.....((......))........)))))............................................................................................ ..............................................................................................95..............................................................159......................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) |
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| .................................................................................................................................TGAAACTCAAGAACGAATACCAAAGTGTG............................................................................................ | 29 | 2 | 4.00 | 4.00 | - | 0.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TGAAACTCAAGAACGAATACCAAAGTGT............................................................................................. | 28 | 2 | 4.00 | 4.00 | - | - | 1.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................................CAAGATACAAGATACAATTTGCAAAACttt......................................................................................................................... | 30 | ttt | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................................................................................................................................................................TTGGAGCTGTGACAAAAGGATGGACCAat | 29 | at | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................CATGAAACTCAAGAACGAATACCAAAGT............................................................................................... | 28 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
| .......................TGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTaga................................................................................................................................................................................................... | 32 | aga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................AGAGACAAAATTTGGAGCTGTGACAt............. | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................AAAATTTGGAGCTGTGACAAAAGGctgg..... | 28 | ctgg | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTaaa................................................................................................................................................................................................... | 32 | aaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................................................................................................ACAGAGACAAAATTTGGAGCTGTGACAtt............ | 29 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TTGGAGCTGTGACAAAAGGATGGACCATta | 30 | ta | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................GGAACAAAACACCCATGGGAGGggtt......................................... | 26 | ggtt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................CAGAGACAAAATTTGGAGCTGTGtcgt............. | 27 | tcgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .............................................................................................................................................................................................................................TTTGGAGCTGTGACAAAAGGATGGcaca. | 28 | caca | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................CAAGATACAAGATACAATTTGCAAAAaact......................................................................................................................... | 30 | aact | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................................................................................................................................................................................................................TGGAGCTGTGACAAAAGGATGGACaata | 28 | aata | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................GTTCTTTATATATATTGGATATTtccc..................................................................................................................................................................................................... | 27 | tccc | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................TAGAATTGGGAACAAAACACCCAcggt................................................ | 27 | cggt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................TGGGAGGAGTTACAGAGACAAta............................. | 23 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................................TTGGAGCTGTGACAAAAGGATGGAtg.. | 26 | tg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAtac..................................................................................................................................................................................................... | 30 | tac | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................................TGGAGCTGTGACAAAAGGATGGAaaaa | 27 | aaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TGAAACTCAAGAACGAATACCAAAGTGTGt........................................................................................... | 30 | t | 0.50 | 4.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................ACACATGAAACTCAAGAACGAATACCAAA................................................................................................. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| TGATTTTCTGTAGTCCACCTTATTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTGCCCTATCTTATTTACGATAGGTAAAGATCCAGAAACTTAAAATACCCAAGATACAAGATACAATTTGCAAAACACATGAAACTCAAGAACGAATACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGGAACAAAACACCCATGGGAGGAGTTACAGAGACAAAATTTGGAGCTGTGACAAAAGGATGGACCAT .............................................................................................................................(((((.....((......))........)))))............................................................................................ ..............................................................................................95..............................................................159......................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) |
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| ...............................................................................CAGAAACTTAAAATACCCAAGATAtgg................................................................................................................................................ | 27 | tgg | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAAACTTAAAATACCCAAGATACAAtttt............................................................................................................................................. | 30 | tttt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CAGAAACTTAAAATACCCAAGATAtgt................................................................................................................................................ | 27 | tgt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .......AGTCCACCTTATTGAGTTCTTTAtcat........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | tcat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................CAGAAACTTAAAATACCCAAGATttct................................................................................................................................................. | 27 | ttct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......AGTCCACCTTATTGAGTTCTTTAtcaa........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | tcaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................AAACTTAAAATACCCAAGATACAAta............................................................................................................................................. | 26 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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