(10)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(3)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(36)
TESTES

Sense strand
CTGCGGCTGAGTGTCACTGCTGACGTGGGGGCGGCTGTCCAATCATCTGGGTATGGAACATTCTAAAACTCAGACAAGACGGCTAGGATTGGCTGATGGGCTAAGCCCGCCTCCAGGGTGACGTGTCTGCCTATGGATATCAGTTGCCAGAGAAACCTGGCTTTACTATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCTGGATTCTCGTTTCAGGTTTCGGGGTGGGGGTG
................................................................................................................................(((.((((.((......(((((......)))))..))))))))).((((......)))).(((....)))....................................................
................................................................................................................................129....................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCAC...................................................... 25 2 52.00 52.00 6.50 5.50 - 5.50 4.50 4.00 2.50 3.00 2.50 1.00 2.50 2.00 1.50 1.00 1.00 - - 0.50 1.50 0.50 2.00 1.50 - 0.50 - 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - 0.50 - - 0.50
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCA....................................................... 24 2 34.00 34.00 13.50 2.00 3.50 2.00 0.50 0.50 - 1.50 2.00 - 1.00 - 2.00 0.50 - - - 0.50 0.50 0.50 0.50 0.50 1.00 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCAC...................................................... 24 2 27.00 27.00 - 3.50 0.50 2.00 0.50 - 2.50 1.50 3.00 - 4.00 - 1.00 0.50 0.50 0.50 - 2.00 0.50 0.50 - 1.00 - - 0.50 1.00 - - 1.00 - - - - 0.50 - - - -
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCAGTGAT......................................................... 22 2 15.50 15.50 4.50 - 4.50 2.00 - - - 0.50 - - - 1.50 - 0.50 1.00 - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCAGTGA.......................................................... 21 2 14.00 14.00 4.00 - 2.00 1.00 2.00 - - 1.50 - 0.50 - 0.50 - 1.00 - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATC........................................................ 23 2 8.50 8.50 2.50 - - 0.50 2.00 - 1.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGATCAC...................................................... 23 2 7.50 7.50 2.00 - - 1.50 1.00 0.50 0.50 - - 0.50 - 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ATCACACGTCGGCTGCTG......................................... 18 2 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACGTCGGCTGCTGGA....................................... 15 4 5.00 5.00 0.75 - 0.75 1.00 - 0.25 - 0.50 - - - 0.75 0.75 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCGGCTGCTGGAGAGAGCTGGATTCTCGTT..................... 30 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CGGCTGCTGGAGAGAGCTGGATTCTCGT...................... 28 1 5.00 5.00 - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CACGTCGGCTGCTGGA....................................... 16 3 4.33 4.33 - 2.33 0.33 - - 0.67 - - - 0.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAACATTCTAAAACTCAGACAAGACGGC....................................................................................................................................................................... 30 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................ATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTGt.......................................................... 25 t 4.00 0.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GCAGTGATCACACGTCGG............................................... 18 2 3.50 3.50 - - - 0.50 - - 1.50 - - 0.50 - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCA....................................................... 23 2 3.50 3.50 - - 0.50 - - - - - 0.50 - 0.50 - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTGA.......................................................... 20 2 3.50 3.50 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 0.50 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAGC................................. 25 2 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAACATTCTAAAACTCAGACAAGACG......................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCACA..................................................... 26 2 2.50 2.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTGAT......................................................... 21 2 2.50 2.50 - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTGATC........................................................ 22 2 2.50 2.50 - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GCGGTTGGAGGAGCAGCA.............................................................. 18 2 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................AGGAGCAGCAGTGATCAC...................................................... 18 2 2.00 2.00 - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
..............................................................................................................................................................................................GATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGA................................... 25 2 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAACATTCTAAAACTCAGACAAGACGG........................................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................ACTATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTG........................................................... 27 2 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCACA..................................................... 25 2 1.50 1.50 - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................CAGTGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCT................................ 32 2 1.50 1.50 - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTt........................................................... 23 t 1.50 0.50 - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CACACGTCGGCTGCTGGAGA..................................... 20 2 1.50 1.50 - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GTGATCACACGTCGGCTGCT.......................................... 20 2 1.50 1.50 - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GAGGAGCAGCAGTGATCACACGTCGG............................................... 26 2 1.50 1.50 - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCA.............................................................. 17 2 1.50 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GATCACACGTCGGCTGCTGGAG...................................... 22 2 1.50 1.50 - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GTCGGCTGCTGGAGAGAG.................................. 18 2 1.50 1.50 - - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCGGCTGCTGGAGAGAGC................................. 18 9 1.11 1.11 - 0.78 0.22 - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................ATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTatt......................................................... 26 att 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GTGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGA................................... 27 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CTATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCA....................................................... 30 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TGCTGGAGAGAGCTGGATTCTCGTTTCAG................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TGGATATCAGTTGCCAGAGAAACCTagct........................................................................................ 29 agct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGATCA....................................................... 22 2 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TTCTAAAACTCAGACAAGACGGCTAGG................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GATCACACGTCGGCTGCTtgag...................................... 22 tgag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................AGGAGCAGCAGTGATCACA..................................................... 19 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGATC........................................................ 21 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AGAGAAACCTGGCTTTACTAT................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................GGAGCAGCAGTGATCACA..................................................... 18 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
...................................................................................................................................................................................................CACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCTGGATTCTCGT...................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TGGATTCTCGTTTCAGGTTTCGGGGT....... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................AGTGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAG.................................... 27 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGATCACACGTCGGCTGCTGGA....................................... 22 2 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................CTCGTTTCAGGTTTCGGGGTGGG.... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CGGCTGCTGGAGAGAGCTG............................... 19 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GCAGTGATCACACGTtggc.............................................. 19 tggc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TGGAACATTCTAAAACTCAGACAAGAC.......................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CACGTCGGCTGCTGGAG...................................... 17 3 0.67 0.67 - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GCGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCA....................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CACACGTCGGCTGCTGG........................................ 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCTGG.............................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGGCGGTTGGAGGAGCAGC............................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................GCAGCAGTGATCACACGTC................................................. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGATa........................................................ 21 a 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................AGGAGCAGCAGTGATCACACG................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCgc...................................................... 24 gc 0.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................ACACGTCGGCTGCTGGAGA..................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ATCACACGTCGGCTGC........................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACGTCGGCTGCTGGAGAG.................................... 18 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGAT......................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAG.................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGCAGTGATCACACGTCGGCT............................................. 21 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................GCAGCAGTGATCACACGTCGG............................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................ACACGTCGGCTGCTGGAG...................................... 18 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCACACGTCGGCTGCTGGAGA..................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGATCACAC.................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGT............................................................ 22 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................GGAGAGAGCTGGATTCTC........................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................GAGGAGCAGCAGTGATCA....................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................AGTGATCACACGTCGGC.............................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAG.................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAG.................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCT................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................AGCAGTGATCACACGTCGG............................................... 19 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCTG............................... 23 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................TACTATGGCGGTTGGAGGAGCAGC............................................................... 24 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGATCACACGT.................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GCGGTTGGAGGAGCAGCAG............................................................. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GGTTGGAGGAGCAGCAGTG........................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GTGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAG.................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GAGCAGCAGTGATCACACGTCG................................................ 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................GCAGCAGTGATCACACGTCGGC.............................................. 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................CAGTGATCACACGTCGGCT............................................. 19 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................CACGTCGGCTGCTGGAGAGA................................... 20 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CAGCAGTGATCACACGTCGG............................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................GCAGTGATCACACGTCGGCTG............................................ 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAG............................................................. 23 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TCGGCTGCTGGAGAGAGCTGGA............................. 22 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CGGCTGCTGGAGAGAGCTGGATTC.......................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GGAGGAGCAGCAGTGATCA....................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................ACTATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTGA.......................................................... 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCTG............................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
...........................................................................................................................................................................CGGTTGGAGGAGCAGCAGTGAccac...................................................... 25 ccac 0.50 14.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGTGATCACACGTC................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GATCACACGTCGGCTG............................................ 16 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GTCGGCTGCTGGAGAGAGCTGGATT........................... 25 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CGGCTGCTGGAGAGAGCT................................ 18 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACGTCGGCTGCTGGAG...................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTTGGAGGAGCAGCAGT............................................................ 17 6 0.17 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGCGGCTGAGTGTCACTGCTGACGTGGGGGCGGCTGTCCAATCATCTGGGTATGGAACATTCTAAAACTCAGACAAGACGGCTAGGATTGGCTGATGGGCTAAGCCCGCCTCCAGGGTGACGTGTCTGCCTATGGATATCAGTTGCCAGAGAAACCTGGCTTTACTATGGCGGTTGGAGGAGCAGCAGTGATCACACGTCGGCTGCTGGAGAGAGCTGGATTCTCGTTTCAGGTTTCGGGGTGGGGGTG
................................................................................................................................(((.((((.((......(((((......)))))..))))))))).((((......)))).(((....)))....................................................
................................................................................................................................129....................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
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Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029036(GSM433288)
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mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)