chrX:166423889 166424138 -
(6)
OTHER.mut 		(5)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(28)
TESTES

Sense strand
TGTGAGACAGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAGCCGAGTCCACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTACGGCTGCCCGCCTGGTTGATGGCCTTCACCGTGAAGATATACTTGGTGCCACTTTGCAGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCAGC
................................................(((..(((((((((((...(((((((...((((...((((....))))...))))...)))))))((((.((((((...(((((.....((....)).)))))...)))))).))))........)))))).))))))))..............................................................
...............................................48.............................................................................................................................................191.........................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
..............................................TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCgc.................................................................................................................................................................................. 26 gc 44.00 0.00 - 34.00 - - - - - - 2.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACG.......... 25 1 11.00 11.00 1.00 - - - - - - 9.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................AGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGt.................................................................................................................................................................................... 31 t 10.00 0.00 - - - - - 10.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGT................................................................................................................................................................................. 28 1 10.00 10.00 - - 1.00 - - 5.00 - - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGC....................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 - - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGC........................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 1.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATa.......................................................................................................................................................................................................... 29 a 8.00 0.00 3.00 - - - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATa.......................................................................................................................................................................................................... 27 a 6.00 0.00 1.00 - - - - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGC....................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................GGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAaga.................................................................................................................................................................................... 28 aga 6.00 0.00 - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAG............................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 2.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGc............................................................................................................................................................................................................... 28 c 5.00 0.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GAGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAG............................................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGGCCTTCACCGTGAAGATATACTTGG............................................................... 27 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGAa........................................................................................................................................................................................................... 28 a 4.00 0.00 1.00 - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTG......................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATG................... 26 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGa................................................................................................................................................................................................. 26 a 3.00 0.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGC.................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGTagga............................................................................................................................................................................. 25 agga 3.00 0.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TATACTTGGTGCCACTTTGCAGGCCGT............................................. 27 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GATTTTCTGAGGCAGGGGGATGACTGa..................................................................................................................................................................................................... 27 a 3.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGA......... 25 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGGCCTTCACCGTGAAGATATACTTG................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCAC........... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................AGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATt.......................................................................................................................................................................................................... 25 t 3.00 0.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGG........................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATC.... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAaa................................................................................................................................................................................................. 27 aa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................TTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTC.................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGaa.................................................................................................................................................................................... 25 aa 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGAaa.......................................................................................................................................................................................................... 29 aa 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGC........................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGa.................................................................................................................................................................................................................... 24 a 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTTCTGAGGCAGGGGGATGACTGa..................................................................................................................................................................................................... 24 a 2.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGt..................................................................................................................................................................................... 26 t 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TTGATGTTGGGCACGATCATCCAGC 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCcga................................................................................................................................................................................................................ 28 cga 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGaaaa.................................................................................................................................................................................. 27 aaaa 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAcg................................................................................................................................................................................. 23 cg 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................CTGTGAGTGATTTTCTGAGGCgcgg................................................................................................................................................................................ 25 gcgg 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAa.................................................................................................................................................................................. 29 a 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGCCGTGCACGGTGTAGTGGT.............................. 26 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGACTGa..................................................................................................................................................................................................... 28 a 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATC....... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGtag................................................................................................................................................................................................................. 27 tag 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GGGGGATGACTGTGAatgc............................................................................................................................................................................................... 19 atgc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - -
..............................................................TCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTC.................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................GATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGG........................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGtagg................................................................................................................................................................................. 27 tagg 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCggga................................................................................................................................................................................ 28 ggga 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGa................................................................................................................................................................................................. 27 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGC............. 24 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGt..................................................................................................................................................................................... 30 t 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAaa................................................................................................................................................................................. 27 aa 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGGCCTTCACCGTGAAGATATACTT................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGACTGTGAGTGATTgagg........................................................................................................................................................................................................................ 19 gagg 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTta....................................................................................................................................................................................... 27 ta 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGacag................................................................................................................................................................................................................. 28 acag 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................CAGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGc..................................................................................................................................................................................... 31 c 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAa................................................................................................................................................................................................................. 26 a 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TACTTGGTGCCACTTTGCAGGCCGTGC........................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGGCCTTCACCGTGAAGATATACTTGGT.............................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAa.................................................................................................................................................................................................. 25 a 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGC........................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................AGTGATTTTCTGAGGCAGGGtt............................................................................................................................................................................................................. 22 tt 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CTCGCTGCTACGGCTGCCCGa.................................................................................................. 21 a 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCgcgg............................................................................................................................................................................................................... 24 gcgg 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGAAGATATACTTGGTGCCACTTT...................................................... 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TATACTTGGTGCCACTTTGCAGGCCGTG............................................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGC.................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCgga................................................................................................................................................................................................................ 28 gga 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGAGTGATTTTCTGAGGCgcgg................................................................................................................................................................................ 22 gcgg 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGtaa................................................................................................................................................................................... 26 taa 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............GATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAa................................................................................................................................................................................................................. 28 a 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AGGGGGATGACTGTGAatga............................................................................................................................................................................................... 20 atga 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGaa................................................................................................................................................................................................ 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAGCCa............................................................................................................................................................. 29 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGaagg.......................................................................................................................................................................................................... 27 aagg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCAGC 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GATTTTCTGAGGCAGGGGGAat.......................................................................................................................................................................................................... 22 at 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGat.............................................................................................................................................................................................................. 30 at 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TTCACCGTGAAGATATACTTGGTGCCACTT....................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GCCTTCACCGTGAAGATATACTTGG............................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGat................................................................................................................................................................................................ 27 at 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGCCGTGCACGGTGgag.................................. 21 gag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGTt................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGAa........................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTG................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................AGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGAag.......................................................................................................................................................................................................... 25 ag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TTTCTGAGGCAGGGGGATGACgg...................................................................................................................................................................................................... 23 gg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAaa................................................................................................................................................................................................. 26 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATt.......................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................ATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGC....................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGatga.......................................................................................................................................................................................................... 27 atga 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAta................................................................................................................................................................................................. 26 ta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGta.............................................................................................................................................................................................................. 23 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGGCCTTCACCGTGAAGATATACTTGGTGC............................................................ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATaag........................................................................................................................................................................................................ 31 aag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAGCCGA............................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAatt................................................................................................................................................................................................ 27 att 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCAGGGGGATGACTGTaaaa................................................................................................................................................................................................. 24 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTG......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGTa................................................................................................................................................................................................ 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGATTTTCTGAGGCAGTGT............................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTACGGC......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGa................................................................................................................................................................................................. 24 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCA................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGAaa....................................................................................................................................................................................................... 30 aa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCA............ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTta..................................................................................................................................................................................................... 22 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGatgt.......................................................................................................................................................................................................... 27 atgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................TGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGAgaa...................................................................................................................................................................................................... 27 gaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGA......... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TTGATGGCCTTCACCGTGAAGATATACT.................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGAg........................................................................................................................................................................................................ 28 g 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGT.................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................TGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAGCC.............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGC.................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCA...................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CGTGAAGATATACTTGGTGCCACTTTG..................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGgga................................................................................................................................................................................................. 27 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGt............................................................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAa.................................................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCCACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTT............................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAA............................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTag................................................................................................................................................................................................... 25 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATGTTGGGCACGATCATCCAGC 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............GGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGt............................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCAa........... 26 a 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACG.......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGcaa........................................................................................................................................................................................................... 28 caa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGgta.......................................................................................................................................................................................................... 29 gta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGtt.............................................................................................................................................................................................................. 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATaa......................................................................................................................................................................................................... 30 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATC....... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTtaga................................................................................................................................................................................................. 27 taga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATaaaa....................................................................................................................................................................................................... 32 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATa.......................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGt............................................................................................................................................................................................................. 31 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGTGAatta........................................................................................................................................................................................... 32 atta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................AGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGC....................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGa............................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAa.................................................................................................................................................................................................. 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTT................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAGC............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTG................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TCAGCCGAGTCCACAGCACTCACTG........................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGAac....................................................................................................................................................................................................... 28 ac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TTGATGTTGGGCACGA......... 16 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGATGGCCTTCACCGTGAAGATATACa.................................................................. 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGAag.......................................................................................................................................................................................................... 27 ag 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGtaa............................................................................................................................................................................................................ 25 taa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTttt.................................................................................................................................................................................................. 26 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGTagg.............................................................................................................................................................................. 26 agg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................TGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGAatga..................................................................................................................................................................................................... 28 atga 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATC....... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATaa......................................................................................................................................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGC............................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTT............................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGCTTGATGTTGGGCACGATCATCC... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGG.............. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................TGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGga........................................................................................................................................................................................................... 28 ga 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGAAGATATACTTGGTGCCACTTTG..................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................................TGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAGCtt............................................................................................................................................................. 29 tt 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAG................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGC........................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TCAGCCGAGTCCACAGCACTCA.............................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAatg................................................................................................................................................................................................ 28 atg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGag.............................................................................................................................................................................................................. 29 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCACCGTGAAGATATACTTGGTGCCA.......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................TTCTGAGGCAGGGGGATGgtgg...................................................................................................................................................................................................... 22 gtgg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................TGATTTTCTGAGGCAGGGGGATt.......................................................................................................................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGA......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..TGAGACAGGGGGATGACTGTGA.................................................................................................................................................................................................................................. 22 5 0.60 0.60 0.20 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGAGACAGGGGGATGACTGTGAGT................................................................................................................................................................................................................................ 24 5 0.60 0.60 0.20 - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTC.................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CACTCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGG........................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTC.................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................ACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTT............................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGG....................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................CACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCT.............................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGC...................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTT............................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTCTTCAGCTTTCCGGG....................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
..TGAGACAGGGGGATGACTGTGAGTG............................................................................................................................................................................................................................... 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 -
.....GACAGGGGGATGACTGTGAGTGATTT........................................................................................................................................................................................................................... 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGAGACAGGGGGATGACTG..................................................................................................................................................................................................................................... 19 5 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACAGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGA...................................................................................................................................................................................................................... 30 12 0.08 0.08 - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTTTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGTGAT.............................................................................................................................................................................................. 33 18 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 -

Antisense strand
TGTGAGACAGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGGGGGATGACTGTGAGTGATTTTCTGAGGCAGTGTAAGCTGGCAGCTCAGCCGAGTCCACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTACGGCTGCCCGCCTGGTTGATGGCCTTCACCGTGAAGATATACTTGGTGCCACTTTGCAGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCAGC
................................................(((..(((((((((((...(((((((...((((...((((....))))...))))...)))))))((((.((((((...(((((.....((....)).)))))...)))))).))))........)))))).))))))))..............................................................
...............................................48.............................................................................................................................................191.........................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
.......................................................................................................................................................................................................GGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGA..................... 30 1 15.00 15.00 - - - 3.00 - - 7.00 - - 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTA............................................................................................................. 26 1 9.00 9.00 - - - 4.00 - - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCT................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 - - - 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................CTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCT................................................................................................................. 29 1 6.00 6.00 - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................CTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCA.. 27 1 6.00 6.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................TGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCA.. 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCT................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTG................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
............................................................................................................................................................................................................................TCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCA.. 28 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCA............ 29 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCA.. 31 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCA.. 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....................................................................................................................CTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTA............................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GGCTGCCCGCCTGGTTGATGGCCTTCAC................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCCGAGTCCACAGCAC................................................................................................................................................. 16 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CCGCCTGGTTGATGGCCTTCACCGTGAA.......................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTG................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTG...................... 30 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTTTCCGGGCTCGCTGCTA............................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCT................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CGCCTGGTTGATGGCCTTCACCGTGAA.......................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................GCAGCTCAGCCGAGTCCACAGCACTCA.............................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTG...................... 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTGAGGCAGGGGGATGACTGTGActt................................................................................................................................................................................................... 26 ctt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGt............... 30 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGAt..................... 29 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCT.............................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGG.............. 30 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GCTGGCAGCTCAGCCGAGTCCAC...................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTt................................................................................................................. 27 t 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GTGTAAGCTGGCAGCTCAGCCGAGTCCA....................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GCAGCTCAGCCGAGTCCACAGCACTCACT............................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGG............... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................CTTGATGTTGGGCACGATCATCCA.. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCCGAGTCCACAGCACTCACTGTTGG....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................GCTTGATGTTGGGCACGATCATCCAG. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GCCTTCACCGTGAAGATATACTTGGTGCCA.......................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................CACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGt................................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................CTGTTGGTCTTCAGCTTa............................................................................................................................. 18 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AGCTCAGCCGAGTCCACAGCACTCA.............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GATATACTTGGTGCCACTT....................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTAt............................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................CTGAGGCAGGGGGATGACTGTGActtc................................................................................................................................................................................................... 27 cttc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTT................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GTAAGCTGGCAGCTCAGCCGAGTCCA....................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................GGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCt.... 30 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGAT.................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTA............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCT................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAGTCCACAGCACTCACTGTTGGTCTTCA................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TCGCTGCTACGGCTGCCCGCCTGGTTGA.......................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTG................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGA..................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................AGTCCACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAG................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTG.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCT........................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................ACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGG............... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................CCGAGTCCACAGCACTCACTGTTGGTCTT................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................GAGTCCACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAG................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTT....................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTG................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................CACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCt.................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCcag...................................................................................................................... 28 cag 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................AGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCA...... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................CCACAGCACTCACTGTTGGT...................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................GTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTAtt............................................................................................................. 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GGTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATC.... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................TGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTtctt................................................................................................................. 29 tctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TAAGCTGGCAGCTCAGCCGAGTCCACAa..................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGGCA............ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGGTTGATGGCCTTCACCGTGAAGATA...................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................................................................................................ACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTG................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTG...................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................GCAGCTCAGCCGAGTCCACAGCACTC............................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGCCGTGCACGGTGTAGTGGTTCTGCTTGA..................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................GCTGCCCGCCTGGTTGATGGCCTTCAC................................................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CAGCTTTCCGGGCTCGCTGCTA............................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CGGTGTAGTGGTTCTGCTTGATGTTGGG.............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GTTGGTCTTCAGCTTTCCGGGCTCGCTGt................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................GCCGAGTCCACAGCACTCACTGTTGGTCTT................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGAAGATATACTTGGTGCCACTTTGCA................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................GTTCTGCTTGATGTTGGGCACGATCATCCAt.. 31 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GGCCTTCACCGTGAAGATATACTTGGTGC............................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................ACAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTTTC........................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTTTC........................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
...................................................................................................CAGCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCC.......................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................CTCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGGG....................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GCACTCACTGTTGGTCTTCAGCTTTCCGG........................................................................................................................ 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTTT............................................................................................................................ 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - -
.............................................................................................................TGTTGGTCTTCAGCTT............................................................................................................................. 16 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - -