chr9:96081991 96082240 +
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(50)
TESTES

Sense strand
ATTTTAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATCATTAAGTAAAATCAGAAATGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAAAATAATTTCTAATATGCTAATATTTCTCAGCATATTTTCTCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTCCTGTCTT
.................................................................((((...((((.((((((..(((((((..((((...(((.(((((..........))))).)))....)))).)))))))...((((((((..........)))))))).........))))))..))))...))))................................................
.................................................................66............................................................................................................................................208........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCA............................ 28 1 191.00 191.00 61.00 67.00 24.00 24.00 12.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAC.............. 30 1 114.00 114.00 10.00 9.00 24.00 10.00 10.00 1.00 - 13.00 16.00 1.00 4.00 7.00 5.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGA............... 29 1 112.00 112.00 26.00 21.00 12.00 13.00 7.00 1.00 - 8.00 11.00 - 4.00 2.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATC.......................................................................................................................................................... 26 1 108.00 108.00 34.00 37.00 11.00 12.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - 2.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGC............................. 27 1 108.00 108.00 28.00 36.00 7.00 13.00 6.00 2.00 - 2.00 - - - - 1.00 - 5.00 - - - - 2.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGC............................. 29 1 98.00 98.00 31.00 30.00 8.00 12.00 12.00 - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCA......................................................................................................................................................... 27 1 85.00 85.00 19.00 15.00 8.00 12.00 13.00 2.00 1.00 1.00 3.00 - 3.00 - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGA....................................................................................................................................................................... 26 1 79.00 79.00 29.00 27.00 1.00 8.00 6.00 1.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGG................ 28 1 67.00 67.00 8.00 9.00 2.00 3.00 4.00 2.00 - 12.00 6.00 - 3.00 3.00 4.00 - 5.00 - - 1.00 1.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAA........................................................................................................................................................ 28 1 62.00 62.00 15.00 18.00 11.00 6.00 2.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAAC..................................................................................................................................................................... 28 1 60.00 60.00 13.00 15.00 11.00 5.00 5.00 2.00 - 5.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACT.................................. 30 1 47.00 47.00 10.00 7.00 13.00 3.00 6.00 - - 2.00 - - - 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGAC................................... 29 1 41.00 41.00 9.00 11.00 3.00 5.00 6.00 2.00 1.00 - - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAC.............. 27 1 36.00 36.00 9.00 6.00 3.00 4.00 6.00 - - 1.00 2.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACT.................................. 28 1 35.00 35.00 8.00 17.00 4.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATC........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 32.00 32.00 4.00 5.00 - - - 7.00 1.00 - 1.00 2.00 - - - - 7.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACA............. 28 1 28.00 28.00 2.00 8.00 4.00 4.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCA............................... 27 1 28.00 28.00 13.00 8.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAA...................................................................................................................................................................... 27 1 27.00 27.00 11.00 9.00 1.00 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAA....................................................................................................................................................... 29 1 26.00 26.00 4.00 6.00 5.00 5.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAA........................... 29 1 22.00 22.00 10.00 4.00 3.00 1.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAC.............. 28 1 21.00 21.00 5.00 6.00 3.00 2.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCC................................ 26 1 20.00 20.00 8.00 4.00 - 2.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGC........................................................................................................................................................................... 27 1 19.00 19.00 - 1.00 2.00 - - 3.00 9.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTC....... 28 1 16.00 16.00 5.00 2.00 2.00 2.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCA............................ 27 1 15.00 15.00 6.00 4.00 - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAG.............................. 28 1 15.00 15.00 8.00 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGG..................................... 27 1 15.00 15.00 - 3.00 - - 2.00 - - 3.00 - 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGT............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 14.00 14.00 - - - - - 10.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTC................................. 31 1 10.00 10.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTA............................................................................................................................................................. 25 1 10.00 10.00 - - 1.00 1.00 - 4.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGAC................................... 27 1 10.00 10.00 2.00 1.00 - - - 1.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGG........................................................................................................................................................................ 25 1 9.00 9.00 - - - - - 3.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAC.............. 29 1 8.00 8.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGA............... 27 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTG............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 7.00 7.00 - - - - - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAAT......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTC................................. 29 1 7.00 7.00 - - 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAAT........................................................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 - - 2.00 - 1.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAA............................................................................................................................................................ 24 1 7.00 7.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACA............. 27 1 6.00 6.00 1.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGA............... 28 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGA............... 26 1 6.00 6.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGT......... 26 1 6.00 6.00 1.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCA............................ 30 1 6.00 6.00 1.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.TTTTAATGACAGGGCTTAGTGATGC................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 6.00 6.00 - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAG............ 29 1 6.00 6.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TAAGTAAAATCAGAAATGTTATGTCATT.......................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGTC............................................................................................................................................................................. 25 1 5.00 5.00 - - - - - - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAt...................................................................................................................................................................... 27 t 5.00 79.00 1.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGt............... 29 t 5.00 67.00 - 1.00 - 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAt....................................................................................................................................................... 29 t 5.00 62.00 - - 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATC.......................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGA.................................... 28 1 5.00 5.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TTCTCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCAT.............................................. 30 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAA............................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTT.............................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACA............. 31 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTT........ 27 1 4.00 4.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAG...................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCC................................ 30 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTTG................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGG................ 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGC............................. 26 1 4.00 4.00 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTCC...... 29 1 4.00 4.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTTTAATGACAGGGCTTAGTGATGCT............................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAt........................... 29 t 4.00 191.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGA................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAG................. 27 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTT.............................................................................................................................................................. 24 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAt........................................................................................................................................................ 28 t 3.00 85.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCCT................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAC.............. 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAAC..................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCC................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTTTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAG..................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.TTTTAATGACAGGGCTTAGTGATGCTT.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATCAT...................................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGA....................................... 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................AGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAAC......................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCATCTGCCTCTTGAAAATAATTTC....................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCATCTGCCTCTTGAAAATAATTTCTA..................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTTAATGACAGGGCTTAGTGATGCTT.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACA.................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTCC...... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTT................................................................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTT........ 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGA....................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAG.............................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................CATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACA.................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACA.................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAAa..................................................................................................................................................................... 28 a 2.00 27.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TATTTCTCAGCATATTTTCTCTTC.................................................................... 24 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATC.......................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGG................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAG.............................. 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTC................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAG............ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTT................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAC.............. 31 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAA........................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATt.......................................................................................................................................................... 26 t 2.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGA.................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAAC..................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTTAATGACAGGGCTTAGTGATGC................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGCCTCTTGAAAATAATTTCTAATATGC............................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATCATT..................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTCCT..... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCA............................ 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGT............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCA......................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACt............. 29 t 2.00 21.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGt....................................................................................................................................................................... 26 t 2.00 9.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTT........ 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGG........................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAG...................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGT.................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTTAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGT............................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAG................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGT.................................................................................................................................................................. 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACT.................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGC............................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTC................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAA.................. 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATC........................................................................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTTTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGA.................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCC................................ 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAAC......................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAA........................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGA....................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAA................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAAAA..................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CTGCCTCTTGAAAATAATTTCTAATATGCT.............................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCA............................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAAa......................................................................................................................................................................................................................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGAAGAATATTGTCCCTTCATCTGC........................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAA........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCggc............................. 29 ggc 1.00 20.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................ATTTTAAGAGGACTCCAGCAAACT........................ 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGAAAATAATTTCTAATATGCTAATATTTC...................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTG.......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTG............................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAATATTTCTCAGCATATTTTCTCTTC.................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCc......................................................................................................................................................... 27 c 1.00 108.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TCTCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGC................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGAAGAATATTGTCCCTTCATCTGCCT...................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATtaa........................................................................................................................................................ 28 taa 1.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCAT.............................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTTTAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGT............................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTC................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGT............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGtaa........................... 29 taa 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAa.............. 29 a 1.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAG................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAG...................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTTTAATGACAGGGCTTAGTGATG................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAA.......................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTGTAAATCTACCAGGC................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...........................................................................................TAATCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCCT................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAG.............................. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGAAGAATATTGTCCCTTCATCccc........................................................................................................................ 25 ccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CTGCCTCTTGAAAATAATTTCTAATATG................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAAAATAATT......................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAAA............................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACa.................................. 28 a 1.00 10.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGG........................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAa.............. 30 a 1.00 112.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAAT........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TTCTCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCA............................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TAATCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCC................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGG................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAg....................................................................................................................................................... 29 g 1.00 62.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTaatc........................................................................................................................................................... 25 aatc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACT.................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGc..................................... 29 c 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAA.......................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TAAAATCAGAAATGTTATGTCATTTGCTTT.................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCCTT............................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TAAAATCAGAAATGTTATGTCATTTGC....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATa........................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 7.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAtt............. 29 tt 1.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTT........ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCA............................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTct............................................................................................................................................................................................................................ 26 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CTGCCTCTTGAAAATAATTTCTAATATGC............................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTTTAAGAGGACTCCAGCAAAC......................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATC........................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TCTCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCAT.............................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTt.......... 31 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................ATATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGca................................................................................................................ 27 ca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGac............................................................................................................................................................................. 25 ac 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAA............................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACA............. 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................GCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAA.......................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................AAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCC................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGtac................................... 27 tac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................AGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTCCTGT... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTTTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAA................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTActc.......................................................................................................................................................... 26 ctc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TCCTTTTGTAAATCTACCAGGCATTTT........................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAt.............................. 28 t 1.00 28.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................CTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGT......... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTTG................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGAa................................... 27 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TTAAGTAAAATCAGAAATGTTATGTCATT.......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAAC......................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TAATCATTAAGTAAAATCAGAAATGTTA................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TAAGTAAAATCAGAAATGTTATGTCATc.......................................................................................................................................................................................... 28 c 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGTTAATCAAAAACAGTTGAAGAATA........................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGT......... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGT............................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAAT........................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAAtt..................................................................................................................................................... 31 tt 1.00 26.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGa........................................................................................................................................................................ 25 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACA............. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TATTTTCTCTTCCTTTTGTAAA.......................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TATTTCTCAGCATATTTTCTCTTCCTT................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAA........................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGc.................................... 28 c 1.00 15.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CTACCAGGCATTTTAAGAG...................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAG................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAc........................... 29 c 1.00 191.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................AATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTC................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGAC................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTACCAGGCATTTTAAGAGGACT.................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAAAAC.................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCATT............................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CATCTGCCTCTTGAAAATAATTTCTA..................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGAt................................... 29 t 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGTTAATCAAAAACAGTTGAAGAATATT...................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGt........................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAt.......................... 30 t 1.00 22.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGAa.............. 28 a 1.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TGAAAATAATTTCTAATATGCTAATATTT....................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAA.......................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TTCTCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGC................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTC................................. 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAAA...................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAAAAT............................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TTTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGG..................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTtatc.......................................................................................................................................................... 26 tatc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....AATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTA........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATCATT..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATCATT..................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGT......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTc.............................................................................................................................................................. 24 c 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGA............... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TTTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAAT........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTTTAATGACAGGGCTTAGTGAggc................................................................................................................................................................................................................................ 25 ggc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCTTCATCTGCCTCTTGAAAATAATTTC....................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAAAAT............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGTCtc........................................................................................................................................................................... 27 tc 1.00 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTtt............................................................................................................................................................ 26 tt 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGt.................................... 28 t 1.00 15.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTT................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGtt.............. 30 tt 1.00 67.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGA.................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................ACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAAC......................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TAATCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTC................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CCCTTCATCTGCCTCTTGAAAATAAT.......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTt....... 28 t 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CTTCATCTGCCTCTTGAAAATAATTT........................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................CAGGAACAGTTGTTAATCAAAAACAGT................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAt............ 32 t 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAG................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGG................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAA........................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCTGCCTCTTGAAAATAATTTCTAATATGCT.............................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTTTAATGACAGGGCTTAGTGAT.................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ATCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCC................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TTGTTAATCAAAAACAGTTGAAGAATATT...................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TTTTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGA....................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCCCTTCATCTGCCTCTTGAAAATAATTT........................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGTCG............................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAG......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGAAGAATATTGTCCCTTCATCTGCCTC..................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCt............................ 29 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTG.......... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAACTC....................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAa............ 30 a 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................AGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGT........... 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGT........... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGtgg..................................... 27 tgg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................ATATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAA................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATCA....................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGT.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGAGGTCGCAGGAAC..................................................................................................................................................................... 15 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ATTTTAATGACAGGGCTTAGTGATGCTTGTAATCATTAAGTAAAATCAGAAATGTTATGTCATTTGCTTTTGAGGTCGCAGGAACAGTTGTTAATCAAAAACAGTTGAAGAATATTGTCCCTTCATCTGCCTCTTGAAAATAATTTCTAATATGCTAATATTTCTCAGCATATTTTCTCTTCCTTTTGTAAATCTACCAGGCATTTTAAGAGGACTCCAGCAAACTCAGAAAGGACAGTGTTCCTGTCTT
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.................................................................66............................................................................................................................................208........................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)