| Gene: Rhox2 | ID: uc009sym.1_intron_0_0_chrX_34785082_f | SPECIES: mm9 |
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(1) OTHER.ip |
(7) OTHER.mut |
(6) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(33) TESTES |
| CAATTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAAATGCGAATGGTCAGTGAGTTTAGGGAAGGGTGGGTTGACGATATCCACAAGGGGAGGAGCATCCCATATAGAATTGAACTGGAGCTGTGCGCCACAGGCTTTGGCCTGACTCCATGACACCTCCGCACCAGCCTAGGCCCTGAGGCCTGGTTTTTCGTTTCCCCACTTAAGGTGTAAAGACTCTGATGGTCTTGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAGGGA ...............................................................................................................(((.((((..((((.(((......(((((....)))))........))).)))).....((((.(((((....))))))))).)))).)))............................................................ ......................................................................................................103..........................................................................................................212................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) |
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| ...........................................................................................................TATAGAATTGAACTGGAGCTGTGCGC................................................................................................................................. | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................................................TATAGAATTGAACTGGAGCTGTGCG.................................................................................................................................. | 25 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..................................................................................TATCCACAAGGGGAGGAGCATCCCAT.......................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............ATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAAt............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................TGAGGAAAATGCGAATGGTgtaa.............................................................................................................................................................................................................. | 23 | gtaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................GAGGATGAGGAAAATGCGAATGGTgtgt.............................................................................................................................................................................................................. | 28 | gtgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................GGATGAGGAAAATGCGAATGGTgtg............................................................................................................................................................................................................... | 25 | gtg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................GAAAATGCGAATGGctca............................................................................................................................................................................................................... | 18 | ctca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................TTCGTTTCCCCgacg..................................................... | 15 | gacg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGt.................................................................................................................................................................................................................................. | 30 | t | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAt... | 26 | t | 1.00 | 3.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ....TACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAG....................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 6 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................GGAGGATGAGGAAAATGCGAATGGTgtat.............................................................................................................................................................................................................. | 29 | gtat | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GAGGATGAGGAAAATGCGAATGGTg................................................................................................................................................................................................................. | 25 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGGTCTTGCTGGCTGGAGAGGGAtt.......... | 25 | tt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................TAGAATTGAACTGGAGCTGTGCGCCAC.............................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGttt................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAa... | 26 | a | 0.50 | 3.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGA........................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 6 | 0.50 | 0.50 | 0.33 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TTAAGGTGTAAAGACTCTGATGGTCTTGC.......................... | 29 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAGGt. | 28 | t | 0.50 | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAG................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 8 | 0.50 | 0.50 | 0.25 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAGGtt | 29 | tt | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................................TCTTGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATG..... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAGttt | 29 | ttt | 0.50 | 2.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAA............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 8 | 0.50 | 0.50 | 0.12 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 6 | 0.50 | 0.50 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAGt.. | 27 | t | 0.50 | 2.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TTAAGGTGTAAAGACTCTGATGGTCTTG........................... | 28 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................................TGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAGGG. | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................................TTGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAG... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGG................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 8 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - |
| ...............................................ATGGTCAGTGAGTTTAGGGAAGGGTG............................................................................................................................................................................................. | 26 | 5 | 0.40 | 0.40 | - | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGt............................................................................................................................................................................................................................... | 28 | t | 0.38 | 0.38 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAAt............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | t | 0.38 | 0.50 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGAGGAGGATGAGGAAAATGCGAATG.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 8 | 0.38 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | 0.12 | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATGTGGGACCTGAGGAGGATGA.................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 8 | 0.38 | 0.38 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGG................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 8 | 0.38 | 0.38 | 0.12 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGt...................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | t | 0.33 | 1.00 | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........AGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................TAAGGTGTAAAGACTCTGATGGTCTTGCT......................... | 29 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGAGGAGGATGAGGAAAATGCGAAT..................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGACTCCATGACACCTCCGCACCAGCC........................................................................................ | 27 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............ATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAA.............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGA............................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGGTCTTGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAA....... | 28 | 4 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGGTCTTGCTGGCTGGAGAGGGAAGt......... | 26 | t | 0.25 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAA.............................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 8 | 0.25 | 0.25 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TGGTCTTGCTGGCTGGAGAGGGAA........... | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................TGATGGTCTTGCTGGCTGGAGAGG.............. | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGACTCCATGACACCTCCGCA.............................................................................................. | 21 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................ATGGTCTTGCTGGCTGGAGAGGGA............ | 24 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................TGGTCAGTGAGTTTAGGGAAGGGTGGG........................................................................................................................................................................................... | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................TGAGGAAAATGCGAATGGTCAGTGAGTT......................................................................................................................................................................................................... | 28 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................TGATGGTCTTGCTGGCTGGAGA................ | 22 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................CTCTGATGGTCTTGCTGGCTGGAGA................ | 25 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................TGGTCAGTGAGTTTAGGGAAGGGTGGGT.......................................................................................................................................................................................... | 28 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................TGCGAATGGTCAGTGAGTTTAGGGAAGG................................................................................................................................................................................................ | 28 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTCAGTGAGTTTAGGGAAGGGTGGGTTGA....................................................................................................................................................................................... | 29 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................GACTCTGATGGTCTTGCTGGCTGGAG................. | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................TGATGGTCTTGCTGGCTGGAGAtgg............. | 25 | tgg | 0.20 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGt...................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 0.17 | 0.67 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACAAGCTTGATGTGGGACC.............................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGtat...................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | tat | 0.17 | 4.00 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........AGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGATG................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAG.......................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGA..................................................................................................................................................................................................................................... | 30 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 |
| ....TACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGG...................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .AATTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGG......................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGt........................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | t | 0.17 | 2.83 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGG...................................................................................................................................................................................................................................... | 29 | 6 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....ACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGG......................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....TACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAc....................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | c | 0.17 | 1.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....ACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGG...................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...TTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAt....................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | t | 0.17 | 0.50 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGAGGCCTGGTTTTTCGTTTCCCCACT...................................................... | 27 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................TGAGGCCTGGTTTTTCGTTTCCCCAC....................................................... | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................GAGCTGTGCGCCACAGGCTTTGGCCTGAC............................................................................................................... | 29 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAaaa............................................................................................................................................................................................................................... | 27 | aaa | 0.12 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAAAT........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............TGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAttt........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | ttt | 0.12 | 1.00 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............ATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGA............................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 8 | 0.12 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........TTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGA............................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAta................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | ta | 0.12 | 2.88 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CTTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGA.................................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAAATG.......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAAATGt......................................................................................................................................................................................................................... | 28 | t | 0.12 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................TGGGACCTGAGGAGGAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CAATTACAAGCTTGATGTGGGACCTGAGGAGGATGAGGAAAATGCGAATGGTCAGTGAGTTTAGGGAAGGGTGGGTTGACGATATCCACAAGGGGAGGAGCATCCCATATAGAATTGAACTGGAGCTGTGCGCCACAGGCTTTGGCCTGACTCCATGACACCTCCGCACCAGCCTAGGCCCTGAGGCCTGGTTTTTCGTTTCCCCACTTAAGGTGTAAAGACTCTGATGGTCTTGCTGGCTGGAGAGGGAAGAAATGAGGGA ...............................................................................................................(((.((((..((((.(((......(((((....)))))........))).)))).....((((.(((((....))))))))).)))).)))............................................................ ......................................................................................................103..........................................................................................................212................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) |
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