(1)
OTHER.ip
(10)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(42)
TESTES

Sense strand
CTCCTGAGTTCATCTAGTCAAAGCACACGTACACTGGTGTTGACTAGCAGGTTGGCATTTCATGTACCCACCTTCCTACCTGCCCCTCTGGCTTTCTTACCCTTGTTCTAGATGATTCTCCATGCCCTTAATTTCAGAACCATTTACAAGTTCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGTGGCCTGCTTCTGTCACCTCTGAGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGCCCTTTTCGTCTTC
.......................................................................................................................((((((((((.....((((((.........))))))...(((((.....))))).))))))))))..................................................................
.........................................................................................90............................................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.................TCAAAGCACACGTACACTGGTGTTGACTAGCAGGTTGGCATTTCATGTACCC..................................................................................................................................................................................... 52 1 667.00 667.00 667.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGT...................................................................... 26 1 15.00 15.00 - 2.00 2.00 - - 3.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTG................ 27 1 9.00 9.00 - 1.00 2.00 - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGG....................................................................... 24 1 8.00 8.00 - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGG............... 28 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTG..................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.......................................................................................................................................................TCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGG........................................................................ 27 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTA...................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTA...................... 25 1 5.00 5.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................................................................................................................................................GTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGG....................................................................... 25 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGT.................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGT...................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGG....................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGCC............ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAG......................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................................................GATGATTCTCCATGCCCTTA........................................................................................................................ 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACT................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAAGTTCTGTAATGTGGTAGA................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGACTAGCAGGTTGGCATTTCATGTA........................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGt............... 28 t 2.00 9.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGCC............ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GGAGTAATGGACTGTGTTGTGGT....................... 23 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GCTTCTGTCACCTCTGAGG............................................ 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTAATGGACTGTGTTGTGGT....................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTG................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGGACTGTGTTGTGGTATCAC.................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGAGTTCATCTAGTCAAAGCACACGTAC.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGTG................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................TACACTGGTGTTGACTAGCAGGTTGGCAT................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGGAGTAATGGACTGTGTTG........................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TTGTTCTAGATGATTCTCCATGCCCTTA........................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TTCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGT...................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTAT..................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................ATAGGAGGGTGTGGCCat.............................................................. 18 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCTTACCCTTGTTCTAGATGATTCTCC................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAAGTTCTGTAATGTGGTAGAGCTATA............................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............................................................................................................................................................GTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGTGGCCT............................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................CTGAGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCA................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGT.................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAAGTTCTGTAATGTGG....................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGTGG.................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGt........................................................................ 27 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTCACCTCTGAGGAGTAATGGACTGTGTT............................ 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GTAGAGCTATAGGAGGGTGTGGCC................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGG............... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................AGAGCTATAGGAGGGTGTGGCCTGC............................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GAGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCttt................. 31 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATC.................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTt................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................AGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTAT..................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGT...................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TTCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGG....................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTCACCTCTGAGGAGTAATG..................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATC.................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTG..................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GACTGTGTTGTGGTATCACTGGG.............. 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTG................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AAAGCACACGTACACTGGTGTTGACTAG........................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................CTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTG..................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAAAGCACACGTACACTGGTGTTGACTAG........................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGT...................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGC............. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGC............. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAAAGCACACGTACACTGGTGTTGACTAGt.......................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................TCAAAGCACACGTACACTGGTGTTGACTA............................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGAGTTCATCTAGTCAAAGCACACGTACACT....................................................................................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................CACGTACACTGGTGTTGACTAGCAGG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTGACTAGCAGGTTGGCATTTCATGT......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AATGTGGTAGAGCTATAGG........................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCAC.................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTAATGTGGTAGAGCTATAGGA.......................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACCTCTGAGGAGTAATGGACTGT............................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGTTCTAGATGATTCTCCATGCCCTTA........................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................TGCTTCTGTCACCTCTGAGGAGTAATGGA................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................AATGGACTGTGTTGTGGTATCACTG................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGCaa........... 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................AGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCAC.................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACCTCTGAGGAGTAATGGACT................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAGTTCATCTAGTCAAAGCACACGTACACT....................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GAGTAATGGACTGTGTTGTG......................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TGTCACCTCTGAGGAGTAATGGACT................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAAAGCACACGTACACTGGTGTTGACT............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.TCCTGAGTTCATCTAGTCAAAGCACACGTA........................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGTGGCCTaag............................................................ 31 aag 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CTGTCACCTCTGAGGAGT......................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GTTCTGTAATGTGGTAGAG.................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGG........................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGCC............ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TGACTAGCAGGTTGGCATT............................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGgat..................... 28 gat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGG............... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TGGACTGTGTTGTGGTA...................... 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TCTGGCTTTCTTACCC.................................................................................................................................................... 16 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GTAGAGCTATAGGAG......................................................................... 15 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCCTGAGTTCATCTAGTCAAAGCACACGTACACTGGTGTTGACTAGCAGGTTGGCATTTCATGTACCCACCTTCCTACCTGCCCCTCTGGCTTTCTTACCCTTGTTCTAGATGATTCTCCATGCCCTTAATTTCAGAACCATTTACAAGTTCTGTAATGTGGTAGAGCTATAGGAGGGTGTGGCCTGCTTCTGTCACCTCTGAGGAGTAATGGACTGTGTTGTGGTATCACTGGGCCCTTTTCGTCTTC
.......................................................................................................................((((((((((.....((((((.........))))))...(((((.....))))).))))))))))..................................................................
.........................................................................................90............................................................................................184................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................................................................................GTTCTAGATGATTCTCCATGCCCTT......................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TTCTGTCACCTCTGAcata.............................................. 19 cata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00