chr9:78327292 78327480 -
(7)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(37)
TESTES

Sense strand
AACTGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCCAGGATGTCTATAAAATTGGAGGTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGACGTGAATTTGAAGTCTTATGTTTTGTGTATTAAATACTTATACAAAACAATACTATTTTAGGCATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAGCCT
....................................................((((((....((((((...(((....)))..)))))).......(((((((((((.........)))))))))))...)))))).....................................................
..................................................51......................................................................................139................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGAC.............................................................................................................. 29 1 17.00 17.00 - - 9.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAGACTGGTGTTCTCAAGC.. 21 1 7.00 7.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCCA............................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - 2.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTG................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 - - 2.00 - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGA............................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGACGT............................................................................................................ 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGT.................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTGGAGACTGGTGTTCTCAAGC.. 22 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACTGACAAGCCCCTGCGAC......................................................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGC........................... 21 6 2.33 2.33 1.33 - - - - - 0.83 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAGCC. 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGACGTGA.......................................................................................................... 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACTGACAAGCCCCTGCGA.......................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAA..................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACTGACAAGCCCCTGCGACTGCCCC................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAGC.. 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTC................................................................................................................................................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 22 4 1.75 1.75 1.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTGG............................. 20 6 1.50 1.50 1.33 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTG........... 27 4 1.50 1.50 - - 0.25 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 20 4 1.50 1.50 0.75 - - 0.50 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCACTGTCCCTGTGGG............................ 18 6 1.33 1.33 1.00 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTGGG............................ 21 6 1.33 1.33 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 33 4 1.25 1.25 - - - - - - 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 24 4 1.25 1.25 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AGACTGGTGTTCTCAAGCC. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 25 4 1.00 1.00 - 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTAGAATATTAAGTAGAATGTTGACG............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTGACAAGCCCCTGCGACTGCCC.................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 28 4 1.00 1.00 - - - 0.25 - 0.25 - - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AAAATTGGAGGTAAGTAGAAT................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCCAGGA............................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TAGGCATTGGCACTGTCCCTGTGG............................. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................AAATTGGAGGTAAGTAGAATATTAAGTAGAA..................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................AAGTAGAATGTTGACG............................................................................................................. 16 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CTTATACAAAACAATACTATTTTAGa................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCC................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAG... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AGAATGTTGACGTGAATTTG..................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....ACAAGCCCCTGCGACTGCCCCT.................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCC................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 27 4 1.00 1.00 - - 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAGC.. 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTt........... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGACG............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATG................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 25 5 1.00 1.00 0.80 - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GGAGACTGGTGTTCTCAAGCCT 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CAAGCCCCTGCGACTGCCC.................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGt............................................................................................................... 28 t 1.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 26 4 1.00 1.00 - - 0.25 - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCCAGGAT........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................CGAGTGGAGACTGGTattc........ 19 attc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCACTGTCCCTGTGGGC........................... 19 6 1.00 1.00 0.83 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 28 4 1.00 1.00 - 0.25 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CTGACAAGCCCCTGCGACTGC...................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TATTAAGTAGAATGTTGACGTGAATTTGAAG.................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACTGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCC................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TGGAGGTAAGTAGAATATTA............................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................ATATTAAGTAGAATGTTGACGTGAAT........................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTAGAATATTAAGTAGAATGTTGACGTGt.......................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................CGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAGC.. 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 32 4 1.00 1.00 0.75 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACTGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCT.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................CGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAG... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTC................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACa............... 26 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTaaaa........................... 20 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 35 4 1.00 1.00 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.ACTGACAAGCCCCTGCGACTGC...................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 27 4 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGGAGACTGGTGTTCTCAAGCC. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATACAAAACAATACTATTTTAGaa................................................ 24 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAGt.. 30 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 32 5 0.80 0.80 - - - - - - 0.60 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 23 5 0.80 0.80 - - - - - - 0.60 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AGGCATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 33 5 0.80 0.80 - - - - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 31 4 0.75 0.75 - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 26 4 0.75 0.75 - - - - - 0.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 30 4 0.75 0.75 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTG........... 23 4 0.75 0.75 - 0.50 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTa........ 26 a 0.75 1.00 - 0.50 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCA..... 29 4 0.75 0.75 - 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 28 4 0.75 0.75 - 0.25 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCT....... 27 4 0.75 0.75 - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCACTGTCCCTGTGGGCC.......................... 20 6 0.67 0.67 0.33 - - 0.17 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 20 5 0.60 0.60 - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 27 5 0.60 0.60 - - - 0.20 - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGG.................... 28 5 0.60 0.60 - - - 0.20 - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 32 5 0.60 0.60 - - - 0.40 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAG....................... 25 5 0.60 0.60 - - - - - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 28 5 0.60 0.60 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGG.................... 29 5 0.60 0.60 - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGG.................... 22 5 0.60 0.60 - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 24 5 0.60 0.60 - - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGA................. 16 9 0.56 0.56 0.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTG........... 26 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCT....... 32 4 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTG........... 29 4 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTG........... 25 4 0.50 0.50 - 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTC...... 28 4 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 18 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AGACTGGTGTTCTCAAG... 17 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 34 4 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CGACTGCCCCTCCAGGA............................................................................................................................................................ 17 7 0.43 0.43 - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GCGACTGCCCCTCCAGGA............................................................................................................................................................ 18 7 0.43 0.43 - - - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 18 7 0.43 0.43 - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 24 7 0.43 0.43 - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 23 7 0.43 0.43 - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 29 5 0.40 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGAC................ 26 5 0.40 0.40 - - - - 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 35 5 0.40 0.40 - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGAC................ 27 5 0.40 0.40 - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 19 5 0.40 0.40 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 25 5 0.40 0.40 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 24 5 0.40 0.40 - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 29 5 0.40 0.40 - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 28 5 0.40 0.40 - 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 24 5 0.40 0.40 - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AGGCATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCG......................... 27 5 0.40 0.40 - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGAC................ 18 6 0.33 0.33 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTGGG............................ 19 6 0.33 0.33 - - - 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGCGACTGCCCCTCCAGGATGTCTA...................................................................................................................................................... 25 6 0.33 0.33 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCC.......................... 22 6 0.33 0.33 - - - - - - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................AGTGGAGACTGGTGTTCT....... 18 13 0.31 0.31 - - - 0.15 - - - - 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCT....... 25 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14
..................................................................................................................................................................CGAGTGGAGACTGGTGTTCT....... 20 7 0.29 0.29 - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTg...... 26 g 0.29 0.29 - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 18 7 0.29 0.29 - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 20 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 19 7 0.29 0.29 - - - 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCT....... 26 7 0.29 0.29 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGC........................... 16 11 0.27 0.27 - - - 0.18 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 32 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 34 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGggtt......... 25 ggtt 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 33 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGa............. 27 a 0.25 0.75 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGa.......... 24 a 0.25 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTatt......... 25 att 0.25 1.75 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCC.......................... 17 8 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACT............... 18 8 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 36 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 26 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 24 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTG.............. 29 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 36 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTC........ 26 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 35 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CTCCAGGATGTCTATAAAA................................................................................................................................................. 19 8 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTC........ 27 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 21 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 30 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTt........... 27 t 0.25 1.00 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGG............. 23 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCA..... 36 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 25 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTa......... 25 a 0.25 1.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCA..... 32 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACTGt............. 21 t 0.25 1.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAGTGGAGACTGGTGTTC........ 18 9 0.22 0.22 - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 22 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GCATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 31 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGT...................... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAGTGGAGACTGGTGTT......... 17 10 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................ACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACa............... 27 a 0.20 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 30 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 23 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - -
....................................................................................................................................................CTGTCCCTGTGGGCCGAG....................... 18 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 25 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGG.................... 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGAC................ 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTG..................... 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGAC................ 32 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 23 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCCTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 22 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GCACTGTCCCTGTGGGCCGAGT...................... 22 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 32 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GGCACTGTCCCTGTGGGCCGA........................ 21 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CCAGGATGTCTATAAAATTGGAGG.......................................................................................................................................... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 26 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GTCCCTGTGGGCCGAGTGGA................... 20 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 34 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGAC................ 29 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CACTGTCCCTGTGGGCCGAG....................... 20 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CCCTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 19 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGA................. 31 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGACT............... 19 5 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTG................................ 17 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTGTGGGCCGAGTGGAG.................. 17 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CTGCGACTGCCCCTCCAGGATGT......................................................................................................................................................... 23 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGG............................. 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTG.............................. 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTGGCACTGTCCCTGTGGGCC.......................... 21 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CTGTGGGCCGAGTGGAGAC................ 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGT............................... 18 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................ATTGGCACTGTCCCTGTGGG............................ 20 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGCGACTGCCCCTCCAGGATGTCTATAA................................................................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................GGCACTGTCCCTGTGGGCC.......................... 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - -
...........................................................................................................................................................TGTGGGCCGAGTGGAGA................. 17 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - -
...............GCGACTGCCCCTCCAGGATGTCTATAAA.................................................................................................................................................. 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CGACTGCCCCTCCAGGATG.......................................................................................................................................................... 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AGGCATTGGCACTGTCCCTGTGGtaa.......................... 26 taa 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCCTGTGGGC........................... 22 6 0.17 0.17 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AGGCATTGGCACTGTCCCTGTGG............................. 23 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTGGAGACTGGTGTTCT....... 17 13 0.15 0.15 - 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................AGTGGAGACTGGTGTTCTCA..... 20 13 0.15 0.15 - - - - - - - - - - 0.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAA.... 29 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGggtt......... 24 ggtt 0.14 0.29 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CCGAGTGGAGACTGGTGTTC........ 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................CCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 19 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 23 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GCCGAGTGGAGACTGGTGTT......... 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................GTCTATAAAATTGGAG........................................................................................................................................... 16 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 20 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTt........ 25 t 0.14 0.43 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................ATGTCTATAAAATTGGAGG.......................................................................................................................................... 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTC........ 25 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCA..... 27 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 -
...............................................................................................................................................................GGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCT....... 23 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTC........ 24 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTG........... 21 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTG........... 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTt...... 26 t 0.14 0.29 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTC...... 27 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGT............ 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - -
...............GCGACTGCCCCTCCAGGAT........................................................................................................................................................... 19 7 0.14 0.14 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................ATGTCTATAAAATTGGAG........................................................................................................................................... 18 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - -
...........................CCAGGATGTCTATAAAATTGG............................................................................................................................................. 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CTCCAGGATGTCTATAAAATT............................................................................................................................................... 21 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GCCGAGTGGAGACTGGTGT.......... 19 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CAGGATGTCTATAAAATTG.............................................................................................................................................. 19 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GCCGAGTGGAGACTGGTGTTC........ 21 7 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTa........ 24 a 0.14 0.14 - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCA..... 28 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - -
....................TGCCCCTCCAGGATGTCT....................................................................................................................................................... 18 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................CTCCAGGATGTCTATAAAAT................................................................................................................................................ 20 8 0.12 0.12 - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AGGCATTGGCACTGTCCC.................................. 18 8 0.12 0.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAGTGGAGACTGGTGTTCa....... 19 a 0.11 0.22 - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................TGGGCCGAGTGGAGAC................ 16 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GGCATTGGCACTGTCC................................... 16 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAGTGGAGACTGGTGTTCTCAA.... 22 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTGGAGACTGGTGTTCTCAA.... 20 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CATTGGCACTGTCCC.................................. 15 14 0.07 0.07 - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................AGACTGGTGTTCTCAA.... 16 18 0.06 0.06 - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AACTGACAAGCCCCTGCGACTGCCCCTCCAGGATGTCTATAAAATTGGAGGTAAGTAGAATATTAAGTAGAATGTTGACGTGAATTTGAAGTCTTATGTTTTGTGTATTAAATACTTATACAAAACAATACTATTTTAGGCATTGGCACTGTCCCTGTGGGCCGAGTGGAGACTGGTGTTCTCAAGCCT
....................................................((((((....((((((...(((....)))..)))))).......(((((((((((.........)))))))))))...)))))).....................................................
..................................................51......................................................................................139................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
.................GACTGCCCCTCCAGGATGTCTATA.................................................................................................................................................... 24 8 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -