| Gene: Snf1lk2 | ID: uc009pky.1_intron_0_0_chr9_50701495_r.3p | SPECIES: mm9 |
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|
(3) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(7) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(28) TESTES |
| AGCTTTGCAAAATAAGCCAAGTTATAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCAGCATTTACTGCACAAGTGCTGTAATATTGACAAAATGAAAATGCCTTCCAGATTGAAAATGGGGGCTGCTCATTTCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAGATTGGCATAAACCCCTGTCCCCCAACAGGGTTGTGAGCTGCTTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATGGCAGGACAGTT ..................................................((((((((..((((((..((((((((.......))))))))..))...))))..........(((.((((.........)))))))..))).)))))...((((.((......))...)))).............................................................................. ..................................................51.........................................................................................................................174.......................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363964(GSM822766) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..........................................CTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCAGCATTTACTGCACAAGTGCTGTAA............................................................................................................................................................ | 52 | 1 | 128.00 | 128.00 | 128.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACT....................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 23.00 | 23.00 | - | 6.00 | - | - | 3.00 | - | 1.00 | 5.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTG...................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 14.00 | 14.00 | - | 2.00 | - | - | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TTTCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGC................................................................................ | 28 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | 3.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................TCATTTCAGGACTGCAGGATCAGACC..................................................................................... | 26 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | - | 3.00 | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................AGGACTGCAGGATCAGA....................................................................................... | 17 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TTCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTC....................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................TAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCAGC.................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 7.00 | 7.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CAGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAGA............................................................................. | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGA......................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGAAAATGCCTTCCAGATTGAAAATGGG..................................................................................................................... | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGCAGGATCAGACCACAGCAGATTGGC........................................................................ | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................TATAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAG.......................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TTCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGT........................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TTTCAGGACTGCAGGATCAGACCACA.................................................................................. | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGATTTCTTTAGACTGAAGGAGAATG............................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTGt..................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 3.00 | 14.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................AAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACT....................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGAC........................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................TGCTCATTTCAGGACTGCAGGATCAGAC...................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................CAGGATCAGACCACAGCAGATTGGCATA..................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................TTATAAAGTGGGGCTTGATTTCTTT............................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................TCAGACCACAGCAGATTGGCATAAACCCCT.............................................................. | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................AGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAGAT............................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CAGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAG.............................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................TGTCCCCCAACAGGGTTGTGAGCTGC..................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCA.................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TTCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCC...................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................CAAGTGCTGTAATATTGACAAAATGAAA............................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCAGC.................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTGA..................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................CGGGAGACCTAGCAGCTATGGCAGG...... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CAGGACTGCAGGATCAGACCACAGC................................................................................ | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTC....................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAG.......................................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................AGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAGA............................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................AGGATCAGACCACAGCAG.............................................................................. | 18 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TTTCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAGA............................................................................. | 31 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................TTCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGC................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGATTTCTTTAGACTGAAGGAGAATGT........................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................TGCTGTAATATTGACAAAATGAAAATGCC....................................................................................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCC...................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................TGCTGTAATATTGACAAAATGAAAATGC........................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGCAGGATCAGACCACAGCAGATTGGCA....................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................AAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTG...................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTT................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................AACAGGGTTGTGAGCTGCTTAGCCCGGGA.......................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................ATTTCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGCA............................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................CTTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATG........... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTGc..................................................................................................................................................................................................... | 29 | c | 1.00 | 14.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................TTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCA.................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................GTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTGAAt................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................TCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGC................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................TGCTTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCT.............. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ...............................................GACTGAAGGAGAATGTTGTCCCAGCA................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................TTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCAGC.................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................................................................................................................................................TGTGAGCTGCTTAGCCCGGGAGACC...................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................TGTTGTCCCAGCATTTACTGCACAAGTGC................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ..............................................................................................TATTGACAAAATGAAAATGCCTTCCAGt................................................................................................................................ | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................TTTCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTC....................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................TGTCCCCCAACAGGGTTGTGAGCTGCT.................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TATAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTA........................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TGGGGGCTGCTCATTTCAGGACTGCAGG............................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGAAAATGCCTTCCAGATTGAAAATGGGt.................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................CATTTCAGGACTGCAGGATCAGACC..................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................TGAGCTGCTTAGCCCGGGAGACCTAGC.................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................TTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATGGC......... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ...........................................................................................................................................TCATTTCAGGACTGCAGGATCAGACCAC................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACa....................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................TGTTGTCCCAGCATTTACTGCACAAGT................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................AGGACTGCAGGATCAGACCACAGC................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................TGAAGGAGAATGTTGTCCCAGCATTT.............................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................ATAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAG.......................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TATAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACT....................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................TCCAGATTGAAAATGGGGGCTGCTCA............................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................TTTCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGaa............................................................................... | 29 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................AGGGTTGTGAGCTGCTTAGCCCGGGA.......................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................................................................AGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATGGCAGG...... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................GTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTGA..................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................................................GCTCATTTCAGGACTGCAGGATCAGACC..................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................TTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATGGCt........ | 29 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GCAGGATCAGACCACAGCAGATTGGCA....................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................TCAGACCACAGCAGATTGGCATAAACCCC............................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCA.................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................................................................................CGGGAGACCTAGCAGCTATGGCAGGAC.... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TGACAAAATGAAAATGCCTTCCAGATTGA............................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ..............................................................................................................................................TTTCAGGACTGCAGGATCAGACCAC................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................CCCGGGAGACCTAGCAGCTATGGCAGG...... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................CTGCAGGATCAGACCACAGCAGATTGGCA....................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ..............................................................................................TATTGACAAAATGAAAATGCCTTCCAGAa............................................................................................................................... | 29 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GACCACAGCAGATTGGCATAAACCCCTG............................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................TTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATG........... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................TAGCAGCTATGGCAGGgc.... | 18 | gc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................TGACAAAATGAAAATGCCTTCCAGAT............................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................TGCAGGATCAGACCACAGCAGATTGGCAT...................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................TGGCATAAACCCCTGTCCCCCAACAGGGT............................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................................................................TTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATGG.......... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CAGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAGAT............................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................TACTGCACAAGTGCTGTAATATTGAC..................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| AGCTTTGCAAAATAAGCCAAGTTATAAAGTGGGGCTTGATTTCTTTAGACTGAAGGAGAATGTTGTCCCAGCATTTACTGCACAAGTGCTGTAATATTGACAAAATGAAAATGCCTTCCAGATTGAAAATGGGGGCTGCTCATTTCAGGACTGCAGGATCAGACCACAGCAGATTGGCATAAACCCCTGTCCCCCAACAGGGTTGTGAGCTGCTTAGCCCGGGAGACCTAGCAGCTATGGCAGGACAGTT ..................................................((((((((..((((((..((((((((.......))))))))..))...))))..........(((.((((.........)))))))..))).)))))...((((.((......))...)))).............................................................................. ..................................................51.........................................................................................................................174.......................................................................... |
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