| Gene: Tfdp2 | ID: uc009rcg.1_intron_1_0_chr9_96123618_f.3p | SPECIES: mm9 |
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(6) OTHER.mut |
(5) PIWI.ip |
(25) TESTES |
| TGCCTCTGCCTCCTCAGTGCTGGGATTAAAAGTGTGCTCTACTACCCCAGGTATACTGTGTCTCCAAATGTAGATTAGTAGAATGGAATAGGACCGCGCGCGCGCGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACTTGATACCGCAGAAGACTGACTTCTTACTTACCTGTCTTTCAGGTAACATTTCACTTGTTGCCTTTCCAGTTTCAAGCACCAACTCACCAACA .............................................................................((((...(((((((.((((((((((((((((((....)))))))))))))))).)).((((.((((..((((....))))...)))))))).....)))..))))...))))............................................................. .............................................................................78.............................................................................................................189........................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCG........................................................................................................................................................ | 17 | 3 | 1298.33 | 1298.33 | 608.33 | 287.00 | 203.67 | 121.67 | 54.00 | 17.33 | 2.00 | 0.33 | 0.67 | 0.33 | 0.67 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCG........................................................................................................................................................ | 16 | 3 | 220.33 | 220.33 | 87.00 | 81.67 | 22.33 | 12.00 | 6.33 | 3.00 | 4.00 | 2.00 | 0.67 | 0.67 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGC......................................................................................................................................................... | 16 | 3 | 117.33 | 117.33 | 22.33 | 78.33 | 5.00 | 4.00 | 1.67 | - | 3.00 | 0.67 | 0.33 | 1.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAATGGAATAGGACCGCGg....................................................................................................................................................... | 20 | g | 31.00 | 9.00 | 14.00 | 1.00 | 8.00 | 3.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCG........................................................................................................................................................ | 15 | 4 | 25.75 | 25.75 | 9.50 | 6.75 | 3.25 | 2.25 | 0.75 | 0.50 | 2.00 | - | - | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCG.......................................................................................................................................................... | 15 | 4 | 17.25 | 17.25 | 5.50 | 2.50 | 1.25 | 5.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | 0.25 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGC......................................................................................................................................................... | 15 | 4 | 11.50 | 11.50 | - | 2.00 | 0.25 | 1.00 | - | - | 5.50 | 0.25 | - | 1.75 | 0.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAATGGAATAGGACCGCG........................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 9.00 | 9.00 | 2.00 | 3.00 | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgg...................................................................................................................................................... | 18 | gg | 9.00 | 220.33 | 1.67 | 5.00 | 0.67 | 0.33 | 1.00 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGC....................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 8.00 | 8.00 | 2.00 | - | 2.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgg...................................................................................................................................................... | 19 | gg | 7.67 | 1298.33 | 1.67 | 2.67 | 2.00 | 0.33 | 0.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGCGgc.................................................................................................................................................... | 20 | gc | 7.00 | 0.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAATGGAATAGGACCGCGgtt..................................................................................................................................................... | 22 | gtt | 6.00 | 9.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GAATGGAATAGGACCGCGgt...................................................................................................................................................... | 20 | gt | 6.00 | 2.00 | - | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAATGGAATAGGACCGC......................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 5.00 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGCag..................................................................................................................................................... | 20 | ag | 5.00 | 8.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAATGGAATAGGACCGCGgt...................................................................................................................................................... | 21 | gt | 5.00 | 9.00 | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGga...................................................................................................................................................... | 19 | ga | 5.00 | 1298.33 | 1.00 | 2.67 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGC....................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GAATGGAATAGGACCGCGg....................................................................................................................................................... | 19 | g | 4.00 | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgtta.................................................................................................................................................... | 21 | gtta | 3.67 | 1298.33 | 2.33 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGag...................................................................................................................................................... | 19 | ag | 3.33 | 1298.33 | 3.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGggt..................................................................................................................................................... | 20 | ggt | 3.33 | 1298.33 | 1.00 | 1.00 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgc...................................................................................................................................................... | 19 | gc | 3.00 | 1298.33 | 0.33 | 0.33 | 2.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgc...................................................................................................................................................... | 18 | gc | 2.67 | 220.33 | 0.33 | 1.00 | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGagg....................................................................................................................................................... | 18 | agg | 2.50 | 17.25 | 1.25 | - | 0.75 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGa....................................................................................................................................................... | 18 | a | 2.33 | 1298.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................GGAATAGGACCGCGCttct................................................................................................................................................... | 19 | ttct | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................TAGTAGAATGGAATAGGACCGCGCGC..................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAATGGAATAGGACCG.......................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGttt..................................................................................................................................................... | 20 | ttt | 2.00 | 1298.33 | - | 1.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................GTAGAATGGAATAGGAC............................................................................................................................................................ | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TTGTTGCCTTTCCAGTTTCAAGCACC............ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GAATGGAATAGGACCGCGgtt..................................................................................................................................................... | 21 | gtt | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCtcgg....................................................................................................................................................... | 18 | tcgg | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TGTCTCCAAATGTAGATTAGTAGAATGG.................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GAATGGAATAGGACCGCG........................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TTCACTTGTTGCCTTTCCAGTTTCAA................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGga...................................................................................................................................................... | 18 | ga | 2.00 | 220.33 | 0.33 | 1.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgttt.................................................................................................................................................... | 20 | gttt | 2.00 | 220.33 | - | 1.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGggt..................................................................................................................................................... | 19 | ggt | 2.00 | 220.33 | 0.33 | - | 1.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgat..................................................................................................................................................... | 19 | gat | 1.67 | 220.33 | 1.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgct..................................................................................................................................................... | 19 | gct | 1.67 | 220.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgctg.................................................................................................................................................... | 20 | gctg | 1.33 | 220.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgcgg.................................................................................................................................................... | 21 | gcgg | 1.33 | 1298.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGCt...................................................................................................................................................... | 19 | t | 1.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................TTAGTAGAATGGAATAGGACCGCGCGC..................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TTCACTTGTTGCCTTTCCAGTTTCA.................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................................TTCACTTGTTGCCTTTCCAGTTTCAAGC............... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................TCCAAATGTAGATTAGTAGAATGGAATAGGACC........................................................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgtc..................................................................................................................................................... | 20 | gtc | 1.00 | 1298.33 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TGTAGATTAGTAGAATGGAATAGGACC........................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgat..................................................................................................................................................... | 20 | gat | 1.00 | 1298.33 | - | - | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................TTTCACTTGTTGCCTTTCCAGTTTCA.................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................TGCACTTGATACCGCAGAAGACTGACT....................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGCttct................................................................................................................................................... | 22 | ttct | 1.00 | 8.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGggtc.................................................................................................................................................... | 21 | ggtc | 1.00 | 1298.33 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGC....................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCcg....................................................................................................................................................... | 18 | cg | 1.00 | 117.33 | 0.33 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCc........................................................................................................................................................ | 17 | c | 1.00 | 117.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................TGATACCGCAGAAGACTGACTTCTTACTT............................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGggtg...................................................................................................................................................... | 19 | ggtg | 1.00 | 17.25 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGtt...................................................................................................................................................... | 19 | tt | 1.00 | 1298.33 | - | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCa........................................................................................................................................................ | 17 | a | 1.00 | 117.33 | 0.67 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgttt.................................................................................................................................................... | 21 | gttt | 1.00 | 1298.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCtc......................................................................................................................................................... | 16 | tc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TTGTTGCCTTTCCAGTTTCAAGCACCA........... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................TGATACCGCAGAAGACTGACTTCTTAC................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGCta..................................................................................................................................................... | 18 | ta | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................AGAATGGAATAGGACCGCGgttc.................................................................................................................................................... | 23 | gttc | 1.00 | 9.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGCttct................................................................................................................................................... | 20 | ttct | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TGTCTCCAAATGTAGATTAGTAGAAT...................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGCaga.................................................................................................................................................... | 20 | aga | 1.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGt....................................................................................................................................................... | 18 | t | 1.00 | 1298.33 | - | - | 0.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCag....................................................................................................................................................... | 17 | ag | 1.00 | 11.50 | 0.75 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACagcg........................................................................................................................................................ | 16 | agcg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GAATGGAATAGGACCG.......................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgtg..................................................................................................................................................... | 19 | gtg | 1.00 | 220.33 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................TGGGATTAAAAGTGTGCTCTACTACCC........................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................TGATACCGCAGAAGACTGACTTCTTACT................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGCt...................................................................................................................................................... | 18 | t | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTAAAAGTGTGCTCTACTACCCCAGGT...................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGgg...................................................................................................................................................... | 17 | gg | 0.75 | 25.75 | 0.25 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCag....................................................................................................................................................... | 18 | ag | 0.67 | 117.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCtg....................................................................................................................................................... | 18 | tg | 0.67 | 117.33 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgta..................................................................................................................................................... | 20 | gta | 0.67 | 1298.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCagg...................................................................................................................................................... | 19 | agg | 0.67 | 117.33 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGatt..................................................................................................................................................... | 19 | att | 0.67 | 220.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGa....................................................................................................................................................... | 17 | a | 0.67 | 220.33 | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgaaa.................................................................................................................................................... | 21 | gaaa | 0.67 | 1298.33 | - | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgct..................................................................................................................................................... | 20 | gct | 0.67 | 1298.33 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgtc..................................................................................................................................................... | 19 | gtc | 0.67 | 220.33 | - | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGgtaa.................................................................................................................................................... | 19 | gtaa | 0.50 | 25.75 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGga...................................................................................................................................................... | 17 | ga | 0.50 | 25.75 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGggt..................................................................................................................................................... | 18 | ggt | 0.50 | 25.75 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGgcgc...................................................................................................................................................... | 19 | gcgc | 0.50 | 17.25 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGttt..................................................................................................................................................... | 19 | ttt | 0.33 | 220.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGtttc.................................................................................................................................................... | 20 | tttc | 0.33 | 220.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgttg.................................................................................................................................................... | 20 | gttg | 0.33 | 220.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgtgg.................................................................................................................................................... | 21 | gtgg | 0.33 | 1298.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCagtt..................................................................................................................................................... | 20 | agtt | 0.33 | 117.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGgta..................................................................................................................................................... | 19 | gta | 0.33 | 220.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGtttc.................................................................................................................................................... | 21 | tttc | 0.33 | 1298.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCGaata.................................................................................................................................................... | 20 | aata | 0.33 | 220.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgggg.................................................................................................................................................... | 21 | gggg | 0.33 | 1298.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCGgtcc.................................................................................................................................................... | 21 | gtcc | 0.33 | 1298.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGCca....................................................................................................................................................... | 18 | ca | 0.33 | 117.33 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGgta..................................................................................................................................................... | 18 | gta | 0.25 | 25.75 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCcgt...................................................................................................................................................... | 18 | cgt | 0.25 | 11.50 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGag........................................................................................................................................................ | 17 | ag | 0.25 | 17.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCtt....................................................................................................................................................... | 17 | tt | 0.25 | 11.50 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGgggg...................................................................................................................................................... | 19 | gggg | 0.25 | 17.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGaggt...................................................................................................................................................... | 19 | aggt | 0.25 | 17.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGgtc..................................................................................................................................................... | 18 | gtc | 0.25 | 25.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCagt...................................................................................................................................................... | 18 | agt | 0.25 | 11.50 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGgg........................................................................................................................................................ | 17 | gg | 0.25 | 17.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGggcg.................................................................................................................................................... | 19 | ggcg | 0.25 | 25.75 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGggg....................................................................................................................................................... | 18 | ggg | 0.25 | 17.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................ATGGAATAGGACCGCtg....................................................................................................................................................... | 17 | tg | 0.25 | 11.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................AATGGAATAGGACCGg......................................................................................................................................................... | 16 | g | 0.25 | 17.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGAATAGGACCGCGgc...................................................................................................................................................... | 17 | gc | 0.25 | 25.75 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TGCCTCTGCCTCCTCAGTGCTGGGATTAAAAGTGTGCTCTACTACCCCAGGTATACTGTGTCTCCAAATGTAGATTAGTAGAATGGAATAGGACCGCGCGCGCGCGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACTTGATACCGCAGAAGACTGACTTCTTACTTACCTGTCTTTCAGGTAACATTTCACTTGTTGCCTTTCCAGTTTCAAGCACCAACTCACCAACA .............................................................................((((...(((((((.((((((((((((((((((....)))))))))))))))).)).((((.((((..((((....))))...)))))))).....)))..))))...))))............................................................. .............................................................................78.............................................................................................................189........................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..CTCTGCCTCCTCAGTGCTGGGATTAAAt............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................TGTGCTCTACTACCatct............................................................................................................................................................................................................ | 18 | atct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| .CTGCCTCCTCAGTGCTGGGATTAtaga.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | taga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TCTGCCTCCTCAGTGCTGGGATTAagcg.............................................................................................................................................................................................................................. | 28 | agcg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....CTGCCTCCTCAGTGCTGGGATTAAAc............................................................................................................................................................................................................................ | 26 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ...GCCTCCTCAGTGCTGGGATTAAAgttg............................................................................................................................................................................................................................ | 27 | gttg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |